| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_007779 | = 3744263 | NA (NA) | 255 (0.880) | 130/180 | NT | 99.6% | intergenic (‑91/+30) | insC/yidZ | IS2 element protein/DNA‑binding transcriptional regulator |
| ? | NC_007779 | 3903274 = | 1 (0.000) | coding (37/825 nt) | bax | hypothetical protein | |||||
Only 100 of 280 total aligned reads displayed.
TTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_007779/3744176‑3744263‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ATTCTTATGTTACTCACTCTGGTGTTTTCGAGTGAGGTGTTAGCGAAGACGCACACAACAACAGCGAGTCAAAAGTCCCACTTAACTAAAGCTAGTAATA > NC_007779/3903274‑3903373 TTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATTacatgaacaa > 1:8275242/1‑91TTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATTCTTATGTTAC < 1:4890302/101‑1 TCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATTCTTATGTTACT > 1:14199794/1‑101 CTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATTCTTATGTTACTC > 1:1781386/1‑101 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TAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATTCTTATGTTACTCACTCTGGTGT < 1:7570791/101‑1 AGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATTCTTATGTTACTCACTCTGGTGTT < 1:11053617/101‑1 GTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATTCTTATGTTACTCACTCTGGTGTTT < 1:10628684/101‑1 TCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATTCTTATGTTACTCACTCTGGTGTTTT < 1:14321366/101‑1 TCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATTCTTATGTTACTCACTCTGGTGTTTT < 1:13457640/101‑1 CTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATTCTTATGTTACTCACTCTGGTGTTTTC > 1:5124451/1‑101 CTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATTCTTATGTTACTCACTCTGGTGTTTTC > 1:653908/1‑101 CTAAAAACTAGTATTAAGACTATAACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATTCTTATGTTACTCACTCTGGTGTTTTC > 1:3151591/1‑101 TAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATTCTTATGTTACTCACTCTGGTGTTTTCG < 1:8806532/101‑1 TAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGCGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATTCTTATGTTACTCACTCTGGTGTTTTCG < 1:10258000/101‑1 AAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATTCTTATGTTACTCACTCTGGTGTTTTCGAG < 1:3775496/101‑1 AAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATTCTTATGTTACTCACTCTGGTGTTTTCGAG > 1:13150451/1‑101 AAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATTCTTATGTTACTCACTCTGGTGTTTTCGAG > 1:10002348/1‑101 ACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATTCTTATGTTACTCACTCTGGTGTTTTCGAGTGA > 1:7212796/1‑101 ACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATTCTTATGTTACTCACTCTGGTGTTTTCGAGTGA > 1:6283096/1‑101 CTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATTCTTATGTTACTCACTCTGGTGTTTTCGAGTGAG > 1:11417268/1‑101 AGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATTCTTATGTTACTCACTCTGGTGTTTTCGAGTGAGGT < 1:8406527/101‑1 AGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATTCTTATGTTACTCACTCTGGTGTTTTCGAGTGAGGT > 1:14380035/1‑101 TATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATTCTTATGTTACTCACTCTGGTGTTTTCGAGTGAGGTGT > 1:8508580/1‑101 ATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATTCTTATGTTACTCACTCTGGTGTTTTCGAGTGAGGTGTT < 1:89088/101‑1 ATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATTCTTATGTTACTCACTCTGGTGTTTTCGAGTGAGGTGTT > 1:13950784/1‑101 TTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATTCTTATGTTACTCACTCTGGTGTTTTCGAGTGAGGTGTTA > 1:14263185/1‑101 TTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATTCTTATGTTACTCACTCTGGTGTTTTCGAGTGAGGTGTTA < 1:5864412/101‑1 AAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATTCTTATGTTACTCACTCTGGTGTTTTCGAGTGAGGTGTTAGC < 1:12918089/101‑1 AAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATTCTTATGTTACTCACTCTGGTGTTTTCGAGTGAGGTGTTAGC < 1:1726524/101‑1 AGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATTCTTATGTTACTCACTCTGGTGTTTTCGAGTGAGGTGTTAGCG < 1:2483728/101‑1 ACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATTCTTATGTTACTCACTCTGGTGTTTTCGAGTGAGGTGTTAGCGAA < 1:5657677/101‑1 TATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATTCTTATGTTACTCACTCTGGTGTTTTCGAGTGAGGTGTTAGCGAAGA > 1:2189831/1‑101 ATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATTCTTATGTTACTCACTCTGGTGTTTTCGAGTGAGGTGTTAGCGAAGAC < 1:8691584/101‑1 TCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATTCTTATGTTACTCACTCTGGTGTTTTCGAGTGAGGTGTTAGCGAAGACG < 1:8535757/101‑1 TCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATTCTTATGTTACTCACTCTGGTGTTTTCGAGTGAGGTGTTAGCGAAGACG > 1:12158017/1‑101 CACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATTCTTATGTTACTCACTCTGGTGTTTTCGAGTGAGGTGTTAGCGAAGACGC < 1:12640500/101‑1 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |