New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_007779 | 2519723 = | NA (NA) | 38 (0.150) | 32/172 | NT | 16.8% | intergenic (+33/‑54) | nupC/insL | nucleoside (except guanosine) transporter/transposase |
? | NC_007779 | 3175156 = | 197 (0.730) | coding (334/828 nt) | cpdA | cyclic 3',5'‑adenosine monophosphate phosphodiesterase |
Only 100 of 562 total aligned reads displayed.
TGAAGCTGGTTTACGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTG > NC_007779/2519623‑2519822 | gAAGCTGGTTTACGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCAt < 1:4903892/101‑1 (MQ=255) aaGCTGGTTTACGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATa < 1:13840587/101‑1 (MQ=255) aaGCTGGTTTACGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATa > 1:8599669/1‑101 (MQ=255) tactgggtgttagtgctggcgttattgccgcattaaaacaaaacaccaaatgggactataccgtgatggggctggcaatgaccggggttgttatcccATaa > 1:14301193‑M2/98‑101 (MQ=255) cTGGTTTACGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAgc > 1:5089715/1‑101 (MQ=255) tGGTTTACGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAgcg > 1:11635339/1‑101 (MQ=255) ggtgttagtgctggcgttattgccgcattaaaacaaaacaccaaatgggactataccgtgatggggctggcaatgaccggggttgttatcccATAAGCGCt < 1:2544294‑M2/9‑1 (MQ=255) tttACGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTa < 1:12619854/101‑1 (MQ=255) ttACGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTaa < 1:5607384/101‑1 (MQ=255) aCGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACt < 1:11688399/101‑1 (MQ=255) tagtgctggcgttattgccgcattaaaacaaaacaccaaatgggactataccgtgatggggctggcaatgaccggggttgttatcccATAAGCGCTAACtt < 1:2259161‑M2/14‑1 (MQ=255) cGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACtt < 1:6616715/101‑1 (MQ=255) cGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACtt < 1:3186092/101‑1 (MQ=255) ggCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCAATAAGCGCTAACTTa < 1:10909237/101‑1 (MQ=255) gCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTaa < 1:4375031/101‑1 (MQ=255) gctggcgttattgccgcattaagacaaaacaccaaatgggactataccgtgatggggctggcaatgaccggggttgttatcccATAAGCGCTAACTTAAgg > 1:10522183‑M2/84‑101 (MQ=255) tggcgttattgccgcattaaaacaaaacaccaaatgggactataccgtgatggggctggcaatgaccggggttgttatcccATAAGCGCTAACTTAAGGGt > 1:8479812‑M2/82‑101 (MQ=255) ggcgttattgccgcattaaaacaaaacaccaaatgggactataccgtgatggggctggcaatgaccggggttgttatcccATAAGCGCTAACTTAAGGGtt < 1:3308556‑M2/21‑1 (MQ=255) cgttattgccgcattaaaacaaaacaccaaatgggactataccgtgatggggctggcaatgaccggggttgttatcccATAAGCGCTAACTTAAGGGTtgt > 1:2807656‑M2/79‑101 (MQ=255) cgttattgccgcattaaaacaaaacaccaaatgggactataccgtgatggggctggcaatgaccggggttgttatcccATAAGCGCTAACTTAAGGGTtgt > 1:413216‑M2/79‑101 (MQ=255) cTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTtgtg < 1:2027084/101‑1 (MQ=255) cTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTtgtg < 1:9395708/101‑1 (MQ=255) tattgccgcattaaaacaaaacaccaaatgggactataccgtgatggggctggcaatgaccggggttgttatcccATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGt < 1:5413325‑M2/26‑1 (MQ=255) gTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTa < 1:9940938/101‑1 (MQ=255) gTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTa > 1:5670973/1‑101 (MQ=255) gTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTa < 1:10240188/101‑1 (MQ=255) ttgccgcattaaaacaaaacaccaaatgggactataccgtgatggggctggcaatgaccggggttgttatcccATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGTTAt < 1:9253096‑M2/28‑1 (MQ=255) tgccgcattaaaacaaaacaccaaatgggactataccgtgatggggctggcaatgaccggggttgttatcccATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTAtt > 1:165676‑M2/73‑101 (MQ=255) gAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTAtt > 1:7616838/1‑101 (MQ=255) gAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTAtt > 1:272531/1‑101 (MQ=255) aGTGTTCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTa < 1:7255478/101‑1 (MQ=255) aGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTa < 1:1404510/101‑1 (MQ=255) tgtgCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACg > 1:6007200/1‑101 (MQ=255) cTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTg < 1:12126163/101‑1 (MQ=255) tCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGata > 1:1141098/1‑101 (MQ=255) aaacaaaacaccaaatgggactataccgtgatggggctggcaatgaccggggttgttatcccATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGata < 1:1521436‑M2/39‑1 (MQ=255) aaacaaaacaccaaatgggactataccgtgatggggctggcaatgaccggggttgttatcccATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGata > 1:7772799‑M2/63‑101 (MQ=255) cGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGAt < 1:4695130/101‑1 (MQ=255) aaacaccaaatgggactataccgtgatggggctggcaatgaccggggttgttatcccATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGAtt > 1:5837301‑M2/58‑101 (MQ=255) tCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGAttt < 1:11120235/101‑1 (MQ=255) tCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGAttt < 1:12360450/101‑1 (MQ=255) acaccaaatgggactataccgtgatggggctggcaatgaccggggttgttatcccATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTa > 1:9774352‑M2/56‑101 (MQ=255) caccaaatgggactataccgtgatggggctggcaatgaccggggttgttatcccATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTaa < 1:4500611‑M2/47‑1 (MQ=255) cGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGt < 1:6997600/101‑1 (MQ=255) gcagcaCTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTg < 1:8320978/101‑1 (MQ=255) aatgggactataccgtgatggggctggcaatgaccggggttgttatcccATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGc > 1:6214809‑M2/50‑101 (MQ=255) aCTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTCATATGATTTAACGTGCCGAt < 1:8751990/101‑1 (MQ=255) gactataccgtgatggggctggcaatgaccggggttgttatcccATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATg < 1:377930‑M2/57‑1 (MQ=255) 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gcaatgaccggggttgttatcccATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTgg > 1:7360940‑M2/24‑101 (MQ=255) aaaaaaGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGt > 1:11278517/1‑101 (MQ=255) aatgaccggggttgttatcccATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTc > 1:14143991‑M2/22‑101 (MQ=255) aatgaccggggttgttatcccATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTc < 1:5883253‑M2/80‑1 (MQ=255) aaaaaGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTc < 1:9036300/101‑1 (MQ=255) aaaaGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCa < 1:10709854/101‑1 (MQ=255) aaaaGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCa > 1:3892375/1‑101 (MQ=255) 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tatcccATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCa > 1:2428461‑M2/7‑101 (MQ=255) aTTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCa > 1:5560539/1‑101 (MQ=31) atcccATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCat < 1:5229718‑M2/96‑1 (MQ=255) tcccATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCata > 1:3014861‑M2/5‑101 (MQ=255) cccATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCatat < 1:10292619‑M2/98‑1 (MQ=255) ccATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATAtt > 1:6447334‑M2/3‑101 (MQ=255) ccATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATAtt > 1:6806293‑M2/3‑101 (MQ=255) cATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTg > 1:11982921‑M2/2‑101 (MQ=255) cATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTg < 1:7423284‑M2/100‑1 (MQ=255) cATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTg < 1:9820003‑M2/100‑1 (MQ=255) | TGAAGCTGGTTTACGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTG > NC_007779/2519623‑2519822 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |