| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_007779 | = 1305037 | 27 (0.060) | 438 (1.050) | 152/172 | NT | 94.4% | coding (425/921 nt) | oppB | oligopeptide transporter subunit |
| ? | NC_007779 | 2519723 = | NA (NA) | intergenic (+33/‑54) | nupC/insL | nucleoside (except guanosine) transporter/transposase | |||||
Only 100 of 1052 total aligned reads displayed.
GTAATACTGGGTGTTAGTGCTGGCGTTATTGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGATATTTGCGATCATTTTGCATTGGCTGCCGGGCGGTGGCTGGAATGGTGGGGCGCTTAAATTCATGATA > NC_007779/1304937‑1305137 | tAATACTGGGTGTTAGTGCTGGCGTTATTGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCa > 1:8528200‑M1/1‑100 (MQ=255) cgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGTTGTTATcccc > 1:3136890‑M2/88‑101 (MQ=255) gcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGTTGTTATCCCCa > 1:13272448‑M2/87‑101 (MQ=255) caattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGTTGTTATCCCCAg < 1:5680726‑M2/16‑1 (MQ=255) aTACTGGGTGTTAGTGCTGGCGTTATTGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCata < 1:10027228‑M1/101‑4 (MQ=255) attgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGTTGTTATCCCCAGtt > 1:10154244‑M2/84‑101 (MQ=255) attgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGTTGTTATCCCCAGtt < 1:4608416‑M2/18‑1 (MQ=255) ttgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGTTGTTATCCCCAGttt > 1:17763449‑M2/83‑101 (MQ=255) tgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGTTGTTATCCCCAGtttt < 1:6458044‑M2/20‑1 (MQ=255) ggTGTTAGTGCTGGCGTTATTGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCataagcgct < 1:16215220‑M1/101‑10 (MQ=255) ttAGTGCTGGCGTTATTGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCataagcgctaact < 1:8688209‑M1/101‑14 (MQ=255) tAGTGCTGGCGTTATTGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCataagcgctaactt > 1:14241818‑M1/1‑87 (MQ=255) cgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTg < 1:1648939‑M2/27‑1 (MQ=255) aGTGCTGGCGTTATTGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCataagcgctaactta > 1:18963121‑M1/1‑86 (MQ=255) gTGCTGGCGTTATTGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCataagcgctaacttaa > 1:15013908‑M1/1‑85 (MQ=255) ggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCa < 1:14434349‑M2/32‑1 (MQ=255) tGGCGTTATTGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCataagcgctaacttaagggt > 1:15458728‑M1/1‑81 (MQ=255) atcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCatta < 1:3941297‑M2/35‑1 (MQ=255) atcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCatta > 1:1341135‑M2/67‑101 (MQ=255) gTTATTGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCataagcgctaacttaagggttgtg < 1:2103690‑M1/101‑25 (MQ=255) gTTATTGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCataagcgctaacttaagggttgtg < 1:1912563‑M1/101‑25 (MQ=255) gtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCAttatta > 1:9746472‑M2/64‑101 (MQ=255) ttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTc > 1:7948328‑M2/61‑101 (MQ=255) ttGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCataagcgctaacttaagggttgtggtat < 1:10586965‑M1/101‑29 (MQ=255) ccGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattac < 1:11481839‑M1/101‑32 (MQ=255) acgaggcaccgaggcgtcacattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATg > 1:19388543‑M2/58‑101 (MQ=255) cGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacg < 1:2063438‑M1/101‑33 (MQ=255) cGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacg > 1:5914561‑M1/1‑69 (MQ=255) gaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGat < 1:2730934‑M2/46‑1 (MQ=255) cATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCataagcgctaacttaagggttgtgatattacgcc > 1:13638463‑M1/1‑67 (MQ=255) aggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGata > 1:13935712‑M2/55‑101 (MQ=255) aggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGata < 1:4448426‑M2/47‑1 (MQ=255) aTTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGAGTTGTTATCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcct > 1:8407721‑M1/1‑66 (MQ=255) ttAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctg < 1:1461114‑M1/101‑37 (MQ=255) accgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGATATTTg < 1:2285951‑M2/51‑1 (MQ=255) accgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGATATTTg < 1:11728950‑M2/51‑1 (MQ=255) aaaacaaaacACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgat < 1:1840682‑M1/101‑39 (MQ=255) aaacaaaacaCCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgata < 1:7809467‑M1/101‑40 (MQ=255) aacaaaacaCCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatat < 1:16829777‑M1/101‑41 (MQ=255) aacaaaacaCCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatat < 1:11170227‑M1/101‑41 (MQ=255) aggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGATATTTGCGAt < 1:4769679‑M2/55‑1 (MQ=255) ggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGATATTTGCGATc < 1:910347‑M2/56‑1 (MQ=255) gcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGATATTTGCGATCa > 1:11347296‑M2/45‑101 (MQ=255) gcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGATATTTGCGATCa > 1:18564067‑M2/45‑101 (MQ=255) aacaCCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgattt < 1:9843796‑M1/101‑46 (MQ=255) aacaCCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgattt > 1:14822656‑M1/1‑56 (MQ=255) gtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGATATTTGCGATCAtt > 1:12343948‑M2/43‑101 (MQ=255) cgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGATATTTGCGATCAtttt > 1:15252312‑M2/41‑101 (MQ=255) cgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGATATTTGCGATCAtttt > 1:5105135‑M2/41‑101 (MQ=255) acCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaac < 1:17166632‑M1/101‑49 (MQ=255) gcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGATATTTGCGATCATTTTg < 1:7129812‑M2/62‑1 (MQ=255) ccAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacg < 1:1666358‑M1/101‑50 (MQ=255) attcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGATATTTGCGATCATTTTGCa > 1:1247522‑M2/38‑101 (MQ=255) cttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGATATTTGCGATCATTTTGCATTg < 1:17874218‑M2/67‑1 (MQ=255) gggACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccga > 1:18220449‑M1/1‑46 (MQ=255) 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ttgttATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGATATTTGCGATCATTTTGCATTGGCTGCCGGGCGGTGGCTGGAATGGTGGGGCGCTTaaa < 1:9537950/101‑1 (MQ=255) gttATCCCataagcgctaacttaagggttggggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtcagcaattctggcc > 1:17007125‑M1/1‑8 (MQ=255) aTCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtcagcaattctggcccat > 1:6723358‑M1/1‑5 (MQ=255) tCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGATATTTGCGATCATTTTGCATTGGCTGCCGGGCGGTGGCTGGAATGGTGGGGCGCTTAAATTCATg < 1:8852723/101‑1 (MQ=255) cccataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtcagcaattctggcccatat > 1:7415582‑M1/1‑3 (MQ=255) cccataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtcagcaattctggcccatat < 1:15770273‑M1/101‑99 (MQ=255) ccataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtcagcaattctggcccatatt > 1:21661‑M1/1‑2 (MQ=255) ccataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtcagcaattctggcccatatt > 1:20750798‑M1/1‑2 (MQ=255) ccAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGATATTTGCGATCATTTTGCATTGGCTGCCGGGCGGTGGCTGGAATGGTGGGGCGCTTAAATTCATGata > 1:12846453/1‑101 (MQ=255) cataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtcagcaattctggcccatattg > 1:3353000‑M1/1‑1 (MQ=255) | GTAATACTGGGTGTTAGTGCTGGCGTTATTGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGATATTTGCGATCATTTTGCATTGGCTGCCGGGCGGTGGCTGGAATGGTGGGGCGCTTAAATTCATGATA > NC_007779/1304937‑1305137 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |