| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_007779 | 3,124,071 | Δ1 bp | 2.2% | coding (45/1224 nt) | glcF ← | glycolate oxidase iron‑sulfur subunit |
| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_007779 | 3,124,071 | 0 | C→. | 2.2% | 14.1 0.0 ‑0.0 | 314 | coding (45/1224 nt) | glcF | glycolate oxidase iron‑sulfur subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (3/4): ref base (148/159): total (151/163) | ||||||||||
| Fisher's exact test strand distribution p-value = 1.00e+00 | ||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 9.96e-01 | ||||||||||
Only 100 of 363 total aligned reads displayed.
GCGGCCCGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCCGCGTACATGCGACCGGGGTTAAACACGCCGCAAGGG > NC_007779/3123971‑3124171 | cccGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAgcgcgc < 1:824242/101‑1 (MQ=255) cccGTCCAGTGCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAgcgcgc > 1:15451142/1‑101 (MQ=255) ccGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAgcgcgcg < 1:5027026/101‑1 (MQ=255) cGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCGGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAgcgcgcgc < 1:8871732/101‑1 (MQ=255) cGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAgcgcgcgc < 1:14212162/101‑1 (MQ=255) cGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAgcgcgcgc < 1:9514028/101‑1 (MQ=255) cGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAgcgcgcgc < 1:11208325/101‑1 (MQ=255) cGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAgcgcgcgc < 1:7907132/101‑1 (MQ=255) gTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGGTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAgcgcgcgcg > 1:13179461/1‑101 (MQ=255) tCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAgcgcgcgcgc > 1:7301440/1‑101 (MQ=255) tCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAgcgcgcgcgc > 1:10804979/1‑101 (MQ=255) cAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGt < 1:12374061/101‑1 (MQ=255) aGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGtt > 1:5533752/1‑101 (MQ=255) ttCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCt < 1:13610256/101‑1 (MQ=255) tCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTg > 1:8520897/1‑101 (MQ=255) cATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGc > 1:6788265/1‑101 (MQ=255) tCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCg > 1:8803232/1‑101 (MQ=255) gCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCa < 1:9628999/101‑1 (MQ=255) cccAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCAt > 1:9816145/1‑101 (MQ=255) cccAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCAt > 1:10408631/1‑101 (MQ=255) ccAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCAtc > 1:11669230/1‑101 (MQ=255) ccAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCAtc > 1:7128040/1‑101 (MQ=255) cAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCAtct < 1:2470488/101‑1 (MQ=255) cAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCAtct > 1:2699267/1‑101 (MQ=255) gAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATctct < 1:15173205/101‑1 (MQ=255) aGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCTGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTc > 1:7856735/1‑101 (MQ=255) gCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCa < 1:309011/101‑1 (MQ=255) cTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAg < 1:5978963/101‑1 (MQ=255) tGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGt < 1:15132718/101‑1 (MQ=255) tGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGt < 1:5706133/101‑1 (MQ=255) gATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGtt < 1:2521023/101‑1 (MQ=255) gATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGtt < 1:14809670/101‑1 (MQ=255) aTAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTa > 1:5340601/1‑101 (MQ=255) tAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGAGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTaa > 1:7989394/1‑101 (MQ=255) aGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAAt > 1:14065048/1‑101 (MQ=255) aGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAAt > 1:7601012/1‑101 (MQ=255) aGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAAt < 1:2057044/101‑1 (MQ=255) gTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTg > 1:1947703/1‑101 (MQ=255) ttGGGAAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTgg > 1:9062109/1‑101 (MQ=255) tGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTggg < 1:9448206/101‑1 (MQ=255) gggCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGt > 1:11549323/1‑101 (MQ=255) gggCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGt > 1:872193/1‑101 (MQ=255) ggCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGtt < 1:7767947/101‑1 (MQ=255) gCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGttt < 1:14589406/101‑1 (MQ=255) gCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGttt < 1:4311700/101‑1 (MQ=255) gCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCA‑‑GCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGc < 1:13901075/101‑1 (MQ=255) ggTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCa < 1:4160348/101‑1 (MQ=255) ggTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCa < 1:8642525/101‑1 (MQ=255) gTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCAt < 1:15854372/101‑1 (MQ=255) ttGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATa < 1:6630479/101‑1 (MQ=255) ttGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATa < 1:4588853/101‑1 (MQ=255) tGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAg > 1:5830489/1‑101 (MQ=255) tGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAg > 1:14027167/1‑101 (MQ=255) tGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAg < 1:13475930/101‑1 (MQ=255) gCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGc < 1:12297227/101‑1 (MQ=255) ggTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCt < 1:9895465/101‑1 (MQ=255) gTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTg < 1:10012505/101‑1 (MQ=255) gTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTg < 1:1375440/101‑1 (MQ=255) gTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTg > 1:2623194/1‑101 (MQ=255) tACAAAATCCGCAGCGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGc > 1:14403967/1‑101 (MQ=255) aCAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGct > 1:8445928/1‑101 (MQ=255) aCAAAATCAGCAGTGAACACAGGCGCGCCGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGGGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGct < 1:1248742/101‑1 (MQ=255) aaaaTCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGctcc > 1:12618127/1‑101 (MQ=255) aaaTCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGctcct < 1:894496/101‑1 (MQ=255) aaaTCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGctcct < 1:6534860/101‑1 (MQ=255) cGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAg > 1:6153692/1‑101 (MQ=255) gCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGt < 1:3531454/101‑1 (MQ=255) cAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGtt > 1:9270075/1‑101 (MQ=255) aGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTc < 1:11088622/101‑1 (MQ=255) aGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTc < 1:3146302/101‑1 (MQ=255) aGTGAACACAGGAGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTc > 1:14659863/1‑101 (MQ=255) aaCACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCcgcg < 1:12182604/101‑1 (MQ=255) acacAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCCGCGt < 1:935725/101‑1 (MQ=255) cacaGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCCGCGTa < 1:4759750/101‑1 (MQ=255) acaGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCCGCGTAc < 1:11797644/101‑1 (MQ=255) caGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCCGCGTACa > 1:7506740/1‑101 (MQ=255) caGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCA‑‑GCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCCGCGTACATg > 1:3863817/1‑101 (MQ=255) aGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCCGCGTACAt < 1:12710586/101‑1 (MQ=255) ggCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCCGCGTACATg < 1:12980373/101‑1 (MQ=255) gcgcgcAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCCGCGTACATGc < 1:2900850/101‑1 (MQ=255) gcgcgcAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCCGCGTACATGc < 1:6981755/101‑1 (MQ=255) gcgcAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCCGCGTACATGCGa > 1:11495224/1‑101 (MQ=255) cgcAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGG‑TTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCCGCGTACATGCGAcc < 1:4364586/101‑1 (MQ=255) gcAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCCGCGTACATGCGAcc > 1:2163794/1‑101 (MQ=255) gcAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCCGCGTACATGCGAcc < 1:1735085/101‑1 (MQ=255) cAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCCGCGTACATGCGACCg < 1:6272511/101‑1 (MQ=255) aGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCCGCGTACATGCGACCgg > 1:3231636/1‑101 (MQ=255) ggATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCCGCGTACATGCGACCggg > 1:5899772/1‑101 (MQ=255) aTGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCCGCGTACATGCGACCGGGGt < 1:13927559/101‑1 (MQ=255) aTGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCCGCGTACATGCGACCGGGGt < 1:12860319/101‑1 (MQ=255) tGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCCGCGTACATGCGACCGGGGtt < 1:14308053/101‑1 (MQ=255) gCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCCGCGTACATGCGACCGGGGTTa < 1:2271316/101‑1 (MQ=255) tCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCCGCGTACATGCGACCGGGGTTAAaca > 1:1219689/1‑101 (MQ=255) tCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCCGCGTACATGCGACCGGGGTTAAaca < 1:15569681/101‑1 (MQ=255) cGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCCGCGTACATGCGACCGGGGTTAAacac < 1:11268880/101‑1 (MQ=255) gCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCCGCGTACATGCGACCGGGGTTAAACAcgc < 1:10644358/101‑1 (MQ=255) cAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCCGCGTACATGCGACCGGGGTTAAACACGCCGCaa < 1:11690416/101‑1 (MQ=255) aGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCCGCGTACATGCGACCGGGGTTAAACACGCCGCAAg > 1:12077911/1‑101 (MQ=255) aGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCCGCGTACATGCGACCGGGGTTAAACACGCCGCAAg < 1:3430266/101‑1 (MQ=255) aGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCCGCGTACATGCGACCGGGGTTAAACACGCCGCAAg > 1:10286069/1‑101 (MQ=255) | GCGGCCCGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCCGCGTACATGCGACCGGGGTTAAACACGCCGCAAGGG > NC_007779/3123971‑3124171 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |