| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_007779 | = 2412225 | NA (NA) | 409 (0.940) | 149/180 | NT | 95.1% | intergenic (‑55/‑782) | insA/yfbQ | IS1 element protein/aminotransferase |
| ? | NC_007779 | 2985047 = | 21 (0.050) | coding (545/1230 nt) | yqeG | transporter | |||||
Only 100 of 942 total aligned reads displayed.
ACTATTCGGGTAATGGGATTTTTGGTATTCCCATTGATTGCCTATTTCTTATTTCTTTCCATTTACCTTGTCGGTAGTTGGCAACCTGATCTATTAACAACCCAGGTAGAGTTCAATCAGAATACCCTTCACCAGATATGGATATCGATTCCCGTGATGGTTTTCGCCTTTAGCCATACGCCCATTATTTCTACGTTTGCC > NC_007779/2984947‑2985147 | aTTCGGGTAATGGGATTTTTGGTATTCCCATTGATTGCCTATTTCTTATTTCTTTCCATTTACCTTGTCGGTAGTTGGCAACCTGATCTATTAACAACCCa < 1:5810530/101‑1 (MQ=255) gggTAATGGGATTTTTGGTATTCCCATTGATTGCCTATTTCTTATTTCTTTCCATTTACCTTGTCGGTAGTTGGCAACCTGATCTATTAACAACCCAGGTa < 1:11999429/101‑1 (MQ=255) aaTGGGATTTTTGGTATTCCCATTGATTGCCTATTTCTTATTTCTTTCCATTTACCTTGTCGGTAGTTGGCAACCTGATCTATTAACAACCCAGGTAGggt < 1:5432876‑M2/101‑4 (MQ=255) aaTGGGATTTTTGGTATTCCCATTGATTGCCTATTTCTTATTTCTTTCCATTTACCTTGTCGGTAGTTGGCAACCTGATCTATTAACAACCCAGGTAGggt > 1:3511796‑M2/1‑98 (MQ=255) caggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCCCAGGTAGAGTTc > 1:15025841‑M2/88‑101 (MQ=255) aggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCCCAGGTAGAGTTCa > 1:9771405‑M2/87‑101 (MQ=255) aggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCCCAGGTAGAGTTCa > 1:17058065‑M2/87‑101 (MQ=255) ggATTTTTGGTATTCCCATTGATTGCCTATTTCTTATTTCTTTCCATTTACCTTGTCGGTAGTTGGCAACCTGATCTATTAACAACCCAGGTAGggtaatg < 1:10403552‑M2/101‑8 (MQ=255) gATTTTTGGTATTCCCATTGATTGCCTATTTCTTATTTCTTTCCATTTACCTTGTCGGTAGTTGGCAACCTGATCTATTAACAACCCAGGTAGggtaatga > 1:17252220‑M2/1‑93 (MQ=255) agggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCCCAGGTAGAGTTCAATc < 1:3139506‑M2/18‑1 (MQ=255) ggTATTCCCATTGATTGCCTATTTCTTATTTCTTTCCATTTACCTTGTCGGTAGTTGGCAACCTGATCTATTAACAACCCAGGTAGggtaatgactccaac > 1:18751102‑M2/1‑86 (MQ=255) ctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCCCAGGTAGAGTTCAATCAGAATAcc > 1:835934‑M2/76‑101 (MQ=255) aTTCCCATTGATTGCCTATTTCTTATTTCTTTCCATTTACCTTGTCGGTAGTTGGCAACCTGATCTATTAACAACCCAGGTAGggtaatgactccaactta < 1:11700109‑M2/101‑19 (MQ=255) ttCCCATTGATTGCCTATTTCTTATTTCTTTCCATTTACCTTGTCGGTAGTTGGCAACCTGATCTATTAACAACCCAGGTAGggtaatgactccaacttat < 1:17627972‑M2/101‑20 (MQ=255) gatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCCCAGGTAGAGTTCAATCAGAATACCCt < 1:19241477‑M2/28‑1 (MQ=255) gatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCCCAGGTAGAGTTCAATCAGAATACCCt > 1:14607354‑M2/74‑101 (MQ=255) atagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCCCAGGTAGAGTTCAATCAGAATACCCtt > 1:10701726‑M2/73‑101 (MQ=255) ccATTGATTTCCTATTTCTTATTTCTTTCCATTTACCTTGTCGGTAGTTGGCAACCTGATCTATTAACAACCCAGGTAGggtaatgactccaacttattga > 1:2616277‑M2/1‑79 (MQ=255) gaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCCCAGGTAGAGTTCAATCAGAATACCCTTCAc > 1:15256089‑M2/70‑101 (MQ=255) cATTGATTGCCTATTTCTTATTTCTTTCCATTTACCTTGTCGGTAGTTGGCAACCTGATCTATTAACAACCCAGGTAGggtaatgactccaacttattgat > 1:11465749‑M2/1‑78 (MQ=255) cATTGATTGCCTATTTCTTATTTCTTTCCATTTACCTTGTCGGTAGTTGGCAACCTGATCTATTAACAACCCAGGTAGggtaatgactccaacttattgat < 1:2811667‑M2/101‑24 (MQ=255) cATTGATTGCCTATTTCTTATTTCTTTCCATTTACCTTGTCGGTAGTTGGCAACCTGATCTATTAACAACCCAGGTAGggtaatgactccaacttattgat > 1:18296481‑M2/1‑78 (MQ=255) aaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCCCAGGTAGAGTTCAATCAGAATACCCTTCAcc > 1:8736843‑M2/69‑101 (MQ=255) tgattgCCTATTTCTTATTTCTTTCCATTTACCTTGTCGGTAGTTGGCAACCTGATCTATTAACAACCCAGGTAGggtaatgactccaacttattgatagt > 1:5675424‑M2/1‑75 (MQ=255) tgattgCCTATTTCTTATTTCTTTCCATTTACCTTGTCGGTAGTTGGCAACCTGATCTATTAACAACCCAGGTAGggtaatgactccaacttattgatagt < 1:10600183‑M2/101‑27 (MQ=255) gattgCCTATTTCTTATTTCTTTCCATTTACCTTGTCGGTAGTTGGCAACCTGATCTATTAACAACCCAGGTAGggtaatgactccaacttattgatagtg < 1:9263880‑M2/101‑28 (MQ=255) gattgCCTATTTCTTATTTCTTTCCATTTACCTTGTCGGTAGTTGGCAACCTGATCTATTAACAACCCAGGTAGggtaatgactccaacttattgatagtg > 1:17870082‑M2/1‑74 (MQ=255) gattgCCTATTTCTTATTTCTTTCCATTTACCTTGTCGGTAGTTGGCAACCTGATCTATTAACAACCCAGGTAGggtaatgactccaacttattgatagtg < 1:3025334‑M2/101‑28 (MQ=255) gattgCCTATTTCTTATTTCTTTCCATTTACCTTGTCGGTAGTTGGCAACCTGATCTATTAACAACCCAGGTAGggtaatgactccaacttattgatagtg > 1:16339623‑M2/1‑74 (MQ=255) attgCCTATTTCTTATTTCTTTCCATTTACCTTGTCGGTAGTTGGCAACCTGATCTATTAACAACCCAGGTAGggtaatgactccaacttattgatagtgt > 1:16154096‑M2/1‑73 (MQ=255) ttgCCTATTTCTTATTTCTTTCCATTTACCTTGTCGGTAGTTGGCAACCTGATCTATTAACAACCCAGGTAGggtaatgactccaacttattgatagtgtt < 1:7697854‑M2/101‑30 (MQ=255) gaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCCCAGGTAGAGTTCAATCAGAATACCCTTCACCAGata > 1:3261164‑M2/64‑101 (MQ=255) agccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCCCAGGTAGAGTTCAATCAGAATACCCTTCACCAGATATg < 1:9465173‑M2/40‑1 (MQ=255) gccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCCCAGGTAGAGTTCAATCAGAATACCCTTCACCAGATATgg < 1:9124151‑M2/41‑1 (MQ=255) cTATCTCTTATTTCTTTCCATTTACCTTGTCGGTAGTTGGCAACCTGATCTATTAACAACCCAGGTAGggtaatgactccaacttattgatagtgttttat < 1:20691266‑M2/101‑34 (MQ=255) cactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCCCAGGTAGAGTTCAATCAGAATACCCTTCACCAGATATGGat > 1:7405478‑M2/59‑101 (MQ=255) tggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCCCAGGTAGAGTTCAATCAGAATCCCCTTCACCAGATATGGATATc < 1:10937204‑M2/46‑1 (MQ=255) gagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCCCAGGTAGAGTTCAATCAGAATACCCTTCACCAGATATGGATATCGa < 1:10198766‑M2/48‑1 (MQ=255) tatttcttTCCATTTACCTTGTCGGTAGTTGGCAACCTGATCTATTAACAACCCAGGTAGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagat < 1:18888899‑M2/101‑42 (MQ=255) tttctttcCATTTACCTTGTCGGTAGTTGGCAACCTGATCTATTAACAACCCAGGTAGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataa < 1:8602508‑M2/101‑44 (MQ=255) ttctttcCATTTACCTTGTCGGTAGTTGGCAACCTGATCTATTAACAACCCAGGTAGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataat > 1:13506008‑M2/1‑57 (MQ=255) ttctttcCATTTACCTTGTCGGTAGTTGGCAACCTGATCTATTAACAACCCAGGTAGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataat < 1:13633620‑M2/101‑45 (MQ=255) ctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCCCAGGTAGAGTTCAATCAGAATACCCTTCACCAGATATGGATATCGATTCCCg > 1:20970589‑M2/48‑101 (MQ=255) ctttcCATTTACCTTGTCGGTAGTTGGCAACCTGATCTATTAACAACCCAGGTAGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgc > 1:16858022‑M2/1‑55 (MQ=255) caaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCCCAGGTAGAGTTCAATCAGAATACCCTTCACCAGATATGGATATCGATTCCCGTg < 1:8134181‑M2/56‑1 (MQ=255) tcCATTTACCTTGTCGGTAGTTGGCAACCTGATCTATTAACAACCCAGGTAGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatattcagataatgcccg < 1:16412123‑M2/101‑50 (MQ=255) ccATTTACCTTGTCGGTAGTTGGCAACCTGATCTATTAACAACCCAGGTAGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccga < 1:2479246‑M2/101‑51 (MQ=255) tttACCTTGTCGGTAGTTGGCAACCTGATCTATTAACAACCCAGGTAGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatga < 1:2054324‑M2/101‑54 (MQ=255) caccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCCCAGGTAGAGTTCAATCAGAATACCCTTCACCAGATATGGATATCGATTCCCGTGATGGtt > 1:11851414‑M2/40‑101 (MQ=255) caccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCCCAGGTAGAGTTCAATCAGAATACCCTTCACCAGATATGGATATCGATTCCCGTGATGGtt < 1:20365103‑M2/62‑1 (MQ=255) caccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCCCAGGTAGAGTTCAATCAGAATACCCTTCACCAGATATGGATATCGATTCCCGTGATGGtt > 1:7857908‑M2/40‑101 (MQ=255) ttACCTTGTCGGTAGTTGGCAACCTGATCTATTAACAACCCAGGTAGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgac < 1:8919980‑M2/101‑55 (MQ=255) accatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCCCAGGTAGAGTTCAATCAGAATACCCTTCACCAGATATGGATATCGATTCCCGTGATGGttt > 1:19818826‑M2/39‑101 (MQ=255) catcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCCCAGGTAGAGTTCAATCAGAATACCCTTCACCAGATATGGATATCGATTCCCGTGATGGTTTTc < 1:21225309‑M2/65‑1 (MQ=255) catcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCCCAGGTAGAGTTCAATCAGAATACCCTTCACCAGATATGGATATCGATTCCCGTGATGGTTTTc < 1:20001905‑M2/65‑1 (MQ=255) catcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCCCAGGTAGAGTTCAATCAGAATACCCTTCACCAGATATGGATATCGATTCCCGTGATGGTTTTc < 1:13221180‑M2/65‑1 (MQ=255) atcatacactaaatcaggaagttggcagcatcaccCCCAGGTAGAGTTCAATCAGAATACCCTTCACCAGATATGGATATCGATTCCCGTGATGGTTTTCg < 1:12307123‑M2/66‑1 (MQ=255) ttGTCGGTAGTTGGCAACCTGATCTATTAACAACCCAGGTAGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgt < 1:5028506‑M2/101‑60 (MQ=255) tGTCGGTAGTTGGCAACCTGATCTATTAACAACCCAGGTAGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtc < 1:2280746‑M2/101‑61 (MQ=255) atacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCCCAGGTAGAGTTCAATCAGAATACCCTTCACCAGATATGGATATCGATTCCCGTGATGGTTTTCGCCt < 1:12745525‑M2/69‑1 (MQ=255) atacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCCCAGGTAGAGTTCAATCAGAATACCCTTCACCAGATATGGATATCGATTCCCGTGATGGTTTTCGCCt > 1:21874980‑M2/33‑101 (MQ=255) tCGGTAGTTGGCAACCTGATCTATTAACAACCCAGGTAGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgtcctatgactttgtcat > 1:18526075‑M2/1‑39 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |