| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_007779 | 1,306,963 | C→T | 5.1% | P166S (CCG→TCG) | oppD → | oligopeptide transporter subunit |
| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_007779 | 1,306,963 | 0 | C→T | 5.1% | 29.1 ‑1.7 ‑0.1 | 293 | P166S (CCG→TCG) | oppD | oligopeptide transporter subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (5/10): ref base (148/130): total (153/140) | ||||||||||
| Fisher's exact test strand distribution p-value = 1.85e-01 | ||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 8.78e-01 | ||||||||||
Only 100 of 307 total aligned reads displayed.
GCTGCATAAGAACATGAGCAAAGCTGAGGCGTTTGAAGAGTCGGTGCGGATGCTCGATGCGGTAAAAATGCCGGAAGCGCGTAAACGCATGAAAATGTACCCGCACGAATTTTCTGGCGGCATGCGTCAGCGAGTCATGATTGCGATGGCCTTGTTATGTCGACCTAAGCTGCTGATTGCGGATGAACCAACAACTGCGCT > NC_007779/1306863‑1307063 | gctgcATAAGAACATGAGCAAAGCTGAGGCGTTTGAAGAGTCGGTGCGGATGCTCGATGCGGTAAAAATGCCGGAAGCGCGTAAACGCATGAAAATGTAcc < 1:10647049/101‑1 (MQ=255) ctgcATAAGAACATGAGCAAAGCTGAGGCGTTTGAAGAGTCGGTGCGGATGCTCGATGCGGTAAAAATGCCGGAAGCGCGTAAACGCATGAAAATGTAccc < 1:4899314/101‑1 (MQ=255) ctgcATAAGAACATGAGCAAAGCTGAGGCGTTTGAAGAGTCGGTGCGGATGCTCGATGCGGTAAAAATGCCGGAAGCGCGTAAACGCATGAAAATGTAccc < 1:6572436/101‑1 (MQ=255) tgcATAAGAACATGAGCAAAGCTGAGGCGTTTGAAGAGTCGGTGCGGATGCTCGATGCGGTAAAAATGCCGGAAGCGCGTAAACGCATGAAAATGTACCCg > 1:12380185/1‑101 (MQ=255) gcATAAGAACATGAGCAAAGCTGAGGCGTTTGAAGAGTCGGTGCGGATGCTCGATGCGGTAAAAATGCCGGAAGCGCGTAAACGCATGAAAATGTACCCGc < 1:7032386/101‑1 (MQ=255) gcATAAGAACATGAGCAAAGCTGAGGCGTTTGAAGAGTCGGTGCGGATGCTCGATGCGGTAAAAATGCCGGAAGCGCGTAAACGCATGAAAATGTACCCGc < 1:3004410/101‑1 (MQ=255) aTAAGAACATGAGCAAAGCTGAGGCGTTTGAAGAGTCGGTGCGGATGCTCGATGCGGTAAAAATGCCGGAAGCGCGTAAACGCATGAAAATGTACCCGCAc > 1:14651107/1‑101 (MQ=255) aaGAACATGAGCAAAGCTGAGGCGTTTGAAGAGTCGGTGCGGATGCTCGATGCGGTAAAAATGCCGGAAGCGCGTAAACGCATGAAAATGTACCCGCACGa > 1:2370958/1‑101 (MQ=255) aGAACATGAGCAAAGCTGAGGCGTTTGAAGAGTCGGTGCGGATGCTCGATGCGGTAAAAATGCCGGAAGCGCGTAAACGCATGAAAATGTACCCGCACGaa > 1:5254949/1‑101 (MQ=255) gAACATGAGCAAAGCTGAGGCGTTTGAAGAGTCGGTGCGGATGCTCGATGCGGTAAAAATGCCGGAAGCGCGTAAACGCATGAAAATGTACCCGCACGAAt > 1:10395560/1‑101 (MQ=255) aaCATGAGCAAAGCTGAGGCGTTTGAAGAGTCGGTGCGGATGCTCGATGCGGTAAAAATGCCGGAAGCGCGTAAACGCATGAAAATGTACTCGCACGAAtt < 1:10326254/101‑1 (MQ=255) aaCATGAGCAAAGCTGAGGCGTTTGAAGAGTCGGTGCGGATGCTCGATGCGGTAAAAATGCCGGAAGCGCGTAAACGCATGAAAATGTACCCGCACGAAtt < 1:13245843/101‑1 (MQ=255) aaCATGAGCAAAGCTGAGGCGTTTGAAGAGTCGGTGCGGATGCTCGATGCGGTAAAAATGCCGGAAGCGCGTAAACGCATGAAAATGTACCCGCACGAAtt < 1:2589789/101‑1 (MQ=255) aaCATGAGCAAAGCTGAGGCGTTTGAAGAGTCGGTGCGGATGCTCGATGCGGTAAAAATGCCGGAAGCGCGTAAACGCATGAAAATGTACCCGCACGAAtt > 1:4305296/1‑101 (MQ=255) aaCATGAGCAAAGCTGAGGCGTTTGAAGAGTCGGTGCGGATGCTCGATGCGGTAAAAATGCCGGAAGCGCGTAAACGCATGAAAATGTACCCGCACGAAtt > 1:7951709/1‑101 (MQ=255) cATGAGCAAAGCTGAGGCGTTTGAAGAGTCGGTGCGGATGCTCGATGCGGTAAAAACGCCGGAAGCGCGTAAACGCATGAAAATGTACCCGCACGAAtttt < 1:3675794/101‑1 (MQ=255) gAGCAAAGCTGAGGCGTTTGAAGAGTCGGTGCGGATGCTCGATGCGGTAAAAATGCCGGAAGCGCGTAAACGCATGAAAATGTACCCGCACGAATTTTCTg > 1:1901999/1‑101 (MQ=255) aGCAAAGCTGAGGCGTTTGAAGAGTCGGTGCGGATGCTCGATGCGGTAAAAATGCCGGAAGCGCGTAAACGCATGAAAATGTACCCGCACGAATTTTCTgg < 1:4477483/101‑1 (MQ=255) cAAAGCTGAGGCGTTTGAAGAGTCGGTGCGGATGCTCGATGCGGTAAAAATGCCGGAAGCGCGTAAACGCATGAAAATGTACCCGCACGAATTTTCTggcg > 1:495842/1‑101 (MQ=255) aaGCTGAGGCGTTTGAAGAGTCGGTGCGGATGCTCGATGCGGTAAAAATGCCGGAAGCGCGTAAACGCATGAAAATGTACCCGCACGAATTTTCTggcggc > 1:12990586/1‑101 (MQ=255) aGCTGAGGCGTTTGAAGAGTCGGTGCGGATGCTCGATGCGGTAAAAATGCCGGAAGCGCGTAAACGCATGAAAATGTACCCGCACGAATTTTCTGGCGGCa > 1:8984943/1‑101 (MQ=255) gCTGAGGCGTTTGAAGAGTCGGTGCGGATGCTCGATGCGGTAAAAATGTCGGAAGCGCGTAAACGCATGAAAATGTACCCGCACGAATTTTCTGGCGGCAt < 1:11318455/101‑1 (MQ=255) cTGAGGCGTTTGAAGAGTCGGTGCGGATGCTCGATGCGGTAAAAATGCCGGAAGCGCGTAAACGCATGAAAATGTACCCGCACGAATTTTCTGGCGGCATg > 1:6085088/1‑101 (MQ=255) tGAGGCGTTTGAAGAGTCGGTGCGGATGCTCGATGCGGTAAAAATGCCGGAAGCGCGTAAACGCATGAAAATGTACCCGCACGAATTTTCTGGCGGCATGc > 1:252645/1‑101 (MQ=255) tGAGGCGTTTGAAGAGTCGGTGCGGATGCTCGATGCGGTAAAAATGCCGGAAGCGCGTAAACGCATGAAAATGTACCCGCACGAATTTTCTGGCGGCATGc > 1:11073356/1‑101 (MQ=255) gAGGCGTTTGAAGAGTCGGTGCGGATGCTCGATGCGGTAAAAATGCCGGAAGCGCGTAAACGCATGAAAATGTACCCGCACGAATTTTCTGGCGGCATGCg > 1:1452005/1‑101 (MQ=255) aGGCGTTTGAAGAGTCGGTGCGGATGCTCGATGCGGTAAAAATGCCGGAAGCGCGTAAACGCATGAAAATGTACCCGCACGAATTTTCTGGCGGCATGCGt > 1:9643935/1‑101 (MQ=255) gTTTGAAGAGTCGGTGCGGATGCTCGATGCGGTAAAAATGCCGGAAGCGCGTAAACGCATGAAAATGTACCCGCACGAATTTTCTGGCGGCATGCGTCAGc > 1:13639948/1‑101 (MQ=255) gTTTGAAGAGTCGGTGCGGATGCTCGATGCGGTAAAAATGCCGGAAGCGCGTAAACGCATGAAAATGTACCCGCACGAATTTTCTGGCGGCATGCGTCAGc > 1:7215522/1‑101 (MQ=255) tttGAAGAGTCGGTGCGGATGCTCGATGCGGTAAAAATGCCGGAAGCGCGTAAACGCATGAAAATGTACCCGCACGAATTTTCTGGCGGCATGCGTCAGCg > 1:12633267/1‑101 (MQ=255) ttGAAGAGTCGGTGCGGATGCTCGATGCGGTAAAAATGCCGGAAGCGCGTAAACGCATGAAAATGTACCCGCACGAATTTTCTGGCGGCATGCGTCAGCGa < 1:207346/101‑1 (MQ=255) gagTCGGTGCGGATGCTCGATGCGGTAAAATTGCCGGAAGCGCGTAAACGCATGAAAATGTACCCGCACGAATTTTCTGGCGGCATGCGTCAGCGAGTCAt < 1:8746683/101‑1 (MQ=255) gagTCGGTGCGGATGCTCGATGCGGTAAAAATGCCGGAAGCGCGTAAACGCATGAAAATGTACCCGCACGAATTTTCTGGCGGCATGCGTCAGCGAGTCAt < 1:1574746/101‑1 (MQ=255) gTCGGTGCGGATGCTCGATGCGGTAAAAATGCCGGAAGCGCGTAAACGCATGAAAATGTACCCGCACGAATTTTCTGGCGGCATGCGTCAGTGAGTCATGa < 1:3753194/101‑1 (MQ=255) gTCGGTGCGGATGCTCGATGCGGTAAAAATGCCGGAAGCGCGTAAACGCATGAAAATGTACCCGCACGAATTTTCTGGCGGCATGCGTCAGCGAGTCATGa > 1:2860755/1‑101 (MQ=255) cGGTGCGGATGCTCGATGCGGTAAAAATGCCGGAAGCGCGTAAACGCATGAAAATGTACCCGCACGAATTTTCTGGCGGCATGCGTCAGCGAGTCATGAtt < 1:3336832/101‑1 (MQ=255) cGGTGCGGATGCTCGATGCGGTAAAAATGCCGGAAGCGCGTAAACGCATGAAAATGTACCCGCACGAATTTTCTGGCGGCATGCGTCAGCGAGTCATGAtt < 1:6291628/101‑1 (MQ=255) cGGTGCGGATGCTCGATGCGGTAAAAATGCCGGAAGCGCGTAAACGCATGAAAATGTACCCGCACGAATTTTCTGGCGGCATGCGTCAGCGAGTCATGAtt > 1:86738/1‑101 (MQ=255) tGCGGATGCTCGATGCGGTAAAAATGCCGGAAGCGCGTAAACGCATGAAAATGTACCCGCACGAATTTTCTGGCGGCATGCGTCAGCGAGTCATGATTGCg < 1:11962344/101‑1 (MQ=255) tGCGGATGCTCGATGCGGTAAAAATGCCGGAAGCGCGTAAACGCATGAAAATGTACCCGCACGAATTTTCTGGCGGCATGCGTCAGCGAGTCATGATTGCg > 1:14082785/1‑101 (MQ=255) gCGGATGCTCGATGCGGTAAAAATGCCGGAAGCGCGTAAACGCATGAAAATGTACCCGCACGAATTTTCTGGCGGCATGCGTCAGCGAGTCATGATTGCGa > 1:400262/1‑101 (MQ=255) cGGATGCTCGATGCGGTAAAAATGCCGGAAGCGCGTAAACGCATGAAAATGTACTCGCACGAATTTTCTGGCGGCATGCGTCAGCGAGTCATGATTGCGAt < 1:9018091/101‑1 (MQ=255) cGGATGCTCGATGCGGTAAAAATGCCGGAAGCGCGTAAACGCATGAAAATGTACCCGCACGAATTTTCTGGCGGCATGCGTCAGCGAGTCATGATTGCGAt < 1:1350200/101‑1 (MQ=255) cGGATGCTCGATGCGGTAAAAATGCCGGAAGCGCGTAAACGCATGAAAATGTACCCGCACGAATTTTCTGGCGGCATGCGTCAGCGAGTCATGATTGCGAt > 1:11274487/1‑101 (MQ=255) gATGCTCGATGCGGTAAAAATGCCGGAAGCGCGTAAACGCATGAAAATGTACCCGCACGAATTTTCTGGCGGCATGCGTCAGCGAGTCATGATTGCGATgg < 1:13587449/101‑1 (MQ=255) aTGCTCGATGCGGTAAAAATGCCGGAAGCGCGTAAACGCATGAAAATGTACCCGCACGAATTTTCTGGCGGCATGCGTCAGCGAGTCATGATTGCGATGGc > 1:2266163/1‑101 (MQ=255) aTGCTCGATGCGGTAAAAATGCCGGAAGCGCGTAAACGCATGAAAATGTACCCGCACGAATTTTCTGGCGGCATGCGTCAGCGAGTCATGATTGCGATGGc > 1:7734767/1‑101 (MQ=255) tGCTCGATGCGGTAAAAATGCCGGAAGCGCGTAAACGCATGAAAATGTACCCGCACGAATTTTCTGGCGGCATGCGTCAGCGAGTCATGATTGCGATGGcc > 1:10883744/1‑101 (MQ=255) gCTCGATGCGGTAAAAATGCCGGAAGCGCGTAAACGCATGAAAATGTACCCGCACGAATTTTCTGGCGGCATGCGTCAGCGAGTCATGATTGCGATGGCCt < 1:9469508/101‑1 (MQ=255) gCTCGATGCGGTAAAAATGCCGGAAGCGCGTAAACGCATGAAAATGTACCCGCACGAATTTTCTGGCGGCATGCGTCAGCGAGTCATGATTGCGATGGCCt > 1:7815099/1‑101 (MQ=255) cTCGATGCGGTAAAAATGCCGGAAGCGCGTAAACGCATGAAAATGTACTCGCACGAATTTTCTGGCGGCATGCGTCAGCGAGTCATGATTGCGATGGCCtt < 1:8339915/101‑1 (MQ=255) cTCGATGCGGTAAAAATGCCGGAAGCGCGTAAACGCATGAAAATGTACTCGCACGAATTTTCTGGCGGCATGCGTCAGCGAGTCATGATTGCGATGGCCtt < 1:845564/101‑1 (MQ=255) tCGATGCGGTAAAAATGCCGGAAGCGCGTAAACGCATGAAAATGTACCCGCACGAATTTTCTGGCGGCATGCGTCAGCGAGTCATGATTGCGATGGCCTTg < 1:7157529/101‑1 (MQ=255) cGATGCGGTAAAAATGCCGGAAGCGCGTAAACGCATGAAAATGTACCCGCACGAATTTTCTGGCGGCATGCGTCAGCGAGTCATGATTGCGATGGCCTTGt > 1:14228389/1‑101 (MQ=255) aTGCGGTAAAAATGCCGGAAGCGCGTAAACGCATGAAAATGTACCCGCACGAATTTTCTGGCGGCATGCGTCAGCGAGTCATGATTGCGATGGCCTTGTTa < 1:5051198/101‑1 (MQ=255) tGCGGTAAAAATGCCGGAAGCGCGTAAACGCATGAAAATGTACCCGCACGAATTTTCTGGCGGCATGCGTCAGCGAGTCATGATTGCGATGGCCTTGTTAt > 1:9232304/1‑101 (MQ=255) gCGGTAAAAATGCCGGAAGCGCGTAAACGCATGAAAATGTACCCGCACGAATTTTCTGGCGGCATGCGTCAGCGAGTCATGATTGCGATGGCCTTGTTATg > 1:10348980/1‑101 (MQ=255) gCGGTAAAAATGCCGGAAGCGCGTAAACGCATGAAAATGTACCCGCACGAATTTTCTGGCGGCATGCGTCAGCGAGTCATGATTGCGATGGCCTTGTTATg < 1:10219913/101‑1 (MQ=255) cGGTAAAAATGCCGGAAGCGCGTAAACGCATGAAAATGTACCCGCACGAATTTTCTGGCGGCATGCGTCAGCGAGTCATGATTGCGATGGCCTTGTTATGt > 1:4793481/1‑101 (MQ=255) ggTAAAAATGCCGGAAGCGCGTAAACGCATGAAAATGTACCCGCACGAATTTTCTGGCGGCATGCGTCAGCGAGTCATGATTGCGATGGCCTTGTTATGTc < 1:740264/101‑1 (MQ=255) ggTAAAAATGCCGGAAGCGCGTAAACGCATGAAAATGTACCCGCACGAATTTTCTGGCGGCATGCGTCAGCGAGTCATGATTGCGATGGCCTTGTTATGTc < 1:10565242/101‑1 (MQ=255) aaaTGCCGGAAGCGCGTAAACGCATGAAAATGTACCCGCACGAATTTTCTGGCGGCATGCGTCAGCGAGTCATGATTGCGATGGCCTTGTTATGTCGACCt > 1:572790/1‑101 (MQ=255) aaaTGCCGGAAGCGCGTAAACGCATGAAAATGTACCCGCACGAATTTTCTGGCGGCATGCGTCAGCGAGTCATGATTGCGATGGCCTTGTTATGTCGACCt < 1:6661636/101‑1 (MQ=255) aaTGCCGGAAGCGCGTAAACGCATGAAAATGTACCCGCACGAATTTTCTGGCGGCATGCGTCAGCGAGTCATGATTGCGATGGCCTTGTTATGTCGACCTa < 1:10000526/101‑1 (MQ=255) aTGCCGGAAGCGCGTAAACGCATGAAAATGTACCCGCACGAATTTTCTGGCGGCATGCGTCAGCGAGTCATGATTGCGATGGCCTTGTTATGTCGACCTaa < 1:13729684/101‑1 (MQ=255) aTGCCGGAAGCGCGTAAACGCATGAAAATGTACCCGCACGAATTTTCTGGCGGCATGCGTCAGCGAGTCATGATTGCGATGGCCTTGTTATGTCGACCTaa < 1:10949587/101‑1 (MQ=255) gCCGGAAGCGCGTAAACGCATGAAAATGTACCCGCACGAATTTTCTGGCGGCATGCGTCAGCGAGTCATGATTGCGATGGCCTTGTTATGTCGACCTAAgc < 1:9139680/101‑1 (MQ=255) ccGGAAGCGCGTAAACGCATGAAAATGTACCCGCACGAATTTTCTGGCGGCATGCGTCAGCGAGTCATGATTGCGATGGCCTTGTTATGTCGACCTAAgct > 1:11124669/1‑101 (MQ=255) ccGGAAGCGCGTAAACGCATGAAAATGTACCCGCACGAATTTTCTGGCGGCATGCGTCAGCGAGTCATGATTGCGATGGCCTTGTTATGTCGACCTAAgct < 1:10792206/101‑1 (MQ=255) cGGAAGCGCGTAAACGCATGAAAATGTACCCGCACGAATTTTCTGGCGGCATGCGTCAGCGAGTCATGATTGCGATGGCCTTGTTATGTCGACCTAAgctg < 1:9825445/101‑1 (MQ=255) gAAGCGCGTAAACGCATGAAAATGTACCCGCACGAATTTTCTGGCGGCATGCGTCAGCGAGTCATGATTGCGATGGCCTTGTTATGTCGACCTAAgctgct < 1:3898143/101‑1 (MQ=255) aGCGCGTAAACGCATGAAAATGTACCCGCACGAATTTTCTGGCGGCATGCGTCAGCGAGTCATGATTGCGATGGCCTTGTTATGTCGACCTAAGCTGCTGa > 1:11814993/1‑101 (MQ=255) gcgcGTAAACGCATGAAAATGTACCCGCACGAATTTTCTGGCGGCATGCGTCAGCGAGTCATGATTGCGATGGCCTTGTTATGTCGACCTAAGCTGCTGAt > 1:13021733/1‑101 (MQ=255) gcgTAAACGCATGAAAATGTACCCGCACGAATTTTCTGGCGGCATGCGTCAGCGAGTCATGATTGCGATGGCCTTGTTATGTCGACCTAAGCTGCTGATTg > 1:1719577/1‑101 (MQ=255) gcgTAAACGCATGAAAATGTACCCGCACGAATTTTCTGGCGGCATGCGTCAGCGAGTCATGATTGCGATGGCCTTGTTATGTCGACCTAAGCTGCTGATTg > 1:9708203/1‑101 (MQ=255) cgTAAACGCATGAAAATGTACCCGCACGAATTTTCTGGCGGCATGCGTCAGCGAGTCATGATTGCGATGGCCTTGTTATGTCGACCTAAGCTGCTGATTGc < 1:11184786/101‑1 (MQ=255) gTAAACGCATGAAAATGTACCCGCACGAATTTTCTGGCGGCATGCGTCAGCGAGTCATGATTGCGATGGCCTTGTTATGTCGACCTAAGCTGCTGATTGCg < 1:6743915/101‑1 (MQ=255) tAAACGCATGAAAATGTACCCGCACGAATTTTCTGGCGGCATGCGTCAGCGAGTCATGATTGCGATGGCCTTGTTATGTCGACCTAAGCTGCTGATTGCgg > 1:6655284/1‑101 (MQ=255) tAAACGCATGAAAATGTACCCGCACGAATTTTCTGGCGGCATGCGTCAGCGAGTCATGATTGCGATGGCCTTGTTATGTCGACCTAAGCTGCTGATTGCgg > 1:6401885/1‑101 (MQ=255) tAAACGCATGAAAATGTACCCGCACGAATTTTCTGGCGGCATGCGTCAGCGAGTCATGATTGCGATGGCCTTGTTATGTCGACCTAAGCTGCTGATTGCgg > 1:12175264/1‑101 (MQ=255) aaaCGCATGAAAATGTACCCGCACGAATTTTCTGGCGGCATGCGTCAGCGAGTCATGATTGCGATGGCCTTGTTATGTCGACCTAAGCTGCTGATTGCGGa > 1:972207/1‑101 (MQ=255) aaCGCATGAAAATGTACCCGCACGAATTTTCTGGCGGCATGCGTCAGCGAGTCATGATTGCGATGGCCTTGTTATGTCGACCTAAGCTGCTGATTGCGGAt < 1:5562121/101‑1 (MQ=255) aaCGCATGAAAATGTACCCGCACGAATTTTCTGGCGGCATGCGTCAGCGAGTCATGATTGCGATGGCCTTGTTATGTCGACCTAAGCTGCTGATTGCGGAt > 1:13061923/1‑101 (MQ=255) aCGCATGAAAATGTACCCGCACGAATTTTCTGGCGGCATGCGTCAGCGAGTCATGATTGCGATGGCCTTGTTATGTCGACCTAAGCTGCTGATTGCGGATg > 1:12707347/1‑101 (MQ=255) aCGCATGAAAATGTACCCGCACGAATTTTCTGGCGGCATGCGTCAGCGAGTCATGATTGCGATGGCCTTGTTATGTCGACCTAAGCTGCTGATTGCGGATg > 1:3166697/1‑101 (MQ=255) cGCATGAAAATGTACCCGCACGAATTTTCTGGCGGCATGCGTCAGCGAGTCATGATTGCGATGGCCTTGTTATGTCGACCTAAGCTGCTGATTGCGGATGa > 1:4994262/1‑101 (MQ=255) cGCATGAAAATGTACCCGCACGAATTTTCTGGCGGCATGCGTCAGCGAGTCATGATTGCGATGGCCTTGTTATGTCGACCTAAGCTGCTGATTGCGGATGa > 1:13870809/1‑101 (MQ=255) tGAAAATGTACCCGCACGAATTTTCTGGCGGCATGCGTCAGCGAGTCATGATTGCGATGGCCTTGTTATGTCGACCTAAGCTGCTGATTGCGGATGAACca < 1:2684934/101‑1 (MQ=255) gAAAATGTACTCGCACGAATTTTCTGGCGGCATGCGTCAGCGAGTCATGATTGCGATGGCCTTGTTATGTCGACCTAAGCTGCTGATTGCGGATGAACcaa > 1:4890803/1‑101 (MQ=255) aaaaTGTACCCGCACGAATTTTCTGGCGGCATGCGTCAGCGAGTCATGATTGCGATGGCCTTGTTATGTCGACCTAAGCTGCTGATTGCGGATGAACcaac > 1:2820860/1‑101 (MQ=255) aaaaTGTACCCGCACGAATTTTCTGGCGGCATGCGTCAGCGAGTCATGATTGCGATGGCCTTGTTATGTCGACCTAAGCTGCTGATTGCGGATGAACcaac > 1:7561716/1‑101 (MQ=255) aaaTGTACTCGCACGAATTTTCTGGCGGCATGCGTCAGCGAGTCATGATTGCGATGGCCTTGTTATGTCGACCTAAGCTGCTGATTGCGGATGAACcaaca > 1:3594829/1‑101 (MQ=255) aTGTACCCGCACGAATTTTCTGGCGGCATGCGTCAGCGAGTCATGATTGCGATGGCCTTGTTATGTCGACCTAAGCTGCTGATTGCGGATGAACCaacaac < 1:5415738/101‑1 (MQ=255) tGTACCCGCACGAATTTTCTGGCGGCATGCGTCAGCGAGTCATGATTGCGATGGCCTTGTTATGTCGACCTAAGCTGCTGATTGCGGATGAACCAACAACt < 1:12897504/101‑1 (MQ=255) tGTACCCGCACGAATTTTCTGGCGGCATGCGTCAGCGAGTCATGATTGCGATGGCCTTGTTATGTCGACCTAAGCTGCTGATTGCGGATGAACCAACAACt > 1:3823461/1‑101 (MQ=255) tGTACCCGCACGAATTTTCTGGCGGCATGCGTCAGCGAGTCATGATTGCGATGGCCTTGTTATGTCGACCTAAGCTGCTGATTGCGGATGAACCAACAACt < 1:4614245/101‑1 (MQ=255) aCCCGCACGAATTTTCTGGCGGCATGCGTCAGCGAGTCATGATTGCGATGGCCTTGTTATGTCGACCTAAGCTGCTGATTGCGGATGAACCAACAACTgcg < 1:8910867/101‑1 (MQ=255) aCCCGCACGAATTTTCTGGCGGCATGCGTCAGCGAGTCATGATTGCGATGGCCTTGTTATGTCGACCTAAGCTGCTGATTGCGGATGAACCAACAACTgcg > 1:12290717/1‑101 (MQ=255) aCCCGCACGAATTTTCTGGCGGCATGCGTCAGCGAGTCATGATTGCGATGGCCTTGTTATGTCGACCTAAGCTGCTGATTGCGGATGAACCAACAACTgcg > 1:5951928/1‑101 (MQ=255) ccGCACGAATTTTCTGGCGGCATGCGTCAGCGAGTCATGATTGCGATGGCCTTGTTATGTCGACCTAAGCTGCTGATTGCGGATGAACCAACAACTGCGCt < 1:3556470/101‑1 (MQ=255) | GCTGCATAAGAACATGAGCAAAGCTGAGGCGTTTGAAGAGTCGGTGCGGATGCTCGATGCGGTAAAAATGCCGGAAGCGCGTAAACGCATGAAAATGTACCCGCACGAATTTTCTGGCGGCATGCGTCAGCGAGTCATGATTGCGATGGCCTTGTTATGTCGACCTAAGCTGCTGATTGCGGATGAACCAACAACTGCGCT > NC_007779/1306863‑1307063 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |