| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_007779 | 4,200,197 | A→G | 38.1% | K271E (AAA→GAA) | rpoA → | RNA polymerase subunit alpha |
| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_007779 | 4,200,197 | 0 | A→G | 38.1% | 0.0 ‑0.2 ‑0.0 | 314 | K271E (AAA→GAA) | rpoA | RNA polymerase subunit alpha |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (52/56): ref base (93/94): total (152/162) | ||||||||||
| Fisher's exact test strand distribution p-value = 8.10e-01 | ||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 9.96e-01 | ||||||||||
Only 100 of 333 total aligned reads displayed.
ACGTCAGCCTGAAGTGAAAGAAGAGAAACCAGAGTTCGATCCGATCCTGCTGCGCCCTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTATCCACTATATCGGTGATCTGGTACAGCGTACCGAGGTTGAGCTCCTTAAAACGCCTAACCTTGGTAAAAAATCTCTTACTGAGATTAA > NC_007779/4200097‑4200297 | cGTCAGCCTGAAGTGAAAGAAGAGAAACCAGAGTTCGATCCGATCCTGCTGCGCCCTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTaa < 1:6908493/101‑1 (MQ=255) cGTCAGCCTGAAGTGAAAGAAGAGAAACCAGAGTTCGATCCGATCCTGCTGCGCCCTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTaa < 1:5161479/101‑1 (MQ=255) cGTCAGCCTGAAGTGAAAGAAGAGAAACCAGAGTTCGATCCGATCCTGCTGCGCCCTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTaa < 1:9434065/101‑1 (MQ=255) gTCAGCCTGAAGTGAAAGAAGAGAAACCAGAGTTCGATCCGATCCTGCTGCGCCCTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTgaa > 1:721649/1‑101 (MQ=255) gTCAGCCTGAAGTGAAAGAAGAGAAACCAGAGTTCGATCCGATCCTGCTGCGCCCTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTgaa < 1:13011169/101‑1 (MQ=255) gTCAGCCTGAAGTGAAAGAAGAGAAACCAGAGTTCGATCCGATCCTGCTGCGCCCTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTaaa < 1:13666114/101‑1 (MQ=255) gTCAGCCTGAAGTGAAAGAAGAGAAACCAGAGTTCGATCCGATCCTGCTGCGCCCTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTaaa < 1:12534692/101‑1 (MQ=255) gTCAGCCTGAAGTGAAAGAAGAGAAACCAGAGTTCGATCCGATCCTGCTGCGCCCTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTaaa > 1:5378799/1‑101 (MQ=255) cAGCCTGAAGTGAAAGAAGAGAAACCAGAGTTCGATCCGATCCTGCTGCGCCCTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTGAAGc > 1:5585148/1‑101 (MQ=255) cAGCCTGAAGTGAAAGAAGAGAAACCAGAGTTCGATCCGATCCTGCTGCGCCCTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAAGc > 1:8935023/1‑101 (MQ=255) aGCCTGAAGTGAAAGAAGAGAAACCAGAGTTCGATCCGATCCTGCTGCGCCCTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTGAAGCa > 1:3480395/1‑101 (MQ=255) aGCCTGAAGTGAAAGAAGAGAAACCAGAGTTCGATCCGATCCTGCTGCGCCCTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTGAAGCa < 1:4191494/101‑1 (MQ=255) aGCCTGAAGTGAAAGAAGAGAAACCAGAGTTCGATCCGATCCTGCTGCGCCCTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTGAAGCa > 1:9355962/1‑101 (MQ=255) cTGAAGAGAAAGAAGAAAAACCAGAGTTCGATCCGATCCTGCTGCGCCCTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTGAAGCAGaa > 1:12779463/1‑101 (MQ=255) tGAAGTGAAAGAAGAGAAACCAGAGTTCGATCCGATCCTGCTGCGCCCTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTGAAGCAGAAg < 1:1742405/101‑1 (MQ=255) tGAAGTGAAAGAAGAGAAACCAGAGTTCGATCCGATCCTGCTGCGCCCTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTGAAGCAGAAg < 1:11256377/101‑1 (MQ=255) tGAAGTGAAAGAAGAGAAACCAGAGTTCGATCCGATCCTGCTGCGCCCTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAg < 1:4557515/101‑1 (MQ=255) gAAGTGAAAGAAGAGAAACCAGAGTTCGATCCGATCCTGCTGCGCCCTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTGAAGCAGAAGc > 1:11802670/1‑101 (MQ=255) aaGTGAAAGAAGAGAAACCAGAGTTCGATCCGATCCTGCTGCGCCCTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTCAAGCAGAAGCt > 1:1308265/1‑101 (MQ=255) tGAAAGAAGAGAAACCAGAGTTCGATCCGATCCTGCTGCGCCCTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTGAAGCAGAAGCTATc > 1:12148781/1‑101 (MQ=255) tGAAAGAAGAGAAACCAGAGTTCGATCCGATCCTGCTGCGCCCTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTATc < 1:10247478/101‑1 (MQ=255) gAAAGAAGAGAAACCAGAGTTCGATCCGATCCTGCTGCGCCCTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTGAAGCAGAAGCTATcc > 1:2709562/1‑101 (MQ=255) aaaGAAGAGAAACCAGAGTTCGATCCGATCCTGCTGCGCCCTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTGAAGCAGAAGCTATCCa > 1:14438887/1‑101 (MQ=255) aaaGAAGAGAAACCAGAGTTCGATCCGATCCTGCTGCGCCCTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTATCCa < 1:7158253/101‑1 (MQ=255) agaagaGAAACCAGAGTTCGATCCGATCCTGCTGCGCCCTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTATCCACt < 1:3157767/101‑1 (MQ=255) aagaGAAACCAGAGTTCGATCCGATCCTGCTGCGCCCTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTGAAGCAGAAGCTATCCACtat > 1:7821990/1‑101 (MQ=255) aagaGAAACCAGAGTTCGATCCGATCCTGCTGCGCCCTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTATCCACtat < 1:24224/101‑1 (MQ=255) gagaAACCAGAGTTCGATCCGATCCTGCTGCTCCCTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTGAAGCAGAAGCTATCCACTatat < 1:9165139/101‑1 (MQ=255) agaAACCAGAGTTCGATCCGATCCTGCTGCGCCCTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTGAAGCAGAAGCTATCCACTATATc > 1:8776285/1‑101 (MQ=255) gaAACCAGAGTTCGATCCGATCCTGCTGCGCCCTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTATCCACTATATCg < 1:4435723/101‑1 (MQ=255) aaaCCAGAGTTCGATCCGATCCTGCTGCGCCCTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTGAAGCAGAAGCTATCCACTATATCgg > 1:3304063/1‑101 (MQ=255) aaaCCAGAGTTCGATCCGATCCTGCTGCGCCCTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTATCCACTATATCgg < 1:1056015/101‑1 (MQ=255) aaCCAGAGTTCGATCCGATCCTGCTGCGCCCTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTATCCACTATATCGGt > 1:4087261/1‑101 (MQ=255) aaCCAGAGTTCGATCCGATCCTGCTGCGCCCTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTATCCACTATATCGGt < 1:10971333/101‑1 (MQ=255) ccAGAGTTCGATCCGATCCTGCTGCGCCCTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTATCCACTATATCAGTGa < 1:1387634/101‑1 (MQ=255) cAGAGTTCGATCCGATCCTGCTGCGCCCTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTGAAGCAGAAGCTATCCACTATATCGGTGAt > 1:2866244/1‑101 (MQ=255) gagTTCGATCCGATCCTGCTGCGCCCTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTGAAGCAGAAGCTATCCACTATATCGGTGATCt < 1:1942345/101‑1 (MQ=255) gTTCGATCCGATCCTGCTGCGCCCTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTATCCACTATATCGGTGATCTgg < 1:13574709/101‑1 (MQ=255) tCGATCCGATCCTGCTGCGCCCTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTGAAGCAGAAGCTATCCACTATATCGGTGATCTGGTa < 1:11587847/101‑1 (MQ=255) gatccgatccTGCTGCGCCCTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTATCCACTATATCGGTGATCTGGTACa < 1:5807825/101‑1 (MQ=255) gatccgatccTGCTGCGCCCTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTATCCACTATATCGGTGATCTGGTACa < 1:2369637/101‑1 (MQ=255) gatccgatccTGCTGCGCCCTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTATCCACTATATCGGTGATCTGGTACa > 1:2567265/1‑101 (MQ=255) atccgatccTGCTGCGCCCTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTGAAGCAGAAGCTATTCACTATATCGGTGATCTGGTACAg < 1:14024328/101‑1 (MQ=255) atccgatccTGCTGCGCCCTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTGAAGCAGAAGCTATCCACTATATCGGTGATCTGGTACAg > 1:6787492/1‑101 (MQ=255) ccgatccTGCTGCGCCCTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTGAAGCAGAAGCTATCCACTATATCGGTGATCTGGTACAGCg < 1:8061798/101‑1 (MQ=255) gatccTGCTGCGCCCTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTGAAGCAGAAGCTATCCACTATATCGGTGATCTGGTACAGCGTa > 1:9820955/1‑101 (MQ=255) gatccTGCTGCGCCCTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTATCCACTATATCGGTGATCTGGTACAGCGTa > 1:8572856/1‑101 (MQ=255) tccTGCTGCGCCCTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTATCCACTATATCGGTGATCTGGTACAGCGTAcc > 1:3377993/1‑101 (MQ=255) tccTGCTGCGCCCTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTATCCACTATATCGGTGATCTGGTACAGCGTAcc > 1:5880819/1‑101 (MQ=255) ccTGCTGCGCCCTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTATCCACTATATCGGTGATCTGGTACAGCGTACCg > 1:2828150/1‑101 (MQ=255) ccTGCTGCGCCCTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTATCAACTATATCGGTGATCTGGTACAGCGTACCg > 1:10497567/1‑101 (MQ=255) ctgctgCGCCCTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTTTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTATCCACTATATCGGTGATCTGGTACAGCGTACCGa > 1:8730123/1‑101 (MQ=255) gctgcGCCCTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTATCCACTATATCGGTGATCTGGTACAGCGTACCGAgg > 1:6635924/1‑101 (MQ=255) ctgcGCCCTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTATCCACTATATCGGTGATCTGGTACAGCGTACCGAGGt > 1:2052578/1‑101 (MQ=255) gcgcCCTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTGAAGCAGAAGCTATCCACTATATCGGTGATCTGGTACAGCGTACCGAGGTTg < 1:10351005/101‑1 (MQ=255) gcgcCCTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTATCCACTATATCGGTGATCTGGTACAGCGTACCGAGGTTg < 1:13780070/101‑1 (MQ=255) gcgcCCTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTATCCACTATATCGGTGATCTGGTACAGCGTACCGAGGTTg < 1:11012498/101‑1 (MQ=255) cgcCCTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTATCCACTATATCGGTGATCTGGTACAGCGTACCGAGGTTGa > 1:5295417/1‑101 (MQ=255) cTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTATCCACTATATCGGTGATCTGGTACAGCGTACCGAGGTTGAGCTc > 1:6004137/1‑101 (MQ=255) tGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTGAAGCAGAAGCTATCCACTATATCGGTGATCTGGTACAGCGTACCGAGGTTGAGCTcc < 1:9683028/101‑1 (MQ=255) tGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTATCCACTATATCGGTGATCTGGTACAGCGTACCGAGGTTGAGCTCCTTa < 1:11383283/101‑1 (MQ=255) tGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTATCCACTATATCGGTGATCTGGTACAGCGTACCGAGGTTGAGCTCCTTa > 1:12407432/1‑101 (MQ=255) gATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTGAAGCAGAAGCTATCCACTATATCGGTGATCTGGTACAGCGTACCGAGGTTGAGCTCCTTAAAAc < 1:5954923/101‑1 (MQ=255) gATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTATCCACTATATCGGTGATCTGGTACAGCGTACCGAGGTTGAGCTCCTTAAAAc < 1:12924987/101‑1 (MQ=255) aTCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTGAAGCAGAAGCTATCCACTATATCGGTGATCTGGTACAGCGTACCGAGGTTGAGCTCCTTAAAACg < 1:375265/101‑1 (MQ=255) aTCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAAGCGGAAGCTATCCACTATATCGGTGATCTGGTACAGCGTACCGAGGTTGAGCTCCTTAAAACg > 1:10007845/1‑101 (MQ=255) aTCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTATCCACTATATCGGTGATCTGGTACAGCGTACCGAGGTTGAGCTCCTTAAAACg > 1:212224/1‑101 (MQ=255) aTCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTATCCACTATATCGGTGATCTGGTACAGCGTACCGAGGTTGAGCTCCTTAAAACg > 1:3969763/1‑101 (MQ=255) aaTTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTATCCACTATATCGGTGATCTGGTACAGCGTACCGAGGTTGAGCTCCTTAAAACGCCTAAc > 1:4923753/1‑101 (MQ=255) aTTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTATCCACTATATCGGTGATCTGGTACAGCGTACCGAGGTTGAGCTCCTTAAAACGCCTAAcc > 1:3067974/1‑101 (MQ=255) ttGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTATCCACTATATCGGTGATCTGGTACAGCGTACCGAGGTTGAGCTCCTTAAAACGCCTAACCt > 1:13239973/1‑101 (MQ=255) gACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTGAAGCAGAAGCTATCCACTATATCGGTGATCTGGTACAGCGTACCGAGGTTGAGCTCCTTAAAACGCCTAACCTTg < 1:10803218/101‑1 (MQ=255) gACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTGAAGCAGAAGCTATCCACTATATCGGTGATCTGGTACAGCGTACCGAGGTTGAGCTCCTTAAAACGCCTAACCTTg > 1:5209152/1‑101 (MQ=255) aCTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTGAAGCAGAAGCTATCCACTATATCGGTGATCTGGTACAGCGTACCGAGGTTGAGCTCCTTAAAACGCCTAACCTTgg > 1:2999242/1‑101 (MQ=255) cTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTATCCACTATATCGGTGATCTGGTACAGCGTACCGAGGTTGAGCTCCTTAAAACGCCTAACCTTGGt > 1:9571541/1‑101 (MQ=255) tGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTATCCACTATATCGGTGATCTGGTACAGCGTACCGAGGTTGAGCTCCTTAAAACGCCTAACCTTGGTa > 1:12275742/1‑101 (MQ=255) tGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTATCCACTATATCGGTGATCTGGTACAGCGTACCGAGGTTGAGCTCCTTAAAACGCCTAACCTTGGTa < 1:7328546/101‑1 (MQ=255) tGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTATCCACTATATCGGTGATCTGGTACAGCGTACCGAGGTTGAGCTCCTTAAAACGCCTAACCTTGGTa < 1:6112510/101‑1 (MQ=255) ggTCCGCTCTGCTACCTGCCTTGAAGCAGAAGCTATCCACTATATCGGTGATCTGGTACAGCGTACCGAGGTTGAGCACCTTAAAACGCCTAACCTTGGTa < 1:6420234/100‑1 (MQ=255) gTCCGCTCTGCTAACTGCCTTGAAGCAGAAGCTATCCACTATATCGGTGATCTGGTACAGCGTACCGAGGTTGAGCTCCTTAAAACGCCTAACCTTGGTaa > 1:3940897/1‑101 (MQ=255) gTCCGCTCTGCTAACTGCCTTGAAGCAGAAGCTATCCACTATATCGGTGATCTGGTACAGCGTACCGAGGTTGAGCTCCTTAAAACGCCTAACCTTGGTaa > 1:13976492/1‑101 (MQ=255) tCCGCTCTGCTAACTGCCTTGAAGCAGAAGCTATCCACTATATCGGTGATCTGGTACAGCGTACCGAGGTTGAGCTCCTTAAAACGCCTAACCTTGGTaaa < 1:1479881/101‑1 (MQ=255) tCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTATCCACTATATCGGTGATCTGGTACAGCGTACCGAGGTTGAGCTCCTTAAAACGCCTAACCTTGGTaaa > 1:6881976/1‑101 (MQ=255) tCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTATCCACTATATCGGTGATCTGGTACAGCGTACCGAGGTTGAGCTCCTTAAAACGCCTAACCTTGGTaaa > 1:12227677/1‑101 (MQ=255) cGCTCTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTATCCACTATATCGGTGATCTGGTACAGCGTACCGAGGTTGAGCTCCTTAAAACGCCTAACCTTGGTaaaaa > 1:2319603/1‑101 (MQ=255) gCTCTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTATCCACTATATCGGTGATCTGGTACAGCGTACCGAGGTTGAGCTCCTTAAAACGCCTAACCTTGGTaaaaaa > 1:8291381/1‑101 (MQ=255) tctGCTAACTGCCTTCAAGCAGAAGCTATCCACTATATCGGTGATCTGGTACAGCGTACCGAGGTTGAGCTCCTTAAAACGCCTAACCTTGGTAAAAAAtc < 1:13639998/101‑1 (MQ=255) tGCTAACTGCCTTGAAGCAGAAGCTATCCACTATATCGGTGATCTGGTACAGCGTACCGAGGTTGAGCTCCTTAAAACGCCTAACCTTGGTAAAAAAtctc > 1:7884168/1‑101 (MQ=255) gccaaCTGCCTTGAAGCAGAAGCTATCCACTATATCGGTGATCTGGTACAGCGTACCGAGGTTGAGCTCCTTAAAACGCCTAACCTTGGTAAAAAATctct > 1:572215/4‑101 (MQ=255) gCTAACTGCCTTGAAGCAGAAGCTATCCACTATATCGGTGATCTGGTACAGCGTACCGAGGTTGAGCTCCTTAAAACGCCTAACCTTGGTAAAAAATctct < 1:505366/101‑1 (MQ=255) gCTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTATCCACTATATCGGTGATCTGGTACAGCGTACCGAGGTTGAGCTCCTTAAAACGCCTAACCTTGGTAAAAAATctct < 1:9075328/101‑1 (MQ=255) cTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTATCCACTATATCGGTGATCTGGTACAGCGTACCGAGGTTGAGCTCCTTAAAACGCCTAACCTTGGTAAAAAATCTCtt > 1:658250/1‑101 (MQ=255) cTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTATCCACTATATCGGTGATCTGGTACAGCGTACCGAGGTTGAGCTCCTTAAAACGCCTAACCTTGGTAAAAAATCTCtt > 1:12057332/1‑101 (MQ=255) tAACTGCCTTGAAGCAGAAGCTATCCACTATATCGGTGATCTGGTACAGCGTACCGAGGTTGAGCTCCTTAAAACGCCTAACCTTGGTAAAAAATCTCTTa > 1:1419439/1‑101 (MQ=255) aaCTGCCTTGAAGCAGAAGCTATCCACTATATCGGTGATCTGGTACAGCGTACCGAGGTTGAGCTCCTTAAAACGCCTAACCTTGGTAAAAAATCTCTTAc > 1:4151408/1‑101 (MQ=255) cTGCCTTAAAGCAGAAGCTATCCACTATATCGGTGATCTGGTACAGCGTACCGAGGTTGAGCTCCTTAAAACGCCTAACCTTGGTAAAAAATCTCTTACTg > 1:11895582/1‑101 (MQ=255) tGCCTTAAAGCAGAAGCTATCCACTATATCGGTGATCTGGTACAGCGTACCGAGGTTGAGCTCCTTAAAACGCCTAACCTTGGTAAAAAATCTCTTACTga > 1:840699/1‑101 (MQ=255) gCCTTAAAGCAGAAGCTATCCACTATATCGGTGATCTGGTACAGCGTACCGAGGTTGAGCTCCTTAAAACGCCTAACCTTGGTAAAAAATCTCTTACTgag > 1:1015964/1‑101 (MQ=255) ccTTAAAGCAGAAGCTATCCACTATATCGGTGATCTGGTACAGCGTACCGAGGTTGAGCTCCTTAAAACGCCTAACCTTGGTAAAAAATCTCTTACTgaga > 1:833534/1‑101 (MQ=255) ttAAAGCAGAAGCTATCCACTATATCGGTGATCTGGTACAGCGTACCGAGGTTGAGCTCCTTAAAACGCCTAACCTTGGTAAAAAATCTCTTACTGAGAtc > 1:9905069/1‑100 (MQ=255) | ACGTCAGCCTGAAGTGAAAGAAGAGAAACCAGAGTTCGATCCGATCCTGCTGCGCCCTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTATCCACTATATCGGTGATCTGGTACAGCGTACCGAGGTTGAGCTCCTTAAAACGCCTAACCTTGGTAAAAAATCTCTTACTGAGATTAA > NC_007779/4200097‑4200297 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |