Read alignment evidence... | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_007779 | 1,348,546 | 1 | .→T | 0.8% | 2.9 ‑1.4 ‑0.6 | 263 | intergenic (‑90/+146) | gmr/rnb | modulator of Rnase II stability/ribonuclease II |
Rejected: Polymorphism prediction not supported by minimum number of reads on both strands. | ||||||||||
Rejected: Polymorphic indel expands or contracts a homopolymer stretch. | ||||||||||
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (2/0): ref base (129/132): total (131/132) | ||||||||||
Fisher's exact test strand distribution p-value = 2.47e-01 | ||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 2.60e-01 |
Only 100 of 304 total aligned reads displayed.
ACGGTTTTCATGATGCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCATTG‑TTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCAGTTTTGGAAAAACGCCAGTTTTCAAACGAAAGTCAGTTAAAAAATCTGCCTGGATATAACGAAGGTAGAGCG > NC_007779/1348446‑1348646 | aCGGTTTTCATGATGCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCATTg < 1:4522028/101‑1 (MQ=255) aCGGTTTTCATGATGCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCATTg < 1:5902244/101‑1 (MQ=255) gTTTTCATGATGCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCATTG‑ttt < 1:2600650/101‑1 (MQ=255) gTTTTCATGATGCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCATTG‑ttt < 1:52454/101‑1 (MQ=255) ttttCATGATGCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCATTG‑tttt < 1:849941/101‑1 (MQ=255) ttCATGATGCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCATTG‑tttttt > 1:3372354/1‑101 (MQ=255) ttCATGATGCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCATTG‑tttttt < 1:1675242/101‑1 (MQ=255) ttCATGATGCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCATTG‑tttttt < 1:569839/101‑1 (MQ=255) tCATGATGCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCATTG‑ttttttt > 1:11779596/1‑101 (MQ=255) cATGATGCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCATTG‑tttttttt < 1:7890666/101‑1 (MQ=255) atgatgCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCATTG‑TTTTTTTta > 1:3665420/1‑101 (MQ=255) atgatgCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCATTG‑TTTTTTTta > 1:11455961/1‑101 (MQ=255) atgatgCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCATTG‑TTTTTTTta < 1:2824705/101‑1 (MQ=255) tgatgCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCATTG‑TTTTTTTtat < 1:3548727/101‑1 (MQ=255) atgCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCATTG‑TTTTTTTtatat > 1:11977124/1‑101 (MQ=255) atgCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCATTG‑TTTTTTTtatat < 1:3436995/101‑1 (MQ=255) tgCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCATTG‑TTTTTTTtatata > 1:6102616/1‑101 (MQ=255) tgCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCATTG‑TTTTTTTtatata < 1:10703280/101‑1 (MQ=255) gCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCATTG‑TTTTTTTTatatat < 1:9405427/101‑1 (MQ=255) atatCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCATTG‑TTTTTTTTATAtattt > 1:3254981/1‑101 (MQ=255) atatCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCATTG‑TTTTTTTTATAtattt < 1:8931272/101‑1 (MQ=255) tcctccGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCATTG‑TTTTTTTTATAtatttatt > 1:9817746/1‑101 (MQ=255) tccGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCATTG‑TTTTTTTTATATATTTATTTGt < 1:8257902/101‑1 (MQ=255) ccGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCATTG‑TTTTTTTTATATATTTATTTGTa > 1:7560556/1‑101 (MQ=255) ggTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCATTG‑TTTTTTTTATATATTTATTTGTAAt < 1:5315860/101‑1 (MQ=255) ggTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCATTG‑TTTTTTTTATATATTTATTTGTAAt > 1:5567325/1‑101 (MQ=255) ggTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCATTG‑TTTTTTTTATATATTTATTTGTAAt > 1:6452665/1‑101 (MQ=255) ggTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCATTG‑TTTTTTTTATATATTTATTTGTAAt < 1:9223925/101‑1 (MQ=255) ttAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCATTG‑TTTTTTTTATATATTTATTTGTAATcc > 1:2976280/1‑101 (MQ=255) tAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCATTG‑TTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCa > 1:9946543/1‑101 (MQ=255) tAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCATTG‑TTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCa > 1:11923239/1‑101 (MQ=255) aaCAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCATTG‑TTTTTTTTATATATTTATTTTTAATCCAg > 1:1839144/1‑101 (MQ=255) aCAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCATTG‑TTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCAGt < 1:1935801/101‑1 (MQ=255) cAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCATTG‑TTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCAGtt < 1:10578457/101‑1 (MQ=255) cAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCATTG‑TTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCAGtt > 1:1132962/1‑101 (MQ=255) aGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCATTG‑TTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCAGttt > 1:5051305/1‑101 (MQ=255) aGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCATTG‑TTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCAGttt > 1:2721649/1‑101 (MQ=255) aGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCATTG‑TTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCAGttt < 1:8154907/101‑1 (MQ=255) aGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCATTG‑TTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCAGttt < 1:7352208/101‑1 (MQ=255) cGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCATTG‑TTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCAGTTTTg < 1:9779566/101‑1 (MQ=255) cGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCATTG‑TTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCAGTTTTg > 1:7060038/1‑101 (MQ=255) ggAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCATTG‑TTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCAGTTTTgg > 1:4728964/1‑101 (MQ=255) ggAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCATTG‑TTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCAGTTTTgg > 1:10991092/1‑101 (MQ=255) aGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCATTG‑TTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCAGTTTTGGaa > 1:9853359/1‑101 (MQ=255) gTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCATTG‑TTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCAGTTTTGGaaa < 1:1085795/101‑1 (MQ=255) gcgGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCCTTG‑TTTTTTTTATATATTTATTTGTAATACAGTTTTGGaaaaaac > 1:11379096/1‑99 (MQ=255) ggTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCATTG‑TTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCAGTTTTGGAAAAACGcc > 1:2106382/1‑101 (MQ=255) ttAAATAAAAGGAACAACATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCATTG‑TTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCAGTTTTGGAAAAACGCCAg > 1:6168274/1‑101 (MQ=255) ttAAATAAAAGGAACAACATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCATTG‑TTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCAGTTTTGGAAAAACGCCAg < 1:5772894/101‑1 (MQ=255) taaataaaAGGAACAACATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCATTG‑TTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCAGTTTTGGAAAAACGCCCGt > 1:10118096/1‑101 (MQ=255) taaataaaAGGAACAACATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCATTG‑TTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCAGTTTTGGAAAAACGCCAGt > 1:1450682/1‑101 (MQ=255) aataaaAGGAACAACATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCATTG‑TTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCAGTTTTGGAAAAACGCCAGttt > 1:5870760/1‑101 (MQ=255) ataaaAGGAACAACATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCATTG‑TTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCAGTTTTGGAAAAACGCCAGtttt > 1:469029/1‑101 (MQ=255) taaaAGGAACAACATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCATTG‑TTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCAGTTTTGGAAAAACGCCAGTTTTc > 1:4035047/1‑101 (MQ=255) aaaaGGAACAACATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCATTG‑TTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCAGTTTTGGAAAAACGCCAGTTTTCa > 1:9605370/1‑101 (MQ=255) aaaGGAACAACATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCATTG‑TTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCAGTTTTGGAAAAACACCAGTTTTCaa > 1:3178806/1‑101 (MQ=255) aaGGAACAACATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCATTG‑TTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCAGTTTTGGAAAAACGCCAGTTTTCaaa > 1:8330077/1‑101 (MQ=255) aaGGAACAACATGACTTACATAAAATTAACGGCGGCTAAACGCATTG‑TTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCAGTTTTGGAAAAACGCCAGTTTTCaaa > 1:138426/1‑101 (MQ=255) aacaacATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCATTG‑TTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCAGTTTTGGAAAAACGCCAGTTTTCAAACGaa < 1:8009087/101‑1 (MQ=255) acaacaTGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCATTGTTTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCAGTTTTGGAAAAACGCCAGTTTTCAAACGaa > 1:5396557/1‑101 (MQ=255) caacaTGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCATTG‑TTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCAGTTTTGGAAAAACGCCAGTTTTCAAACGAAAg < 1:7289423/101‑1 (MQ=255) caTGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCATTG‑TTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCAGTTTTGGAAAAACGCCAGTTTTCAAACGAAAGTCa > 1:9750740/1‑101 (MQ=255) gACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCATTG‑TTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCAGTTTTGGAAAAACGCCAGTTTTCAAACGAAAGTCAGtt > 1:1588010/1‑101 (MQ=255) aCTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCATTG‑TTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCAGTTTTGGAAAAACGCCAGTTTTCAAACGAAAGTCAGTTa > 1:8408826/1‑101 (MQ=255) cTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCATTG‑TTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCAGTTTTGGAAAAACGCCAGTTTTCAAACGAAAGTCAGTTaa < 1:6603478/101‑1 (MQ=255) ttACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCATTG‑TTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCAGTTTTGGAAAAACGCCAGTTTTCAAACGAAAGTCAGTTaaa > 1:7475216/1‑101 (MQ=255) tACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCATTG‑TTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCAGTTTTGGAAAAACGCCAGTTTTCAAACGAAAGTCAGTTaaaa < 1:11543097/101‑1 (MQ=255) tACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCATTG‑TTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCAGTTTTGGAAAAACGCCAGTTTTCAAACGAAAGTCAGTTaaaa > 1:10811074/1‑101 (MQ=255) aCATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCATTG‑TTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCAGTTTTGGAAAAACGCCAGTTTTCAAACGAAAGTCAGTTaaaaa > 1:7653181/1‑101 (MQ=255) aTGAAATTAACGGCGGCTAAACGCATTG‑TTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCAGTTTTGGAAAAACGCCAGTTTTCAAACGAAAGTCAGTTAAAAAAt > 1:2855087/1‑101 (MQ=255) gAAATTAACGGCGGCTAAACGCATTG‑TTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCAGTTTTGGAAAAACGCCAGTTTTCAAACGAAAGTCAGTTAAAAAATCt < 1:11501024/101‑1 (MQ=255) gAAATTAACGGCGGCTAAACGCATTG‑TTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCAGTTTTGGAAAAACGCCAGTTTTCAAACGAAAGTCAGTTAAAAAATCt > 1:7801687/1‑101 (MQ=255) aaaTTAACGGCGGCTAAACGCATTG‑TTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCAGTTTTGGAAAAACGCCAGTTTTCAAACGAAAGTCAGTTAAAAAATCTg < 1:4127133/101‑1 (MQ=255) aTTAACGGCGGCTAAACGCATTG‑TTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCAGTTTTGGAAAAACGCCAGTTTTCAAACGAAAGTCAGTTAAAAAATCTGcc > 1:3213602/1‑101 (MQ=255) tAACGGCGGCTAAACGCATTG‑TTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCAGTTTTGGAAAAACGCCAGTTTTCAAATGAAAGTCAGTTAAAAAATCTGCCTg < 1:8675927/101‑1 (MQ=255) tAACGGCGGCTAAACGCATTG‑TTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCAGTTTTGGAAAAACGCCAGTTTTCAAACGAAAGTCAGTTAAAAAATCTGCCTg > 1:2201795/1‑101 (MQ=255) aaCGGCGGCTAAACGCATTG‑TTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCAGTTTTGGAAAAACGCCAGTTTTCAAACGAAAGTCAGTTAAAAAATCTGCCTgg < 1:5460850/101‑1 (MQ=255) aCGGCGGCTAAACGCATTG‑TTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCAGTTTTGGAAAAACGCCAGTTTTCAAACGAAAGTCAGTTAAAAAATCTGCCTGGa < 1:10420308/101‑1 (MQ=255) gcggcTAAACGCATTG‑TTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCAGTTTTGGAAAAACGCCAGTTTTCAAACGAAAGTCAGTTAAAAAATCTGCCTGGatat > 1:8561400/1‑101 (MQ=255) gcggcTAAACGCATTG‑TTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCAGTTTTGGAAAAACGCCAGTTTTCAAACGAAAGTCAGTTAAAAAATCTGCCTGGatat > 1:4558150/1‑101 (MQ=255) cggcTAAACGCATTG‑TTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCAGTTTTGGAAAAACGCCAGTTTTCAAACGAAAGTCAGTTAAAAAATCTGCCTGGAtata < 1:1354280/101‑1 (MQ=255) ggcTAAACGCATTG‑TTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCAGTTTTGGAAAAACGCCAGTTTTCAAACGAAAGTCAGTTAAAAAATCTGCCTGGATATaa > 1:6898821/1‑101 (MQ=255) gcTAAACGCATTG‑TTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCAGTTTTGGAAAAACGCCAGTTTTCAAACGAAAGTCAGTTAAAAAATCTGCCTGGATATAAc < 1:11675859/101‑1 (MQ=255) cTAAACGCATTG‑TTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCAGTTTTGGAAAAACGCCAGTTTTCAAACGAAAGTCAGTTAAAAAATCTGCCTGGATATAACg > 1:10796265/1‑101 (MQ=255) cTAAACGCATTG‑TTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCAGTTTTGGAAAAACGCCAGTTTTCAAACGAAAGTCAGTTAAAAAATCTGCCTGGATATAACg < 1:1550091/101‑1 (MQ=255) tAAACGCATTG‑TTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCAGTTTTGGAAAAACGCCAGTTTTCAAACGAAAGTCAGTTAAAAAATCTGCCTGGATATAACGa > 1:4306916/1‑101 (MQ=255) tAAACGCATTG‑TTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCAGTTTTGGAAAAACGCCAGTTTTCAAACGAAAGTCAGTTAAAAAATCCGCCTGGATATAACGa > 1:8219482/1‑101 (MQ=255) aaCGCATTG‑TTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCAGTTTTGGAAAAACGCCAGTTTTCAAACGAAAGTCAGTTAAAAAATCTGCCTGGATATAACGAAg < 1:11121124/101‑1 (MQ=255) cGCATTG‑TTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCAGTTTTGGAAAAACGCCAGTTTTCAAACGAAAGTCAGTTAAAAAATCTGCCTGGATATAACGAAGGt > 1:2459933/1‑101 (MQ=255) gCATTG‑TTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCAGTTTTGGAAAAACGCCAGTTTTCAAACGAAAGTCAGTTAAAAAATCTGCCTGGATATAACGAAGGTa > 1:9036841/1‑101 (MQ=255) gCATTG‑TTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCAGTTTTGGAAAAACGCCAGTTTTCAAACGAAAGTCAGTTAAAAAATCTGCCTGGATATAACGAAGGTa > 1:6946658/1‑101 (MQ=255) gCATTG‑TTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCAGTTTTGGAAAAACGCCAGTTTTCAAACGAAAGTCAGTTAAAAAATCTGCCTGGATATAACGAAGGTa < 1:4371228/101‑1 (MQ=255) cATTG‑TTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCAGTTTTGGAAAAACGCCAGTTTTCAAACGAAAGTCAGTTAAAAAATCTGCCTGGATATAACGAAGGTag > 1:3011716/1‑101 (MQ=255) cATTG‑TTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCAGTTTTGGAAAAACGCCAGTTTTCAAACGAAAGTCAGTTAAAAAATCTGCCTGGATATAACGAAGGTag > 1:1230099/1‑101 (MQ=255) cATTG‑TTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCAGTTTTGGAAAAACGCCAGTTTTCAAACGAAAGTCAGTTAAAAAATCTGCCTGGATATAACGAAGGTag < 1:9903298/101‑1 (MQ=255) aTTG‑TTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCAGTTTTGGAAAAACGCCAGTTTTCAAACGAAAGTCAGTTAAAAAATCTGCCTGGATATAACGAAGGTaga > 1:10539555/1‑101 (MQ=255) ttG‑TTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCAGTTTTGGAAAAACGCCAGTTTTCAAACGAAAGTCAGTTAAAAAATCTGCCTGGATATAACGAAGGTagag > 1:6802211/1‑101 (MQ=255) tG‑TTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCAGTTTTGGAAAAACGCCAGTTTTCAAACGAAAGTCAGTTAAAAAATCTGCCTGGATATAACGAAGGTAGAGc > 1:8736285/1‑101 (MQ=255) g‑TTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCAGTTTTGGAAAAACGCCAGTTTTCAAACGAAAGTCAGTTAAAAAATCTGCCTGGATATAACGAAGGTAGAGCg < 1:3906915/101‑1 (MQ=255) g‑TTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCAGTTTTGGAAAAACGCCAGTTTTCAAACGAAAGTCAGTTAAAAAATCTGCCTGGATATAACGAAGGTAGAGCg > 1:2303974/1‑101 (MQ=255) | ACGGTTTTCATGATGCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCATTG‑TTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCAGTTTTGGAAAAACGCCAGTTTTCAAACGAAAGTCAGTTAAAAAATCTGCCTGGATATAACGAAGGTAGAGCG > NC_007779/1348446‑1348646 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |