| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_007779 | = 2322124 | NA (NA) | 327 (1.130) | 156/180 | NT | 100% | intergenic (‑91/‑2589) | insC/atoS | IS2 element protein/sensory histidine kinase in two‑component regulatory system with AtoC |
| ? | NC_007779 | 2589830 = | 0 (0.000) | intergenic (+466/‑73) | acrD/yffB | aminoglycoside/multidrug efflux system/hypothetical protein | |||||
Only 100 of 443 total aligned reads displayed.
ATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_007779/2322025‑2322124‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ATAATCATTTGCAGGCAAAATGTTTTCACCCTTAAATGAGTATTTATTCTCATAAATCGAAAAAGGATTCATTATGGTTACACTTTACGGTATCAAAAA > NC_007779/2589830‑2589928 ATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAA > 1:631806/1‑101ATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAA < 1:14496785/101‑1 TCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAAT > 1:12078605/1‑101 TCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAAT < 1:6610576/101‑1 CAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATA > 1:13576866/1‑101 CAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATA > 1:10525229/1‑101 CAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATA < 1:8893894/101‑1 AATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATAA < 1:13504309/101‑1 AATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGACAGTCTAATtc > 1:9623884/1‑99 AATCATCTGTCCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATT‑AGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATtct < 1:8022281/101‑4 CATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATAATtt < 1:4253421/101‑3 CATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATAATCA < 1:4586901/101‑1 ATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATAATCAT > 1:6818949/1‑101 TCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATAATttac < 1:5511092/101‑5 TCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATAATCATT < 1:6949926/101‑1 CTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATAATCATTT < 1:5338700/101‑1 TGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATtcttatgtt < 1:12295757/101‑10 GTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATAATttactgc < 1:4706275/101‑8 TTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATAATttactgca > 1:1256640/1‑93 TTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATAATttactgca < 1:707561/101‑9 TTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATAATCATTTGCA > 1:6660735/1‑101 TCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATAATttactgcat < 1:8327531/101‑10 CTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATAATttactgcatc > 1:3427298/1‑91 CTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATAATttactgcatc < 1:12650987/101‑11 CTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATAATCATTTGCAGG < 1:260024/101‑1 CAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATAATCATTTGCAGGCAA < 1:12942513/101‑1 AATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATAATCATTTGCAGGCAAA < 1:10778326/101‑1 AATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATAATCATTTGCAGGCAAA > 1:14300686/1‑101 TGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATAATCATTTGCAGGCAAAAT < 1:13167021/101‑1 TGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATAATCATTTGCAGGCAAAAT > 1:3141274/1‑101 TGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATAATCATTTGCAGGCAAAAT < 1:13813121/101‑1 GACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATAATCATTTGCAGGCAAAATG > 1:8434392/1‑101 GACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATAATCATTTGCAGGCAAAATG < 1:6239292/101‑1 CTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATAATCATTTGCAGGCAAAATGTT < 1:7852563/101‑1 AGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATAATCATTTGCAGGCAAAATGTTTT < 1:14391666/101‑1 AGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGACCAGTCTAATAATCATTTGCAGGCAAAATGTTTT < 1:14118313/101‑1 TCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATAATCATTTGCAGGCAAAATGTTTTCA < 1:466612/101‑1 CTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATAATCATTTGCAGGCAAAATGTTTTCAC > 1:3997673/1‑101 AAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATAATCATTTGCAGGCAAAATGTTTTCACCC < 1:700938/101‑1 AACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATAATCATTTGCAGGCAAAATGTTTTCACCCTTA > 1:10712986/1‑101 AACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATAATCATTTGCAGGCAAAATGTTTTCACCCTTA < 1:5717774/101‑1 CTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATAATCATTTGCAGGCAAAATGTTTTCACCCTTAAA > 1:13713828/1‑101 TAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATAATCATTTGCAGGCAAAATGTTTTCACCCTTAAAT > 1:14212818/1‑101 GTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATAATCATTTGCAGGCAAAATGTTTTCACCCTTAAATGA > 1:12753662/1‑101 TATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATAATCATTTGCAGGCAAAATGTTTTCACCCTTAAATGAG > 1:12833578/1‑101 ATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATAATCATTTGCAGGCAAAATGTTTTCACCCTTAAATGAGT < 1:11848515/101‑1 ATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATAATCATTTGCAGGCAAAATGTTTTCACCCTTAAATGAGT > 1:6041506/1‑101 ATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATAATCATTTGCAGGCAAAATGTTTTCACCCTTAAATGAGT < 1:9444646/101‑1 TTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATAATCATTTGCAGGCAAAATGTTTTCACCCTTAAATGAGTA < 1:1989228/101‑1 TTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATAATCATTTGCAGGCAAAATGTTTTCACCCTTAAATGAGTA > 1:10864467/1‑101 CTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATAATCATTTGCAGGCAAAATGTTTTCACCCTTAAATGAGTATTTATT > 1:718949/1‑101 TATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATAATCATTTGCAGGCAAAATGTTTTCACCCTTAAATGAGTATTTATTC > 1:3808538/1‑101 ATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATAATCATTTGCAGGCAAAATGTTTTCACCCTTAAATGAGTATTTATTCT > 1:7629465/1‑101 TCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATAATCATTTGCAGGCAAAATGTTTTCACCCTTAAATGAGTATTTATTCTC < 1:11389892/101‑1 TCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATAATCATTTGCAGGCAAAATGTTTTCACCCTTAAATGAGTATTTATTCTC < 1:8600616/101‑1 CACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATAATCATTTGCAGGCAAAATGTTTTCACCCTTAAATGAGTATTTATTCTCA > 1:5220972/1‑101 ACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATAATCATTTGCAGGCAAAATGTTTTCACCCTTAAATGAGTATTTATTCTCAT < 1:1638814/101‑1 CTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATAATCATTTGCAGGCAAAATGTTTTCACCCTTAAATGAGTATTTATTCTCATA < 1:6485692/101‑1 CTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATAATCATTTGCAGGCAAAATGTTTTCACCCTTAAATGAGTATTTATTCTCATA < 1:3595096/101‑1 TTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATAATCATTTGCAGGCAAAATGTTTTCACCCTTAAATGAGTATTTATTCTCATAA < 1:4461114/101‑1 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AAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATAATCATTTGCAGGCAAAATGTTTTCACCCTTAAATGAGTATTTATTCTCATAAATCGAA < 1:13259137/101‑1 GATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATAATCATTTGCAGGCAAAATGTTTTCACCCTTAAATGAGTATTTATTCTCATAAATCGAAAAAG < 1:2286356/101‑1 GATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATAATCATTTGCAGGCAAAATGTTTTCACCCTTAAATGAGTATTTATTCTCATAAATCGAAAAAG > 1:3054146/1‑101 ATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATAATCATTTGCAGGCAAAATGTTTTCACCCTTAAATGAGTATTTATTCTCATAAATCGAAAAAGG > 1:7384214/1‑101 ATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATAATCATTTGCAGGCAAAATGTTTTCACCCTTAAATGAGTATTTATTCTCATAAATCGAAAAAGG < 1:2126076/101‑1 ATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATAATCATTTGCAGGCAAAATGTTTTCACCCTTAAATGAGTATTTATTCTCATAAATCGAAAAAGG > 1:1855879/1‑101 ATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATAATCATTTGCAGGCAAAATGTTTTCACCCTTAAATGAGTATTTATTCTCATAAATCGAAAAAGG > 1:9361828/1‑101 TATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATAATCATTTGCAGGCAAAATGTTTTCACCCTTAAATGAGTATTTATTCTCATAAATCGAAAAAGGA > 1:10159320/1‑101 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ATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_007779/2322025‑2322124‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ATAATCATTTGCAGGCAAAATGTTTTCACCCTTAAATGAGTATTTATTCTCATAAATCGAAAAAGGATTCATTATGGTTACACTTTACGGTATCAAAAA > NC_007779/2589830‑2589928 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |