| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_007779 | = 2521060 | NA (NA) | 26 (0.100) | 23/176 | NT | 12.3% | intergenic (+171/+29) | insL/yfeA | transposase/diguanylate cyclase |
| ? | NC_007779 | = 3175166 | 189 (0.700) | coding (324/828 nt) | cpdA | cyclic 3',5'‑adenosine monophosphate phosphodiesterase | |||||
CGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGgg‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_007779/2520973‑2521060‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGGTATCTCCCCGGCGAAGCGCGTGTTTATTGGTGAGCAATGGCAAATCCTGTTGCTGGATAGCCAGGTGTTTGGCGTGCCGCACGGTGAGCTGAGCGAGTT < NC_007779/3175166‑3175065 CGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTATCTCCCCG < 1:8059826/101‑1 TTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTATCTCCCCGGCGAA < 1:10081821/101‑1 TTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTATCTCCCCGGCGAA < 1:5093995/101‑1 AGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTATCTCCCCGGCGAAGCGC < 1:5113979/101‑1 AGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTATCTCCCCGGCGAAGCGC > 1:4768522/1‑101 AACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTATCTCCCCGGCGAAGCGCGT > 1:11570467/1‑101 AACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTATCTCCCCGGCGAAGCGCGT > 1:10566081/1‑101 CGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTATCTCCCCGGCGAAGCGCGTGTTT < 1:13516905/101‑1 CGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTATCTCCCCGGCGAAGCGCGTGTTT < 1:11456544/101‑1 GGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTATCTCCCCGGCGAAGCGCGTGTTTATT < 1:189015/101‑1 CATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTATCTCCCCGGCGAAGCGCGTGTTTATTGG < 1:13156985/101‑1 CTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTATCTCCCCGGCGAAGCGCGTGTTTATTGGTGAGCA < 1:2587830/101‑1 AACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTATCTCCCCGGCGAAGCGCGTGTTTATTGGTGAGCAATG > 1:5291231/1‑101 GGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTGATGGGGTAGCTCCCCGGCGAAGCGCGTGTTTATTGGTGAGCAATGGCAAA < 1:7978466/101‑1 GCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTATCTCCCCGGCGAAGCGCGTGTTTATTGGTGAGCAATGGCAAAT > 1:9943326/1‑101 ACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTATCTCCCCGGCGAAGCGCGTGTTTATTGGTGAGCAATGGCAAATCC > 1:753823/1‑101 CGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTATCTCCCCGGCGAAGCGCGTGTTTATTGGTGAGCAATGGCAAATCCTG > 1:8392028/1‑101 GTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTATCTCCCCGGCGAAGCGCGTGTTTATTGGTGAGCAATGGCAAATCCTGTTGCTG > 1:2606282/1‑101 TCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTATCTCCCCGGCGAAGCGCGTGTTTATTGGTGAGCAATGGCAAATCCTGTTGCTGG < 1:6484783/101‑1 CGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTATCTCCCCGGCGAAGCGCGTGTTTATTGGTGAGCAATGGCAAATCCTGTTGCTGGA < 1:7130463/101‑1 GCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTATCTCCCCGGCGAAGCGCGTGTTTATTGGTGAGCAATGGCAAATCCTGTTGCTGGAT < 1:11265628/101‑1 ATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTATCTCCCCGGCGAAGCGCGTGTTTATTGGTGAGCAATGGCAAATCCTGTTGCTGGATAG < 1:8754024/101‑1 TCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTATCTCCCCGGCGAAGCGCGTGTTTATTGGTGAGCAATGGCAAATCCTGTTGCTGGATAGCC < 1:9171048/101‑1 TCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTATCTCCCCGGCGAAGCGCGTGTTTATTGGTGAGCAATGGCAAATCCTGTTGCTGGATAGCCCGG > 1:2597244/1‑101 AACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTATCTCCCCGGCGAAGCGCGTGTTTATTGGTGAGCAATGGCAAATCCTGTTGCTGGATAGCCAGGTGTTTGGCGTG > 1:13300071/1‑101 GCTTATGGGGTATCTCCCCGGCGAAGCGCGTGTTTATTGGTGAGCAATGGCAAATCCTGTTGCTGGATAGCCAGGTGTTTGGCGTGCCGCACGGTGAGCTG > 1:7273809/1‑101 TTATGGGGTATCTCCCCGGCGAAGCGCGTGTTTATTGGTGAGCAATGGCAAATCCTGTTGCTGGATAGCCAGGTGTTTGGCGTGCCGCACGGTGAGCTGAG > 1:11560330/1‑101 TATGGGGTATCTCCCCGGCGAAGCGCGTGTTTATTGGTGAGCAATGGCAAATCCTGTTGCTGGATAGCCAGGTGTTTGGCGTGCCGCACGGTGAGCTGAGC > 1:7253049/1‑101 TATGGGGTATCTCCCCGGCGAAGCGCGTGTTTATTGGTGAGCAATGGCAAATCCTGTTGCTGGATAGCCAGGTGTTTGGCGTGCCGCACGGTGAGCTGAGC < 1:5758747/101‑1 TGGGGTATCTCCCCGGCGAAGCGCGTGTTTATTGGTGAGCAATGGCAAATCCTGTTGCTGGATAGCCAGGTGTTTGGCGTGCCGCACGGTGAGCTGAGCGA < 1:8251635/101‑1 GGGTATCTCCCCGGCGAAGCGCGTGTTTATTGGTGAGCAATGGCAAATCCTGTTGCTGGATAGCCAGGTGTTTGGCGTGCCGCACGGTGAGCTGAGCGAGT < 1:11285403/101‑1 GGGTATCTCCCCGGCGAAGCGCGTGTTTATTGGTGAGCAATGGCAAATCCTGTTGCTGGATAGCCAGGTGTTGGGCGTGCCGCACGGTGAGCTGAGCGAGT > 1:3328356/1‑101 GGTATCTCCCCGGCGAAGCGCGTGTTTATTGGTGAGCAATGGCAAATCCTGTTGCTGGATAGCCAGGTGTTTGGCGTGCCGCACGGTGAGCTGAGCGAGTT < 1:6868384/101‑1 GGTATCTCCCCGGCGAAGCGCGTGTTTATTGGTGAGCAATGGCAAATCCTGTTGCTGGATAGCCAGGTGTTTGGCGTGCCGCACGGTGAGCTGAGCGAGTT < 1:7274719/101‑1 GGTATCTCCCCGGCGAAGCGCGTGTTTATTGGTGAGCAATGGCAAATCCTGTTGCTGGATAGCCAGGTGTTTGGCGTGCCGCACGGTGAGCTGAGCGAGTT < 1:7294168/101‑1 GGTATCTCCCCGGCGAAGCGCGTGTTTATTGGTGAGCAATGGCAAATCCTGTTGCTGGATAGCCAGGTGTTTGGCGTGCCGCACGGTGAGCTGAGCGAGTT < 1:6051339/101‑1 GGTATCTCCCCGGCGAAGCGCGTGTTTATTGGTGAGCAATGGCAAATCCTGTTGCTGGATAGCCAGGTGTTTGGCGTGCCGCACGGTGAGCTGAGCGAGTT > 1:4857155/1‑101 GGTATCTCCCCGGCGAAGCGCGTGTTTATTGGTGAGCAATGGCAAATCCTGTTGCTGGATAGCCAGGTGTTTGGCGTGCCGCACGGTGAGCTGAGCGAGTT > 1:173129/1‑101 CGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGgg‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_007779/2520973‑2521060‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGGTATCTCCCCGGCGAAGCGCGTGTTTATTGGTGAGCAATGGCAAATCCTGTTGCTGGATAGCCAGGTGTTTGGCGTGCCGCACGGTGAGCTGAGCGAGTT < NC_007779/3175166‑3175065 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |