| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_007779 | = 4355066 | 3 (0.010) | 205 (0.880) | 119/176 | NT | 98.6% | coding (1275/1632 nt) | dcuS | sensory histidine kinase in two‑component regulatory system with DcuR, regulator of anaerobic fumarate respiration |
| ? | NC_007779 | = 4504189 | NA (NA) | intergenic (+9/‑90) | insD/yjgW | IS2 insertion element transposase InsAB'/hypothetical protein | |||||
Only 100 of 513 total aligned reads displayed.
TAATTTCGCCTCCGGGTTCCGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTCGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGA > NC_007779/4354966‑4355166 | tAATTTCGCCTCCGGGTTCCGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTG < 1:2138786‑M1/101‑1 (MQ=255)tAATTTCGCCTCCGGGTTCCGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTCCCGCTG > 1:10014323‑M1/1‑101 (MQ=255)catctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTg > 1:2604110‑M1/95‑101 (MQ=255)catctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTg < 1:10489212‑M1/7‑1 (MQ=255) aaTTTCGCCTCCGGGTTCCGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGg > 1:941178‑M1/1‑100 (MQ=255) tctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTc > 1:10784923‑M1/93‑101 (MQ=255) tttCGCCTCCGGGTTCCGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGgat > 1:1650836‑M1/1‑98 (MQ=255) ttCGCCTCCGGGTTCCGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGgatt < 1:789878‑M1/101‑5 (MQ=255) tgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTg > 1:9332245‑M1/91‑101 (MQ=255) tCGCCTCCGGGTTCCGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGgattt < 1:6574250‑M1/101‑6 (MQ=255) tCGCCTCCGGGTTCCGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGgattt < 1:3014016‑M1/101‑6 (MQ=255) cGCCTCCGGGTTCCGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGgatttg < 1:11969952‑M1/101‑7 (MQ=255) ctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAg < 1:11422792‑M1/15‑1 (MQ=255) ccTCCGGGTTCCGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGgatttgcc < 1:6798745‑M1/101‑9 (MQ=255) cTCCGGGTTCCGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGgatttgccc > 1:8894383‑M1/1‑92 (MQ=255) ccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCt < 1:6221155‑M1/17‑1 (MQ=255) ccGGGTTCCGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGgatttgcccct < 1:10959115‑M1/101‑12 (MQ=255) ccGGGTTCCGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGgatttgcccct > 1:5666603‑M1/1‑90 (MQ=255) ccGGGTTCCGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGgatttgcccct < 1:307570‑M1/101‑12 (MQ=255) cGGGTTCCGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGgatttgccccta < 1:2501750‑M1/101‑13 (MQ=255) cGGGTTCCGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGgatttgccccta < 1:2862454‑M1/101‑13 (MQ=255) cGGGTTCCGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGgatttgccccta < 1:7701462‑M1/101‑13 (MQ=255) atgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGc > 1:2237257‑M1/82‑101 (MQ=255) gTTCCGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGgatttgcccctatat < 1:9817120‑M1/101‑16 (MQ=255) tagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCa < 1:11128519‑M1/25‑1 (MQ=255) tagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatactggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCa < 1:2531359‑M1/25‑1 (MQ=255) ccGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGgatttgcccctatatttc > 1:9116747‑M1/1‑83 (MQ=255) ggCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGgatttgcccctatatttcca > 1:5528413‑M1/1‑81 (MQ=255) ggCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGgatttgcccctatatttcca < 1:10730060‑M1/101‑21 (MQ=255) cccTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGgatttgcccctatatttccaga > 1:4422746‑M1/1‑79 (MQ=255) cccTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGgatttgcccctatatttccaga > 1:8761447‑M1/1‑79 (MQ=255) aaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGttt < 1:9689212‑M1/31‑1 (MQ=255) aaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGttt > 1:2683027‑M1/71‑101 (MQ=255) tAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGgatttgcccctatatttccagacat < 1:3992505‑M1/101‑26 (MQ=255) aTGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGgatttgcccctatatttccagacatct < 1:10888834‑M1/101‑28 (MQ=255) aTGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGgatttgcccctatatttccagacatct < 1:6356936‑M1/101‑28 (MQ=255) ctagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAAt < 1:10819161‑M1/36‑1 (MQ=255) agtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCa > 1:158100‑M1/64‑101 (MQ=255) gtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAg > 1:9022091‑M1/63‑101 (MQ=255) attaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCg > 1:9466950‑M1/61‑101 (MQ=255) ttaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGt < 1:11773649‑M1/42‑1 (MQ=255) taagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTa > 1:3421029‑M1/59‑101 (MQ=255) cgcgTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGgatttgcccctatatttccagacatctgttatcactt > 1:2041271‑M1/1‑64 (MQ=255) aagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTAt > 1:4534059‑M1/58‑101 (MQ=255) gcgTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGgatttgcccctatatttccagacatctgttatcactta < 1:122802‑M1/101‑39 (MQ=255) gcgTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGgatttgcccctatatttccagacatctgttatcactta < 1:7380288‑M1/101‑39 (MQ=255) gcgTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGgatttgcccctatatttccagacatctgttatcactta < 1:8953702‑M1/101‑39 (MQ=255) agactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATg > 1:721318‑M1/57‑101 (MQ=255) cgTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGgatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaa < 1:1351170‑M1/101‑40 (MQ=255) gTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGgatttgcccctatatatccagacatctgttatcacttaac < 1:1134627‑M1/101‑41 (MQ=255) ctatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGcc > 1:7133878‑M1/54‑101 (MQ=255) ttCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGgatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaaccca < 1:700459‑M1/101‑44 (MQ=255) tATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGgatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccatta > 1:41098‑M1/1‑55 (MQ=255) acttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAAt < 1:7983491‑M1/53‑1 (MQ=255) acttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAAt < 1:1876198‑M1/53‑1 (MQ=255) cttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATc > 1:365559‑M1/48‑101 (MQ=255) cttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATc > 1:5189608‑M1/48‑101 (MQ=255) ttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCg < 1:10068326‑M1/55‑1 (MQ=255) atttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGt < 1:1767261‑M1/57‑1 (MQ=255) aGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGgatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaag < 1:10252638‑M1/101‑51 (MQ=255) aGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGgatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaag < 1:11573943‑M1/101‑51 (MQ=255) tttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTc > 1:5999598‑M1/44‑101 (MQ=255) ttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTcg < 1:5035943‑M1/59‑1 (MQ=255) ttCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGgatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccg > 1:7760846‑M1/1‑47 (MQ=255) gtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTcgcgcg < 1:5718859‑M1/63‑1 (MQ=255) tgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTCGCGCgg > 1:145623‑M1/38‑101 (MQ=255) tgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTCGCGCgg < 1:6435281‑M1/64‑1 (MQ=255) gatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTCGCGCGGt > 1:10577349‑M1/37‑101 (MQ=255) gatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTCGCGCGGt < 1:3836693‑M1/65‑1 (MQ=255) aaCGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGgatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgcc < 1:6104521‑M1/101‑60 (MQ=255) tattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTCGCGCGGTTa < 1:11841891‑M1/67‑1 (MQ=255) tattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTCGCGCGGTTa < 1:4724295‑M1/67‑1 (MQ=255) ttggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCTCTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTCGCGCGGTTAAt > 1:5822744‑M1/33‑101 (MQ=255) ttggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTCGCGCGGTTAAt < 1:8221019‑M1/69‑1 (MQ=255) ttggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTCGCGCGGTTAAt < 1:8134079‑M1/69‑1 (MQ=255) ggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTCGCGCGGTTAATCt > 1:8399021‑M1/31‑101 (MQ=255) aaTCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGgatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatat > 1:2786196‑M1/1‑34 (MQ=255) aTCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGgatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatatt < 1:5207495‑M1/101‑69 (MQ=255) tctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTCGCGCGGTTAATCTTGCTg < 1:3572464‑M1/76‑1 (MQ=255) aGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGgatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattccc > 1:4300895‑M1/1‑30 (MQ=255) ggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTCGCGCGGTTAATCTTGCTGAtt > 1:11636981‑M1/23‑101 (MQ=255) gagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTCGCGCGGTTAATCTTGCTGATTa < 1:4945579‑M1/80‑1 (MQ=255) gTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGgatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtg > 1:6928265‑M1/1‑27 (MQ=255) gattcagggggccaggctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTCGCGCGGTTAATCTTGCTGATTaaa > 1:10151372‑M1/20‑101 (MQ=255) cgcgACCTGGTCCTCACTGCCGCTGgatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggc < 1:8795881‑M1/101‑77 (MQ=255) attcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTCGCGCGGGTAATCTTGCTGATTaaaa < 1:236792‑M1/83‑1 (MQ=255) gACCTGGTCCTCACTGCCGCTGgatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgag > 1:6647992‑M1/1‑22 (MQ=255) gggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTCGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGc < 1:10398266‑M1/90‑1 (MQ=255) ccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTCGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGAt > 1:7608002‑M1/9‑101 (MQ=255) ccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTCGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGAt < 1:8261351‑M1/93‑1 (MQ=255) cACTGCCGCTGgatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccag > 1:9589444‑M1/1‑11 (MQ=255) aCTGCCGCTGgatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagc < 1:6515034‑M1/101‑92 (MQ=255) taGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTCGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCgg < 1:7330971‑M1/99‑1 (MQ=255) tGCCGCTGgatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgc < 1:10318902‑M1/101‑94 (MQ=255) tGCCGCTGgatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgc > 1:9249947‑M1/1‑8 (MQ=255) aGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTCGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGa > 1:8569643‑M1/2‑101 (MQ=255) cGCTGgatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcact > 1:1948499‑M1/1‑5 (MQ=255) cGCTGgatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcact < 1:5391636‑M1/101‑97 (MQ=255) gCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTCGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGAtt < 1:3203506/101‑1 (MQ=255) gTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTCGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGa > 1:7528121/1‑101 (MQ=255) | TAATTTCGCCTCCGGGTTCCGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTCGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGA > NC_007779/4354966‑4355166 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |