| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_007779 | 1,213,013 | T→C | 1.5% | intergenic (+257/+244) | mcrA → / ← elbA | 5‑methylcytosine‑specific restriction endonuclease B/hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_007779 | 1,213,013 | 0 | T→C | 1.5% | 3.7 0.0 ‑0.2 | 269 | intergenic (+257/+244) | mcrA/elbA | 5‑methylcytosine‑specific restriction endonuclease B/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (2/2): ref base (148/116): total (151/118) | ||||||||||
| Fisher's exact test strand distribution p-value = 1.00e+00 | ||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 6.38e-01 | ||||||||||
Only 100 of 279 total aligned reads displayed.
TAAGGGCTAATGAGTTATATGCAAATTAGTAAAATTATGTTGCTATGTCAGATAGTTACGATTTAGTCATCTAACTAATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGA > NC_007779/1212913‑1213113 | tAAGGGCTAATGAGTTATATGCAAATTAGTAAAATTATGTTGCTATGTCAGATAGTTACGATTTAGTCATCTAACTAATGCTGCGCCATATGGGTTGGACt < 1:11602906/101‑1 (MQ=255) aGGGCTAATGAGTTATATGCAAATTAGTAAAATTATGTTGCTATGTCAGATAGTTACGATTTAGTCATCTAACTAATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGa < 1:3657598/101‑1 (MQ=255) gggCTAATGAGTTATATGCAAATTAGTAAAATTATGTTGCTATGTCAGATAGTTACGATTTAGTCATCTAACTAATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGaa < 1:2528628/101‑1 (MQ=255) gggCTAATGAGTTATATGCAAATTAGTAAAATTATGTTGCTATGTCAGATAGTTACGATTTAGTCATCTAACTAATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGaa > 1:3250759/1‑101 (MQ=255) cTAATGAGTTATATGCAAATTAGTAAAATTATGTTGCTATGTCAGATAGTTACGATTTAGTCATCTAACTAATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCg < 1:4076784/101‑1 (MQ=255) aTGAGTTATATGCAAATTAGTAAAATTATGTTGCTATGTCAGATAGTTACGATTTAGTCATCTAACTAATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCt > 1:7610010/1‑101 (MQ=255) aTGAGTTATATGCAAATTAGTAAAATTATGTTGCTATGTCAGATAGTTACGATTTAGTCATCTAACTAATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCt > 1:8860627/1‑101 (MQ=255) aTGAGTTATATGCAAATTAGTAAAATTATGTTGCTATGTCAGATAGTTACGATTTAGTCATCTAACTAATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCt > 1:4489002/1‑101 (MQ=255) aTGAGTTATATGCAAATTAGTAAAATTATGTTGCTATGTCAGATAGTTACGATTTAGTCATCTAACTAATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCt > 1:9365138/1‑101 (MQ=255) aTGAGTTATATGCAAATTAGTAAAATTATGTTGCTATGTCAGATAGTTACGATTTAGTCATCTAACTAATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCt > 1:9246552/1‑101 (MQ=255) tGAGTTATATGCAAATTAGTAAAATTATGTTGCTATGTCAGATAGTTACGATTTAGTCATCTAACTAATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTg > 1:6369369/1‑101 (MQ=255) gAGTTATATGCAAATTAGTAAAATTATGTTGCTATGTCATATAGTTACGATTTAGTCATCTAACTAATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGa < 1:10194503/101‑1 (MQ=255) aGTTATATGCAAATTAGTAAAATTATGTTGCTATGTCAGATAGTTACGATTTAGTCATCTAACTAATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGAc > 1:11367230/1‑101 (MQ=255) gTTATATGCAAATTAGTAAAATTATGTTGCTATGTCAGATAGTTACGATTTAGTCATCTAACTAATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGAcc > 1:6288736/1‑101 (MQ=255) ttATATGCAAATTAGTAAAATTATGTTGCTATGTCTGATAGTTACGATTTAGTCATCTAACTAATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCt > 1:7844464/1‑101 (MQ=255) ttATATGCAAATTAGTAAAATTATGTTGCTATGTCAGATAGTTACGATTTAGTCATCTAACTAATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCt > 1:5238489/1‑101 (MQ=255) tataTGCAAATTAGTAAAATTATGTTGCTATGTCAGATAGTTACGATTTAGTCATCTAACTAATGCTGCGCCATATGGGTTGGACGGAAGCGGCTGACCTg > 1:10256230/1‑101 (MQ=255) atatGCAAATTAGTAAAATTATGTTGCTATGTCAGATAGTTACGATTTAGTCATCTAACTAATGCTGCGCCACATGGGTTGGACCGAAGCGGCTGActtaa > 1:903446/1‑97 (MQ=255) tatGCAAATTAGTAAAATTATGTTGCTATGTCAGATAGTTACGATTTAGTCATCTAACTAATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGAt > 1:1062910/1‑101 (MQ=255) tatGCAAATTAGTAAAATTATGTTGCTATGTCAGATAGTTACGATTTAGTCATCTAACTAATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGAt > 1:11916220/1‑101 (MQ=255) tatGCAAATTAGTAAAATTATGTTGCTATGTCAGATAGTTACGATTTAGTCATCTAACTAATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGAt > 1:2982267/1‑101 (MQ=255) atGCAAATTAGTAAAATTATGTTGCTATGTCAGATAGTTACGATTTAGTCATCTAACTAATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGAtt < 1:8347357/101‑1 (MQ=255) atGCAAATTAGTAAAATTATGTTGCTATGTCAGATAGTTACGATTTAGTCATCTAACTAATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGAtt > 1:11949252/1‑101 (MQ=255) tGCAAATTAGTAAAATTATGTTGCTATGTCAGATAGTTACGATTTAGTCATCTAACTAATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTg > 1:5127751/1‑101 (MQ=255) gCAAATTAGTAAAATTATGTTGCTATGTCAGATAGTTACGATTTAGTCATCTAACTAATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGt > 1:1970137/1‑101 (MQ=255) aaaTTAGTAAAATTATGTTGCTATGTCAGATAGTTACGATTTAGTCATCTAACTAATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTa > 1:5771659/1‑101 (MQ=255) aaTTAGTAAAATTATGTTGCTATGTCAGATAGTTACGATTTAGTCATCTAACTAATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTaa > 1:5801207/1‑101 (MQ=255) aGTAAAATTATGTTGCTATGTCAGATAGTTACGATTTAGTCATCTAACTAATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGt > 1:12038934/1‑101 (MQ=255) aGTAAAATTATGTTGCTATGTCAGATAGTTACGATTTAGTCATCTAACTAATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGt < 1:3284877/101‑1 (MQ=255) gTAAAATTATGTTGCTATGTCAGATAGTTACGATTTAGTCATCTAACTAATGCTGCGCCACATGGGTTGGACCGAAGCGGCTGACTTAATTGTTAAAGGTa < 1:9491136/101‑1 (MQ=21) aaaaTTATGTTGCTATGTCAGATAGTTACGATTTAGTCATCTAACTAATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATg > 1:8767901/1‑101 (MQ=255) aaaTTATGTTGCTATGTCAGATAGTTACGATTTAGTCATCTAACTAATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATgg < 1:9305953/101‑1 (MQ=255) aaTTATGTTGCTATGTCAGATAGTTACGATTTAGTCATCTAACTAATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGa < 1:6118591/101‑1 (MQ=255) aTTATGTTGCTATGTCAGATAGTTACGATTTAGTCATCTAACTAATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGaa < 1:5935373/101‑1 (MQ=255) aTTATGTTGCTATGTCAGATAGTTACGATTTAGTCATCTAACTAATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGaa < 1:5885351/101‑1 (MQ=255) aTTATGTTGCTATGTCAGATAGTTACGATTTAGTCATCTAACTAATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGaa < 1:5691746/101‑1 (MQ=255) ttATGTTGCTATGTCAGATAGTTACGATTTAGTCATCTAACTAATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAg > 1:7708352/1‑101 (MQ=255) tATGTTGCTATGTCAGATAGTTACGATTTAGTCATCTAACTAATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAgg > 1:8600406/1‑101 (MQ=255) tATGTTGCTATGTCAGATAGTTACGATTTAGTCATCTAACTAATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAgg > 1:4008812/1‑101 (MQ=255) aTGTTGCTATGTCAGATAGTTACGATTTAGTCATCTAACTAATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGgc > 1:70361/1‑101 (MQ=255) aTGTTGCTATGTCAGATAGTTACGATTTAGTCATCTAACTAATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGgc < 1:10768894/101‑1 (MQ=255) aTGTTGCTATGTCAGATAGTTACGATTTAGTCATCTAACTAATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGgc < 1:10037817/101‑1 (MQ=255) tGTTGCTATGTCAGATAGTTACGATTTAGTCATCTAACTAATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGgcg > 1:7503313/1‑101 (MQ=255) tGTTGCTATGTCAGATAGTTACGATTTAGTCATCTAACTAATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGgcg > 1:8001297/1‑101 (MQ=255) gTTGCTATGTCAGATAGTTACGATTTAGTCATCTAACTAATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGgcgc > 1:10566635/1‑101 (MQ=255) ttGCTATGTCAGATAGTTACGATTTAGTCATCTAACTAATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGca < 1:7669103/101‑1 (MQ=255) tGCTATGTCAGATAGTTACGATTTAGTCATCTAACTAATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGcaa > 1:10448962/1‑101 (MQ=255) tATGTCAGATAGTTACGATTTAGTCATCTAACTAATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGcaatca < 1:9765062/101‑1 (MQ=255) aTGTCAGATAGTTACGATTTAGTCATCTAACTAATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGcaatcaa > 1:2344357/1‑101 (MQ=255) tGTCAGATAGTTACGATTTAGTCATCTAACTAATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGcaatcaat > 1:5055908/1‑101 (MQ=255) tGTCAGATAGTTACGATTTAGTCATCTAACTAATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGCATGGAAGGCGcaatcaat > 1:6259086/1‑101 (MQ=255) gTCAGATAGTTACGATTTAGTCATCTAACTAATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATg < 1:6019781/101‑1 (MQ=255) tCAGATAGTTACGATTTAGTCATCTAACTAATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGc < 1:7424001/101‑1 (MQ=255) cAGATAGTTACGATTTAGTCATCTAACTAATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGcc > 1:10917190/1‑101 (MQ=255) cAGATAGTTACGATTTAGTCATCTAACTAATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGcc > 1:6914309/1‑101 (MQ=255) gATAGTTACGATTTAGTCATCTAACTAATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCaa < 1:10389924/101‑1 (MQ=255) gTTACGATTTAGTCATCTAACTAATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGAcc > 1:6788443/1‑101 (MQ=255) gTTACGATTTAGTCATCTAACTAATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGAcc < 1:516143/101‑1 (MQ=255) ttACGATTTAGTCATCTAACTAATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCg < 1:11394310/101‑1 (MQ=255) ttACGATTTAGTCATCTAACTAATGCTGCGCCACATGGGTTGGACCGAAGCGGCTGACTTAATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAACGCGAAAACCg < 1:11343367/101‑1 (MQ=11) tACGATTTAGTCATCTAACTAATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGt > 1:30417/1‑101 (MQ=255) aCGATTTAGTCATCTAACTAATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTa < 1:6516708/101‑1 (MQ=255) cGATTTAGTCATCTAACTAATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTaa < 1:8115560/101‑1 (MQ=255) gATTTAGTCATCTAACTAATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAAc > 1:3897063/1‑101 (MQ=255) tttAGTCATCTAACTAATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACtt > 1:715992/1‑101 (MQ=255) ttAGTCATCTAACTAATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTa > 1:1178948/1‑101 (MQ=255) aGTCATCTAACTAATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATg > 1:11526159/1‑101 (MQ=255) tCATCTAACTAATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGAc > 1:1114508/1‑101 (MQ=255) cATCTAACTAATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACt < 1:2558511/101‑1 (MQ=255) aTCTAACTAATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACtt > 1:5965676/1‑101 (MQ=255) tCTAACTAATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTc > 1:9606282/1‑101 (MQ=255) tCTAACTAATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTc < 1:4404104/101‑1 (MQ=255) ctaactaaTGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCg > 1:6842754/1‑101 (MQ=255) taactaaTGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGa < 1:8244164/101‑1 (MQ=255) aactaaTGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGaa > 1:912769/1‑101 (MQ=255) actaaTGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAAc < 1:11633753/101‑1 (MQ=255) taaTGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGt > 1:4705755/1‑101 (MQ=255) taaTGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGt > 1:2665747/1‑101 (MQ=255) taaTGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGt > 1:7061937/1‑101 (MQ=255) taaTGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGt > 1:8811502/1‑101 (MQ=255) aaTGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTc > 1:981204/1‑101 (MQ=255) aaTGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTc > 1:8448104/1‑101 (MQ=255) gctgcGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGa > 1:11272788/1‑101 (MQ=255) gctgcGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGa > 1:1448215/1‑101 (MQ=255) ctgcGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGAt > 1:4252751/1‑101 (MQ=255) tgcGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATg > 1:4993883/1‑101 (MQ=255) gcgcCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATgg > 1:11183637/1‑101 (MQ=255) ccATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAg > 1:4260038/1‑101 (MQ=255) atatGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGgc < 1:4929134/101‑1 (MQ=255) atatGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGgc < 1:10427462/101‑1 (MQ=255) tatGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGgcg < 1:5620386/101‑1 (MQ=255) tatGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGgcg < 1:7241037/101‑1 (MQ=255) tGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCt < 1:9903238/101‑1 (MQ=255) gTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAg > 1:3413568/1‑101 (MQ=255) ttGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAgc < 1:4613343/101‑1 (MQ=255) ttGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAgc < 1:9565126/101‑1 (MQ=255) tGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAgct < 1:11798433/101‑1 (MQ=255) tGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAgct > 1:7763115/1‑101 (MQ=255) tGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGa > 1:171507/1‑101 (MQ=255) tGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGa > 1:5635406/1‑101 (MQ=255) | TAAGGGCTAATGAGTTATATGCAAATTAGTAAAATTATGTTGCTATGTCAGATAGTTACGATTTAGTCATCTAACTAATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGA > NC_007779/1212913‑1213113 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |