| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_007779 | 4,016,769 | 1 | .→C | 1.6% | 7.9 ‑3.8 ‑0.0 | 253 | coding (248/384 nt) | yhhH | hypothetical protein |
| Rejected: Polymorphism prediction not supported by minimum number of reads on both strands. | ||||||||||
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (4/0): ref base (95/154): total (99/154) | ||||||||||
| Fisher's exact test strand distribution p-value = 2.26e-02 | ||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 1.00e+00 | ||||||||||
Only 100 of 262 total aligned reads displayed.
ATTTTTGCCTATTTCTATAATAAAAACCCCACCAGCAATTTGGTCTGAGTGAATGGTACCTTCAACAACCCAACTTGTTGTTAACTCAGTGATTTCGTATG‑GTTTTTCTTCTTCTGCGGCATCCTGTCCATAACGATTCTTAACATATATCTCAGCTAATTCCAATGCTATAGCTTTATTTTTAACCAAATTTCTAACGGT > NC_007779/4016669‑4016869 | ttttGCCTATTTCTATAATAAAAACCCCACCAGCAATTTGGTCTGAGTGAATGGTACCTTCAACAACCCAACTTGTTGTTAACTCAGTGATTTCGTATG‑Gt > 1:9847492/1‑101 (MQ=255) tttGCCTATTTCTATAATAAAAACCCCACCAGCAATTTGGTCTGAGTGAATGGTACCTTCAACAACCCAACTTGTTGTTAACTCAGTGATTTCGTATG‑Gtt > 1:1739933/1‑101 (MQ=255) tttGCCTATTTCTATAATAAAAACCCCACCAGCAATTTGGTCTGAGTGAATGGTACCTTCAACAACCCAACTTGTTGTTAACTCAGTGATTTCGTATG‑Gtt < 1:8014080/101‑1 (MQ=255) tttGCCTATTTCTATAATAAAAACCCCACCAGCAATTTGGTCTGAGTGAATGGTACCTTCAACAACCCAACTTGTTGTTAACTCAGTGATCTCGTATgcct > 1:434629/1‑98 (MQ=255) ttGCCTATTTCTATAATAAAAACCCCACCAGCAATTTGGTCTGAGTGAATGGTACCTTCAACAACCCAACTTGTTGTTAACTCAGTGATTTCGTATG‑Gttt < 1:3564707/101‑1 (MQ=255) tGCCTATTTCTATAATAAAAACCCCACCAGCAATTTGGTCTGAGTGAATGGTACCTTCAACAACCCAACTTGTTGTTAACTCAGTGATTTCGTATG‑Gtttt > 1:7954210/1‑101 (MQ=255) gCCTATTTCTATAATAAAAACCCCACCAGCAATTTGGTCTGAGTGAATGGTACCTTCAACAACCCAACTTGTTGTTAACTCAGTGATTTCGTATG‑Gttttt < 1:2684807/101‑1 (MQ=255) gCCTATTTCTATAATAAAAACCCCACCAGCAATTTGGTCTGAGTGAATGGTACCTTCAACAACCCAACTTGTTGTTAACTCAGTGATTTCGTATG‑Gttttt > 1:9337309/1‑101 (MQ=255) cTATTTCTATAATAAGAACCCCACCAGCAATTTGGTCTGAGTGAATGGTACCTTCAACAACCCAACTTGTTGTTAACTCAGTGATTTCGTATG‑GTTTttct < 1:8242411/101‑1 (MQ=255) cTATTTCTATAATAAAAACCCCACCAGCAATTTGGTCTGAGTGAATGGTACCTTCAACAACCCAACTTGTTGTTAACTCAGTGATTTCGTATG‑GTTTttct > 1:10666200/1‑101 (MQ=255) aTTTCTATAATAAAAACCCCACCAGCAATTTGGTCTGAGTGAATGGTACCTTCAACAACCCAACTTGTTGTTAACTCAGTGATCTCGTATgccgtcttctg > 1:10340089/1‑91 (MQ=255) tttCTATAATAAAAACCCCACCAGCAATTTGGTCTGAGTGAATGGTACCTTCAACAACCCAACTTGTTGTTAACTCAGTGATTTCGTATG‑GTTTttcttct < 1:7067154/101‑1 (MQ=255) ttCTATAATAAAAACCCCACCAGCAATTTGGTCTGAGTGAATGGTACCTTCAACAACCCAACTTGTTGTTAACTCAGTGATTTCGTATG‑GTTTttcttctt < 1:11616695/101‑1 (MQ=255) tCTATAATAAAAACCCCACCAGCAATTTGGTCTGAGTGAATGGTACCTTCAACAACCCAACTTGTTGTTAACTCAGTGATTTCGTATG‑GTTTttcttcttc < 1:1650159/101‑1 (MQ=255) cTATAATAAAAACCCCACCAGCAATTTGGTCTGAGTGAATGGTACCTTCAACAACCCAACTTGTTGTTAACTCAGTGATTTCGTATG‑GTTTTtcttcttct < 1:6922020/101‑1 (MQ=255) taataaAAACCCCACCAGCAATTTGGTCTGAGTGAATGGTACCTTCAACAACCCAACTTGTTGTTAACTCAGTGATTTCGTATG‑GTTTTTCTTCTTCTGCg < 1:5553281/101‑1 (MQ=255) aataaAAACCCCACCAGCAATTTGGTCTGAGTGAATGGTACCTTCAACAACCCAACTTGTTGTTAACTCAGTGATTTCGTATG‑GTTTTTCTTCTTCTGCgg > 1:6420852/1‑101 (MQ=255) aaaaCCCCACCAGCAATTTGGTCTGAGTGAATGGTACCTTCAACAACCCAACTTGTTGTTAACTCAGTGATTTCGTATG‑GTTTTTCTTCTTCTGCGGCATc > 1:428767/1‑101 (MQ=255) aaCCCCACCAGCAATTTGGTCTGAGTGAATGGTACCTTCAACAACCCAACTTGTTGTTAACTCAGTGATTTCGTATG‑GTTTTTCTTCTTCTGCGGCATCCt > 1:1170571/1‑101 (MQ=255) aaCCCCACCAGCAATTTGGTCTGAGTGAATGGTACCTTCAACAACCCAACTTGTTGTTAACTCAGTGATTTCGTATG‑GTTTTTCTTCTTCTGCGGCATCCt > 1:9211367/1‑101 (MQ=255) caccaGCAATTTGGTCTGAGTGAATGGTACCTTCAACAACCCAACTTGTTGTTAACTCAGTGATTTCGTATG‑GTTTTTCTTCTTCTGCGGCATCCTGTCCa < 1:4806996/101‑1 (MQ=255) accaGCAATTTGGTCTGAGTGAATGGTACCTTCAACAACCCAACTTGTTGTTAACTCAGTGATTTCGTATG‑GTTTTTCTTCTTCTGCGGCATCCTGTCCAt > 1:1864051/1‑101 (MQ=255) caGCAATTTGGTCTGAGTGAATGGTACCTTCAACAACCCAACTTGTTGTTAACTCAGTGATTTCGTATG‑GTTTTTCTTCTTCTGCGGCATCCTGTCCATaa < 1:5847621/101‑1 (MQ=255) aGCAATTTGGTCTGAGTGAATGGTACCTTCAACAACCCAACTTGTTGTTAACTCAGTGATTTCGTATG‑GTTTTTCTTCTTCTGCGGCATCCTGTCCATAAc > 1:734864/1‑101 (MQ=255) aGCAATTTGGTCTGAGTGAATGGTACCTTCAACAACCCAACTTGTTGTTAACTCAGTGATTTCGTATG‑GTTTTTCTTCTTCTGCGGCATCCTGTCCATAAc > 1:6832052/1‑101 (MQ=255) aGCAATTTGGTCTGAGTGAATGGTACCTTCAACAACCCAACTTGTTGTTAACTCAGTGATTTCGTATG‑GTTTTTCTTCTTCTGCGGCATCCTGTCCATAAc < 1:9459108/101‑1 (MQ=255) aGCAATTTGGTCTGAGTGAATGGTACCTTCAACAACCCAACTTGTTGTTAACTCAGTGATTTCGTATG‑GTTTTTCTTCTTCTGCGGCATCCTGTCCATAAc < 1:516276/101‑1 (MQ=255) cAATTTGGTCTGAGTGAATGGTACCTTCAACAACCCAACTTGTTGTTAACTCAGTGATTTCGTATG‑GTTTTTCTTCTTCTGCGGCATCCTGTCCATAACGa < 1:1233861/101‑1 (MQ=255) aTTTGGTCTGAGTGAATGGTACCTTCAACAACCCAACTTGTTGTTAACTCAGTGATTTCGTATG‑GTTTTTCTTCTTCTGCGGCATCCTGTCCATAACGAtt > 1:3309486/1‑101 (MQ=255) ggTCTGAGTGAATGGTACCTTCAACAACCCAACTTGTTGTTAACTCAGTGATTTCGTATG‑GTTTTTCTTCTTCTGCGGCATCCTGTCCATAACGATTCTTa < 1:100795/101‑1 (MQ=255) ggTCTGAGTGAATGGTACCTTCAACAACCCAACTTGTTGTTAACTCAGTGATTTCGTATG‑GTTTTTCTTCTTCTGCGGCATCCTGTCCATAACGATTCTTa > 1:4752959/1‑101 (MQ=255) ggTCTGAGTGAATGGTACCTTCAACAACCCAACTTGTTGTTAACTCAGTGATTTCGTATG‑GTTTTTCTTCTTCTGCGGCATCCTGTCCATAACGATTCTTa < 1:1995934/101‑1 (MQ=255) ggTCTGAGTGAATGGTACCTTCAACAACCCAACTTGTTGTTAACTCAGTGATTTCGTATG‑GTTTTTCTTCTTCTGCGGCATCCTGTCCATAACGATTCTTa > 1:8032928/1‑101 (MQ=255) ggTCTGAGTGAATGGTACCTTCAACAACCCAACTTGTTGTTAACTCAGTGATTTCGTATG‑GTTTTTCTTCTTCTGCGGCATCCTGTCCATAACGATTCTTa > 1:7030795/1‑101 (MQ=255) tCTGAGTGAATGGTACCTTCAACAACCCAACTTGTTGTTAACTCAGTGATTTCGTATG‑GTTTTTCTTCTTCTGCGGCATCCTGTCCATAACGATTCTTAAc < 1:11152625/101‑1 (MQ=255) tCTGAGTGAATGGTACCTTCAACAACCCAACTTGTTGTTAACTCAGTGATTTCGTATG‑GTTTTTCTTCTTCTGCGGCATCCTGTCCATAACGATTCTTAAc > 1:3174853/1‑101 (MQ=255) tGAGTGAATGGTACCTTCAACAACCCAACTTGTTGTTAACTCAGTGATTTCGTATG‑GTTTTTCTTCTTCTGCGGCATCCTGTCCATAACGATTCTTAACat < 1:3880389/101‑1 (MQ=255) gAGTGAATGGTACCTTCAACAACCCAACTTGTTGTTAACTCAGTGATTTCGTATG‑GTTTTTCTTCTTCTGCGGCATCCTGTCCATAACGATTCTTAACata < 1:7715936/101‑1 (MQ=255) gTGAATGGTACCTTCAACAACCCAACTTGTTGTTAACTCAGTGATTTCGTATG‑GTTTTTCTTCTTCTGCGGCATCCTGTCCATAACGATTCTTAACatata < 1:9900076/101‑1 (MQ=255) ctGAATGGTACCTTCAACAACCCAACTTGTTGTTAACTCAGTGATCTCGTATGCCGTCTTCTGCTT‑TGAAGAATCCTGTACATAACGATTCTTAACatata > 1:5678286/2‑101 (MQ=255) tGAATGGTACCTTCAACAACCCAACTTGTTGTTAACTCAGTGATTTCGTATG‑GTTTTTCTTCTTCTGCGGCATCCTGTCCATAACGATTCTTAACatatat > 1:11499568/1‑101 (MQ=255) gAATGGTACCTTCAACAACCCAACTTGTTGTTAACTCAGTGATTTCGTATG‑GTTTTTCTTCTTCTGCGGCATCCTGTCCATAACGATTCTTAACATATAtc > 1:8732650/1‑101 (MQ=255) aaTGGTACCTTCAACAACCCAACTTGTTGTTAACTCAGTGATTTCGTATG‑GTTTTTCTTCTTCTGCGGCATCCTGTCCATAACGATTCTTAACATATAtct < 1:4030208/101‑1 (MQ=255) aTGGTACCTTCAACAACCCAACTTGTTGTTAACTCAGTGATTTCGTATG‑GTTTTTCTTCTTCTGCGGCATCCTGTCCATAACGATTCTTAACATATAtctc < 1:9789839/101‑1 (MQ=255) tGGTACCTTCAACAACCCAACTTGTTGTTAACTCAGTGATTTCGTATG‑GTTTTTCTTCTTCTGCGGCATCCTGTCCATAACGATTCTTAACATATATCTCa > 1:536822/1‑101 (MQ=255) gTACCTTCAACAACCCAACTTGTTGTTAACTCAGTGATTTCGTATG‑GTTTTTCTTCTTCTGCGGCATCCTGTCCATAACGATTCTTAACATATATCTCAGc < 1:2988622/101‑1 (MQ=255) aCCTTCAACAACCCAACTTGTTGTTAACTCAGTGATTTCGTATG‑GTTTTTCTTCTTCTGCGGCATCCTGTCCATAACGATTCTTAACATATATCTCAGCTa < 1:8274414/101‑1 (MQ=255) aCCTTCAACAACCCAACTTGTTGTTAACTCAGTGATTTCGTATG‑GTTTTTCTTCTTCTGCGGCATCCTGTCCATAACGATTCTTAACATATATCTCAGCTa < 1:7205514/101‑1 (MQ=255) aCCTTCAACAACCCAACTTGTTGTTAACTCAGTGATCTCGTATGCCGTCTTCTGCTT‑GGAAAAATCCTATCCATAACGATACTTAACATAGAgctcctcta > 1:11401815/1‑96 (MQ=255) cTTCAACAACCCAACTTGTTGTTAACTCAGTGATTTCGTATG‑GTTTTTCTTCTTCTGCGGCATCCTGTCCATAACGATTCTTAACATATATCTCAGCTAAt < 1:11308083/101‑1 (MQ=255) tCAACAACCCAACTTGTTGTTAACTCAGTGATTTCGTATG‑GTTTTTCTTCTTCTGCGGCATCCTGTCCATAACGATTCTTAACATATATCTCAGCTAATTc > 1:328205/1‑101 (MQ=255) caacaaCCCAACTTGTTGTTAACTCAGTGATTTCGTATG‑GTTTTTCTTCTTCTGCGGCATCCTGTCCATAACGATTCTTAACATATATCTCAGCTAATTcc < 1:675839/101‑1 (MQ=255) acaacCCAACTTGTTGTTAACTCAGTGATTTCGTATG‑GTTTTTCTTCTTCTGCGGCATCCTGTCCATAACGATTCTTAACATATATCTCAGCTAATTCCaa < 1:1975132/101‑1 (MQ=255) acaacCCAACTTGTTGTTAACTCAGTGATTTCGTATG‑GTTTTTCTTCTTCTGCGGCATCCTGTCCATAACGATTCTTAACATATATCTCAGCTAATTCCaa < 1:11051578/101‑1 (MQ=255) caacCCAACTTGTTGTTAACTCAGTGATTTCGTATG‑GTTTTTCTTCTTCTGCGGCATCCTGTCCATAACGATTCTTAACATATATCTCAGCTAATTCCAAt < 1:10702594/101‑1 (MQ=255) caacCCAACTTGTTGTTAACTCAGTGATTTCGTATG‑GTTTTTCTTCTTCTGCGGCATCCTGTCCATAACGATTCTTAACATATATCTCAGCTAATTCCAAt < 1:7020189/101‑1 (MQ=255) aacCCAACTTGTTGTTAACTCAGTGATTTCGTATG‑GTTTTTCTTCTTCTGCGGCATCCTGTCCATAACGATTCTTAACATATATCTCAGCTAATTCCAATg < 1:5524693/101‑1 (MQ=255) acCCAACTTGTTGTTAACTCAGTGATTTCGTATG‑GCGTTTTTTCTTCTGCGACATCCTGTCCATAACGATTCTTAACATATATCTCAGCTAATTCCAATGc > 1:2817286/1‑101 (MQ=255) cccAACTTGTTGTTAACTCAGTGATTTCGTATG‑GTTTTTCTTCTTCTGCGGCATCCTGTCCATAACGATTCTTAACATATATCTCAGCTAATTCCAATGCt > 1:10589482/1‑101 (MQ=255) ccAACTTGTTGTTAACTCAGTGATTTCGTATG‑GTTTTTCTTCTTCTGCGGCATCCTGTCCATAACGATTCTTAACATATATCTCAGCTAATTCCAATGCta < 1:4932199/101‑1 (MQ=255) cAACTTGTTGTTAACTCAGTGATTTCGTATG‑GTTTTTCTTCTTCTGCGGCATCCTGTCCATAACGATTCTTAACATATATCTCAGCTAATTCCAATGCtat > 1:8818346/1‑101 (MQ=255) cAACTTGTTGTTAACTCAGTGATTTCGTATG‑GTTTTTCTTCTTCTGCGGCATCCTGTCCATAACGATTCTTAACATATATCTCAGCTAATTCCAATGCtat < 1:9150114/101‑1 (MQ=255) cAACTTGTTGTTAACTCAGTGATTTCGTATG‑GTTTTTCTTCTTCTGCGGCATCCTGTCCATAACGATTCTTAACATATATCTCAGCTAATTCCAATGCtat < 1:248936/101‑1 (MQ=255) aCTTGTTGTTAACTCAGTGATTTCGTATG‑GTTTTTCTTCTTCTGCGGCATCCTGTCCATAACGATTCTTAACATATATCTCAGCTAATTCCAATGCTATAg < 1:10255548/101‑1 (MQ=255) cTTGTTGTTAACTCAGTGATTTCGTATG‑GTTTTTCTTCTTCTGCGGCATCCTGTCCATAACGATTCTTAACATATATCTCAGCTAATTCCAATGCTATAGc > 1:6079501/1‑101 (MQ=255) tgttgtTAACTCAGTGATTTCGTATG‑GTTTTTCTTCTTCTGCGGCATCCTGTCCATAACGATTCTTAACATATATCTCAGCTAATTCCAATGCTATAGCtt < 1:7785470/101‑1 (MQ=255) tgttgtTAACTCAGTGATTTCGTATG‑GTTTTTCTTCTTCTGCGGCATCCTGTCCATAACGATTCTTAACATATATCTCAGCTAATTCCAATGCTATAGCtt < 1:4451695/101‑1 (MQ=255) gttgttAACTCAGTGATTTCGTATG‑GTTTTTCTTCTTCTGCGGCATCCTGTCCATAACGATTCTTAACATATATCTCAGCTAATTCCAATGCTATAGCttt < 1:3588884/101‑1 (MQ=255) ttgttAACTCAGTGATTTCGTATG‑GTTTTTCTTCTTCTGCGGCATCCTGTCCATAACGATTCTTAACATATATCTCAGCTAATTCCAATGCTATAGCTTTa < 1:10000434/101‑1 (MQ=255) ttgttAACTCAGTGATTTCGTATG‑GTTTTTCTTCTTCTGCGGCATCCTGTCCATAACGATTCTTAACATATATCTCAGCTAATTCCAATGCTATAGCTTTa < 1:3425467/101‑1 (MQ=255) tgttAACTCAGTGATTTCGTATG‑GTTTTTCTTCTTCTGCGGCATCCTGTCCATAACGATTCTTAACATATATCTCAGCTAATTCCAATGCTATAGCTTTAt < 1:3246516/101‑1 (MQ=255) tgttAACTCAGTGATTTCGTATG‑GTTTTTCTTCTTCTGCGGCATCCTGTCCATAACGATTCTTAACATATATCTCAGCTAATTCCAATGCTATAGCTTTAt < 1:540033/101‑1 (MQ=255) aaCTCAGTGATTTCGTATG‑GTTTTTCTTCTTCTGCGGCATCCTGTCCATAACGATTCTTAACATATATCTCAGCTAATTCCAATGCTATAGCTTTAttttt < 1:4689250/101‑1 (MQ=255) aaCTCAGTGATTTCGTATG‑GTTTTTCTTCTTCTGCGGCATCCTGTCCATAACGATTCTTAACATATATCTCAGCTAATTCCAATGCTATAGCTTTAttttt < 1:8499664/101‑1 (MQ=255) aaCTCAGTGATTTCGTATG‑GTTTTTCTTCTTCTGCGGCATCCTGTCCATAACGATTCTTAACATATATCTCAGCTAATTCCAATGCTATAGCTTTAttttt > 1:11495649/1‑101 (MQ=255) aCTCAGTGATTTCGTATG‑GTTTTTCTTCTTCTGCGGCATCCTGTCCATAACGATTCTTAACATATATCTCAGCTAATTCCAATGCTATAGCTTTATTTTTa < 1:1142392/101‑1 (MQ=255) aCTCAGTGATTTCGTATG‑GTTTTTCTTCTTCTGCGGCATCCTGTCCATAACGATTCTTAACATATATCTCAGCTAATTCCAATGCTATAGCTTTATTTTTa < 1:12006499/101‑1 (MQ=255) tCAGTGATTTCGTATG‑GTTTTTCTTCTTCTGCGGCATCCTGTCCATAACGATTCTTAACATATATCTCAGCTAATTCCAATGCTATAGCTTTATTTTTAAc < 1:11575344/101‑1 (MQ=255) tCAGTGATTTCGTATG‑GTTTTTCTTCTTCTGCGGCATCCTGTCCATAACGATTCTTAACATATATCTCAGCTAATTCCAATGCTATAGCTTTATTTTTAAc > 1:4535726/1‑101 (MQ=255) cAGTGATTTCGTATG‑GTTTTTCTTCTTCTGCGGCATCCTGTCCATAACGATTCTTAACATATATCTCAGCTAATTCCAATGCTATAGCTTTATTTTTAAcc > 1:7466636/1‑101 (MQ=255) cAGTGATTTCGTATG‑GTTTTTCTTCTTCTGCGGCATCCTGTCCATAACGATTCTTAACATATATCTCAGCTAATTCCAATGCTATAGCTTTATTTTTAAcc > 1:6600495/1‑101 (MQ=255) cAGTGATTTCGTATG‑GTTTTTCTTCTTCTGCGGCATCCTGTCCATAACGATTCTTAACATATATCTCAGCTAATTCCAATGCTATAGCTTTATTTTTAAcc > 1:800503/1‑101 (MQ=255) aGTGATTTCGTATG‑GTTTTTCTTCTTCTGCGGCATCCTGTCCATAACGATTCTTAACATATATCTCAGCTAATTCCAATGCTATAGCTTTATTTTTAACCa < 1:5114818/101‑1 (MQ=255) tGATTTCGTATG‑GTTTTTCTTCTTCTGCGGCATCCTGTCCATAACGATTCTTAACATATATCTCAGCTAATTCCAATGCTATAGCTTTATTTTTAACCaaa < 1:6705370/101‑1 (MQ=255) gATTTCGTATG‑GTTTTTCTTCTTCTGCGGCATCCTGTCCATAACGATTCTTAACATATATCTCAGCTAATTCCAATGCTATAGCTTTATTTTTAACCAAAt < 1:6118885/101‑1 (MQ=255) gATTTCGTATG‑GTTTTTCTTCTTCTGCGGCATCCTGTCCATAACGATTCTTAACATATATCTCAGCTAATTCCAATGCTATAGCTTTATTTTTAACCAAAt > 1:9521262/1‑101 (MQ=255) tttCGTATG‑GTTTTTCTTCTTCTGCGGCATCCTGTCCATAACGATTCTTAACATATATCTCAGCTAATTCCAATGCTATAGCTTTATTTTTAACCAAAttt < 1:43742/101‑1 (MQ=255) tttCGTATG‑GTTTTTCTTCTTCTGCGGCATCCTGTCCATAACGATTCTTAACATATATCTCAGCTAATTCCAATGCTATAGCTTTATTTTTAACCAAAttt > 1:11922420/1‑101 (MQ=255) ttCGTATG‑GTTTTTCTTCTTCTGCGGCATCCTGTCCATAACGATTCTTAACATATATCTCAGCTAATTCCAATGCTATAGCTTTATTTTTAACCAAATTTc < 1:6208137/101‑1 (MQ=255) ttCGTATG‑GTTTTTCTTCTTCTGCGGCATCCTGTCCATAACGATTCTTAACATATATCTCAGCTAATTCCAATGCTATAGCTTTATTTTTAACCAAATTTc < 1:1471642/101‑1 (MQ=255) tCGTATG‑GTTTTTCTTCTTCTGCGGCATCCTGTCCATAACGATTCTTAACATATATCTCAGCTAATTCCAATGCTATAGCTTTATTTTTAACCAAATTTCt < 1:4499991/101‑1 (MQ=255) tCGTATG‑GTTTTTCTTCTTCTGCGGCATCCTGTCCATAACGATTCTTAACATATATCTCAGCTAATTCCAATGCTATAGCTTTATTTTTAACCAAATTTCt < 1:7584400/101‑1 (MQ=255) tCGTATG‑GTTTTTCTTCTTCTGCGGCATCCTGTCCATAACGATTCTTAACATATATCTCAGCTAATTCCAATGCTATAGCTTTATTTTTAACCAAATTTCt > 1:1917438/1‑101 (MQ=255) cGTATG‑GTTTTTCTTCTTCTGCGGCATCCTGTCCATAACGATTCTTAACATATATCTCAGCTAATTCCAATGCTATAGCTTTATTTTTAACCAAATTTCTa < 1:6440972/101‑1 (MQ=255) gTATG‑GTTTTTCTTCTTCTGCGGCATCCTGTCCATAACGATTCTTAACATATATCTCAGCTAATTCCAATGCTATAGCTTTATTTTTAACCAAATTTCTaa < 1:11818472/101‑1 (MQ=255) tATG‑GTTTTTCTTCTTCTGCGGCATCCTGTCCATAACGATTCTTAACATATATCTCAGCTAATTCCAATGCTATAGCTTTATTTTTAACCAAATTTCTAAc > 1:2243855/1‑101 (MQ=255) tATG‑GTTTTTCTTCTTCTGCGGCATCCTGTCCATAACGATTCTTAACATATATCTCAGCTAATTCCAATGCTATAGCTTTATTTTTAACCAAATTTCTAAc < 1:5998732/101‑1 (MQ=255) aTG‑GTTTTTCTTCTTCTGCGGCATCCTGTCCATAACGATTCTTAACATATATCTCAGCTAATTCCAATGCTATAGCTTTATTTTTAACCAAATTTCTAACg < 1:2396301/101‑1 (MQ=255) aTG‑GTTTTTCTTCTTCTGCGGCATCCTGTCCATAACGATTCTTAACATATATCTCAGCTAATTCCAATGCTATAGCTTTATTTTTAACCAAATTTCTAACg > 1:5737284/1‑101 (MQ=255) g‑gTTTTTCTTCTTCTGCGGCATCCTGTCCATAACGATTCTTAACATATATCTCAGCTAATTCCAATGCTATAGCTTTATTTTTAACCAAATTTCTAACGGt < 1:8165067/101‑1 (MQ=255) | ATTTTTGCCTATTTCTATAATAAAAACCCCACCAGCAATTTGGTCTGAGTGAATGGTACCTTCAACAACCCAACTTGTTGTTAACTCAGTGATTTCGTATG‑GTTTTTCTTCTTCTGCGGCATCCTGTCCATAACGATTCTTAACATATATCTCAGCTAATTCCAATGCTATAGCTTTATTTTTAACCAAATTTCTAACGGT > NC_007779/4016669‑4016869 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |