| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_007779 | 2178209 = | 0 (0.000) | 284 (0.900) | 133/180 | NT | 100% | intergenic (+178/+184) | insH/gatZ | IS5 element protein/D‑tagatose 1,6‑bisphosphate aldolase 2, subunit |
| ? | NC_007779 | = 2412225 | NA (NA) | intergenic (‑55/‑782) | insA/yfbQ | IS1 element protein/aminotransferase | |||||
Only 100 of 302 total aligned reads displayed.
ATGCTCGCCAAAGGTGTGGTTCATGATACCTGGCCACAGGCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_007779/2178308‑2178209‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTG < NC_007779/2412225‑2412139 TGCTCGCCAAAGGTGTGGTTCATGATACCTGGCCACAGGCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGG > 1:9886846/1‑101 TGCTCGCCAAAGGTGTGGTTCATGATACCTGGCCACAGGCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGG < 1:9357084/101‑1 TCGCCAAAGGTGTGGTTCATGATACCTGGCCACAGGCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGA < 1:7491885/101‑1 TCGCCAAAGGTGTGGTTCATGATACCTGGCCACAGGCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGA > 1:7266037/1‑101 CGCCAAAGGTGTGGTTCATGATACCTGGCCACAGGCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTATCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGAT < 1:10073768/101‑1 GCCAAAGGTGTGGTTCATGATACCTGGCCACAGGCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATG > 1:6025797/1‑101 GCCAAAGGTGTGGTTCATGATACCTGGCCACAGGCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATG < 1:11415075/101‑1 CCAAAGGTGTGGTTCATGATACCTGGCCACAGGCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGC > 1:8341006/1‑101 CAAAGGTGTGGTTCATGATACCTGGCCACAGGCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCT > 1:1018441/1‑101 CAAAGGTGTGGTTCATGATACCTGGCCACAGGCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCT > 1:15531930/1‑101 AAAGGTGTGGTTCATGATACCTGGCCACAGGCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTG > 1:970308/1‑101 AAAGGTGTGGTTCATGATACCTGGCCACAGGCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTG < 1:11267261/101‑1 AGGTGTGGTTCATGATACCTGGCCACAGGCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCC > 1:7209380/1‑101 GGTGTGGTTCATGATACCTGGCCACAGGCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCA > 1:11782502/1‑101 GTGTGGTTCATGATACCTGGCCACAGGCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAA < 1:10561564/101‑1 GTGGTTCATGATACCTGGCCACAGGCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACT < 1:14002694/101‑1 TGGTTCATGATACCTGGCCACAGGCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTT < 1:4825788/101‑1 TGGTTCATGATACCTGGCCACAGGCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTT < 1:10651226/101‑1 GGTTCATGATACCTGGCCACAGGCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTA > 1:7609704/1‑101 GTTCATGATACCTGGCCACAGGCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCTGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTAC < 1:8520561/101‑1 GTTCATGATACCTGGCCACAGGCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTAC < 1:7958595/101‑1 GTTCATGATACCTGGCCACAGGCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTAC < 1:13257076/101‑1 TTCATGATACCTGGCCACAGGCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACT > 1:6580040/1‑101 cCATGATACCTGGCCACAGGCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTG < 1:7883585/100‑1 TCATGATACCTGGCCACAGGCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTG < 1:15071349/101‑1 ATGATACCTGGCCACAGGCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGAT < 1:8921418/101‑1 TGATACCTGGCCACAGGCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATT > 1:1867101/1‑101 TGATACCTGGCCACAGGCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATT < 1:7387870/101‑1 GATACCTGGCCACAGGCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTT < 1:1582278/101‑1 ATACCTGGCCACAGGCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTA > 1:15429470/1‑101 TACCTGGCCACAGGCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAG > 1:5415848/1‑101 TACCTGGCCACAGGCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAG > 1:10937107/1‑101 ACCTGGCCACAGGCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGT > 1:3218545/1‑101 CCTGGCCACAGGCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTG < 1:3901737/101‑1 TGGCCACAGGCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTA > 1:1344615/1‑101 GGCCACAGGCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTAT < 1:9527738/101‑1 GGCCACAGGCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTAT > 1:4197935/1‑101 GCCACAGGCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATG > 1:12445584/1‑101 GCCACAGGCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATG > 1:6154871/1‑101 CCACAGGCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGA > 1:12048003/1‑101 ACAGGCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATG > 1:6683313/1‑101 GGCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTG > 1:13748662/1‑101 GCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGT < 1:3827981/101‑1 CATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTT < 1:3027334/101‑1 ATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTT < 1:15952340/101‑1 ATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTT < 1:14441176/101‑1 TAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTT < 1:5052003/101‑1 TAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTT < 1:8048247/101‑1 TAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTT < 1:3990820/101‑1 AATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTG > 1:4117178/1‑101 AATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTG > 1:8208704/1‑101 TTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAG < 1:6920653/101‑1 TTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAG > 1:13722850/1‑101 TTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAG > 1:4639547/1‑101 TTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAG < 1:10765895/101‑1 GCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGT < 1:3763450/101‑1 CCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTG > 1:12403289/1‑101 CAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGC > 1:8644246/1‑101 CAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGC > 1:199919/1‑101 aAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGTTTGAGCAGCACTCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTC < 1:14585769/100‑1 GAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTC < 1:14803903/101‑1 GAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCA < 1:15894375/101‑1 GAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCA > 1:12583422/1‑101 GAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCA > 1:13916799/1‑101 GCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTG < 1:9102257/101‑1 GCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTG < 1:7117320/101‑1 AGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGC > 1:2401584/1‑101 AGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGC > 1:6344786/1‑101 AGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGC > 1:10961539/1‑101 GAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCT < 1:10794911/101‑1 AATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTT < 1:1949726/101‑1 ATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTC > 1:4313934/1‑101 TTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCT < 1:3010980/101‑1 TTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATGTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCT > 1:13508005/1‑101 TCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTG < 1:9026815/101‑1 TCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTG > 1:9174388/1‑101 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TACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTC > 1:5558678/1‑101 CCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTA > 1:2870445/1‑101 CGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTAT < 1:12384036/101‑1 GGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCA < 1:2768928/101‑1 TAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCT < 1:13302778/101‑1 ATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGT > 1:11547898/1‑101 ATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGT > 1:11111041/1‑101 TGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTC > 1:15605605/1‑101 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ATGCTCGCCAAAGGTGTGGTTCATGATACCTGGCCACAGGCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_007779/2178308‑2178209‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTG < NC_007779/2412225‑2412139 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |