New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_007779 | 4355060 = | 0 (0.000) | 354 (1.220) | 152/180 | NT | 100% | coding (1281/1632 nt) | dcuS | sensory histidine kinase in two‑component regulatory system with DcuR, regulator of anaerobic fumarate respiration |
? | NC_007779 | 4502861 = | NA (NA) | intergenic (+241/‑46) | intB/insC | integrase/IS2 insertion element repressor InsA |
Only 100 of 291 total aligned reads displayed.
TACATTCAATAAAAAAGTAACCTCATAAAAAATCCTGTACTCACAGGGTGATGCGGGATAACTGACGTAAGGAGTGCTGCAGGGATTTGATGGT‑CCCTTGTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGTTTTTAGACTAGTCATTGGAGAACAGATGATTGAT > NC_007779/4502761‑4502960 | aCATTCAATAAAAAAGTAACCTCATAAAAAATCCTGTACTCACAGGGTGATGCGGGATAACTGACGTAAGGAGTGCTGCAGGGATTTGATGGT‑CCCTTGTa > 1:10077689/1‑101 (MQ=255) aCATTCAATAAAAAAGTAACCTCATAAAAAATCCTGTACTCACAGGGTGATGCGGGATAACTGACGTAAGGAGTGCTGCAGGGATTTGATGGT‑CCCTTGTa > 1:3555315/1‑101 (MQ=255) ttCAATAAAAAAGTAACCTCATAAAAAATCCTGTACTCACAGGGTGATGCGGGATAACTGACGTAAGGAGTGCTGCAGGGATTTGATGGT‑CCCTTGTAGAc > 1:8077/1‑101 (MQ=255) tCAATAAAAAAGTAACCTCATAAAAAATCCTGTACTCACAGGGTGATGCGGGATAACTGACGTAAGGAGTGCTGCAGGGATTTGATGGT‑CCCTTGTAGACt > 1:14513780/1‑101 (MQ=255) cAATAAAAAAGTAACCTCATAAAAAATCCTGTACTCACAGGGTGATGCGGGATAACTGACGTAAGGAGTGCTGCAGGGATTTGATGGT‑CCCTTGTAGACTg > 1:10106006/1‑101 (MQ=255) cAATAAAAAAGTAACCTCATAAAAAATCCTGTACTCACAGGGTGATGCGGGATAACTGACGTAAGGAGTGCTGCAGGGATTTGATGGT‑CCCTTGTAGACTg > 1:4627445/1‑101 (MQ=255) tAAAAAAGTAACCTCGTAAAAAATCCTGTACTCACAGGGTGATGCGGGATAACTGACGTAAGGAGTGCTGCAGGGATTTGATGGT‑CCCTTGTAGACTGGcc > 1:10750260/1‑101 (MQ=255) tAAAAAAGTAACCTCATAAAAAATCCTGTACTCACAGGGTGATGCGGGATAACTGACGTAAGGAGTGCTGCAGGGATTTGATGGT‑CCCTTGTAGACTGGcc > 1:13898400/1‑101 (MQ=255) tAAAAAAGTAACCTCATAAAAAATCCTGTACTCACAGGGTGATGCGGGATAACTGACGTAAGGAGTGCTGCAGGGATTTGATGGT‑CCCTTGTAGACTGGcc > 1:5031640/1‑101 (MQ=255) aaaaaaGTAACCTCATAAAAAATCCTGTACTCACAGGGTGATGCGGGATAACTGACGTAAGGAGTGCTGCAGGGATTTGATGGT‑CCCTTGTAGACTGGccc < 1:6254649/101‑1 (MQ=255) aaaaaGTAACCTCATAAAAAATCCTGTACTCACAGGGTGATGCGGGATAACTGACGTAAGGAGTGCTGCAGGGATTTGATGGT‑CCCTTGTAGACTGGcccc > 1:12527686/1‑101 (MQ=255) aaaaaGTAACCTCATAAAAAATCCTGTACTCACAGGGTGATGCGGGATAACTGACGTAAGGAGTGCTGCAGGGATTTGATGGT‑CCCTTGTAGACTGGcccc < 1:11353392/101‑1 (MQ=255) aaaaGTAACCTCATAAAAAATCCTGTACTCACAGGGTGATGCGGGATAACTGACGTAAGGAGTGCTGCAGGGATTTGATGGT‑CCCTTGTAGACTGGccccc > 1:5523646/1‑101 (MQ=255) aaaaGTAACCTCATAAAAAATCCTGTACTCACAGGGTGATGCGGGATAACTGACGTAAGGAGTGCTGCAGGGATTTGATGGT‑CCCTTGTAGACTGGccccc > 1:12448148/1‑101 (MQ=255) aaaGTAACCTCATAAAAAATCCTGTACTCACAGGGTGATGCGGGATAACTGACGTAAGGAGTGCTGCAGGGATTTGATGGT‑CCCTTGTAGACTGGCCCCCt < 1:5255912/101‑1 (MQ=255) aaGTAACCTCATAAAAAATCCTGTACTCACAGGGTGATGCGGGATAACTGACGTAAGGAGTGCTGCAGGGATTTGATGGT‑CCCTTGTAGACTGGCCCCCTg > 1:3192381/1‑101 (MQ=255) aaGTAACCTCATAAAAAATCCTGTACTCACAGGGTGATGCGGGATAACTGACGTAAGGAGTGCTGCAGGGATTTGATGGT‑CCCTTGTAGACTGGCCCCCTg > 1:6306895/1‑101 (MQ=255) aaGTAACCTCATAAAAAATCCTGTACTCACAGGGTGATGCGGGATAACTGACGTAAGGAGTGCTGCAGGGATTTGATGGT‑CCCTTGTAGACTGGCCCCCTg > 1:6540440/1‑101 (MQ=255) aGTAACCTCATAAAAAATCCTGTACTCACAGGGTGATGCGGGATAACTGACGTAAGGAGTGCTGCAGGGATTTGATGGT‑CCCTTGTAGACTGGCCCCCTGa > 1:3993715/1‑101 (MQ=255) gTAACCTCATAAAAAATCCTGTACTCACAGGGTTATGCGGGATAACTGACGTAAGGAGTGCTGCAGGGATTTGATGGT‑CCCTTGTAGACTGGCCCCCTGaa > 1:7161635/1‑101 (MQ=255) gTAACCTCATAAAAAATCCTGTACTCACAGGGTGATGCGGGATAACTGACGTAAGGAGTGCTGCAGGGATTTGATGGT‑CCCTTGTAGACTGGCCCCCTGaa > 1:5872513/1‑101 (MQ=255) gTAACCTCATAAAAAATCCTGTACTCACAGGGTGATGCGGGATAACTGACGTAAGGAGTGCTGCAGGG‑TTTGGTGGTCCCCTTGAAGACTGCCCCCCtaat > 1:11175394/1‑98 (MQ=255) tAACCTCATAAAAAATCCTGTACTCACAGGGTGATGCGGGATAACTGACGTAAGGAGTGCTGCAGGGATTTGATGGT‑CCCTTGTAGACTGGCCCCCTGAAt > 1:7258438/1‑101 (MQ=255) tAACCTCATAAAAAATCCTGTACTCACAGGGTGATGCGGGATAACTGACGTAAGGAGTGCTGCAGGGATTTGATGGT‑CCCTTGTAGACTGGCCCCCTGAAt < 1:8781166/101‑1 (MQ=255) aaCCTCATAAAAAATCCTGTACTCACAGGGTGATGCGGGATAACTGACGTAAGGAGTGCTGCAGGGATTTGATGGT‑CCCTTGTAGACTGGCCCCCTGAAtc > 1:11573929/1‑101 (MQ=255) aaCCTCATAAAAAATCCTGTACTCACAGGGTGATGCGGGATAACTGACGTAAGGAGTGCTGCAGGGATTTGATGGT‑CCCTTGTAGACTGGCCCCCTGAAtc > 1:8114593/1‑101 (MQ=255) aCCTCATAAAAAATCCTGTACTCACAGGGTGATGCGGGATAACTGACGTAAGGAGTGCTGCAGGGATTTGATGGT‑CCCTTGTAGACTGGCCCCCTGAAtct > 1:9712891/1‑101 (MQ=255) cTCATAAAAAATCCTGTACTCACAGGGTGATGCGGGATAACTGACGTAAGGAGTGCTGCAGGGATTTGATGGT‑CCCTTGTAGACTGGCCCCCTGAATCTcc > 1:12653152/1‑101 (MQ=255) cTCATAAAAAATCCTGTACTCACAGGGTGATGCGGGATAACTGACGTAAGGAGTGCTGCAGGGATTTGATGGT‑CCCTTGTAGACTGGCCCCCTGAATCTcc < 1:930576/101‑1 (MQ=255) tCATAAAAAATCCTGTACTCACAGGGTGATGCGGGATAACTGACGTAAGGAGTGCTGCAGGGATTTGATGGT‑CCCTTGTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCa > 1:1640488/1‑101 (MQ=255) tCATAAAAAATCCTGTACTCACAGGGTGATGCGGGATAACTGACGTAAGGAGTGCTGCAGGGATTTGATGGT‑CCCTTGTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCa < 1:7874199/101‑1 (MQ=255) tCATAAAAAATCCTGTACTCACAGGGTGATGCGGGATAACTGACGTAAGGAGTGCTGCAGGGATTTGATGGT‑CCCTTGTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCa > 1:856384/1‑101 (MQ=255) aTAAAAAATCCTGTACTCACAGGGTGATGCGGGATAACTGACGTAAGGAGTACTGCAGGGATTTGATGGT‑CCCTTGTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGa > 1:11432462/1‑101 (MQ=255) aaaaaaTCCTGTACTCACAGGGTGATGCGGGATAACTGACGTAAGGAGTGCTGCAGGGATTTGATGGT‑CCCTTGTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACa > 1:13456447/1‑101 (MQ=255) aaaaaTCCTGTACTCACAGGGTGATGCGGGATAACTGACGTAAGGAGTGCTGCAGGGATTTGATGGT‑CCCTTGTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACaa < 1:8242590/101‑1 (MQ=255) aaaaaTCCTGTACTCACAGGGTGATGCGGGATAACTGACGTAAGGAGTGCTGCAGGGATTTGATGGT‑CCCTTGTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACaa < 1:116881/101‑1 (MQ=255) aaaTCCTGTACTCACAGGGTGATGCGGGATAACTGACGTAAGGAGTGCTGCAGGGATTTGATGGT‑CCCTTGTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAAcc > 1:362715/1‑101 (MQ=255) aaTCCTGTACTCACAGGGTGATGCGGGATAACTGACGTAAGGAGTGCTGCAGGGATTTGATGGT‑CCCTTGTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCa < 1:12839504/101‑1 (MQ=255) tCCTGTACTCACAGGGTGATGCGGGATAACTGACGTAAGGAGTGCTGCAGGGATTTGATGGT‑CCCTTGTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAat > 1:7487368/1‑101 (MQ=255) ccTGTACTCACAGGGTGATGCGGGATAACTGACGTAAGGAGTGCTGCAGGGATTTGATGGT‑CCCTTGTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAata > 1:6051208/1‑101 (MQ=255) ccTGTACTCACAGGGTGATGCGGGATAACTGACGTAAGGAGTGCTGCAGGGATTTGATGGT‑CCCTTGTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAata > 1:1849351/1‑101 (MQ=255) cTGTACTCACAGGGTGATGCGGGATAACTGACGTAAGGAGTGCTGCAGGGATTTGATGGT‑CCCTTGTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAatat > 1:7660376/1‑101 (MQ=255) tGTACTCACAGGGTGATGCGGGATAACTGACGTAAGGAGTGCTGCAGGGATTTGATGGT‑CCCTTGTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATc > 1:6949176/1‑101 (MQ=255) tGTACTCACAGGGTGATGCGGGATAACTGACGTAAGGAGTGCTGCAGGGATTTGATGGT‑CCCTTGTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATc > 1:1130037/1‑101 (MQ=255) gTACTCACAGGGTGATGCGGGATAACTGACGTAAGGAGTGCTGCAGGGATTTGATGGT‑CCCTTGTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCa > 1:9435690/1‑101 (MQ=255) gTACTCACAGGGTGATGCGGGATAACTGACGTAAGGAGTGCTGCAGGGATTTGATGGT‑CCCTTGTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCa > 1:3343712/1‑101 (MQ=255) tACTCACAGGGTGATGCGGGATAACTGACGTAAGGAGTGCTGCAGGGATTTGATGGT‑CCCTTGTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCAc > 1:14558819/1‑101 (MQ=255) tACTCACAGGGTGATGCGGGATAACTGACGTAAGGAGTGCTGCAGGGATTTGATGGT‑CCCTTGTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCAc > 1:10564562/1‑101 (MQ=255) aCTCACAGGGTGATGCGGGATAACTGACGTAAGGAGTGCTGCAGGGATTTGATGGT‑CCCTTGTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACt > 1:1214397/1‑101 (MQ=255) aCTCACAGGGTGATGCGGGATAACTGACGTAAGGAGTGCTGCAGGGATTTGATGGT‑CCCTTGTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACt > 1:2633240/1‑101 (MQ=255) cTCACAGGGTGATGCGGGATAACTGACGTAAGGAGTGCTGCAGGGATTTGATGGT‑CCCTTGTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACtt > 1:10268281/1‑101 (MQ=255) acaGGGTGATGCGGGATAACTGACGTAAGGAGTGCTGCAGGGATTTGATGGT‑CCCTTGTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTaaa < 1:4353604/101‑1 (MQ=255) acaGGGTGATGCGGGATAACTGACGTAAGGAGTGCTGCAGGGATTTGATGGT‑CCCTTGTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTaaa > 1:6184065/1‑101 (MQ=255) acaGGGTGATGCGGGATAACTGACGTAAGGAGTGCTGCAGGGATTTGATGGT‑CCCTTGTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTaaa > 1:2862404/1‑101 (MQ=255) acaGGGTGATGCGGGATAACTGACGTAAGGAGTGCTGCAGGGATTTGATGGT‑CCCTTGTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTaaa > 1:2349497/1‑101 (MQ=255) caGGGTGATGCGGGATAACTGACGTAAGGAGTGCTGCGGGGATTTGATGGT‑CCCTTGTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAAt < 1:10226977/101‑1 (MQ=255) caGGGTGATGCGGGATAACTGACGTAAGGAGTGCTGCAGGGATTTGATGGT‑CCCTTGTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAAt < 1:213595/101‑1 (MQ=255) gggTGATGCGGGATAACTGACGTAAGGAGTGCTGCAGGGATTTGATGGT‑CCCTTGTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATaa > 1:13633975/1‑101 (MQ=255) gggTGATGCGGGATAACTGACGTAAGGAGTGCTGCAGGGATTTGATGGT‑CCCTTGTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATaa < 1:13018099/101‑1 (MQ=255) ggTGATGCGGGATAACTGACGTAAGGAGTGCTGCAGGGATTTGATGGT‑CCCTTGTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAg < 1:6423779/101‑1 (MQ=255) gATGCGGGATAACTGACGTAAGGAGTGCTGCAGGGATTTGATGGT‑CCCTTGTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGa > 1:12042895/1‑101 (MQ=255) gATGCGGGATAACTGACGTAAGGAGTGCTGCAGGGATTTGATGGT‑CCCTTGTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGa > 1:83918/1‑101 (MQ=255) 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aTAACTGACGTAAGGAGTGCTGCAGGGATTTGATGGT‑CCCTTGTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTa > 1:12407538/1‑101 (MQ=255) tAACTGACGTAAGGAGTGCTGCAGGGATTTGATGGT‑CCCTTGTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTaa < 1:2430470/101‑1 (MQ=255) aCTGACGTAAGGAGTGCTGCAGGGATTTGATGGT‑CCCTTGTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATa < 1:2550472/101‑1 (MQ=255) tGACGTAAGGAGTGCTGCAGGGATTTGATGGT‑CCCTTGTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACt < 1:9135692/101‑1 (MQ=255) gACGTAAGGAGTGCTGCAGGGATTTGATGGT‑CCCTTGTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTa < 1:6448574/101‑1 (MQ=255) aCGTAAGGAGTGCTGCAGGGATTTGATGGT‑CCCTTGTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAg < 1:5688262/101‑1 (MQ=255) aCGTAAGGAGTGCTGCAGGGATTTGATGGT‑CCCTTGTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAg > 1:13606821/1‑101 (MQ=255) 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aTGGT‑CCCTTGTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGTTTTTAGACTAGTCATTGGAGAACa < 1:4264550/101‑1 (MQ=40) aTGGT‑CCCTTGTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGTTTTTAGACTAGTCATTGGAGAACa < 1:5932457/101‑1 (MQ=40) tGGT‑CCCTTGTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGTTTTTAGACTAGTCATTGGAGAACAg > 1:7341710/1‑101 (MQ=40) tGGT‑CCCTTGTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGTTTTTAGACTAGTCATTGGAGAACAg < 1:4194558/101‑1 (MQ=40) ggT‑CCCTTGTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGTTTTTAGACTAGTCATTGGAGAACAga < 1:1759873/101‑1 (MQ=39) t‑CCCTTGTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGTTTTTAGACTAGTCATTGGAGAACAgatg > 1:7983619/1‑101 (MQ=37) cccTTGTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGTTTTTAGACTAGTCATTGGAGAACAgatga > 1:8956965/1‑101 (MQ=35) ccTTGTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGTTTTTAGACTAGTCATTGGAGAACAgatgat < 1:8109035/101‑1 (MQ=34) gTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGTTTTTAGACTAGTCATTGGAGAACAGAtgattgat < 1:6621425/101‑1 (MQ=11) gTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGTTTTTAGACTACTCATTGGAGAACAGAtgattgat > 1:741976/1‑101 (MQ=11) | TACATTCAATAAAAAAGTAACCTCATAAAAAATCCTGTACTCACAGGGTGATGCGGGATAACTGACGTAAGGAGTGCTGCAGGGATTTGATGGT‑CCCTTGTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGTTTTTAGACTAGTCATTGGAGAACAGATGATTGAT > NC_007779/4502761‑4502960 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |