New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_007779 | = 3742935 | 0 (0.000) | 455 (1.140) | 151/164 | NT | 100% | intergenic (‑123/+9) | yieE/insD | phosphopantetheinyl transferase/IS2 element protein |
? | NC_007779 | 3744272 = | 0 (0.000) | intergenic (‑100/+21) | insC/yidZ | IS2 element protein/DNA‑binding transcriptional regulator |
Only 100 of 560 total aligned reads displayed.
TCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAGAAATTGGGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTATGGCTGTTCCGTTTATGCC > NC_007779/3744172‑3744372 | aagagtaatcatttactggaatgatggacagactaaagcggctaaaagttcgattcagacaagcttattacaacttttttacattttattgtgaaattggg < 1:8162024‑M2/1‑1 (MQ=255) gagtaatcatttactggaatgatggacagactaaagcggctaaaagttcgattcagacaagcttattacaacttttttacattttattgtgaaattggGTc < 1:14109873‑M2/3‑1 (MQ=255) gagtaatcatttactggaatgatggacagactaaagcggctaaaagttcgattcagacaagcttattacaacttttttacattttattgtgaaattggGTc < 1:4742414‑M2/3‑1 (MQ=255) taatcatttactggaatgatggacagactaaagcggctaaaagttcgattcagacaagcttattacaacttttttacattttattgtgaaattggGTcgcg < 1:19859154‑M2/6‑1 (MQ=255) aatcatttactggaatgatggacagactaaagcggctaaaagttcgattcagacaagcttattacaacttttttacattttattgtgaaattggGTCGCGt < 1:377121‑M2/7‑1 (MQ=255) catttactggaatgatggacagactaaagcggctaaaagttcgattcagacaagcttattacaacttttttacattttattgtgaaattggGTCGCGTTTc < 1:3398036‑M2/10‑1 (MQ=255) atttactggaatgatggacagactaaagcggctaaaagttcgattcagacaagcttattacaacttttttacattttattgtgaaattggGTCGCGTTTCa < 1:20548224‑M2/11‑1 (MQ=255) atttactggaatgatggacagactaaagcggctaaaagttcgattcagacaagcttattacaacttttttacattttattgtgaaattggGTCGCGTTTCa > 1:6848349‑M2/91‑101 (MQ=255) atttactggaatgatggacagactaaagcggctaaaagttcgattcagacaagcttattacaacttttttacattttattgtgaaattggGTCGCGTTTCa > 1:21958270‑M2/91‑101 (MQ=255) ttactggaatgatggacagactaaagcggctaaaagttcgattcagacaagcttattacaacttttttacattttattgtgaaattggGTCGCGTTTCATa > 1:1159979‑M2/89‑101 (MQ=255) ttactggaatgatggacagactaaagcggctaaaagttcgattcagacaagctgattacaacttttttacattttattgtgaaattggGTCGCGTTTCATa > 1:15176765‑M2/89‑101 (MQ=255) ctggaatgatggacagactaaagcggctaaaagttcgattcagacaagcttattacaacttttttacattttattgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGa < 1:14224512‑M2/16‑1 (MQ=255) ctggaatgatggacagactaaagcggctaaaagttcgattcagacaagcttattacaacttttttacattttattgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGa > 1:15412737‑M2/86‑101 (MQ=255) tggaatgatggacagactaaagcggctaaaagttcgattcagacaagcttattacaacttttttacattttattgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGAt > 1:10723982‑M2/85‑101 (MQ=255) aatgatggacagactaaagcggctaaaagttcgattcagacaagcttattacaacttttttacattttattgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCg > 1:11319556‑M2/82‑101 (MQ=255) aatgatggacagactaaagcggctaaaagttcgattcagacaagcttattacaacttttttacattttattgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCg < 1:18508106‑M2/20‑1 (MQ=255) aatgatggacagactaaagcggctaaaagttcgattcagacaagcttattacaacttttttacattttattgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCg < 1:14901344‑M2/20‑1 (MQ=255) aatgatggacagactaaagcggctaaaagttcgattcagacaagcttattacaacttttttacattttattgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCg < 1:8334306‑M2/20‑1 (MQ=255) tgatggacagactaaagcggctaaaagttcgattcagacaagcttattacaacttttttacattttattgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGt < 1:5420795‑M2/22‑1 (MQ=255) tgatggacagactaaagcggctaaaagttcgattcagacaagcttattacaacttttttacattttattgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGt < 1:16011833‑M2/22‑1 (MQ=255) agactaaagcggctaaaagttcgattcagacaagcttattacaacttttttacattttattgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCAt < 1:2754404‑M2/30‑1 (MQ=255) agactaaagcggctaaaagttcgattcagacaagcttattacaacttttttacattttattgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCAt < 1:19968132‑M2/30‑1 (MQ=255) agactaaagcggctaaaagttcgattcagacaagcttattacaacttttttacattttattgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCAt < 1:18106732‑M2/30‑1 (MQ=255) gactaaagcggctaaaagttcgattcagacaagcttattacaacttttttacattttattgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATc > 1:18743590‑M2/71‑101 (MQ=255) taaagcggctaaaagttcgattcagacaagcttattacaacttttttacattttattgtgaaattggGTCGCGTTTCATAGGATTCGGTTATGCCATCGAc < 1:4169918‑M2/34‑1 (MQ=255) taaagcggctaaaagttcgattcagacaagcttattacaacttttttacattttattgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGAc < 1:13679453‑M2/34‑1 (MQ=255) aaagcggctaaaagttcgattcagacaagcttattacaacttttttacattttattgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGAcg < 1:19476410‑M2/35‑1 (MQ=255) aaagcggctaaaagttcgattcagacaagcttattacaacttttttacattttattgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGAcg > 1:15011469‑M2/67‑101 (MQ=255) aaagcggctaaaagttcgattcagacaagcttattacaacttttttacattttattgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGAcg < 1:12399032‑M2/35‑1 (MQ=255) gcggctaaaagttcgattcagacaagcttattacaacttttttacattttattgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGt < 1:14569384‑M2/38‑1 (MQ=255) ggctaaaagttcgattcagacaagcttattacaacttttttacattttattgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTaa > 1:12951313‑M2/62‑101 (MQ=255) ggctaaaagttcgattcagacaagcttattacaacttttttacattttattgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTaa > 1:11166628‑M2/62‑101 (MQ=255) ctaaaagttcgattcagacaagcttattacaacttttttacattttattgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAg > 1:18409916‑M2/60‑101 (MQ=255) ctaaaagttcgattcagacaagcttattacaacttttttacattttattgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAg > 1:3672644‑M2/60‑101 (MQ=255) taaaagttcgattcagacaagcttattacaacttttttacattttattgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAgg < 1:6542862‑M2/43‑1 (MQ=255) aaaagttcgattcagacaagcttattacaacttttttacattttattgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGt < 1:3142181‑M2/44‑1 (MQ=255) aaaagttcgattcagacaagcttattacaacttttttacattttattgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGt > 1:11408656‑M2/58‑101 (MQ=255) aagttcgattcagacaagcttattacaacttttttacattttattgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGttt < 1:6482591‑M2/46‑1 (MQ=255) aagttcgattcagacaagcttattacaacttttttacattttattgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGttt > 1:21265749‑M2/56‑101 (MQ=255) aagttcgattcagacaagcttattacaacttttttacattttattgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGttt < 1:7857386‑M2/46‑1 (MQ=255) agttcgattcagacaagcttattacaacttttttacattttattgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGtttt < 1:11932999‑M2/47‑1 (MQ=255) agttcgattcagacaagcttattacaacttttttacattttattgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGtttt < 1:13888927‑M2/47‑1 (MQ=255) agttcgattcagacaagcttattacaacttttttacattttattgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGtttt > 1:4416941‑M2/55‑101 (MQ=255) ttcgattcagacaagcttattacaacttttttacattttattgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTa < 1:10417345‑M2/49‑1 (MQ=255) tcgattcagacaagcttattacaacttttttacattttattgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTaa < 1:17553472‑M2/50‑1 (MQ=255) tcgattcagacaagcttattacaacttttttacattttattgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTaa < 1:9296661‑M2/50‑1 (MQ=255) gattcagacaagcttattacaacttttttacattttattgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATg < 1:10049185‑M2/52‑1 (MQ=255) attcagacaagcttattacaacttttttacattttattgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATgg < 1:5056059‑M2/53‑1 (MQ=255) attcagacaagcttattacaacttttttacattttattgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATgg > 1:20193997‑M2/49‑101 (MQ=255) ttcagacaagcttattacaacttttttacattttattgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGt < 1:800799‑M2/54‑1 (MQ=255) tcagacaagcttattacaacttttttacattttattgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGtt < 1:16364481‑M2/55‑1 (MQ=255) tcagacaagcttattacaacttttttacattttattgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGtt > 1:21880930‑M2/47‑101 (MQ=255) cagacaagcttattacaacttttttacattttattgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGttt > 1:17718509‑M2/46‑101 (MQ=255) agacaagcttattacaacttttttacattttattgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTc > 1:1275875‑M2/45‑101 (MQ=255) agacaagcttattacaacttttttacattttattgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTc < 1:2557129‑M2/57‑1 (MQ=255) agacaagcttattacaacttttttacattttattgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTc > 1:21423609‑M2/45‑101 (MQ=255) agacaagcttattacaacttttttacattttattgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTc < 1:7026313‑M2/57‑1 (MQ=255) aagcttattacaacttttttacattttattgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGt > 1:9019590‑M2/41‑101 (MQ=255) gcttattacaacttttttacattttattgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCTATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTaa < 1:17355779‑M2/63‑1 (MQ=255) cttattacaacttttttacattttattgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAAc < 1:13143897‑M2/64‑1 (MQ=255) ttattacaacttttttacattttattgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAAcc > 1:7696008‑M2/37‑101 (MQ=255) tattacaacttttttacattttattgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCa > 1:8646247‑M2/36‑101 (MQ=255) ttacaacttttttacattttattgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGa < 1:12125525‑M2/68‑1 (MQ=255) tacaacttttttacattttattgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACcaggc < 1:21689735‑M2/69‑3 (MQ=255) acaacttttttacattttattgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACg > 1:7258772‑M2/32‑101 (MQ=255) acaacttttttacattttattgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACg < 1:2348329‑M2/70‑1 (MQ=255) aacttttttacattttattgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGAt > 1:5894881‑M2/30‑101 (MQ=255) aacttttttacattttattgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGAt < 1:9733747‑M2/72‑1 (MQ=255) ttttttacattttattgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCtt < 1:4257596‑M2/75‑1 (MQ=255) tttttacattttattgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTc < 1:6679108‑M2/76‑1 (MQ=255) tttttacattttattgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTc > 1:4629376‑M2/26‑101 (MQ=255) tttttacattttattgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTc < 1:16488122‑M2/76‑1 (MQ=255) tacattttattgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGAt > 1:20793616‑M2/22‑101 (MQ=255) tacattttattgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGAt < 1:12491811‑M2/80‑1 (MQ=255) acattttattgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGAtt > 1:15910846‑M2/21‑101 (MQ=255) attttattgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTAt < 1:13522020‑M2/83‑1 (MQ=255) attttattgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTAt > 1:6332278‑M2/19‑101 (MQ=255) ttttattgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTATg < 1:1398797‑M2/84‑1 (MQ=255) ttttattgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTATg < 1:18331278‑M2/84‑1 (MQ=255) ttattgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTATGGc < 1:1971543‑M2/86‑1 (MQ=255) ttattgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTATGGc > 1:1686164‑M2/16‑101 (MQ=255) tattgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTATGGCt > 1:9172682‑M2/15‑101 (MQ=255) attgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTATGGCTg > 1:19036302‑M2/14‑101 (MQ=255) ttgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTATGGCTGt > 1:5267676‑M2/13‑101 (MQ=255) ttgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTATGGCTGt < 1:10881619‑M2/89‑1 (MQ=255) ttgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTATGGCTGt > 1:20347194‑M2/13‑101 (MQ=255) tgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTATGGCTGtt > 1:1259437‑M2/12‑101 (MQ=255) tgtgaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTATGGCTGtt > 1:17958384‑M2/12‑101 (MQ=255) gtgaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTATGGCTGTTc > 1:15586775‑M2/11‑101 (MQ=255) tgaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTATGGCTGTTcc < 1:5712867‑M2/92‑1 (MQ=255) tgaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTATGGCTGTTcc > 1:20911106‑M2/10‑101 (MQ=255) gaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTATGGCTGTTCCg > 1:1108988‑M2/9‑101 (MQ=255) gaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTATGGCTGTTCCg > 1:7488509‑M2/9‑101 (MQ=255) aaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTATGGCTGTTCCGt > 1:9346931‑M2/8‑101 (MQ=255) tggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTATGGCTGTTCCGTTTAt < 1:19353075‑M2/98‑1 (MQ=255) tggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTATGGCTGTTCCGTTTAt > 1:16703174‑M2/4‑101 (MQ=255) ggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTATGGCTGTTCCGTTTATg < 1:2944530‑M2/99‑1 (MQ=255) gGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTATGGCTGTTCCGTTTATGc > 1:16785066‑M2/2‑101 (MQ=255) gTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTATGGCTGTTCCGTTTATGcc < 1:5545672/101‑1 (MQ=255) gTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACACGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTATGGCTGTTCCGTTTATGcc < 1:1023973/101‑1 (MQ=255) | TCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAGAAATTGGGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTATGGCTGTTCCGTTTATGCC > NC_007779/3744172‑3744372 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |