| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_007779 | 3987186 = | NA (NA) | 483 (1.120) | 165/178 | NT | 100% | intergenic (‑732/‑31) | slp/insH | outer membrane lipoprotein/IS5 transposase and trans‑activator |
| ? | NC_007779 | = 4009203 | 0 (0.000) | coding (1379/1623 nt) | yhiJ | hypothetical protein | |||||
Only 100 of 671 total aligned reads displayed.
TCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCc‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_007779/3987284‑3987186‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTAACATTTGTGAACATGCTAATAGTGCTTCAAGTTTAGGTCTGTAATCTGTCGAAACAGAAAAATAACGATTAAAGGATCGACAAGAGATAGCCCGGCT < NC_007779/4009203‑4009103 TCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCC < 1:20106650/101‑1 CACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCa < 1:6430712/101‑2 CACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCT > 1:13554892/1‑101 CACTGTCGGCGAAGGTAAGGTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCT < 1:2977331/101‑1 ACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCca > 1:17543676/1‑99 ACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCaa > 1:14050849/1‑99 ACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTA < 1:7543936/101‑1 ACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTA > 1:2390492/1‑101 ACTGTCGGCGAAAGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTA < 1:5904555/101‑1 CTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAA < 1:19842037/101‑1 CTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAA < 1:20362138/101‑1 CTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAA > 1:14139235/1‑101 TGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCaaga > 1:2853977/1‑97 GTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCaagag < 1:4269723/101‑6 GTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAgcg > 1:12210380/1‑98 GTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAACA < 1:565031/101‑1 CGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAGCCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCaagagtt > 1:14977602/1‑94 CGAAGGTAAGTTGATGTCTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAACATTTGT < 1:20775610/101‑1 CGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCaagagtttta > 1:17101415/1‑91 CGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAACATTTGT > 1:4455765/1‑101 CGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAACATTTGT > 1:4986375/1‑101 CGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAACATTTGT > 1:9558877/1‑101 AAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAgcgtcatcag < 1:16155601/101‑11 AAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAACATTTGTGA > 1:11688976/1‑101 TAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAACATTTGTGAACAT < 1:2194140/101‑1 TAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAACATTTGTGAACAT < 1:11027004/101‑1 TAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAACATTTGTGAACAT < 1:6920079/101‑1 TAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAACATTTGTGAACAT < 1:12849386/101‑1 AAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAACATTTGTGAACATG > 1:11844842/1‑101 TTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAACATTTGTGAACATGCTA > 1:12142058/1‑101 ATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAACATTTGTGAACATGCTAATA < 1:2124408/101‑1 ACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATGTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAACATTTGTGAACATGCTAATAGTG < 1:7792732/101‑1 ACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAACATTTGTGAACATGCTAATAGTG < 1:11224309/101‑1 ACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAACATTTGTGAACATGCTAATAGTG < 1:5309398/101‑1 TGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAACATTTGTGAACATGCTAATAGTGCTTCA < 1:2580578/101‑1 GATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCACACCTTCCCTAACATTTGTGAACATGCTAATAGTGCTTCAA < 1:6997370/101‑1 ATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAACATTTGTGAACATGCTAATAGTGCTTCAAG > 1:13929879/1‑101 AACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAACATTTGTGAACATGCTAATAGTGCTTCAAGTTT < 1:7672300/101‑1 ACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCATGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAACATTTGTGAACATGCTAATAGTGCTTCAAGTTTA > 1:15155079/1‑101 ACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAACATTTGTGAACATGCTAATAGTGCTTCAAGTTTA > 1:18289490/1‑101 CCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAACATTTGTGAACATGCTAATAGTGCTTCAAGTTTAG > 1:6007367/1‑101 GTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAACATTTGTGAACATGCTAATAGTGCTTCAAGTTTAGGTCT > 1:17935964/1‑101 TTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAACATTTGTGAACATGCTAATAGTGCTTCAAGTTTAGGTCTG < 1:11480125/101‑1 TATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAACATTTGTGAACATGCTAATAGTGCTTCAAGTTTAGGTCTGTAA > 1:12647825/1‑101 ATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAACATTTGTGAACATGCTAATAGTGCTTCAAGTTTAGGTCTGTAAT < 1:3218412/101‑1 ATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAACATTTGTGAACATGCTAATAGTGCTTCAAGTTTAGGTCTGTAAT > 1:35201/1‑101 GGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAACATTTGTGAACATGCTAATAGTGCTTCAAGTTTAGGTCTGTAATCT < 1:827533/101‑1 CTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAACATTTGTGAACATGCTAATAGTGCTTCAAGTTTAGGTCTGTAATCTGT > 1:19654256/1‑101 AGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAACATTTGTGAACATGCTAATAGTGCTTCAAGTTTAGGTCTGTAATCTGTCGAA > 1:16835877/1‑101 AGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAACATTTGTGAACATGCTAATAGTGCTTCAAGTTTAGGTCTGTAATCTGTCGAA > 1:13359843/1‑101 AGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAACATTTGTGAACATGCTAATAGTGCTTCAAGTTTAGGTCTGTAATCTGTCGAA < 1:6327928/101‑1 GATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAACATTTGTGAACATGCTAATAGTGCTTCAAGTTTAGGTCTGTAATCTGTCGAAA < 1:11978523/101‑1 GATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAACATTTGTGAACATGCTAATAGTGCTTCAAGTTTAGGTCTGTAATCTGTCGAAA > 1:9272572/1‑101 ATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAACATTTGTGAACATGCTAATAGTGCTTCAAGTTTAGGTCTGTAATCTGTCGAAAC < 1:14846040/101‑1 ATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAACATTTGTGAACATGCTAATAGTGCTTCAAGTTTAGGTCTGTAATCTGTCGAAAC < 1:8611068/101‑1 TGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAACATTTGTGAACATGCTAATAGTGCTTCAAGTTTAGGTCTGTAATCTGTCGAAACA > 1:1240867/1‑101 TGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAACATTTGTGAACATGCTAATAGTGCTTCAAGTTTAGGTCTGTAATCTGTCGAAACA > 1:838065/1‑101 GACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAACATTTGTGAACATGCTAATAGTGCTTCAAGTTTAGGTCTGTAATCTGTCGAAACAG < 1:15806770/101‑1 AAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAACATTTGTGAATATGCTAATAGTGCTTCAAGTTTAGGTCTGTAATCTGTCGAAACAGAAA < 1:13675834/101‑1 AACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAACATTTGTGAACATGCTAATAGTGCTTCAAGTTTAGGTCTGTAATCTGTCGAAACAGAAAA < 1:5856955/101‑1 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GATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAACATTTGTGAACATGCTAATAGTGCTTCAAGTTTAGGTCTGTAATCTGTCGAAACAGAAAAATAAC < 1:18840235/101‑1 ATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAACATTTGTGAACATGCTAATAGTGCTTCAAGTTTAGGTCTGTAATCTGTCGAAACAGAAAAATAACG < 1:511142/101‑1 CTCATATCAGGGATTTGTTCGCACCTTCCCTAACATTTGTGAACATGCTAATAGTGCTTCAAGTTTAGGTCTGTAATCTGTCGAACCAGAAAAATAACGAT > 1:16482589/1‑101 ATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAACATTTGTGAACATGCTAATAGTGCTTCAAGTTTAGGTCTGTAATCTGTCGAAACAGAAAAATAACGATTAA < 1:15257631/101‑1 ATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAACATTTGTGAACATGCTAATAGTGCTTCAAGTTTAGGTCTGTAATCTGTCGAAACAGAAAAATAACGATTAA < 1:18437010/101‑1 ATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAACATTTGTGAACATGCTAATAGTGCTTCAAGTTTAGGTCTGTAATCTGTCGAAACAGAAAAATAACGATTAA < 1:10412327/101‑1 TATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAACATTTGTGAACATGCTAATAGTGCTTCAAGTTTAGGTCTGTAATCTGTCGAAACAGAAAAATAACGATTAAA < 1:19486145/101‑1 ATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAACATTTGTGAACATGCTAATAGTGCTTCAAGTTTAGGTCTGTAATCTGTCGAAACAGAAAAATAACGATTAAAG > 1:4900468/1‑101 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ACCTTCCCTAACATTTGTGAACATGCTAATAGTGCTTCAAGTTTAGGTCTGTAATCTGTCGAAACAGAAAAATAACGATTAAAGGATCGACAAGAGATAGC < 1:7312773/101‑1 ACCTTCCCTAACATTTGTGAACATGCTAATAGTGCTTCAAGTTTAGGTCTGTAATCTGTCGAAACAGAAAAATAACGATTAAAGGATCGACAAGAGATAGC < 1:7869447/101‑1 ACCTTCCCTAACATTTGTGAACATGCTAATAGTGCTTCAAGTTTAGGTCTGTAATCTGTCGAAACAGAAAAATAACGATTAAAGGATCGACAAGAGATAGC > 1:19327531/1‑101 CCTTCCCTAACATTTGTGAACATGCTAATAGTGCTTCAAGTTTAGGTCTGTAATCTGTCGAAACAGAAAAATAACGATTAAAGGATCGACAAGAGATAGCC > 1:1783790/1‑101 CTTCCCTAACATTTGTGAACATGCTAATAGTGCTTCAAGTTTAGGTCTGTAATCTGTCGAAACAGAAAAATAACGATTAAAGGATCGACAAGAGATAGCCC < 1:14731319/101‑1 TCCCTAACATTTGTGAACATGCTAATAGTGCTTCAAGTTTAGGTCTGTAATCTGTCGAAACAGAAAAATAACGATTAAAGGATCGACAAGAGATAGCCCGG < 1:20877830/101‑1 CCCTAACATTTGTGAACATGCTAATAGTGCTTCAAGTTTAGGTCTGTAATCTGTCGAAACAGAAAAATAACGATTAAAGGATCGACAAGAGATAGCCCGGC < 1:21770117/101‑1 CCTAACATTTGTGAACATGCTAATAGTGCTTCAAGTTTAGGTCTGTAATCTGTCGAAACAGAAAAATAACGATTAAAGGATCGACAAGAGATAGCCCGGCT < 1:3807263/101‑1 TCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCc‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_007779/3987284‑3987186‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTAACATTTGTGAACATGCTAATAGTGCTTCAAGTTTAGGTCTGTAATCTGTCGAAACAGAAAAATAACGATTAAAGGATCGACAAGAGATAGCCCGGCT < NC_007779/4009203‑4009103 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |