New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_007779 | 2411458 = | NA (NA) | 238 (0.990) | 129/180 | NT | 96.4% | intergenic (‑147/+15) | lrhA/insB | DNA‑binding transcriptional repressor/IS1 element protein |
? | NC_007779 | = 2985055 | 9 (0.040) | coding (553/1230 nt) | yqeG | transporter |
Only 100 of 256 total aligned reads displayed.
CACACACAAACAAGCAATTCCATTTGTAATGTGCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCG > NC_007779/2411358‑2411556 | cacacacaAACAAGCAATTCCATTTGTAATGTGCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCg > 1:7803646/1‑101 (MQ=255) cacacaAACAAGCAATTCCATTTGTAATGTGCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGt < 1:5246178/101‑1 (MQ=255) cacaAACAAGCAATTCCATTTGTAATGTGCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTaa > 1:7457736/1‑101 (MQ=255) cacaAACAAGCAATTCCATTTGTAATGTGCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGCaa > 1:8761430/1‑101 (MQ=255) acaaacaaGCAATTCCATTTGTAATGTGCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAAt < 1:2181643/101‑1 (MQ=255) aaacaaGCAATTCCATTTGTAATGTGCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCGGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGa < 1:8032077/101‑1 (MQ=255) aacaaGCAATTCCATTTGTAATGTGCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGAc > 1:12043823/1‑101 (MQ=255) acaaGCAATTCCATTTGTAATGTGCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACt > 1:4604915/1‑101 (MQ=255) acaaGCAATTCCATTTGTAATGTGCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACt > 1:5129559/1‑101 (MQ=255) aaGCAATTCCATTTGTAATGTGCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTcc < 1:6326764/101‑1 (MQ=255) aGCAATTCCATTTGTAATGTGCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCATTAAAAAAGCGGTAATGACTCCa < 1:7438152/101‑1 (MQ=255) aGCAATTCCATTTGTAATGTGCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCa < 1:8127107/101‑1 (MQ=255) aGCAATTCCATTTGTAATGTGCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCa < 1:5213853/101‑1 (MQ=255) gCAATTCCATTTGTAATGTGCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCaa < 1:2630581/101‑1 (MQ=255) gCAATTCCATTTGTAATGTGCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCaa > 1:4186258/1‑101 (MQ=255) aTTCCATTTGTAATGTGCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACtt > 1:8721200/1‑101 (MQ=255) ttCCATTTGTAATGTGCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTa < 1:3933053/101‑1 (MQ=255) ttCCATTTGTAATGTGCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTa < 1:10006738/101‑1 (MQ=255) cATTTGTAATGTGCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTg > 1:1276345/1‑101 (MQ=255) cATTTGTAATGTGCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTg < 1:4932107/101‑1 (MQ=255) cATTTGTAATGTGCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTg < 1:10188253/101‑1 (MQ=255) tttGTAATGTGCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGAt < 1:7030595/101‑1 (MQ=255) ttGTAATGTGCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATa > 1:11030363/1‑101 (MQ=255) gTAATGTGCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAgt < 1:4155350/101‑1 (MQ=255) tAATGTGCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAgtg < 1:6813941/101‑1 (MQ=255) tAATGTGCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAgtg < 1:1668109/101‑1 (MQ=255) tgCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTa > 1:8563921/1‑101 (MQ=255) gCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTAt < 1:7861602/101‑1 (MQ=255) tCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGtt > 1:2412362/1‑101 (MQ=255) ccTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCa > 1:1200890/1‑101 (MQ=255) ccTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCa < 1:5440892/101‑1 (MQ=255) ccTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCa < 1:8666165/101‑1 (MQ=255) ggCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGAt < 1:1539279/101‑1 (MQ=255) gCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATa > 1:11756532/1‑101 (MQ=255) gCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATa < 1:6538104/101‑1 (MQ=255) aGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAAt > 1:4714788/1‑101 (MQ=255) ttCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGcc > 1:9950035/1‑101 (MQ=255) ttCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGcc > 1:3393278/1‑101 (MQ=255) ttCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGcc < 1:1432720/101‑1 (MQ=255) tCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGccc < 1:9643280/101‑1 (MQ=255) cATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCg < 1:3243070/101‑1 (MQ=255) aTCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGa < 1:10730269/101‑1 (MQ=255) aTCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGa < 1:8299679/101‑1 (MQ=255) tCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGAt < 1:5769317/101‑1 (MQ=255) cGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGa < 1:7690304/101‑1 (MQ=255) cGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGa > 1:4654938/1‑101 (MQ=255) ggAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGAc < 1:8452287/101‑1 (MQ=255) gAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACt > 1:8336454/1‑101 (MQ=255) gAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACt > 1:4869858/1‑101 (MQ=255) gAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACt > 1:7527321/1‑101 (MQ=255) aaCCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACtt > 1:1069065/1‑101 (MQ=255) aCCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACttt > 1:5387966/1‑101 (MQ=255) cccGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGATTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTg < 1:1445418/101‑1 (MQ=255) ccGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGt < 1:9801675/101‑1 (MQ=255) gACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCAt > 1:2823551/1‑101 (MQ=255) cGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGc > 1:1862626/1‑101 (MQ=255) cGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGc > 1:3772095/1‑101 (MQ=255) gAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCa > 1:2054153/1‑101 (MQ=255) gAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCa < 1:5624440/101‑1 (MQ=255) gAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCa > 1:11429160/1‑101 (MQ=255) aaaGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAg < 1:2251484/101‑1 (MQ=255) aaGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGc > 1:11607842/1‑101 (MQ=255) gTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTc > 1:10632294/1‑101 (MQ=255) tAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTcc > 1:8488747/1‑101 (MQ=255) tAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTcc > 1:9513079/1‑101 (MQ=255) aaaaTGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCAc < 1:3038595/101‑1 (MQ=255) aaaaTGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCAc > 1:4324470/1‑101 (MQ=255) aaaaTGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCAc > 1:3663345/1‑101 (MQ=255) aaaTGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCAcc > 1:7716068/1‑101 (MQ=255) aaTGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCg > 1:11812863/1‑101 (MQ=255) aaTGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCg > 1:11476894/1‑101 (MQ=255) gCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGAtt < 1:6716490/101‑1 (MQ=255) cATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGAttt > 1:10415434/1‑101 (MQ=255) atatGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGAtttt < 1:9132775/101‑1 (MQ=255) atatGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGAtttt > 1:10429402/1‑101 (MQ=255) atatGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCCATGACTTTTTTTTGCAGCCCCCcccccttt > 1:10493687/1‑95 (MQ=17) tatGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTg > 1:6077150/1‑101 (MQ=255) tGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTgag > 1:480506/1‑101 (MQ=255) gAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTgaga > 1:3178404/1‑101 (MQ=255) gTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAAc > 1:5719772/1‑101 (MQ=255) gTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAAc > 1:9048126/1‑101 (MQ=255) ttGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACg < 1:10216338/101‑1 (MQ=255) tGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGa > 1:9893901/1‑101 (MQ=255) tGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGa < 1:6250033/101‑1 (MQ=255) gCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTTTGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGAc < 1:7941780/101‑1 (MQ=255) gCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGGACGAc < 1:7203190/101‑1 (MQ=255) gCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGAc < 1:2076583/101‑1 (MQ=255) cACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACa > 1:343698/1‑101 (MQ=40) cACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACa > 1:5846608/1‑101 (MQ=40) cACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACa < 1:8917731/101‑1 (MQ=40) cTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGc > 1:8384173/1‑101 (MQ=39) tAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCg > 1:10558691/1‑101 (MQ=38) aaaaaaGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGa > 1:1247762/1‑101 (MQ=37) aaaaGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACt > 1:5981787/1‑101 (MQ=34) aaaGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACtt < 1:1008857/101‑1 (MQ=33) aaaGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACtt < 1:7661735/101‑1 (MQ=33) aGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTcc > 1:2448029/1‑101 (MQ=31) aGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTcc > 1:10846411/1‑101 (MQ=31) aGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTcc < 1:5902467/101‑1 (MQ=31) gCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCg < 1:4416476/101‑1 (MQ=11) | CACACACAAACAAGCAATTCCATTTGTAATGTGCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCG > NC_007779/2411358‑2411556 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |