New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_007779 | 380484 = | NA (NA) | 25 (0.090) | 24/180 | NT | 6.2% | intergenic (‑418/‑46) | yaiO/insC | hypothetical protein/IS2 insertion element repressor InsA |
? | NC_007779 | 675203 = | 378 (1.400) | coding (3/2583 nt) | leuS | leucyl‑tRNA synthetase |
Only 100 of 494 total aligned reads displayed.
ACTTCTCTTTGCTCTCGTCTTCGGTTACTTCAAATGTGCGCTTCTCATCCCAATGAAGCTGTACTTTGGATTCTATCTCTTCCGGGCGGTATTGCTCTTGCATGGCAGCCAGTGGTCCTGTTTTCAATACGGCTACAAATGTAGCGTTGAGGTGGTTTTTCAGATCCGCATAGCATAGCCCAAACGTCCGCGTCAAAACAG > NC_007779/675103‑675303 | tcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaCa > 1:4342181‑M2/100‑101 (MQ=255) ttCTCTTTGCTCTCGTCTTCGGTTACTTCAAATGTGCGCTTCTCATCCCAATGAAGCTGTACTTTGGATTCTATCTCTTCCGGGCGGTATTGCTCTTGCAt > 1:9038625/1‑101 (MQ=255) ttCTCTTTGCTCTCGTCTTCGGTTACTTCAAATGTGCGCTTCTCATCCCAATGAAGCTGTACTTTGGATTCTATCTCTTCCGGGCGGTATTGCTCTTGCAt > 1:10771660/1‑101 (MQ=255) ctctTTGCTCTCGTCTTCGGTTACTTCAAATGTGCGCTTCTCATCCCAATGAAGCTGTACTTTGGATTCTATCTCTTCCGGGCGGTATTGCTCTTGCATgg < 1:7271262/101‑1 (MQ=255) ctTTGCTCTCGTCTTCGGTTACTTCAAATGTGCGCTTCTCATCCCAATGAAGCTGTACTTTGGATTCTATCTCTTCCGGGCGGTATTGCTCTTGCATGGCa > 1:4290346/1‑101 (MQ=255) tttGCTCTCGTCTTCGGTTACTTCAAATGTGCGCTTCTCATCCCAATGAAGCTGTACTTTGGATTCTATCTCTTCCGGGCGGTATTGCTCTTGCATGGtgg < 1:11793042‑M2/101‑4 (MQ=255) tttGCTCTCGTCTTCGGTTACTTCAAATGTGCGCTTCTCATCCCAATGAAGCTGTACTTTGGATTCTATCTCTTCCGGGCGGTATTGCTCTTGCATGGCAg < 1:9511228/101‑1 (MQ=255) ttGCTCTCGTCTTCGGTTACTTCAAATGTGCGCTTCTCATCCCAATGAAGCTGTACTTTGGATTCTATCTCTTCCGGGCGGTATTGCTCTTGCATGGtgga < 1:11651832‑M2/101‑5 (MQ=255) tGCTCTCGTCTTCGGTTACTTCAAATGTGCGCTTCTCATCCCAATGAAGCTGTACTTTGGATTCTATCTCTTCCGGGCGGTATTGCTCTTGCATGGCAGcc > 1:6539986/1‑101 (MQ=255) tGCTCTCGTCTTCGGTTACTTCAAATGTGCGCTTCTCATCCCAATGAAGCTGTACTTTGGATTCTATCTCTTCCGGGCGGTATTGCTCTTGCATGGCAGcc > 1:8596886/1‑101 (MQ=255) gCTCTCGTCTTCGGTTACTTCAAATGTGCGCTTCTCATCCCAATGAAGCTGTACTTTGGATTCTATCTCTTCCGGGCGGTATTGCTCTTGCATGGCAGCCa < 1:452350/101‑1 (MQ=255) tctcGTCTTCGGTTACTTCAAATGTGCGCTTCTCATCCCAATGAAGCTGTACTTTGGATTCTATCTCTTCCGGGCGGTATTGCTCTTGCATGGCAGCCAGt > 1:227600/1‑101 (MQ=255) tctcGTCTTCGGTTACTTCAAATGTGCGCTTCTCATCCCAATGAAGCTGTACTTTGGATTCTATCTCTTCCGGGCGGTATTGCTCTTGCATGGCAGCCAGt > 1:2163824/1‑101 (MQ=255) tctcGTCTTCGGTTACTTCAAATGTGCGCTTCTCATCCCAATGAAGCTGTACTTTGGATTCTATCTCTTCCGGGCGGTATTGCTCTTGCATGGCAGCCAGt > 1:690227/1‑101 (MQ=255) ctcGTCTTCGGTTACTTCAAATGTGCGCTTCTCATCCCAATGAAGCTGTACTTTGGATTCTATCTCTTCCGGGCGGTATTGCTCTTGCATGGCAGCCAGTg < 1:14349564/101‑1 (MQ=255) tcGTCTTCGGTTACTTCAAATGTGCGCTTCTCATCCCAATGAAGCTGTACTTTGGATTCTATCTCTTCCGGGCGGTATTGCTCTTGCATGGCAGCCAGTgg < 1:1239604/101‑1 (MQ=255) gTCTTCGGTTACTTCAAATGTGCGCTTCTCATCCCAATGAAGCTGTACTTTGGATTCTATCTCTTCCGGGCGGTATTGCTCTTGCATGGCAGCCAGTGGTc < 1:4649204/101‑1 (MQ=255) tCTTCGGTTACTTCAAATGTGCGCTTCTCATCCCAATGAAGCTGTACTTTGGATTCTATCTCTTCCGGGCGGTATTGCTCTTGCATGGCAGCCAGTGGTcc > 1:6573676/1‑101 (MQ=255) cTTCGGTTACTTCAAATGTGCGCTTCTCATCCCAATGAAGCTGTACTTTGGATTCTATCTCTTCCGGGCGGTATTGCTCTTGCATGGCAGCCAGTGGTCCt < 1:10486083/101‑1 (MQ=255) ttCGGTTACTTCAAATGTGCGCTTCTCATCCCAATGAAGCTGTACTTTGGATTCTATCTCTTCCGGGCGGTATTGCTCTTGCATGGCAGCCAGTGGTCCTg > 1:10417112/1‑101 (MQ=255) tCGGTTACTTCAAATGTGCGCTTCTCATCCCAATGAAGCTGTACTTTGGATTCTATCTCTTCCGGGCGGTATTGCTCTTGCATGGCAGCCAGTGGTCCTGt > 1:7117538/1‑101 (MQ=255) cGGTTACTTCAAATGTGCGCTTCTCATCCCAATGAAGCTGTACTTTGGATTCTATCTCTTCCGGGCGGTATTGCTCTTGCATGGCAGCCAGTGGTCCTGtt < 1:8309842/101‑1 (MQ=255) cGGTTACTTCAAATGTGCGCTTCTCATCCCAATGAAGCTGTACTTTGGATTCTATCTCTTCCGGGCGGTATTGCTCTTGCATGGCAGCCAGTGGTCCTGtt > 1:2382251/1‑101 (MQ=255) ggctACTTCAAATGTGCGCTTCTCATCCCAATGAAGCTGTACTTTGGATTCTATCTCTTCCGGGCGGTATTGCTCTTGCATGGCAGCCAGTGGTCCTGttt > 1:12148916/4‑101 (MQ=255) ggTTACTTCAAATGTGCGCTTCTCATCCCAATGAAGCTGTACTTTGGATTCTATCTCTTCCGGGCGGTATTGCTCTTGCATGGCAGCCAGTGGTCCTGttt < 1:12047034/101‑1 (MQ=255) ggTTACTTCAAATGTGCGCTTCTCATCCCAATGAAGCTGTACTTTGGATTCTATCTCTTCCGGGCGGTATTGCTCTTGCATGGCAGCCAGTGGTCCTGttt > 1:4732889/1‑101 (MQ=255) ggTTACTTCAAATGTGCGCTTCTCATCCCAATGAAGCTGTACTTTGGATTCTATCTCTTCCGGGCGGTATTGCTCTTGCATGGCAGCCAGTGGTCCTGttt > 1:6392223/1‑101 (MQ=255) ttACTTCAAATGTGCGCTTCTCATCCCAATGAAGCTGTACTTTGGATTCTATCTCTTCCGGGCGGTATTGCTCTTGCATGGtggatttgcccctatattcc > 1:8726975‑M2/1‑81 (MQ=255) ttACTTCAAATGTGCGCTTCTCATCCCAATGAAGCTGTACTTTGGATTCTATCTCTTCCGGGCGGTATTGCTCTTGCATGGCAGCCAGTGGTCCTGTTTTc < 1:8949740/101‑1 (MQ=255) ttACTTCAAATGTGCGCTTCTCATCCCAATGAAGCTGTACTTTGGATTCTATCTCTTCCGGGCGGTATTGCTCTTGCATGGCAGCCAGTGGTCCTGTTTTc > 1:2500086/1‑101 (MQ=255) tACTTCAAATGTGCGCTTCTCATCCCAATGAAGCTGTACTTTGGATTCTATCTCTTCCGGGCGGTATTGCTCTTGCATGGCAGCCAGTGGTCCTGTTTTCa < 1:3808356/101‑1 (MQ=255) tACTTCAAATGTGCGCTTCTCATCCCAATGAAGCTGTACTTTGGATTCTATCTCTTCCGGGCGGTATTGCTCTTGCATGGCAGCCAGTGGTCCTGTTTTCa > 1:10170277/1‑101 (MQ=255) tACTTCAAATGTGCGCTTCTCATCCCAATGAAGCTGTACTTTGGATTCTATCTCTTCCGGGCGGTATTGCTCTTGCATGGCAGCCAGTGGTCCTGTTTTCa < 1:4422178/101‑1 (MQ=255) ttCAAATGTGCGCTTCTCATCCCAATGAAGCTGTACTTTGGATTCTATCTCTTCCGGGCGGTATTGCTCTTGCATGGCAGCCAGTGGTCCTGTTTTCAATa < 1:5798082/101‑1 (MQ=255) tCAAATGTGCGCTTCTCATCCCAATGAAGCTGTACTTTGGATTCTATCTCTTCCGGGCGGTATTGCTCTTGCATGGCAGCCAGTGGTCCTGTTTTCAATAc < 1:13117685/101‑1 (MQ=255) cAAATGTGCGCTTCTCATCCCAATGAAGCTGTACTTTGGATTCTATCTCTTCCGGGCGGTATTGCTCTTGCATGGtggatttgcccctatatttccagaca > 1:885960‑M2/1‑75 (MQ=255) cAAATGTGCGCTTCTCATCCCAATGAAGCTGTACTTTGGATTCTATCTCTTCCGGGCGGTATTGCTCTTGCATGGCAGCCAGTGGTCCTGTTTTCAATACg > 1:3687725/1‑101 (MQ=255) cAAATGTGCGCTTCTCATCCCAATGAAGCTGTACTTTGGATTCTATCTCTTCCGGGCGGTATTGCTCTTGCATGGCAGCCAGTGGTCCTGTTTTCAATACg > 1:14051348/1‑101 (MQ=255) aaaTGTGCGCTTCTCATCCCAATGAAGCTGTACTTTGGATTCTATCTCTTCCGGGCGGTATTGCTCTTGCATGGCAGCCAGTGGTCCTGTTTTCAATACgg > 1:10617584/1‑101 (MQ=255) aTGTGCGCTTCTCATCCCAATGAAGCTGTACTTTGGATTCTATCTCTTCCGGGCGGTATTGCTCTTGCATGGCAGCCAGTGGTCCTGTTTTCAATACGGCt > 1:9160062/1‑101 (MQ=255) aTGTGCGCTTCTCATCCCAATGAAGCTGTACTTTGGATTCTATCTCTTCCGGGCGGTATTGCTCTTGCATGGCAGCCAGTGGTCCTGTTTTCAATACGGCt < 1:3493865/101‑1 (MQ=255) tgtgCGCTTCTCATCCCAATGAAGCTGTACTTTGGATTCTATCTCTTCCGGGCGGTATTGCTCTTGCATGGCAGCCAGTGGTCCTGTTTTCAATACGGCTa > 1:6184288/1‑101 (MQ=255) tgtgCGCTTCTCATCCCAATGAAGCTGTACTTTGGATTCTATCTCTTCCGGGCGGTATTGCTCTTGCATGGCAGCCAGTGGTCCTGTTTTCAATACGGCTa < 1:3647153/101‑1 (MQ=255) actagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaCATGGCAGCCAGTGGTCCTGTTTTCAATACGGCTa < 1:6091050‑M2/35‑1 (MQ=255) gcgcTTCTCATCCCAATGAAGCTGTACTTTGGATTCTATCTCTTCCGGGCGGTATTGCTCTTGCATGGCAGCCAGTGGTCCTGTTTTCAATACGGCTACaa > 1:771941/1‑101 (MQ=255) cgcTTCTCATCCCAATGAAGCTGTACTTTGGATTCTATCTCTTCCGGGCGGTATTGCTCTTGCATGGCAGCCAGTGGTCCTGTTTTCAATACGGCTACaaa < 1:13279305/101‑1 (MQ=255) ttCTCATCCCAATGAAGCTGTACTTTGGATTCTATCTCTTCCGGGCGGTATTGCTCTTGCATGGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcac < 1:5451057‑M2/101‑38 (MQ=255) ttCTCATCCCAATGAAGCTGTACTTTGGATTCTATCTCTTCCGGGCGGTATTGCTCTTGCATGGCAGCCAGTGGTCCTGTTTTCAATACGGCTACAAATGt > 1:11612644/1‑101 (MQ=255) ttCTCATCCCAATGAAGCTGTACTTTGGATTCTATCTCTTCCGGGCGGTATTGCTCTTGCATGGCAGCCAGTGGTCCTGTTTTCAATACGGCTACAAATGt > 1:10922702/1‑101 (MQ=255) gactatcacttatttaagtgatagtggttgtctggagattcagggggccagtctaCATGGCAGCCAGTGGTCCTGTTTTCAATACGGCTGCAAATGTAGCg < 1:331132‑M2/46‑1 (MQ=255) cATCCCAATGAAGCTGTACTTTGGATTCTATCTCTTCCGGGCGGTATTGCTCTTGCATGGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaa < 1:11080391‑M2/101‑42 (MQ=255) actatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaCATGGCAGCCAGTGGTCCTGTTTTCAATACGGCTACAAATGTAGCGt < 1:4005222‑M2/47‑1 (MQ=255) tCCCAATGAAGCTGTACTTTGGATTCTATCTCTTCCGGGCGGTATTGCTCTTGCATGGCAGCCAGTGGTCCTGTTTTCAATACGGCTACAAATGTAGCGtt < 1:12798762/101‑1 (MQ=255) cccAATGAAGCTGTACTTTGGATTCTATCTCTTCCGGGCGGTATTGCTCTTGCATGGCAGCCAGTGGTCCTGTTTTCAATACGGCTACAAATGTAGCGTTg > 1:13779938/1‑101 (MQ=255) ccAATGAAGCTGTACTTTGGATTCTATCTCTTCCGGGCGGTATTGCTCTTGCATGGCAGCCAGTGGTCCTGTTTTCAATACGGCTACAAATGTAGCGTTGa < 1:9289597/101‑1 (MQ=255) cAATGAAGCTGTACTTTGGATTCTATCTCTTCCGGGCGGTATTGCTCTTGCATGGCAGCCAGTGGTCCTGTTTTCAATACGGCTACAAATGTAGCGTTGAg > 1:12722592/1‑101 (MQ=255) aTGAAGCTGTACTTTGGATTCTATCTCTTCCGGGCGGTATTGCTCTTGCATGGCAGCCAGTGGTCCTGTTTTCAATACGGCTACAAATGTAGCGTTGAggt < 1:1677891/101‑1 (MQ=255) tGAAGCTGTACTTTGGATTCTATCTCTTCCGGGCGGTATTGCTCTTGCATGGCAGCCAGTGGTCCTGTTTTCAATACGGCTACAAATGTAGCGTTGAggtg < 1:5646849/101‑1 (MQ=255) tGAAGCTGTACTTTGGATTCTATCTCTTCCGGGCGGTATTGCTCTTGCATGGCAGCCAGTGGTCCTGTTTTCAATACGGCTACAAATGTAGCGTTGAggtg < 1:11157634/101‑1 (MQ=255) cttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaCATGGCAGCCAGTGGTCCTGTTTTCAATACGGCTACAAATGTAGCGTTGAggtg > 1:9808335‑M2/48‑101 (MQ=255) gAAGCTGTACTTTGGATTCTATCTCTTCCGGGCGGTATTGCTCTTGCATGGCAGCCAGTGGTCCTGTTTTCAATACGGCTACAAATGTAGCGTTGAggtgg > 1:698685/1‑101 (MQ=255) aaGCTGTACTTTGGATTCTATCTCTTCCGGGCGGTATTGCTCTTGCATGGCAGCCAGTGGTCCTGTTTTCAATACGGCTACAAATGTAGCGTTGAggtggt > 1:13586690/1‑101 (MQ=255) aaGCTGTACTTTGGATTCTATCTCTTCCGGGCGGTATTGCTCTTGCATGGCAGCCAGTGGTCCTGTTTTCAATACGGCTACAAATGTAGCGTTGAggtggt < 1:14221399/101‑1 (MQ=255) gCTGTACTTTGGATTCTATCTCTTCCGGGCGGTATTGCTCTTGCATGGCAGCCAGTGGTCCTGTTTTCAATACGGCTACAAATGTAGCGTTGAGGTGGttt < 1:8137418/101‑1 (MQ=255) cTGTACTTTGGATTCTATCTCTTCCGGGCGGTATTGCTCTTGCATGGCAGCCAGTGGTCCTGTTTTCAATACGGCTACAAATGTAGCGTTGAGGTGGtttt > 1:6737818/1‑101 (MQ=255) tGTACTTTGGATTCTATCTCTTCCGGGCGGTATTGCTCTTGCATGGCAGCCAGTGGTCCTGTTTTCAATACGGCTACAAATGTAGCGTTGAGGTGGttttt < 1:4943732/101‑1 (MQ=255) tcagttGGACTCTATCCCTCCCCGGCGGTATTGCTCCTGCGTCGCAGGCAGTAGTCCTGTTTTCAATGCGGCTACAAATGTAGCGTTGAGGTGGGCTTTCa < 1:1413838/97‑1 (MQ=255) tACTTTGGATTCTATCTCTTCCGGGCGGTATTGCTCTTGCATGGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgc > 1:12462343‑M2/1‑44 (MQ=255) tACTTTGGATTCTATCTCTTCCGGGCGGTATTGCTCTTGCATGGCAGCCAGTGGTCCTGTTTTCAATACGGCTACAAATGTAGCGTTGAGGTGGTTTTTCa < 1:10011691/101‑1 (MQ=255) aCTTTGGATTCTATCTCTTCCGGGCGGTATTGCTCTTGCATGGCAGCCAGTGGTCCTGTTTTCAATACGGCTACAAATGTAGCGTTGAGGTGGTTTTTCAg > 1:4920829/1‑101 (MQ=255) cTTTGGATTCTATCTCTTCCGGGCGGTATTGCTCTTGCATGGCAGCCAGTGGTCCTGTTTTCAATACGGCTACAAATGTAGCGTTGAGGTGGTTTTTCAGa < 1:13006103/101‑1 (MQ=255) tttGGATTCTATCTCTTCCGGGCGGTATTGCTCTTGCATGGCAGCCAGTGGTCCTGTTTTCAATACGGCTACAAATGTAGCGTTGAGGTGGTTTTTCAGAt < 1:1522123/101‑1 (MQ=255) ggATTCTATCTCTTCCGGGCGGTATTGCTCTTGCATGGCAGCCAGTGGTCCTGTTTTCAATACGGCTACAAATGTAGCGTTGAGGTGGTTTTTCAGATcct < 1:7191103/101‑2 (MQ=255) ggATTCTATCTCTTCCGGGCGGTATTGCTCTTGCATGGCAGCCAGTGGTCCTGTTTTCAATACGGCTACAAATGTAGCGTTGAGGTGGTTTTTCAGATCCg < 1:11224170/101‑1 (MQ=255) ggATTCTATCTCTTCCGGGCGGTATTGCTCTTGCATGGCAGCCAGTGGTCCTGTTTTCAATACGGCTACAAATGTAGCGTTGAGGTGGTTTTTCAGATCCg < 1:7953278/101‑1 (MQ=255) aTTCTATCTCTTCCGGGCGGTATTGCTCTTGCATGGCAGCCAGTGGTCCTGTTTTCAATACGGCTACAAATGTAGCGTTGAGGTGGTTTTTCAGATCCgca > 1:9623679/1‑101 (MQ=255) aTTCTATCTCTTCCGGGCGGTATTGCTCTTGCATGGCAGCCAGTGGTCCTGTTTTCAATACGGCTACAAATGTAGCGTTGAGGTGGTTTTTCAGATCCgca < 1:7537145/101‑1 (MQ=255) tCTATCTCTTCCGGGCGGTATTGCTCTTGCATGGCAGCCAGTGGTCCTGTTTTCAATACGGCTACAAATGTAGCGTTGAGGTGGTTTTTCAGATCCgcata < 1:4117388/101‑1 (MQ=255) tCTATCTCTTCCGGGCGGTATTGCTCTTGCATGGCAGCCAGTGGTCCTGTTTTCAATACGGCTACAAATGTAGCGTTGAGGTGGTTTTTCAGATCCgcata < 1:2094018/101‑1 (MQ=255) tgtctggagattcagggggccagtctaCATGGCAGCCAGTGGTCCTGTTTTCAATACGGCTACAAATGTAGCGTTGAGGTGGTTTTTCAGATCCgcatagc > 1:5958065‑M2/28‑101 (MQ=255) tctcTTCCGGGCGGTATTGCTCTTGCATGGCAGCCAGTGGTCCTGTTTTCAATACGGCTACAAATGTAGCGTTGAGGTGGTTTTTCAGATCCgcatagcat > 1:2938148/1‑101 (MQ=255) tctcTTCCGGGCGGTATTGCTCTTGCATGGCAGCCAGTGGTCCTGTTTTCAATACGGCTACAAATGTAGCGTTGAGGTGGTTTTTCAGATCCgcatagcat < 1:5593964/101‑1 (MQ=255) ctctTCCGGGCGGTATTGCTCTTGCATGGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcc < 1:2791491‑M2/101‑73 (MQ=255) ccGGGCGGTATTGCTCTTGCATGGCAGCCAGTGGTCCTGTTTTCAATACGGCTACAAATGTAGCGTTGAGGTGGTTTTTCAGATCCGCATAGCATAGCCCa < 1:8443320/101‑1 (MQ=255) cGGGCGGTATTGCTCTTGCATGGCAGCCAGTGGTCCTGTTTTCAATACGGCTACAAATGTAGCGTTGAGGTGGTTTTTCAGATCCGCATAGCATAGCCCaa > 1:2671804/1‑101 (MQ=255) gggCGGTATTGCTCTTGCATGGCAGCCAGTGGTCCTGTTTTCAATACGGCTACAAATGTAGCGTTGAGGTGGTTTTTCAGATCCGCATAGCATAGCCCaaa > 1:11537898/1‑101 (MQ=255) ggCGGTATTGCTCTTGCATGGCAGCCAGTGGTCCTGTTTTCAATGCGGCTACAAATGTAGCGTTGAGGTGGTTTTTCGGATCCGAATAGGATGGCCCAAAc > 1:5324833/1‑101 (MQ=255) gCGGTATTGCTCTTGCATGGCAGCCAGTGGTCCTGTTTTCAATACGGCTACAAATGTAGCGTTGAGGTGGTTTTTCAGATCCGCATAGCATAGCCCAAACg > 1:7887594/1‑101 (MQ=255) gCGGTATTGCTCTTGCATGGCAGCCAGTGGTCCTGTTTTCAATACGGCTACAAATGTAGCGTTGAGGTGGTTTTTCAGATCCGCATAGCATAGCCCAAACg > 1:1261274/1‑101 (MQ=255) cGGTATTGTTATTGCATGGCCGCCTGTCGTCCTGTTTTCCATACGGCTAAAAATGTAGCGTTGAGGTTGTTTTTCAGATCCGCATAGCATAACCCTAACGt < 1:6294148/101‑1 (MQ=255) ggTATTGCTCTTGCATGGCAGCCAGTGGTCCTGTTTTCAATACGGCTACAAATGTAGCGTTGAGGTGGTTTTTCAGATCCGCATAGCATAGCCCAAACGTc < 1:11915980/101‑1 (MQ=255) ggTATTGCTCTTGCATGGCAGCCAGTGGTCCTGTTTTCAATACGGCTACAAATGTAGCGTTGAGGTGGTTTTTCAGATCCGCATAGCATAGCCCAAACGTc > 1:10336810/1‑101 (MQ=255) ggTATTGCTCTTGCATGGCAGCCAGTGGTCCTGTTTTAAATACGGCTACAAATGTAGCGTTGAGGTGGTTTTTCAGATCCGCATAGCATAGCCCAAACGTc > 1:1962983/1‑101 (MQ=255) tGCTCTTGCATGGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataac < 1:5019757‑M2/101‑89 (MQ=255) ctctTGCATGGCAGCCAGTGGTCCTGTTTTCAATACGGCTACAAATGTAGCGTTGAGGTGGTTTTTCAGATCCGCATAGCATAGCCCAAACGTCCGCGTCa < 1:1767012/101‑1 (MQ=255) ctTGCATGGCAGCCAGTGGTCCTGTTTTCAATACGGCTACAAATGTAGCGTTGAGGTGGTTTTTCAGATCCGCATAGCATAGCCCAAACGTCCGCGTCaaa < 1:1228136/101‑1 (MQ=255) ctTGCATGGCAGCCAGTGGTCCTGTTTTCAATACGGCTACAAATGTAGCGTTGAGGTGGTTTTTCAGATCCGCATAGCATAGCCCAAACGTCCGCGTCaaa < 1:11370112/101‑1 (MQ=255) ttGCATGGCAGCCAGTGGTCCTGTTTTCAATACGGCTACAAATGTAGCGTTGAGGTGGTTTTTCAGATCCGCATAGCATAGCCCAAACGTCCGCGTCaaaa > 1:7823298/1‑101 (MQ=255) cATGGCAGCCAGTGGTCCTGTTTTCAATACGGCTACAAATGTAGCGTTGAGGTGGTTTTTCAGATCCGCATAGCATAGCCCAAACGTCCGCGTCAAAACAg > 1:3228340/1‑101 (MQ=255) cATGGCAGCCAGTGGTCCTGTTTTCAATACGGCTACAAATGTAGCGTTGAGGTGGTTTTTCAGATCCGCATAGCATAGCCCAAACGTCCGCGTCAAAACAg < 1:10117469/101‑1 (MQ=255) | ACTTCTCTTTGCTCTCGTCTTCGGTTACTTCAAATGTGCGCTTCTCATCCCAATGAAGCTGTACTTTGGATTCTATCTCTTCCGGGCGGTATTGCTCTTGCATGGCAGCCAGTGGTCCTGTTTTCAATACGGCTACAAATGTAGCGTTGAGGTGGTTTTTCAGATCCGCATAGCATAGCCCAAACGTCCGCGTCAAAACAG > NC_007779/675103‑675303 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |