New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_007779 | 2178209 = | 0 (0.000) | 237 (0.820) | 126/180 | NT | 100% | intergenic (+178/+184) | insH/gatZ | IS5 element protein/D‑tagatose 1,6‑bisphosphate aldolase 2, subunit |
? | NC_007779 | = 2412225 | NA (NA) | intergenic (‑55/‑782) | insA/yfbQ | IS1 element protein/aminotransferase |
Only 100 of 252 total aligned reads displayed.
TGCTCGCCAAAGGTGTGGTTCATGATACCTGGCCACAGGCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_007779/2178307‑2178209 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTT < NC_007779/2412225‑2412137 TCGCCAAAGGTGTGGTTCATGATACCTGGCCACAGTCATTAATTCCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGA < 1:11853821/101‑1 TCGCCAAAGGTGTGGTTCATGATACCTGGCCACAGGCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGA > 1:9150491/1‑101 TCGCCAAAGGTGTGGTTCATGATACCTGGCCACAGGCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGA > 1:1563519/1‑101 CGCCAAAGGTGTGGTTCATGATACCTGGCCACAGGCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGAT > 1:4984634/1‑101 CGCCAAAGGTGTGGTTCATGATACCTGGCCACAGGCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGAT < 1:2246905/101‑1 GCCAAAGGTGTGGTTCATGATACCTGGCCACAGGCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATG > 1:367863/1‑101 CAAAGGTGTGGTTCATGATACCTGGCCACAGGCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCT < 1:570560/101‑1 AAAGGTGTGGTTCATGATACCTGGCCACAGGCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTG > 1:8074414/1‑101 AAAGGTGTGGTTCATGATACCTGGCCACAGGCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTG > 1:1736491/1‑101 AAAGGTGTGGTTCATGATACCTGGCCACAGGCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGGGATGCTc > 1:6811503/1‑100 AAGGTGTGGTTCATGATACCTGGCCACAGGCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGC > 1:5667679/1‑101 AGGTGTGGTTCATGATACCTGGCCACAGGCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCC > 1:7590346/1‑101 GGTGTGGTTCATGATACCTGGCCACAGGCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCA < 1:7134596/101‑1 GGTGTGGTTCATGATACCTGGCCACAGGCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCA < 1:12305218/101‑1 GTGTGGTTCATGATACCTGGCCACAGGCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAA > 1:8297889/1‑101 GTGTGGTTCATGATACCTGGCCACAGGCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAA > 1:1841763/1‑101 GTGTGGTTCATGATACCTGGCCACAGGCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAACTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAA > 1:13556254/1‑101 TGTGGTTCATGATACCTGGCCACAGGCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAAC < 1:11595246/101‑1 TGGTTCATGATACCTGGCCACAGGCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTT < 1:12917401/101‑1 GTTCATGATACCTGGCCACAGGCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTAC > 1:5299069/1‑101 ATGATACCTGGCCACAGGCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGAT > 1:11985309/1‑101 ATGATACCTGGCCACAGGCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGAT < 1:4383138/101‑1 GATACCTGGCCACAGGCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTT < 1:5971570/101‑1 GATACCTGGCCACAGGCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTT < 1:952756/101‑1 TACCTGGCCACAGGCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAG > 1:871383/1‑101 ACCTGGCCACAGGCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGT < 1:13505556/101‑1 CCTGGCCACAGGCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTG > 1:8020125/1‑101 CCTGGCCACAGGCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTAATTTAGTG > 1:8477625/1‑101 CTGGCCACAGGCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGT < 1:11170885/101‑1 CTGGCCACAGGCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGT < 1:2697604/101‑1 TGGCCACAGGCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTA < 1:6243237/101‑1 TGGCCACAGGCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTA < 1:4290080/101‑1 GGCCACAGGCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTAT > 1:4041531/1‑101 GCCACAGGCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATG > 1:13238270/1‑101 CCACAGGCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGA > 1:2331851/1‑101 CACAGGCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGAT > 1:4420463/1‑101 ACAGGCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATG < 1:10319170/101‑1 ACAGGCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATG < 1:11710134/101‑1 ACAGGCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATG > 1:8927569/1‑101 CAGGCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGG < 1:631364/101‑1 AGGCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGT < 1:7878944/101‑1 AGGCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGT > 1:13884943/1‑101 AGGCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGT > 1:2830668/1‑101 GGCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTG > 1:10949783/1‑101 GCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGT < 1:12527788/101‑1 GCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGT > 1:3133442/1‑101 ATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTT > 1:5578981/1‑101 ATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTT < 1:6373317/101‑1 TAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTT < 1:10748373/101‑1 AATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGGTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTG < 1:13096900/101‑1 AATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTG > 1:337343/1‑101 AATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTG > 1:3800993/1‑101 TTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAG < 1:1126033/101‑1 TGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGG > 1:3779921/1‑101 GCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGT > 1:8647660/1‑101 GCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGT < 1:8561280/101‑1 GCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGT < 1:12965375/101‑1 GCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGT < 1:14179210/101‑1 CCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTG < 1:6561072/101‑1 CCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTG > 1:7207356/1‑101 CCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTG > 1:5358506/1‑101 CCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTG < 1:14035150/101‑1 CAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGC > 1:8398151/1‑101 CAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGC > 1:14251491/1‑101 AGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCT > 1:14644294/1‑101 GAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTC < 1:7637993/101‑1 GAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCA > 1:4118117/1‑101 GAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCA < 1:4781950/101‑1 AGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGT < 1:10176195/101‑1 GCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTG > 1:13150830/1‑101 GCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTG < 1:13400064/101‑1 GCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTG > 1:6868827/1‑101 CAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGG < 1:9702556/101‑1 AGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGC < 1:831289/101‑1 AGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGC > 1:13928822/1‑101 GAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCT < 1:5912920/101‑1 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TGCTCGCCAAAGGTGTGGTTCATGATACCTGGCCACAGGCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_007779/2178307‑2178209 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTT < NC_007779/2412225‑2412137 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |