| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_007779 | 3,447,067 | 1 | .→C | 1.1% | 1.4 ‑2.4 0.0 | 272 | intergenic (‑172/+41) | htrC/rpoC | heat shock protein/RNA polymerase, beta prime subunit |
| Rejected: E-value exceeds prediction threshold. | ||||||||||
| Rejected: Polymorphism prediction not supported by minimum number of reads on both strands. | ||||||||||
| Rejected: Polymorphic indel expands or contracts a homopolymer stretch. | ||||||||||
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (0/3): ref base (150/119): total (150/122) | ||||||||||
| Fisher's exact test strand distribution p-value = 8.90e-02 | ||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 1.00e+00 | ||||||||||
Only 100 of 311 total aligned reads displayed.
AGTTTCAGGATATTAGTCATCTCTACATTGATTATGAGTATTCAGAAATTCCTTAAATATTCTGACAAATGCTCTTTCCCTAAACTCCCCCCATAAAAAAA‑CCCGCCGAAGCGGGTTTTTACGTTATTTGCGGATTAACGATTACTCGTTATCAGAACCGCCCAGACCTGCGTTCAGCAGTTCTGCCAGGCTGGCAGATGC > NC_007779/3446967‑3447167 | gtTTCAGGATATTAGTCATCTCTACATTGATTATGAGTATTCAGAAATTCCTTAAATATTCTGACAAATGCTCTTTCCCTAAACTCCCCCCATAAAAAAA‑c > 1:9779058/1‑101 (MQ=255) gtTTCAGGATATTAGTCATCTCTACATTGATTATGAGTATTCAGAAATTCCTTAAATATTCTGACAAATGCTCTTTCCCTAAACTCCCCCCATAAAAAAA‑c < 1:7915462/101‑1 (MQ=255) gtTTCAGGATATTAGTCATCTCTACATTGATTATGAGTATTCAGAAATTCCTTAAATATTCTGACAAATGCTCTTTCCCTAAACTCCCCCCATAAAAAAA‑c < 1:289645/101‑1 (MQ=255) tttCAGGATATTAGTCATCTCTACATTGATTATGAGTATTCAGAAATTCCTTAAATATTCTGACAAATGCTCTTTCCCTAAACTCCCCCCATAAAAAAA‑cc > 1:11762647/1‑101 (MQ=255) ttCAGGATATTAGTCATCTCTACATTGATTATGAGTATTCAGAAATTCCTTAAATATTCTGACAAATGCTCTTTCCCTAAACTCCCCCCATAAAAAAA‑ccc < 1:6398216/101‑1 (MQ=255) ttCAGGATATTAGTCATCTCTACATTGATTATGAGTATTCAGAAATTCCTTAAATATTCTGACAAATGCTCTTTCCCTAAACTCCCCCCATAAAAAAA‑ccc > 1:10594076/1‑101 (MQ=255) ttCAGGATATTAGTCATCTCTACATTGATTATGAGTATTCAGAAATTCCTTAAATATTCTGACAAATGCTCTTTCCCTAAACTCCCCCCATAAAAAAA‑ccc < 1:4196704/101‑1 (MQ=255) ttCAGGATATTAGTCATCTCTACATTGATTATGAGTATTCAGAAATTCCTTAAATATTCTGACAAATGCTCTTTCCCTAAACTCCCCCCATAAAAAAA‑ccc > 1:2656358/1‑101 (MQ=255) aGGATATTAGTCATCTCTACATTGATTATGAGTATTCAGAAATTCCTTAAATATTCTGACAAATGCTCTTTCCCTAAACTCCCCCCATAAAAAAA‑Cccgcc < 1:9651364/101‑1 (MQ=255) aGGATATTAGTCATCTCTACATTGATTATGAGTATTCAGAAATTCCTTAAATATTCTGACAAATGCTCTTTCCCTAAACTCCCCCCATAAAAAAA‑Cccgcc > 1:1672939/1‑101 (MQ=255) tatTAGTCATCTCTACATTGATTATGAGTATTCAGAAATTCCTTAAATATTCTGACAAATGCTCTTTCCCTAAACTCCCCCCATAAAAAAA‑CCCGCCGAAg < 1:11242341/101‑1 (MQ=255) atTAGTCATCTCTACATTGATTATGAGTATTCAGAAATTCCTTAAATATTCTGACAAATGCTCTTTCCCTAAACTCCCCCCATAAAAAAA‑CCCGCCGAAGc < 1:6575456/101‑1 (MQ=255) atTAGTCATCTCTACATTGATTATGAGTATTCAGAAATTCCTTAAATATTCTGACAAATGCTCTTTCCCTAAACTCCCCCCATAAAAAAA‑CCCGCCGAAGc < 1:10785213/101‑1 (MQ=255) atTAGTCATCTCTACATTGATTATGAGTATTCAGAAATTCCTTAAATATTCTGACAAATGCTCTTTCCCTAAACTCCCCCCATAAAAAAA‑CCCGCCGAAGc > 1:4089132/1‑101 (MQ=255) atTAGTCATCTCTACATTGATTATGAGTATTCAGAAATTCCTTAAATATTCTGACAAATGCTCTTTCCCTAAACTCCCCCCATAAAAAAA‑CCCGCCGAAGc < 1:11861006/101‑1 (MQ=255) ttAGTCATCTCTACATTGATTATGAGTATTCAGAAATTCCTTAAATATTCTGACAAATGCTCTTTCCCTAAACTCCCCCCATAAAAAAA‑CCCGCCGAAGCg < 1:12032960/101‑1 (MQ=255) tAGTCATCTCTACATTGATTATGAGTATTCAGAAATTCCTTAAATATTCTGACAAATGCTCTTTCCCTAAACTCCCCCCATAAAAAAA‑CCCGCCGAAGCgg < 1:7744218/101‑1 (MQ=255) cATCTCTACATTGATTATGAGTATTCAGAAATTCCTTAAATATTCTGACAAATGCTCTTTCCCTAAACTCCCCCCATAAAAAAA‑CCCGCCGAAGCGGGttt < 1:1551171/101‑1 (MQ=255) aTCTCTACATTGATTATGAGTATTCAGAAATTCCTTAAATATTCTGACAAATGCTCTTTCCCTAAACTCCCCCCAAAAAAAAA‑CCCGCCGAAGCGGGtttt < 1:2260685/101‑1 (MQ=255) tctcTACATTGATTATGAGTATTCAGAAATTCCTTAAATATTCTGACAAATGCTCTTTCCCTAAACTCCCCCCATAAAAAAA‑CCCGCCGAAGCGGGttttt < 1:6891220/101‑1 (MQ=255) tctcTAATTTGATTATGATTATT‑AAAAATTTCTTAAAATTTTTGAACAATGTTTTTTCCCAAAACCCCCCCCAAAAAAAAACCCCGCCGAAGCGGGttttt < 1:8124994/101‑1 (MQ=255) ctctACATTGATTATGAGTATTCAGAAATTCCTTAAATATTCTGACAAATGCTCTTTCCCTAAACTCCCCCCATAAAAAAA‑CCCGCCGAAGCGGGTTTTTa > 1:8813384/1‑101 (MQ=255) ctctACATTGATTATGAGTATTCAGAAATTCCTTAAATATTCTGACAAATGCTCTTTCCCTAAACTCCCCCCATAAAAAAA‑CCCGCCGAAGCGGGTTTTTa > 1:7277553/1‑101 (MQ=255) ctctACATTGATTATGAGTATTCAGAAATTCCTTAAATATTCTGACAAATGCTCTTTCCCTAAACTCCCCCCATAAAAAAA‑CCCGCCGAAGCGGGTTTTTa > 1:9858178/1‑101 (MQ=255) tctACATTGATTATGAGTATTCAGAAATTCCTTAAATATTCTGACAAATGCTCTTTCCCTAAACTCCCCCCATAAAAAAA‑CCCGCCGAAGCGGGTTTTTAc < 1:10290602/101‑1 (MQ=255) tctACATTGATTATGAGTATTCAGAAATTCCTTAAATATTCTGACAAATGCTCTTTCCCTAAACTCCCCCCATAAAAAAA‑CCCGCCGAAGCGGGTTTTTAc < 1:6233030/101‑1 (MQ=255) tACATTGATTATGAGTATTCAGAAATTCCTTAAATATTCTGACAAATGCTCTTTCCCTAAACTCCCCCCATAAAAAAA‑CCCGCCGAAGCGGGTTTTTACGt > 1:10492065/1‑101 (MQ=255) aCATTGATTATGAGTATTCAGAAATTCCTTAAATATTCTGACAAATGCTCTTTCCCTAAACTCCCCCCATAAAAAAA‑CCCGCCGAAGCGGGTTTTTACGtt < 1:11458321/101‑1 (MQ=255) cATTGATTATGAGTATTCAGAAATTCCTTAAATATTCTGACAAATGCTCTTTCCCTAAACTCCCCCCATAAAAAAA‑CCCGCCGAAGCGGGTTTTTACGTTa < 1:1489292/101‑1 (MQ=255) ttGATTATGAGTATTCAGAAATTCCTTAAATATTCTGACAAATGCTCTTTCCCTAAACTCCCCCCATAAAAAAA‑CCCGCCGAAGCGGGTTTTTACGTTAtt > 1:6446391/1‑101 (MQ=255) ttGATTATGAGTATTCAGAAATTCCTTAAATATTCTGACAAATGCTCTTTCCCTAAACTCCCCCCATAAAAAAA‑CCCGCCGAAGCGGGTTTTTACGTTAtt < 1:7530447/101‑1 (MQ=255) tGATTATGAGTATTCAGAAATTCCTTAAATATTCTGACAAATGCTCTTTCCCTAAACTACCCCCATAAAAAAA‑CCCGCCGCAGCGGGATTTTACGTTAttt > 1:3914775/1‑101 (MQ=255) gATTATGAGTATTCAGAAATTCCTTAAATATTCTGACAAATGCTCTTTCCCTAAACTCCCCCCATAAAAAAA‑CCCGCCGAAGCGGGTTTTTACGTTATTTg > 1:9301923/1‑101 (MQ=255) gATTATGAGTATTCAGAAATTCCTTAAATATTCTGACAAATGCTCTTTCCCTAAACTCCCCCCATAAAAAAA‑CCCGCCGAAGCGGGTTTTTACGTTATTTg > 1:1000465/1‑101 (MQ=255) gATTATGAGTATTAAGAAATTCCTTAAATATTCTGACAAATGCTCTTTCCCTAAACCCCCCCCATAAAAAAA‑CCCGCCGAAGCGGGTTTTTACGTTATTTg < 1:8301119/101‑1 (MQ=255) aTTATGAGTATTCAGAAATTCCTTAAATATTCTGACAAATGCTCTTTCCCTAAACTCCCCCCATAAAAAAA‑CCCGCCGAAGCGGGTTTTTACGTTATTTGc > 1:5779126/1‑101 (MQ=255) ttATGAGTATTCAGAAATTCTTTAAATATTCTGACAAATGCTCTTCCCCTAACCTCCCCCCAAAAAAAAA‑CCCGCCGAAGCGGGTTTTTACGTTATTTGCg < 1:5969488/101‑1 (MQ=39) ttATGAGTATTCAGAAATTCCTTAAATATTCTGACAAATGCTCTTTCCCTAAACTCCCCCCATAAAAAAC‑CCCGCCGAAGCGGGTTTTTACGTTATGTGCg < 1:1947149/101‑1 (MQ=255) ttATGAGTATTCAGAAATTCCTTAAATATTCTGACAAATGCTCTTTCCCTAAACTCCCCCCATAAAAAAA‑CCCGCCGAAGCGGGTTTTTACGTTATTTGCg > 1:6163779/1‑101 (MQ=255) ttATGAGTATTCAGAAATTCCTTAAATATTCTGACAAATGCTCTTTCCCTAAACTCCCCCCATAAAAAAA‑CCCGCCGAAGCGGGTTTTTACGTTATTTGCg < 1:10865918/101‑1 (MQ=255) tATGAGTATTCAGAAATTCCTTAAATATTCTGACAAATGCTCTTTCCCTAAACTCCCCCCATAAAAAAA‑CCCGCCGAAGCGGGTTTTTACGTTATTTGCgg < 1:7454274/101‑1 (MQ=255) tATGAGTATTCAGAAATTCCTTAAATATTCTGACAAATGCTCTTTCCCTAAACTCCCCCCATAAAAAAA‑CCCGCCGAAGCGGGTTTTTACGTTATTTGCgg < 1:8627568/101‑1 (MQ=255) tATGAGTATTCAGAAATTCCTTAAATATTCTGACAAATGCTCTTTCCCTAAACTCCCCCCATAAAAAAA‑CCCGCCGAAGCGGGTTTTTACGTTATTTGCgg < 1:3381272/101‑1 (MQ=255) aTGAGTATTCAGAAATTCCTTAAATATTCTGACAAATGCTCTTTCCCTAAACTCCCCCCATAAAAAAA‑CCCGCCGAAGCGGGTTTTTACGTTATTTGCGGa > 1:2537055/1‑101 (MQ=255) aGTATTCAGAAATTCCTTAAATATTCTGACAAATGCTCTTTCCCTAAACTCCCCCCATAAAAAAA‑CCCGCCGAAGCGGGTTTTTACGTTATTTGCGGATTa < 1:3671726/101‑1 (MQ=255) gTATTCAGAAATTCCTTAAATATTCTGACAAATGCTCTTTCCCTAAACTCCCCCCATAAAAAAA‑CCCGCCGAAGCGGGTTTTTACGTTATTTGCGGATTaa > 1:2113580/1‑101 (MQ=255) tATTCAGAAATTCCTTAAATATTCTGACAAATGCTCTTTCCCTAAACTCCCCCCATAAAAAAA‑CCCGCCGAAGCGGGTTTTTACGTTATTTGCGGATTAAc < 1:1396345/101‑1 (MQ=255) aTTCAGAAATTCCTTAAATATTCTGACAAATGCTCTTTCCCTAAACTCCCCCCATAAAAAAA‑CCCGCCGAAGCGGGTTTTTACGTTATTTGCGGATTAACg < 1:4698609/101‑1 (MQ=255) tCAGAAATTCCTTAAATATTCTGACAAATGCTCTTTCCCTAAACTCCCCCCATAAAAAAA‑CCCGCCGAAGCGGGTTTTTACGTTATTTGCGGATTAACGAt < 1:9390307/101‑1 (MQ=255) tCAGAAATTCCTTAAATATTCTGACAAATGCTCTTTCCCTAAACTCCCCCCATAAAAAAA‑CCCGCCGAAGCGGGTTTTTACGTTATTTGCGGATTAACGAt > 1:7024970/1‑101 (MQ=255) tCAGAAATTCCTTAAATATTCTGACAAATGCTCTTTCCCTAAACTCCCCCCATAAAAAAA‑CCCGCCGAAGCGGGTTTTTACGTTATTTGCGGATTAACGAt > 1:11060291/1‑101 (MQ=255) gAAATTCCTTAAATATTCTGACAAATGCTCTTTCCCTAAACTCCCCCCATAAAAAAA‑CCCGCCGAAGCGGGTTTTTACGTTATTTGCGGATTAACGATTAc < 1:7816624/101‑1 (MQ=255) gAAATTCCTTAAATATTCTGACAAATGCTCTTTCCCTAAACTCCCCCCATAAAAAAA‑CCCGCCGAAGCGGGTTTTTACGTTATTTGCGGATTAACGATTAc > 1:8090816/1‑101 (MQ=255) aaaTTCCTTAAATATTCTGACAAATGCTCTTTCCCTAAACTCCCCCCATAAAAAAA‑CCCGCCGAAGCGGGTTTTTACGTTATTTGCGGATTAACGATTACt > 1:3284620/1‑101 (MQ=255) aaTTCCTTAAATATTCTGACAAATGCTCTTTCCCTAAACTCCCCCCATAAAAAAA‑CCCGCCGAAGCGGGTTTTTACGTTATTTGCGGATTAACGATTACTc < 1:7843409/101‑1 (MQ=255) aTTCCTTAAATATTCTGACAAATGCTCTTTCCCTAAACTCCCCCCATAAAAAAA‑CCCGCCGAAGCGGGTTTTTACGTTATTTGCGGATTAACGATTACTCg > 1:84618/1‑101 (MQ=255) aTTCCTTAAATATTCTGACAAATGCTCTTTCCCTAAACCCCCCCCATAAAAAAA‑CCCGCCGAAGCGGGTTTTTACGTTATTTGCGGATTAACGATTACTCg < 1:271773/101‑1 (MQ=255) ttCCTTAAATATTCTGACAAATGCTCTTTCCCTAAACTCCCCCCATAAAAAAA‑CCCGCCGAAGCGGGTTTTTACGTTATTTGCGGATTAACGATTACTCGt < 1:9078260/101‑1 (MQ=255) ttCCTTAAATATTCTGACAAATGCTCTTTCCCTAAACTCCCCCCATAAAAAAA‑CCCGCCGAAGCGGGTTTTTACGTTATTTGCGGATTAACGATTACTCGt > 1:4137565/1‑101 (MQ=255) ccTTAAATATTCTGACAAATGCTCTTTCCCTAAACTCCCCCCATAAAAAAA‑CCCGCCGAAGCGGGTTTTTACGTTATTTGCGGATTAACGATTACTCGTTa > 1:4379555/1‑101 (MQ=255) cTTAAATATTCTGACAAATGCTCTTTCCCTAAACTCCCCCCATAAAAAAA‑CCCGCCGAAGCGGGTTTTTACGTTATTTGCGGATTAACGATTACTCGTTAt > 1:1878274/1‑101 (MQ=255) tAAATATTCTGACAAATGCTCTTTCCCTAAACTCCCCCCATAAAAAAA‑CCCGCCGAAGCGGGTTTTTACGTTATTTGCGGATTAACGATTACTCGTTATCa > 1:5404252/1‑101 (MQ=255) aaaTATTCTGACAAATGCTCTTTCCCTAAACTCCCCCCATAAAAAAA‑CCCGCCGAAGCGGGTTTTTACGTTATTTGCGGATTAACGATTACTCGTTATCAg > 1:1184740/1‑101 (MQ=255) aaTATTCTGACAAATGCTCTTTCCCTAAACTCCCCCCATAAAAAAA‑CCCGCCGAAGCGGGTTTTTACGTTATTTGCGGATTAACGATTACTCGTTATCAGa < 1:3068439/101‑1 (MQ=255) atTCTGACAAATGCTCTTTCCCTAAACTCCCCCCATAAAAAAA‑CCCGCCGAAGCGGGTTTTTACGTTATTTGCGGATTAACGATTACTCGTTATCAGAAcc > 1:1042417/1‑101 (MQ=255) ttCTGACAAATGCTCTTTCCCTAAACTCCCCCCATAAAAAAA‑CCCGCCGAAGCGGGTTTTTACGTTATTTGCGGATTAACGATTACTCGTTATCAGAACCg < 1:1770564/101‑1 (MQ=255) ttCTGACAAATGCTCTTTCCCAAAACCCCCCCCATAAAAAAA‑CCCGCCGAAGCGGGTTTTTACGTTATTTGCGGATTAACGATTACTCGTTATCAGAACCg < 1:4231825/101‑1 (MQ=255) ttCTGACAAATGCTCTATCCCTAAACTCCCCCCATAAAAAAA‑CCCGCCGAAGCGGGTTTTTACGTTATTTGCGGATTAACGATTACTCGTTATCAGAACCg > 1:11325780/1‑101 (MQ=255) cTGACAAATGCTCTTTCCCTAAACTCCCCCCATAAAAAAA‑CCCGCCGAAGCGGGTTTTTACGTTATTTGCGGATTAACGATTACTCGTTATCAGAACCGcc < 1:9974339/101‑1 (MQ=255) tGACAAATGCTCTTTCCCTAAACTCCCCCCATAAAAAAA‑CCCGCCGAAGCGGGTTTTTACGTTATTTGCGGATTAACGATTACTCGTTATCAGAACCGccc > 1:6800505/1‑101 (MQ=255) gACAAATGCTCTTTCCCTAAACTCCCCCCATAAAAAAA‑CCCGCCGAAGCGGGTTTTTACGTTATTTGCGGATTAACGATTACTCGTTATCAGAACCGCCCa > 1:5224417/1‑101 (MQ=255) gACAAATGCTCTTTCCCTAAACTCCCCCCATAAAAAAA‑CCCGCCGAAGCGGGTTTTTACGTTATTTGCGGATTAACGATTACTCGTTATCAGAACCGCCCa > 1:5351274/1‑101 (MQ=255) cAAATGCTCTTTCCCTAAACTCCCCCCATAAAAAAA‑CCCGCCGAAGCGGGTTTTTACGTTATTTGCGGATTAACGATTACTCGTTATCAGAACCGCCCAGa < 1:12095878/101‑1 (MQ=255) aaTGCTCTTTCCCTAAACTCCCCCCATAAAAAAA‑CCCGCCGAAGCGGGTTTTTACGTTATTTGCGGATTAACGATTACTCGTTATCAGAACCGCCCAGAcc > 1:11619985/1‑101 (MQ=255) aaTGCTCTTTCCCTAAACTCCCCCCATAAAAAAA‑CCCGCCGAAGCGGGTTTTTACGTTATTTGCGGATTAACGATTACTCGTTATCAGAACCGCCCAGAcc > 1:3615528/1‑101 (MQ=255) aTGCTCTTTCCCTAAACTCCCCCCATAAAAAAA‑CCCGCCGAAGCGGGTTTTTACGTTATTTGCGGATTAACGATTACTCGTTATCAGAACCGCCCAGACCt > 1:4595758/1‑101 (MQ=255) ctctTTCCCTAAACTCCCCCCATAAAAAAA‑CCCGCCGAAGCGGGTTTTTACGTTATTTGCGGATTAACGATTACTCGTTATCAGAACCGCCCAGACCTGCg < 1:7096024/101‑1 (MQ=255) ctTTCCCTAAACTCCCCCCATAAAAAAA‑CCCGCCGAAGCGGGTTTTTACGTTATTTGCGGATTAACGATTACTCGTTATCAGAACCGCCCAGACCTGCGtt > 1:5632709/1‑101 (MQ=255) ctTTCCCTAAACTCCCCCCATAAAAAAA‑CCCGCCGAAGCGGGTTTTTACGTTATTTGCGGATTAACGATTACTCGTTATCAGAACCGCCCAGACCTGCGtt > 1:1323963/1‑101 (MQ=255) tttCCCTAAACTCCCCCCATAAAAAAA‑CCCGCCGAAGCGGGTTTTTACGTTATTTGCGGATTAACGATTACTCGTTATCAGAACCGCCCAGACCTGCGTTc < 1:3243860/101‑1 (MQ=255) ttCCCTAAACTCCCCCCATAAAAAAA‑CCCGCCGAAGCGGGTTTTTACGTTATTTGCGGATTAACGATTACTCGTTATCAGAACCGCCCAGACCTGCGTTca > 1:6325728/1‑101 (MQ=255) ttCCCTAAACTCCCCCCATAAAAAAA‑CCCGCCGAAGCGGGTTTTTACGTTATTTGCGGATTAACGATTACTCGTTATCAGAACCGCCCAGACCTGCGTTca > 1:3166380/1‑101 (MQ=255) tCCCTAAACTCCCCCCATAAAAAAA‑CCCGCCGAAGCGGGTTTTTACGTTATTTGCGGATTAACGATTACTCGTTATCAGAACCGCCCAGACCTGCGTTcag > 1:8890852/1‑101 (MQ=255) ccTAAACTCCCCCCATAAAAAAA‑CCCGCCGAAGCGGGTTTTTACGTTATTTGCGGATTAACGATTACTCGTTATCAGAACCGCCCAGACCTGCGTTcagca > 1:4289388/1‑101 (MQ=255) aaaCTCCCCCCATAAAAAAA‑CCCGCCGAAGCGGGTTTTTACGTTATTTGCGGATTAACGATTACTCGTTATCAGAACCGCCCAGACCTGCGTTCAGCAGtt < 1:8984691/101‑1 (MQ=255) aaCTCCCCCCATAAAAAAA‑CCCGCCGAAGCGGGTTTTTACGTTATTTGCGGATTAACGATTACTCGTTATCAGAACCGCCCAGACCTGCGTTCAGCAGTTc < 1:5467432/101‑1 (MQ=255) aCTCCCCCCATAAAAAAA‑CCCGCCGAAGCGGGTTTTTACGTTATTTGCGGATTAACGATTACTCGTTATCAGAACCGCCCAGACCTGCGTTCAGCAGTTCt < 1:11900271/101‑1 (MQ=255) ccccccccATAAAAAAC‑CCCGCCGAAGCGGGTTTTTACGTTATTTGCGGATTAACGATTACTCGTTATCAGAACCGCCCAGACCTGCGTTCAGCAGTTCTg < 1:1817505/99‑1 (MQ=255) cTCCCCCCATAAAAAAA‑CCCGCCGAAGCGGGTTTTTACGTTATTTGCGGATTAACGATTACTCGTTATCAGAACCGCCCAGACCTGCGTTCAGCAGTTCTg > 1:6078142/1‑101 (MQ=255) cTCCCCCCATAAAAAAA‑CCCGCCGAAGCGGGTTTTTACGTTATTTGCGGATTAACGATTACTCGTTATCAGAACCGCCCAGACCTGCGTTCAGCAGTTCTg > 1:8260766/1‑101 (MQ=255) ccccATAAAAAAA‑CCCGCCGAAGCGGGTTTTTACGTTATTTGCGGATTAACGATTACTCGTTATCAGAACCGCCCAGACCTGCGTTCAGCAGTTCTGCCAg < 1:5052123/101‑1 (MQ=255) ccccATAAAAAAA‑CCCGCCGAAGCGGGTTTTTACGTTATTTGCGGATTAACGATTACTCGTTATCAGAACCGCCCAGACCTGCGTTCAGCAGTTCTGCCAg > 1:4850185/1‑101 (MQ=255) cccATAAAAAAA‑CCCGCCGAAGCGGGTTTTTACGTTATTTGCGGATTAACGATTACTCGTTATCAGAACCGCCCAGACCTGCGTTCAGCAGTTCTGCCAgg > 1:3779040/1‑101 (MQ=255) ccATAAAAAAA‑CCCGCCGAAGCGGGTTTTTACGTTATTTGCGGATTAACGATTACTCGTTATCAGAACCGCCCAGACCTGCGTTCAGCAGTTCTGCCAGGc < 1:7117755/101‑1 (MQ=255) aTAAAAAAA‑CCCGCCGAAGCGGGTTTTTACGTTATTTGCGGATTAACGATTACTCGTTATCAGAACCGCCCAGACCTGCGTTCAGCAGTTCTGCCAGGCTg > 1:9545074/1‑101 (MQ=255) aaaaaaa‑CCCGCCGAAGCGGGTTTTTACGTTATTTGCGGATTAACGATTACTCGTTATCAGAACCGCCCAGACCTGCGTTCAGCAGTTCTGCCAGGCTGGc > 1:7166239/1‑101 (MQ=255) aaaaac‑CCCGCCGAAGCGGGTTTTTACGTTATTTGCGGATTAACGATTACTCGTTATCAGAACCGCCCAGACCTGCGTTCAGCAGTTCTGCCAGGCTGGCa < 1:2198414/101‑1 (MQ=255) aaaaac‑CCCGCCGAAGCGGGTTTTTACGTTATTTGCGGATTAACGATTACTCGTTATCAGAACCGCCCAGACCTGCGTTCAGCAGTTCTGCCAGGCTGGCa < 1:116928/101‑1 (MQ=255) aaa‑CCCGCCGAAGCGGGTTTTTACGTTATTTGCGGATTAACGATTACTCGTTATCAGAACCGCCCAGACCTGCGTTCAGCAGTTCTGCCAGGCTGGCAGAt > 1:9166426/1‑101 (MQ=255) a‑CCCGCCGAAGCGGGTTTTTACGTTATTTGCGGATTAACGATTACTCGTTATCAGAACCGCCCAGACCTGCGTTCAGCAGTTCTGCCAGGCTGGCAGATGc > 1:7244280/1‑101 (MQ=255) | AGTTTCAGGATATTAGTCATCTCTACATTGATTATGAGTATTCAGAAATTCCTTAAATATTCTGACAAATGCTCTTTCCCTAAACTCCCCCCATAAAAAAA‑CCCGCCGAAGCGGGTTTTTACGTTATTTGCGGATTAACGATTACTCGTTATCAGAACCGCCCAGACCTGCGTTCAGCAGTTCTGCCAGGCTGGCAGATGC > NC_007779/3446967‑3447167 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |