| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_007779 | 3,450,056 | C→A | 22.3% | A426S (GCA→TCA) | rpoC ← | RNA polymerase, beta prime subunit |
| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_007779 | 3,450,056 | 0 | C→A | 22.3% | 247.3 ‑0.1 ‑0.1 | 363 | A426S (GCA→TCA) | rpoC | RNA polymerase, beta prime subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (42/39): ref base (150/132): total (192/171) | ||||||||||
| Fisher's exact test strand distribution p-value = 9.00e-01 | ||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 8.89e-01 | ||||||||||
Only 100 of 367 total aligned reads displayed.
GCGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAACGACAGCTTCTTCGCGCTCAACCATTTTCTTCGCAGCTTTAATGGTG > NC_007779/3449956‑3450156 | cGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCa > 1:4746718/1‑101 (MQ=255) cGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCa > 1:1113356/1‑101 (MQ=255) gTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTCCCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATTCCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCAc < 1:6576155/101‑1 (MQ=255) gTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCAc < 1:6801218/101‑1 (MQ=255) ttATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACg < 1:10126037/101‑1 (MQ=255) ttATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGAACg > 1:7028907/1‑101 (MQ=255) atatGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGt < 1:8133326/101‑1 (MQ=255) tatGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGtt < 1:10864420/101‑1 (MQ=255) tatGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGtt > 1:10729059/1‑101 (MQ=255) tGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTca < 1:9220044/101‑1 (MQ=255) gCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTcag > 1:10519647/1‑101 (MQ=255) cGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTcagca < 1:9163450/101‑1 (MQ=255) gCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGCGCAGAGTCGGTGCACGGTTcagcag > 1:5403993/1‑101 (MQ=255) cacaAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGt > 1:12954426/1‑101 (MQ=255) cacaAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGt > 1:13794180/1‑101 (MQ=255) acaAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTa < 1:13904459/101‑1 (MQ=255) acaAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTa > 1:13228360/1‑101 (MQ=255) acaAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTa < 1:5906709/101‑1 (MQ=255) caAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTAc < 1:695245/101‑1 (MQ=255) aaaCCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTAcc < 1:1105019/101‑1 (MQ=255) aaaCCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGAACGGTTCAGCAGTAcc < 1:7411557/101‑1 (MQ=255) ccAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCggg < 1:11926033/101‑1 (MQ=255) cAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGgt > 1:4377798/1‑101 (MQ=255) aGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGgtg > 1:172979/1‑101 (MQ=255) cGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGtt > 1:3576643/1‑101 (MQ=255) gggTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTc > 1:777397/1‑101 (MQ=255) gggTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGAACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTc > 1:13152709/1‑101 (MQ=255) gTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTcgc > 1:10595252/1‑101 (MQ=255) gCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCgg > 1:5733952/1‑101 (MQ=255) aGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGAACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGAt > 1:11285873/1‑101 (MQ=255) gCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATa < 1:4627218/101‑1 (MQ=255) gCTGGATAGCTATACCTTCGATCAGGACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATa < 1:2624144/101‑1 (MQ=255) cTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATaa > 1:10191927/1‑101 (MQ=255) tGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAAc > 1:5786675/1‑101 (MQ=255) tGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAAc > 1:7188188/1‑101 (MQ=255) ggATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGAACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACt > 1:2571786/1‑101 (MQ=255) gATAGCTTTTCCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACtt < 1:13055562/101‑1 (MQ=255) aTAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTc < 1:11834384/101‑1 (MQ=255) tAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCg > 1:2696737/1‑101 (MQ=255) aGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGt > 1:5616749/1‑101 (MQ=255) aGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGt > 1:2491434/1‑101 (MQ=255) gCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGAACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTc > 1:7263590/1‑101 (MQ=255) gCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGAACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTc < 1:8840256/101‑1 (MQ=255) gCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCACACGGCGCAGAGTCGGTGAACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTc > 1:6185263/1‑101 (MQ=255) cTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTcc < 1:3743746/101‑1 (MQ=255) tACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAgg > 1:4566725/1‑101 (MQ=255) tACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAgg > 1:10298692/1‑101 (MQ=255) tACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAgg > 1:12637580/1‑101 (MQ=255) tACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTATTCGCGGATAACTTCGTCCAgg < 1:9940041/101‑1 (MQ=255) aCCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGa > 1:6671985/1‑101 (MQ=255) ttCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGAACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGatat > 1:12777530/1‑101 (MQ=255) tCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGAACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATc > 1:9571150/1‑101 (MQ=255) cGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGAACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATcc < 1:9707214/101‑1 (MQ=255) aTCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCa < 1:3810748/101‑1 (MQ=255) tCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCaa < 1:14217347/101‑1 (MQ=255) cAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCaaa > 1:8536345/1‑101 (MQ=255) aGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAAc < 1:1657612/101‑1 (MQ=255) aGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAAc < 1:12209727/101‑1 (MQ=255) aGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAAc > 1:3069186/1‑101 (MQ=255) aGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGAACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAAc < 1:9436607/101‑1 (MQ=255) gTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGAACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAACg > 1:2345915/1‑101 (MQ=255) tACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAACGa > 1:4237776/1‑101 (MQ=255) tACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAACGa > 1:8400812/1‑101 (MQ=255) aCCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAACGAc > 1:1950557/1‑101 (MQ=255) aCCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAACGAc > 1:1490874/1‑101 (MQ=255) ccGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAACGACa < 1:301795/101‑1 (MQ=255) ggTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGAACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAACGACAGc < 1:10433525/101‑1 (MQ=255) cAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAACGACAGcttct < 1:60965/101‑1 (MQ=255) cAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAACGACAGcttct < 1:3644543/101‑1 (MQ=255) aTGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAACGACAGCTTCTTcg < 1:5286906/101‑1 (MQ=255) aTGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAACGACAGCTTCTTcg < 1:2893525/101‑1 (MQ=255) tGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAACGACAGCTTCTTcgc < 1:3402915/101‑1 (MQ=255) tGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGAACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAACGACAGCTTCTTcgc < 1:14083874/101‑1 (MQ=255) ccTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAACGACAGCTTCTTCgcgc > 1:7888641/1‑101 (MQ=255) ccTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGAACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAACGACAGCTTCTTCgcgc < 1:4046199/101‑1 (MQ=255) cTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAACGACAGCTTCTTCGCGCt > 1:14434777/1‑101 (MQ=255) tGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAACCGACAGCTTCTTCGCGCTc < 1:8948134/101‑1 (MQ=255) tGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGAACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAACGACAGCTTCTTCGCGCTc < 1:7270630/101‑1 (MQ=255) tGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGAACGGTTCAGCACTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAACGACAGCTTCTTCGCGCTc < 1:12407692/101‑1 (MQ=255) ggATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAACGACAGCTTCTTCGCGCTCa < 1:11583407/101‑1 (MQ=255) gATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAACGACAGCTTCTTCGCGCTCaa < 1:14159637/101‑1 (MQ=255) tACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAACGACAGCTTCTTCGCGCTCAAcc < 1:7684328/101‑1 (MQ=255) cccAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAACGACAGCTTCTTCGCGCTCAACCAt > 1:4016764/1‑101 (MQ=255) ccAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAACGACAGCTTCTTCGCGCTCAACCAtt > 1:4802542/1‑101 (MQ=255) ccAGACGGTGCAGAGTCGGTGAACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAACGACAGCTTCTTCGCGCTCAACCAtt < 1:10005442/101‑1 (MQ=255) ccAGACGGTGCAGAGTCGGTGAACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAACGACAGCTTCTTCGCGCTCAACCAtt < 1:6409129/101‑1 (MQ=255) cAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAACGACAGCTTCTTCGCGCTCAACCAttt < 1:14369553/101‑1 (MQ=255) aGACGGTGCAGAGTCGGTGAACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAACGACAGCTTCTTCGCGCTCAACCAtttt > 1:1860296/1‑101 (MQ=255) cGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAACGACAGCTTCTTCGCGCTCAACCATTttctt > 1:3297327/1‑101 (MQ=255) ggTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAACGACAGCTTCTTCGCGCTCAACCATTttcttc < 1:826101/101‑1 (MQ=255) tGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAACGACAGCTTCTTCGCGCTCAACCATTTTCTTCGc < 1:7471250/101‑1 (MQ=255) gCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAACGACAGCTTCTTCGCGCTCAACCATTTTCTTCGCa < 1:5056476/101‑1 (MQ=255) agagTCGGTGAACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAACGACAGCTTCTTCGCGCTCAACCATTTTCTTCGCAGc > 1:11967136/1‑101 (MQ=255) gagTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAACGACAGCTTCTTCGCGCTCAACCATTTTCTTCGCAGCt < 1:9298150/101‑1 (MQ=255) gagTCGGTGAACGGTTCAGCAGTACCAGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAACGACAGCTTCTTCGCGCTCAACCATTTTCTTCGCAGCt < 1:7972271/101‑1 (MQ=255) agTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAACGACAGCTTCTTCGCGCTCAACCATTTTCTTCGCAGCtt < 1:13600237/101‑1 (MQ=255) cGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAACGACAGCTTCTTCGCGCTCAACCATTTTCTTCGCAGCTTTaa > 1:1246144/1‑101 (MQ=255) gTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAACGACAGCTTCTTCGCGCTCAACCATTTTCTTCGCAGCTTTAAtg > 1:10376937/1‑101 (MQ=255) gTGAACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAACGACAGCTTCTTCGCGCTCAACCATTTTCTTCGCAGCTTTAAtg < 1:1337915/101‑1 (MQ=255) gCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAACGACAGCTTCTTCGCGCTCAACCATTTTCTTCGCAGCTTTAAtggt < 1:9827813/101‑1 (MQ=255) | GCGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAACGACAGCTTCTTCGCGCTCAACCATTTTCTTCGCAGCTTTAATGGTG > NC_007779/3449956‑3450156 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |