New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_007779 | 2320794 = | NA (NA) | 457 (1.050) | 158/180 | NT | 100% | intergenic (+633/+11) | rcsB/insD | DNA‑binding response regulator in two‑component regulatory system with RcsC and YojN/IS2 element protein |
? | NC_007779 | = 2589834 | 0 (0.000) | intergenic (+470/‑69) | acrD/yffB | aminoglycoside/multidrug efflux system/hypothetical protein |
Only 100 of 645 total aligned reads displayed.
TAGTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_007779/2320892‑2320794 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ATTATCAGGAAATATAACATTATCGAAGTATTCAAATTAACAACTATTAAATAATATTAAACATTTTTAACGTAAACATTAAGAATATTCATCTTGTTAT < NC_007779/2589834‑2589735 TAGTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAAT > 1:19681319/1‑101 TAGTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAAT < 1:15114098/101‑1 TAGTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAAT > 1:15426152/1‑101 TAGTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAAT < 1:7488654/101‑1 AGTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAATc < 1:1486536/101‑2 AGTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAATT < 1:6648976/101‑1 AGTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAATT > 1:4335909/1‑101 AGTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAATT < 1:18864113/101‑1 AGTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAATT < 1:7811577/101‑1 AGTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAATT < 1:7346167/101‑1 GTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAATTA < 1:12094186/101‑1 GTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCAAATcg > 1:13070198/1‑99 TGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGTGGCAAATCCAATcgc > 1:16425730/1‑98 GCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAATTATt < 1:3244045/101‑2 CGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAATTATtt < 1:6820394/101‑3 CGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAATTATCA < 1:3410961/101‑1 GCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAATcgctat > 1:6281181/1‑95 GCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAATcgctat > 1:9124819/1‑95 GCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAATcgctat < 1:19524042/101‑7 GCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAATTATtta < 1:5404039/101‑4 GCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAATTATtta < 1:13957533/101‑4 GCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAATTATtta > 1:11011459/1‑98 TGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAATTATttata > 1:21464953/1‑96 TGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAATTATttata < 1:12313380/101‑6 TGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAATTATttata > 1:3845146/1‑96 TGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAATTATCAGGA < 1:21248080/101‑1 GGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAATTATttatat < 1:5761905/101‑7 GGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAATTATttatat < 1:16765566/101‑7 GGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAATTATCAGGAA < 1:18261628/101‑1 GGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAATTATCAGGAA > 1:13408511/1‑101 GGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAATTATttatatg > 1:12919803/1‑94 GGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAATTATttatatg < 1:1865021/101‑8 GGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAATTATttatatg < 1:11143809/101‑8 GTTATGGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAATTATttatatga < 1:797109/101‑9 GTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAATTATttatatga < 1:20115998/101‑9 GTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAATTATttatatga < 1:556908/101‑9 GTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAATTATCAGGAAAT > 1:2805735/1‑101 TCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAATTATCAGGAAATATAACATT < 1:2068489/101‑1 GCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAATTATCAGGAAATATAACATTAT > 1:11430091/1‑101 CCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAATTATCAGGAAATATAACATTATC < 1:1001384/101‑1 CACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAATTATCAGGAAATATAACATTATCG > 1:19215050/1‑101 ACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAATTATCAGGAAATATAACATTATCGA < 1:13583421/101‑1 ACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAATTATCAGGAAATATAACATTATCGA < 1:9309807/101‑1 GGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAATTATCAGGAAATATAACATTATCGAAGT < 1:16923299/101‑1 GGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAATTATCAGGAAATATAACATTATCGAAGT < 1:4280593/101‑1 AATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAATTATCAGGAAATATAACATTATCGAAGTAT < 1:17474601/101‑1 AATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAATTATCAGGAAATATAACATTATCGAAGTAT < 1:2168994/101‑1 AATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAATTATCAGGAAATATAACATTATCGAAGTAT < 1:8426721/101‑1 ATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAATTATCAGGAAATATAACATTATCGAAGTATT < 1:7565541/101‑1 TATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAATTATCAGGAAATATAACATTATCGAAGTATTC > 1:9690306/1‑101 TCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAATTATCAGGAAATATAACATTATCGAAGTATTCAA > 1:16196057/1‑101 CTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAATTATCAGGAAATATAACATTATCGAAGTATTCAAA < 1:6507167/101‑1 TGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAATTATCAGGAAATATAACATTATCGAAGTATTCAAAT < 1:15244358/101‑1 CGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAATTATCAGGAAATATAACATTATCGAAGTATTCAAATTA < 1:6132351/101‑1 GGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAATTATCAGGAAATATAACATTATCGAAGTATTCAAATTAA < 1:14086322/101‑1 GCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAATTATCAGGAAATATAACATTATCGAAGTATTCAAATTAAC > 1:10343448/1‑101 CGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAATTATCAGGAAATATAACATTATCGAAGTATTCAAATTAACAACT > 1:20830519/1‑101 GGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAATTATCAGGAAATATAACATTATCGAAGTATTCAAATTAACAACTAT < 1:21031706/101‑1 GGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAATTATCAGGAAATATAACATTATCGAAGTATTCAAATTAACAACTAT < 1:10739902/101‑1 GGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGGCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAATTATCAGGAAATATAACATTATCGAAGTATTCAAATTAACAACTAT > 1:127661/1‑101 GCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAATTATCAGGAAATATAACATTATCGAAGTATTCAAATTAACAACTATT < 1:5882225/101‑1 TGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAATTATCAGGAAATATAACATTATCGAAGTATTCAAATTAACAACTATTAAA < 1:20507576/101‑1 GTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAATTATCAGGAAATATAACATTATCGAAGTATTCAAATTAACAACTATTAAAT > 1:10127684/1‑101 GTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAATTATCAGGAAATATAACATTATCGAAGTATTCAAATTAACAACTATTAAAT > 1:20219644/1‑101 TAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAATTATCAGGAAATATAACATTATCGAAGTATTCAAATTAACAACTATTAAATA < 1:2609486/101‑1 ATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAATTATCAGGAAATATAACATTATCGAAGTATTCAAATTAACAACTATTAAATAAT < 1:2311322/101‑1 TGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAATTATCAGGAAATATAACATTATCGAAGTATTCAAATTACCAACTATTAAATAATA < 1:14683758/101‑1 TGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAATTATCAGGAAATATAACATTATCGAAGTATTCAAATTAACAACTATTAAATAATA < 1:361580/101‑1 GGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAATTATCAGGAAATATAACATTATCGAAGTATTCAAATTAACAACTATTAAATAATATT < 1:5056692/101‑1 GTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAATTATCAGGAAATATAACATTATCGAAGTATTCAAATTAACAACTATTAAATAATATTA < 1:12551097/101‑1 TTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAATTATCAGGAAATATAACATTATCGAAGTATTCAAATTAACAACTATTAAATAATATTAA > 1:16551505/1‑101 TAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAATTATCAGGAAATATAACATTATCGAAGTATTCAAATTAACAACTATTAAATAATATTAAA < 1:21965732/101‑1 TAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAATTATCAGGAAATATAACATTATCGAAGTATTCAAATTAACAACTATTAAATAATATTAAA < 1:14554732/101‑1 AAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAATTATCAGGAAATATAACATTATCGAAGTATTCAAATTAACAACTATTAAATAATATTAAAC > 1:1982674/1‑101 AAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAATTATCAGGAAATATAACATTATCGAAGTATTCAAATTAACAACTATTAAATAATATTAAAC > 1:17967749/1‑101 AAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAATTATCAGGAAATATAACATTATCGAAGTATTCAAATTAACAACTATTAAATAATATTAAAC < 1:2429461/101‑1 AGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAATTATCAGGAAATATAACATTATCGAAGTATTCAAATTAACAACTATTAAATAATATTAAACA < 1:8384009/101‑1 GTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAATTATCAGGAAATATAACATTATCGAAGTATTCAAATTAACAACTATTAAATAATATTAAACAT < 1:881353/101‑1 AACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAATTATCAGGAAATATAACATTATCGAAGTATTCAAATTAACAACTATTAAATAATATTAAACATTTTTA > 1:17796442/1‑101 AACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAATTATCAGGAAATATAACATTATCGAAGTATTCAAATTAACAACTATTAAATAATATTAAACATTTTTA < 1:11997570/101‑1 ACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAATTATCAGGAAATATAACATTATCGAAGTATTCAAATTAACAACTATTAAATAATATTAAACATTTTTAA < 1:2998911/101‑1 ATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAATTATCAGGAAATATAACATTATCGAAGTATTCAAATTAACAACTATTAAATAATATTAAACATTTTTAACGTA < 1:10884944/101‑1 TGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAATTATCAGGAAATATAACATTATCGAAGTATTCAAATTAACAACTATTAAATAATATTAAACATTTTTAACGTAA < 1:483524/101‑1 GTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAATTATCAGGAAATATAACATTATCGAAGTATTCAAATTAACAACTATTAAATAATATTAAACATTTTTAACGTAAA > 1:21136365/1‑101 CTGGAAATATAGGGGCAAATCCAATTATCAGGAAATATAACATTATCGAAGTATTCAAATTAACAACTATTAAATAATATTAAACATTTTTAACGTAAACA < 1:18955150/101‑1 CTGGAAATATAGGGGCAAATCCAATTATCAGGAAATATAACATTATCGAAGTATTCAAATTAACAACTATTAAATAATATTAAACATTTTTAACGTAAACA < 1:17261541/101‑1 AAATATAGGGGCAAATCCAATTATCAGGAAATATAACATTATCGAAGTATTCAAATTAACAACTATTAAATAATATTAAACATTTTTAACGTAAACATTAA > 1:7040300/1‑101 AAATATAGGGGCAAATCCAATTATCAGGAAATATAACATTATCGAAGTATTCAAATTAACAACTATTAAATAATATTAAACATTTTTAACGTAAACATTAA > 1:15920948/1‑101 ATATAGGGGCAAATCCAATTATCAGGAAATATAACATTATCGAAGTATTCAAATTAACAACTATTAAATAATATTAAACATTTTTAACGTAAACATTAAGA > 1:13652639/1‑101 ATATAGGGGCAAATCCAATTATCAGGAAATATAACATTATCGAAGTATTCAAATTAACAACTATTAAATAATATTAAACATTTTTAACGTAAACATTAAGA < 1:4145259/101‑1 TATAGGGGCAAATCCAATTATCAGGAAATATAACATTATCGAAGTATTCAAATTAACAACTATTAAATAATATTAAACATTTTTAACGTAAACATTAAGAA < 1:11848027/101‑1 ATAGGGGCAAATCCAATTATCAGGAAATATAACATTATCGAAGTATTCAAATTAACAACTATTAAATAATATTAAACATTTTTAACGTAAACATTAAGAAT < 1:8164574/101‑1 GGGGCAAATCCAATTATCAGGAAATATAACATTATCGAAGTATTCAAATTAACAACTATTAAATAATATTAAACATTTTTAACGTAAACATTAAGAATATT < 1:8702599/101‑1 GCAAATCCAATTATCAGGAAATATAACATTATCGAAGTATTCAAATTAACAACTATTAAATAATATTAAACATTTTTAACGTAAACATTAAGAATATTCAT < 1:11573488/101‑1 CAAATCCAATTATCAGGAAATATAACATTATCGAAGTATTCAAATTAACAACTATTAAATAATATTAAACATTTTTAACGTAAACATTAAGAATATTCATC < 1:21789447/101‑1 AAATCCAATTATCAGGAAATATAACATTATCGAAGTATTCAAATTAACAACTATTAAATAATATTAAACATTTTTAACGTAAACATTTAGAATATTCATCT < 1:18463234/101‑1 ATCCAATTATCAGGAAATATAACATTATCGAAGTATTCAAATTAACAACTATTAAATAATATTAAACATTTTTAACGTAAACATTAAGAATATTCATCTTG < 1:15674947/101‑1 TCCAATTATCAGGAAATATAACATTATCGAAGTATTCAAATTAACAACTATTAAATAATATTAAACATTTTTAACGTAAACATTAAGAATATTCATCTTGT > 1:9570216/1‑101 CCAATTATCAGGAAATATAACATTATCGAAGTATTCAAATTAACAACTATTAAATAATATTAAACATTTTTAACGTAAACATTAAGAATATTCATCTTGTT < 1:1440224/101‑1 AATTATCAGGAAATATAACATTATCGAAGTATTCAAATTAACAACTATTAAATAATATTAAACATTTTTAACGTAAACATTAAGAATATTCATCTTGTTAT < 1:4721039/101‑1 TAGTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_007779/2320892‑2320794 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ATTATCAGGAAATATAACATTATCGAAGTATTCAAATTAACAACTATTAAATAATATTAAACATTTTTAACGTAAACATTAAGAATATTCATCTTGTTAT < NC_007779/2589834‑2589735 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |