| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_007779 | 4,000,535 | 1 | .→A | 1.4% | 11.6 ‑3.4 ‑0.1 | 276 | intergenic (‑231/‑160) | uspA/yhiO | universal stress global response regulator/universal stress (ethanol tolerance) protein B |
| Rejected: Polymorphism prediction not supported by minimum number of reads on both strands. | ||||||||||
| Rejected: Polymorphic indel expands or contracts a homopolymer stretch. | ||||||||||
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (0/4): ref base (158/114): total (158/118) | ||||||||||
| Fisher's exact test strand distribution p-value = 3.24e-02 | ||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 7.98e-01 | ||||||||||
Only 100 of 310 total aligned reads displayed.
CTTACCTTATAGCGACCCGGATGATCCGTCAATCCGCCTTGCTTACTCGTTAGATAAACAAATTTTCGACATGAATATATTGATAGTGGTTAACCTTCTGG‑AAAAAAAACAACCTGATCTCCTACACTATCTATAGAGCCGCTCGTATGTTGGTCACCACAAAAGCGGTTTCTCCAGGACCTGGTGTTAACTGATTGGCAG > NC_007779/4000435‑4000635 | ttaccttaTAGCGACCCGGATGATCCGTCAATCCGCCTTGCTTACTCGTTAGATAAACAAATTTTCGACATGAATATATTGATAGTGGTTAACCTTCTGG‑a < 1:10378583/101‑1 (MQ=255) ttaccttaTAGCGACCCGGATGATCCGTCAATCCGCCTTGCTTACTCGTTAGATAAACAAATTTTCGACATGAATATATTGATAGTGGTTAACCTTCTGG‑a < 1:11319075/101‑1 (MQ=255) ttaccttaTAGCGACCCGGATGATCCGTCAATCCGCCTTGCTTACTCGTTAGATAAACAAATTTTCGACATGAATATATTGATAGTGGTTAACCTTCTGG‑a < 1:11156320/101‑1 (MQ=255) accttaTAGCGACCCGGATGATCCGTCAATCCGCCTTGCTTACTCGTTAGATAAACAAATTTTCGACATGAATATATTGATAGTGGTTAACCTTCTGG‑aaa > 1:2226167/1‑101 (MQ=255) accttaTAGCGACCCGGATGATCCGTCAATCCGCCTTGCTTACTCGTTAGATAAACAAATTTTCGACATGAATATATTGATAGTGGTTAACCTTCTGG‑aaa > 1:11746404/1‑101 (MQ=255) accttaTAGCGACCCGGATGATCCGTCAATCCGCCTTGCTTACTCGTTAGATAAACAAATTTTCGACATGAATATATTGATAGTGGTTAACCTTCTGG‑aaa > 1:3318510/1‑101 (MQ=255) accttaTAGCGACCCGGATGATCCGTCAATCCGCCTTGCTTACTCGTTAGATAAACAAATTTTCGACATGAATATATTGATAGTGGTTAACCTTCTGG‑aaa < 1:6121335/101‑1 (MQ=255) accttaTAGCGACCCGGATGATCCGTCAATCCGCCTTGCTTACTCGTTAGATAAACAAATTTTCGACATGAATATATTGATAGTGGTTAACCTTCTGG‑aaa > 1:3730201/1‑101 (MQ=255) cttaTAGCGACCCGGATGATCCGTCAATCCGCCTTGCTTACTCGTTAGATAAACAAATTTTCGACATGAATATATTGATAGTGGTTAACCTTCTGG‑aaaaa > 1:9725863/1‑101 (MQ=255) ataGCGACCCGGATGATCCGTCAATCCGCCTTGCTTACTCGTTAGATAAACAAATTTTCGACATGAATATATTGATAGTGGTTAACCTTCTGG‑aaaaaaaa > 1:3443101/1‑101 (MQ=255) ataGCGACCCGGATGATCCGTCAATCCGCCTTGCTTACTCGTTAGATAAACAAATTTTCGACATGAATATATTGATAGTGGTTAACCTTCTGG‑aaaaaaaa > 1:1719702/1‑101 (MQ=255) taGCGACCCGGATGATCCGTCAATCCGCCTTGCTTACTCGTTAGATAAACAAATTTTCGACATGAATATATTGATAGTGGTTAACCTTCTGG‑AAAAAAaac < 1:653097/101‑1 (MQ=255) gACCCGGATGATCCGTCAATCCGCCTTGCTTACTCGTTAGATAAACAAATTTTCGACATGAATATATTGATAGTGGTTAACCTTCTGG‑AAAAAAAACAAcc < 1:10634945/101‑1 (MQ=255) gACCCGGATGATCCGTCAATCCGCCTTGCTTACTCGTTAGATAAACAAATTTTCGACATGAATATATTGATAGTGGTTAACCTTCTGG‑AAAAAAAACAAcc < 1:3532461/101‑1 (MQ=255) gACCCGGATGATCCGTCAATCCGCCTTGCTTACTCGTTAGATAAACAAATTTTCGACATGAATATATTGATAGTGGTTAACCTTCTGG‑AAAAAAAACAAcc > 1:7253949/1‑101 (MQ=255) cccGGATGATCCGTCAATCCGCCTTGCTTACTCGTTAGATAAACAAATTTTCGACATGAATATATTGATAGTGGTTAACCTTCTGG‑AAAAAAAACAACCTg < 1:6269235/101‑1 (MQ=255) cccGGATGATCCGTCAATCCGCCTTGCTTACTCGTTAGATAAACAAATTTTCGACATGAATATATTGATAGTGGTTAACCTTCTGG‑AAAAAAAACAACCTg < 1:12089231/101‑1 (MQ=255) cGGATGATCCGTCAATCCGCCTTGCTTACTCGTTAGATAAACAAATTTTCGACATGAATATATTGATAGTGGTTAACCTTCTGG‑AAAAAAAACAACCTGAt > 1:12028096/1‑101 (MQ=255) ggATGATCCGTCAATCCGCCTTGCTTACTCGTTAGATAAACAAATTTTCGACATGAATATATTGATAGTGGTTAACCTTCTGGAAAAAAAAACAACCTGAt < 1:3496898/101‑1 (MQ=255) ggATGATCCGTCAATCCGCCTTGCTTACTCGTTAGATAAACAAATTTTCGACATGAATATATTGATAGTGGTTAACCTTCTGG‑AAAAAAAACAACCTGAtc > 1:7834434/1‑101 (MQ=255) ggATGATCCGTCAATCCGCCTTGCTTACTCGTTAGATAAACAAATTTTCGACATGAATATATTGATAGTGGTTAACCTTCTGG‑AAAAAAAACAACCTGAtc > 1:8966481/1‑101 (MQ=255) ggATGATCCGTCAATCCGCCTTGCTTACTCGTTAGATAAACAAATTTTCGACATGAATATATTGATAGTGGTTAACCTTCTGG‑AAAAAAAACAACCTGAtc > 1:984930/1‑101 (MQ=255) gatgatCCGTCAATCCGCCTTGCTTACTCGTTAGATAAACAAATTTTCGACATGAATATATTGATAGTGGTTAACCTTCTGG‑AAAAAAAACAACCTGAtct < 1:8002998/101‑1 (MQ=255) gatgatCCGTCAATCCGCCTTGCTTACTCGTTAGATAAACAAATTTTCGACATGAATATATTGATAGTGGTTAACCTTCTGG‑AAAAAAAACAACCTGAtct < 1:3245224/101‑1 (MQ=255) gatCCGTCAATCCGCCTTGCTTACTCGTTAGATAAACAAATTTTCGACATGAATATATTGATAGTGGTTAACCTTCTGG‑AAAAAAAACAACCTGATCTCCt < 1:9432214/101‑1 (MQ=255) atCCGTCAATCCGCCTTGCTTACTCGTTAGATAAACAAATTTTCGACATGAATATATTGATAGTGGTTAACCTTCTGG‑AAAAAAAACAACCTGATCTCCTa > 1:11599927/1‑101 (MQ=255) atCCGTCAATCCGCCTTGCTTACTCGTTAGATAAACAAATTTTCGACATGAATATATTGATAGTGGTTAACCTTCTGG‑AAAAAAAACAACCTGATCTCCTa > 1:929858/1‑101 (MQ=255) ccGTCAATCCGCCTTGCTTACTCGTTAGATAAACAAATTTTCGACATGAATATATTGATAGTGGTTAACCTTCTGG‑AAAAAAAACAACCTGATCTCCTaca < 1:9059860/101‑1 (MQ=255) aaTCCGCCTTGCTTACTCGTTAGATAAACAAATTTTCGACATGAATATATTGATAGTGGTTAACCTTCTGG‑AAAAAAAACAACCTGATCTCCTACActatc < 1:10610305/101‑1 (MQ=255) aTCCGCCTTGCTTACTCGTTAGATAAACAAATTTTCGACATGAATATATTGATAGTGGTTAACCTTCTGG‑AAAAAAAACAACCTGATCTCCTACActatct < 1:2574375/101‑1 (MQ=255) tCCGCCTTGCTTACTCGTTAGATAAACAAATTTTCGACATGAATATATTGATAGTGGTTAACCTTCTGG‑AAAAAAAACAACCTGATCTCCTACActatcta > 1:8337051/1‑101 (MQ=255) cGCCTTGCTTACTCGTTAGATAAACAAATTTTCGACATGAATATATTGATAGTGGTTAACCTTCTGG‑AAAAAAAACAACCTGATCTCCTACACTATCtata > 1:5385972/1‑101 (MQ=255) cGCCTTGCTTACTCGTTAGATAAACAAATTTTCGACATGAATATATTGATAGTGGTTAACCTTCTGG‑AAAAAAAACAACCTGATCTCCTACACTATCtata < 1:7278809/101‑1 (MQ=255) gCCTTGCTTACTCGTTAGATAAACAAATTTTCGACATGAATATATTGATAGTGGTTAACCTTCTGG‑AAAAAAAACAACCTGATCTCCTACACTATCTATag < 1:2275613/101‑1 (MQ=255) ttGCTTACTCGTTAGATAAACAAATTTTCGACATGAATATATTGATAGTGGTTAACCTTCTGG‑AAAAAAAACAACCTGATCTCCTACACTATCTATAGAGc < 1:5219417/101‑1 (MQ=255) ctGCTTACTCGTTAGATAAACAAATTTTCGACATGAATATATTGATAGTGGTTAACCTTCTGG‑AAAAAAAACAACCTGATCTCCTACACTATCTATAGAGc > 1:6049646/2‑101 (MQ=255) gCTTACTCGTTAGATAAACAAATTTTCGACATGAATATATTGATAGTGGTTAACCTTCTGG‑AAAAAAAACAACCTGATCTCCTACACTATCTATAGAGCCg > 1:7459132/1‑101 (MQ=255) ttACTCGTTAGATAAACAAATTTTCGACATGAATATATTGATAGTGGTTAACCTTCTGG‑AAAAAAAACAACCTGATCTCCTACACTATCTATAGAGCCGCt > 1:2158226/1‑101 (MQ=255) tACTCGTTAGATAAACAAATTTTCGACATGAATATATTGATAGTGGTTAACCTTCTGG‑AAAAAAAACAACCTGATCTCCTACACTATCTATAGAGCCGCTc < 1:5582588/101‑1 (MQ=255) aCTCGTTAGATAAACAAATTTTCGACATGAATATATTGATAGTGGTTAACCTTCTGG‑AAAAAAAACAACCTGATCTCCTACACTATCTATAGAGCCGCTCg > 1:1932502/1‑101 (MQ=255) cTCGTTAGATAAACAAATTTTCGACATGAATATATTGATAGTGGTTAACCTTCTGG‑AAAAAAAACAACCTGATCTCCTACACTATCTATAGAGCCGCTCGt < 1:10942408/101‑1 (MQ=255) tCGTTAGATAAACAAATTTTCGACATGAATATATTGATAGTGGTTAACCTTCTGG‑AAAAAAAACAACCTGATCTTCTACACTATCTATAGAGCCGCTCGTa < 1:7137508/101‑1 (MQ=255) gTTAGATAAACAAATTTTCGACATGAATATATTGATAGTGGTTAACCTTCTGG‑AAAAAAAACAACCTGATCTCCTACACTATCTATAGAGCCGCTCGTATg > 1:11521722/1‑101 (MQ=255) gTTAGATAAACAAATTTTCGACATGAATATATTGATAGTGGTTAACCTTCTGG‑AAAAAAAACAACCTGATCTCCTACACTATCTATAGAGCCGCTCGTATg > 1:11922963/1‑101 (MQ=255) ttAGATAAACAAATTTTCGACATGAATATATTGATAGTGGTTAACCTTCTGG‑AAAAAAAACAACCTGATCTCCTACACTATCTATAGAGCCGCTCGTATGt < 1:1744577/101‑1 (MQ=255) ttAGATAAACAAATTTTCGACATGAATATATTGATAGTGGTTAACCTTCTGG‑AAAAAAAACAACCTGATCTCCTACACTATCTATAGAGCCGCTCGTATGt > 1:3556313/1‑101 (MQ=255) tAGATAAACAAATTTTCGACATGAATATATTGATAGTGGTTAACCTTCTGG‑AAAAAAAACAACCTGATCTCCTACACTATCTATAGAGCCGCTCGTATGtt > 1:2432840/1‑101 (MQ=255) aGATAAACAAATTTTCGACATGAATATATTGATAGTGGTTAACCTTCTGG‑AAAAAAAACAACCTGATCTCCTACACTATCTATAGAGCCGCTCGTATGTTg > 1:1567731/1‑101 (MQ=255) aGATAAACAAATTTTCGACATGAATATATTGATAGTGGTTAACCTTCTGG‑AAAAAAAACAACCTGATCTCCTACACTATCTATAGAGCCGCTCGTATGTTg > 1:958977/1‑101 (MQ=255) aTAAACAAATTTTCGACATGAATATATTGATAGTGGTTAACCTTCTGG‑AAAAAAAACAACCTGATCTCCTAAATATTCTTTAGAGCCCCTCGTATGTTggc > 1:8271060/1‑100 (MQ=255) tAAACAAATTTTCGACATGAATATATTGATAGTGGTTAACCTTCTGG‑AAAAAAAACAACCTGATCTCCTACACTATCTATAGAGCCGCTCGTATGTTGGTc > 1:4076052/1‑101 (MQ=255) tAAACAAATTTTCGACATGAATATATTGATAGTGGTTAACCTTCTGG‑AAAAAAAACAACCTGATCTCCTACACTATCTATAGAGCCGCTCGTATGTTGGTc > 1:8771950/1‑101 (MQ=255) aaaCAAATTTTCGACATGAATATATTGATAGTGGTTAACCTTCTGG‑AAAAAAAACAACCTGATCTCCTACACTATCTATAGAGCCGCTCGTATGTTGGTca > 1:10179746/1‑101 (MQ=255) aaCAAATTTTCGACATGAATATATTGATAGTGGTTAACCTTCTGG‑AAAAAAAACAACCTGATCTCCTACACTATCTATAGAGCCGCTCGTATGTTGGTcac < 1:4855921/101‑1 (MQ=255) aCAAATTTTCGACATGAATATATTGATAGTGGTTAACCTTCTGG‑AAAAAAAACAACCTGATCTCCTACACTATCTATAGAGCCGCTCGTATGTTGGTcacc > 1:7004945/1‑101 (MQ=255) aCAAATTTTCGACATGAATATATTGATAGTGGTTAACCTTCTGG‑AAAAAAAACAACCTGATCTCCTACACTATCTATAGAGCCGCTCGTATGTTGGTcacc < 1:385286/101‑1 (MQ=255) cAAATTTTCGCCATGAATATATTGATAGTGGTTACCTTTCTGA‑AAAAAAAACAACCTGATCTCCTACACTATCTATAGAGCCGCTCGTATGTTGGTcacca < 1:4812526/101‑1 (MQ=255) cAAATTTTCGACATGAATATATTGATAGTGGTTAACCTTCTGG‑AAAAAAAACAACCTGATCTCCTACACTATCTATAGAGCCGCTCGTATGTTGGTcacca > 1:6402366/1‑101 (MQ=255) cAAATTTTCGACATGAATATATTGATAGTGGTTAACCTTCTGG‑AAAAAAAACAACCTGATCTCCTACACTATCTATAGAGCCGCTCGTATGTTGGTcacca < 1:4974157/101‑1 (MQ=255) cAAATTTTCGACATGAATATATTGATAGTGGTTAACCTTCTGG‑AAAAAAAACAACCTGATCTCCTACACTATCTATAGAGCCGCTCGTATGTTGGTcacca < 1:1050372/101‑1 (MQ=255) aaaTTTTCGACATGAATATATTGATAGTGGTTAACCTTCTGG‑AAAAAAAACAACCTGATCTCCTACACTATCTATAGAGCCGCTCGTATGTTGGTcaccac < 1:2343841/101‑1 (MQ=255) aaTTTTCGACATGAATATATTGATAGTGGTTAACCTTCTGG‑AAAAAAAACAACCTGATCTCCTACACTATCTATAGAGCCGCTCGTATGTTGGTCACcaca > 1:5122185/1‑101 (MQ=255) tttCGACATGAATATATTGATAGTGGTTAACCTTCTGG‑AAAAAAAACAACCTGATCTCCTACACTATCTATAGAGCCGCTCGTATGTTGGTCACCACaaaa > 1:9557009/1‑101 (MQ=255) ttCGACATGAATATATTGATAGTGGTTAACCTTCTGG‑AAAAAAAACAACCTGATCTCCTACACTATCTATAGAGCCGCTCGTATGTTGGTCACCACAAAAg < 1:2696143/101‑1 (MQ=255) gACATGAATATATTGATAGTGGTTAACCTTCTGG‑AAAAAAAACAACCTGATCTCCTACACTATCTATAGAGCCGCTCGTATGTTGGTCACCACAAAAGCgg > 1:8387672/1‑101 (MQ=255) tGAATATATTGATAGTGGTTAACCTTCTGG‑AAAAAAAACAACCTGATCTCCTACACTATCTATAGAGCCGCTCGTATGTTGGTCACCACAAAAGCGGTTtc < 1:4242589/101‑1 (MQ=255) tGAATATATTGATAGTGGTTAACCTTCTGG‑AAAAAAAACAACCTGATCTCCTACACTATCTATAGAGCCGCTCGTATGTTGGTCACCACAAAAGCGGTTtc < 1:2961683/101‑1 (MQ=255) gAATATATTGATAGTGGTTAACCTTTTGG‑AAAAAAAACAACCTGATCTCCTACACTATCTATAGAGCCGCTCGTATGTTGGTCACCACAAAAGCGGTTtct > 1:8670472/1‑101 (MQ=255) gAATATATTGATAGTGGTTAACCTTCTGG‑AAAAAAAACAACCTGATCTCCTACACTATCTATAGAGCCGCTCGTATGTTGGTCACCACAAAAGCGGTTtct < 1:8939200/101‑1 (MQ=255) atatatTGATAGTGGTTAACCTTCTGG‑AAAAAAAACAACCTGATCTCCTACACTATCTATAGAGCCGCTCGTATGTTGGTCACCACAAAAGCGGTTTCTcc > 1:9490338/1‑101 (MQ=255) tatatTGATAGTGGTTAACCTTCTGG‑AAAAAAAACAACCTGATCTCCTACACTATCTATAGAGCCGCTCGTATGTTGGTCACCACAAAAGCGGTTTCTCCa < 1:10779717/101‑1 (MQ=255) tatatTGATAGTGGTTAACCTTCTGG‑AAAAAAAACAACCTGATCTCCTACACTATCTATAGAGCCGCTCGTATGTTGGTCACCACAAAAGCGGTTTCTCCa > 1:10988388/1‑101 (MQ=255) tatatTGATAGTGGTTAACCTTCTGG‑AAAAAAAACAACCTGATCTCCTACACTATCTATAGAGCCGCTCGTATGTTGGTCACCACAAAAGCGGTTTCTCCa > 1:4419142/1‑101 (MQ=255) tatatTGATAGTGGTTAACCTTCTGG‑AAAAAAAACAACCTGATCTCCTACACTATCTATAGAGCCGCTCGTATGTTGGTCACCACAAAAGCGGTTTCTCCa < 1:1806335/101‑1 (MQ=255) atatTGATAGTGGTTAACCTTCTGG‑AAAAAAAACAACCTGATCTCCTACACTATCTATAGAGCCGCTCGTATGTTGGTCACCACAAAAGCGGTTTCTCCAg < 1:11741034/101‑1 (MQ=255) atatTGATAGTGGTTAACCTTCTGG‑AAAAAAAACAACCTGATCTCCTACACTATCTATAGAGCCGCTCGTATGTTGGTCACCACAAAAGCGGTTTCTCCAg > 1:11538520/1‑101 (MQ=255) atatTGATAGTGGTTAACCTTCTGG‑AAAAAAAACAACCTGATCTCCTACACTATCTATAGAGCCGCTCGTATGTTGGTCACCACAAAAGCGGTTTCTCCAg > 1:5766925/1‑101 (MQ=255) tatTGATAGTGGTTAACCTTCTGG‑AAAAAAAACAACCTGATCTCCTACACTATCTATAGAGCCGCTCGTATGTTGGTCACCACAAAAGCGGTTTCTCCAgg > 1:8488047/1‑101 (MQ=255) atTGATAGTGGTTAACCTTCTGG‑AAAAAAAACAACCTGATCTCCTACACTATCTATAGAGCCGCTCGTATGTTGGTCACCACAAAAGCGGTTTCTCCAGGa < 1:7930857/101‑1 (MQ=255) tGATAGTGGTTAACCTTCTGG‑AAAAAAAACAACCTGATCTCCTACACTATCTATAGAGCCGCTCGTATGTTGGTCACCACAAAAGCGGTTTCTCCAGGAcc > 1:7172587/1‑101 (MQ=255) gATAGTGGTTAACCTTCTGG‑AAAAAAAACAACCTGATCTCCTACACTATCTATAGAGCCGCTCGTATGTTGGTTACCACAAAAGCGGTTTCTCCAGGACCt > 1:3989422/1‑101 (MQ=255) gATAGTGGTTAACCTTCTGG‑AAAAAAAACAACCTGATCTCCTACACTATCTATAGAGCCGCTCGTATGTTGGTCACCACAAAAGCGGTTTCTCCAGGACCt < 1:54478/101‑1 (MQ=255) aGTGGTTAACCTTCTGG‑AAAAAAAACAACCTGATCTCCTACACTATCTATAGAGCCGCTCGTATGTTGGTCACCACAAAAGCGGTTTCTCCAGGACCTGgt < 1:7590195/101‑1 (MQ=255) gTGGTTATCCTTCTGG‑AAAAAAAACAACCTGATCTCGTAGTCTAGCTATAGAGCCGCTTGTATGTTGGTCACCACAAAAGCGGTTTCTCCAGGACCTGgtg < 1:4145349/101‑1 (MQ=255) tGGTTAACCTTCTGG‑AAAAAAAACAACCTGATCTCCTACACTATCTATAGAGCCGCTCGTATGTTGGTCACCACAAAAGCGGTTTCTCCAGGACCTGgtgt < 1:818762/101‑1 (MQ=255) tGGTTAACCTTCTGG‑AAAAAAAACAACCTGATCTCCTACACTATCTATAGAGCCGCTCGTATGTTGGTCACCACAAAAGCGGTTTCTCCAGGACCTGgtgt > 1:5874200/1‑101 (MQ=255) ggTTAACCTTCTGG‑AAAAAAAACAACCTGATCTCCTACACTATCTATAGAGCCGCTCGTATGTTGGTCACCACAAAAGCGGTTTCTCCAGGACCTGGTGtt < 1:8608454/101‑1 (MQ=255) ggTTAACCTTCTGG‑AAAAAAAACAACCTGATCTCCTACACTATCTATAGAGCCGCTCGTATGTTGGTCACCACAAAAGCGGTTTCTCCAGGACCTGGTGtt > 1:5973380/1‑101 (MQ=255) ttAACCTTCTGG‑AAAAAAAACAACCTGATCTCCTACACTATCTATAGAGCCGCTCGTATGTTGGTCACCACAAAAGCGGTTTCTCCAGGACCTGGTGTTaa > 1:1392417/1‑101 (MQ=255) aaCCTTCTGG‑AAAAAAAACAACCTGATCTCCTACACTATCTATAGAGCCGCTCGTATGTTGGTCACCACAAAAGCGGTTTCTCCAGGACCTGGTGTTAACt < 1:6649259/101‑1 (MQ=255) ccTTCTGG‑AAAAAAACCAACCTGATCTCCTACACTATCTATAGAGCCGCTCGTATGTTGGTCACCACAAAAGCGGTTTCTCCACCACCTGGTGTTAACTGa > 1:2505522/1‑101 (MQ=255) ccTTCTGG‑AAAAAAAACAACCTGATCTCCTACACTATCTATAGAGCCGCTCGTATGTTGGTCACCACAAAAGCGGTTTCTCCAGGACCTGGTGTTAACTGa > 1:2392350/1‑101 (MQ=255) ttCTGG‑AAAAAAAACAACCTGATCTCCTACACTATCTATAGAGCCGCTCGTATGTTGGTCACCACAAAAGCGGTTTCTCCAGGACCTGGTGTTAACTGAtt > 1:5317796/1‑101 (MQ=255) ttCTGG‑AAAAAAAACAACCTGATCTCCTACACTATCTATAGAGCCGCTCGTATGTTGGTCACCACAAAAGCGGTTTCTCCAGGACCTGGTGTTAACTGAtt > 1:10033159/1‑101 (MQ=255) tCTGG‑AAAAAAAACAACCTGATCTCCTACACTATCTATAGAGCCGCTCGTATGTTGGTCACCACAAAAGCGGTTTCTCCAGGACCTGGTGTTAACTGATTg < 1:7379632/101‑1 (MQ=255) cTGG‑AAAAAAAACAACCTGATCTCCTACACTATCTATAGAGCCGCTCGTATGTTGGTCGCCACAAAAGCGGTTTCTCCAGGACCTGGTGTTAACTGATTgg > 1:209934/1‑101 (MQ=255) cTGG‑AAAAAAAACAACCTGATCTCCTACACTATCTATAGAGCCGCTCGTATGTTGGTCACCACAAAAGCGGTTTCTCCAGGACCTGGTGTTAACTGATTgg < 1:1523588/101‑1 (MQ=255) tGG‑AAAAAAAACAACCTGATCTCCTACACTATCTATAGAGCCGCTCGTATGTTGGTCACCACAAAAGCGGTTTCTCCAGGACCTGGTGTTAACTGATTGGc < 1:5493336/101‑1 (MQ=255) gg‑AAAAAAAACAACCTGATCTCCTACACTATCTATAGAGCCGCTCGTATGTTGGTCACCACAAAAGCGGTTTCTCCAGGACCTGGTGTTAACTGATTGGCa > 1:7709936/1‑101 (MQ=255) gg‑AAAAAAAACAACCTGATCTCCTACACTATCTATAGAGCCGCTCGTATGTTGGTCACCACAAAAGCGGTTTCTCCAGGACCTGGTGTTAACTGATTGGCa > 1:467257/1‑101 (MQ=255) | CTTACCTTATAGCGACCCGGATGATCCGTCAATCCGCCTTGCTTACTCGTTAGATAAACAAATTTTCGACATGAATATATTGATAGTGGTTAACCTTCTGG‑AAAAAAAACAACCTGATCTCCTACACTATCTATAGAGCCGCTCGTATGTTGGTCACCACAAAAGCGGTTTCTCCAGGACCTGGTGTTAACTGATTGGCAG > NC_007779/4000435‑4000635 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |