| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_007779 | 4,200,197 | A→G | 14.9% | K271E (AAA→GAA) | rpoA → | RNA polymerase subunit alpha |
| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_007779 | 4,200,197 | 0 | A→G | 14.9% | 145.5 ‑1.0 ‑0.2 | 323 | K271E (AAA→GAA) | rpoA | RNA polymerase subunit alpha |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (22/26): ref base (147/128): total (169/154) | ||||||||||
| Fisher's exact test strand distribution p-value = 3.51e-01 | ||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 5.92e-01 | ||||||||||
Only 100 of 345 total aligned reads displayed.
ACGTCAGCCTGAAGTGAAAGAAGAGAAACCAGAGTTCGATCCGATCCTGCTGCGCCCTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTATCCACTATATCGGTGATCTGGTACAGCGTACCGAGGTTGAGCTCCTTAAAACGCCTAACCTTGGTAAAAAATCTCTTACTGAGATTAA > NC_007779/4200097‑4200297 | aCGTCAGCCTGAAGTGAAAGAAGAGAAACCAGAGTTCGATCCGATCCTGCTGCGCCCTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTa < 1:2609682/101‑1 (MQ=255) cGTCAGCCTGAAGTGAAAGAAGAGAAACCAGAGTTCGATCCGATCCTGCTGCGCCCTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTaa > 1:10265171/1‑101 (MQ=255) gTCAGCCTGAAGTGAAAGAAGAGAAACCAGAGTTCGATCCGATCCTGCTGCGCCCTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTgaa > 1:8483938/1‑101 (MQ=255) gTCAGCCTGAAGTGAAAGAAGAGAAACCAGAGTTCGATCCGATCCTGCTGCGCCCTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTaaa > 1:10838356/1‑101 (MQ=255) tCAGCCTGAAGTGAAAGAAGAGAAACCAGAGTTCGATCCGATCCTGCTGCGCCCTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAAg > 1:6744460/1‑101 (MQ=255) tCAGCCTGAAGTGAAAGAAGAGAAACCAGAGTTCGATCCGATCCTGCTGCGCCCTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAAg < 1:8743326/101‑1 (MQ=255) cTGAAGTGAAAGAAGAGAAACCAGAGTTCGATCCGATCCTGCTGCGCCCTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAAGCAGaa > 1:13738863/1‑101 (MQ=255) tGAAGTGAAAGAAGAGAAACCAGAGTTCGATCCGATCCTGCTGCGCCCTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAg > 1:4187437/1‑101 (MQ=255) tGAAGTGAAAGAAGAGAAACCAGAGTTCGATCCGATCCTGCTGCGCCCTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAg < 1:12015840/101‑1 (MQ=255) agagAAAGAAGAGAAACCAGAGTTCGATCCGATGCTGCTGCGCCCTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTCAAGCAGAAGCTa > 1:9742977/4‑101 (MQ=255) aGTGAAAGATGAGAAACCAGAGTTCGATCCGATCCTGCTGCGCCCTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTa > 1:12515680/1‑101 (MQ=255) aGTGAAAGAAGAGAAACCAGAGTTCGATCCGATCCTGCTGCGCCCTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTa > 1:9249185/1‑101 (MQ=255) tGAAAGAAGAGAAACCAGAGTTCGATCCGATCCTGCTGCGCCCTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTATc < 1:3033883/101‑1 (MQ=255) tGAAAGAAGAGAAACCAGAGTTCGATCCGATCCTGCTGCGCCCTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTATc > 1:8331239/1‑101 (MQ=255) tGAAAGAAGAGAAACCAGAGTTCGATCCGATCCTGCTGCGCCCTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTATc < 1:5181557/101‑1 (MQ=255) gAAAGAAGAGAAACCAGAGTTCGATCCGATCCTGCTGCGCCCTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTATcc > 1:3972807/1‑101 (MQ=255) aaaGAAGAGAAACCAGAGTTCGATCCGATCCTGCTGCGCCCTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTATCCa < 1:8552803/101‑1 (MQ=255) aaaGAAGAGAAACCAGAGTTCGATCCGATCCTGCTGCGCCCTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTATCCa > 1:6890708/1‑101 (MQ=255) gaagaGAAACCAGAGTTCGATCCGATCCTGCTGCGCCCTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTATCCACta < 1:5676417/101‑1 (MQ=255) gaagaGAAACCAGAGTTCGATCCGATCCTGCTGCGCCCTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCGCTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTATCCACta < 1:12796380/101‑1 (MQ=255) aagtGAAACCAGAGTTCGATCCGATCCTGCTGCGCCCTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTATCCACtat < 1:7077241/101‑1 (MQ=255) aagaGAAACCAGAGTTCGATCCGATCCTGCTGCGCCCTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTATCCACtat > 1:1332281/1‑101 (MQ=255) gagaAACCAGAGTTCGATCCGATCCTGCTGCGCCCTGTTGACGATCTGGAATTGGCTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTATCCACTatat < 1:4272895/101‑1 (MQ=255) agaAACCAGAGTTCGATCCGATCCTGCTGCGCCCTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGTCTTAAAGCAGAAGCTATCCACTATATc < 1:14486127/101‑1 (MQ=255) gaAACCAGAGTTCGATCCGATCCTGCTGCGCCCTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTGAAGCAGAAGCTATCCACTATATCg < 1:10068361/101‑1 (MQ=255) gaAACCAGAGTTCGATCCGATCCTGCTGCGCCCTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTATCCACTATATCg > 1:4593476/1‑101 (MQ=255) gaAACCAGAGTTCGATCCGATCCTGCTGCGCCCTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTATCCACTATATCg > 1:13424086/1‑101 (MQ=255) aaaCCAGAGTTCGATCCGATCCTGCTGCGCCCTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTATCCACTATATCgg > 1:8429633/1‑101 (MQ=255) aCCAGAGTTCGATCCGATCCTGCTGCGCCCTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTGAAGCAGAAGCTATCCACTATATCGGTg < 1:6322505/101‑1 (MQ=255) cAGAGTTCGATCCGATCCTGCTGCGCCCTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTGAAGCAGAAGCTATCCACTATATCGGTGAt < 1:6114251/101‑1 (MQ=255) gagTTCGATCCGATCCTGCTGCGCCCTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTATCCACTATATCGGTGATCt > 1:2403855/1‑101 (MQ=255) tCGATCCGATCCTGCTGCGCCCTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTATCCACTATATCGGTGATCTGGTa < 1:9140897/101‑1 (MQ=255) tCGATCCGATCCTGCTGCGCCCTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTATCCACTATATCGGTGATCTGGTa > 1:5051072/1‑101 (MQ=255) tCGATCCGATCCTGCTGCGCCCTGTTGACGACCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTATCCACTATATCGGTGATCTGGTa > 1:10215145/1‑101 (MQ=255) cgatccgatcCTGCTGCGCCCTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTATCCACTATATCGGTGATCTGGTAc < 1:1313729/101‑1 (MQ=255) gatccgatccTGCTGCGCCCTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTATCCACTATATCGGTGATCTGGTACa > 1:5520191/1‑101 (MQ=255) tccgatccTGCTGCGCCCTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTATCCACTATATCGGTGATCTGGTACAGc < 1:3809686/101‑1 (MQ=255) tccgatccTGCTGCGCCCTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTATCCACTATATCGGTGATCTGGTACAGc < 1:964167/101‑1 (MQ=255) ccgatccTGCTGCGCCCTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTGAAGCAGAAGCTATCCACTATATCGGTGATCTGGTACAGCg < 1:5425804/101‑1 (MQ=255) ccgatccTGCTGCGCCCTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTATCCACTATATCGGTGATCTGGTACAGCg > 1:2131180/1‑101 (MQ=255) ccgatccTGCTGCGCCCTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTATCCACTATATCGGTGATCTGGTACAGCg > 1:13864195/1‑101 (MQ=255) ccgatccTGCTGCGCCCTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTATCCACTATATCGGTGATCTGGTACAGCg < 1:7695018/101‑1 (MQ=255) cgatccTGCTGCGCCCTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTATCCACTATATCGGTGATCTGGTACAGCGt < 1:7202610/101‑1 (MQ=255) cgatccTGCTGCGCCCTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTATCCACTATATCGGTGATCTGGTACAGCGt > 1:10519772/1‑101 (MQ=255) gatccTGCTGCGCCCTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTATCCACTATATCGGTGATCTGGTACAGCGTa > 1:6485524/1‑101 (MQ=255) gatccTGCTGCGCCCTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTATCCACTATATCGGTGATCTGGTACAGCGTa > 1:6617706/1‑101 (MQ=255) gatccTGCTGCGCCCTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTATCCACTATATCGGTGATCTGGTACAGCGTa > 1:6996468/1‑101 (MQ=255) atccTGCTGCGCCCTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTGAAGCAGAAGCTATCCACTATATCGGTGATCTGGTACAGCGTAc > 1:7541987/1‑101 (MQ=255) tccTGCTGCGCCCTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTGAAGCAGAAGCTATCCACTATATCGGTGATCTGGTACAGCGTAcc > 1:4156909/1‑101 (MQ=255) ctgctgCGCCCTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTGAAGCAGAAGCTATCCACTATATCGGTGATCTGGTACAGCGTACCGa < 1:9312649/101‑1 (MQ=255) ctgctgCGCCCTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTATCCACTATATCGGTGATCTGGTACAGCGTACCGa > 1:7396097/1‑101 (MQ=255) tgctgcGCCCTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTATCCACTATATCGGTGATCTGGTACAGCGTACCGAg < 1:2934570/101‑1 (MQ=255) gctgcGCCCTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTATCCACTATATCGGTGATCTGGTACAGCGTACCGAgg > 1:197013/1‑101 (MQ=255) ctgcGCCCTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTGAAGCAGAAGCTATCCACTATATCGGTGATCTGGTACAGCGTACCGAGGt > 1:9562168/1‑101 (MQ=255) ctgcGCCCTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTATCCACTATATCGGTGATCTGGTACAGCGTACCGAGGt > 1:11447300/1‑101 (MQ=255) tgcGCCCTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTATCCACTATATCGGTGATCTGGTACAGCGTACCGAGGtt > 1:13778560/1‑101 (MQ=255) gcgcCCTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTATCCACTATATCGGTGATCTGGTACAGCGTACCGAGGTTg < 1:11173114/101‑1 (MQ=255) cgcCCTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTGAAGCAGAAGCTATCCACTATATCGGTGATCTGGTACAGCGTACCGAGGTTGa < 1:14152471/101‑1 (MQ=255) gcCCTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTATCCACTATATCGGTGATCTGGTACAGCGTACCGAGGTTGAg < 1:8888382/101‑1 (MQ=255) gcCCTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTATCCACTATATCGGTGATCTGGTACAGCGTACCGAGGTTGAg < 1:4484584/101‑1 (MQ=255) gcCCTGTTGACGATCGGGAATTGACTGTCCGCGGTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAGGCTACCCACTATATCGGTGATCTGGTACAGCGTACCGAGGTTGAg < 1:3575494/101‑1 (MQ=255) cccTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTATCCACTATATCGGTGATCTGGTACAGCGTACCGAGGTTGAGc < 1:12893313/101‑1 (MQ=255) cccTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTATCCACTATATCGGTGATCTGGTACAGCGTACCGAGGTTGAGc < 1:340241/101‑1 (MQ=255) gTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTATCCACTATATCGGTGATCTGGTACAGCGTACCGAGGTTGAGCTCCt > 1:12572544/1‑101 (MQ=255) ttGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTATCCACTATATCGGTGATCTGGTACAGCGTACCGAGGTTGAGCTCCtt < 1:5281966/101‑1 (MQ=255) ttGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTATCCACTATATCGGTGATCTGGTACAGCGTACCGAGGTTGAGCTCCtt > 1:9431705/1‑101 (MQ=255) tGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTGAAGCAGAAGCTATCCACTATATCGGTGATCTGGTACAGCGTACCGAGGTTGAGCTCCTTa > 1:14047169/1‑101 (MQ=255) tGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTATCCACTATATCGGTGATCTGGTACAGCGTACCGAGGTTGAGCTCCTTa < 1:11976456/101‑1 (MQ=255) tGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTATCCACTATATCGGTGATCTGGTACAGCGTACCGAGGTTGAGCTCCTTa < 1:507056/101‑1 (MQ=255) tGACGATCGGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTATCCACTATATCGGTGATCTGGTACAGCGTACCGAGGTTGAGCTCCTTa < 1:3247620/101‑1 (MQ=255) gACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTATCCACTATATCGGTGATCTGGTACAGCGTACCGAGGTTGAGCTCCTTaa < 1:1515974/101‑1 (MQ=255) aTCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTATCCACTATATCGGTGATCTGGTACAGCGTACCGAGGTTGAGCTCCTTAAAACg < 1:14111640/101‑1 (MQ=255) aTCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTATCCACTATATCGGTGATCTGGTACAGCGTACCGAGGTTGAGCTCCTTAAAACg < 1:13461565/101‑1 (MQ=255) tCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTATCCACTATATCGGTGATCTGGTACAGCGTACCGAGGTTGAGCTCCTTAAAACGc < 1:14398462/101‑1 (MQ=255) tGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTATCCACTATATCGGTGATCTGGTACAGCGTACCGAGGTTGAGCTCCTTAAAACGCCt < 1:11340089/101‑1 (MQ=255) ggAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTATCCACTATATCGGTGATCTGGTACAGCGTACCGAGGTTGAGCTCCTTAAAACGCCTa > 1:6002640/1‑101 (MQ=255) aTTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTGAAGCAGAAGCTATCCACTATATCGGTGATCTGGTACAGCGTACCGAGGTTGAGCTCCTTAAAACGCCTAAcc < 1:11037149/101‑1 (MQ=255) gACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTATCCACTATATCGGTGATCTGGTACAGCGTACCGAGGTTGAGCTCCTTAAAACGCCTAACCTTg < 1:9806673/101‑1 (MQ=255) tGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTGAAGCAGAAGCTATCCACTATATCGGTGATCTGGTACAGCGTACCGAGGTTGAGCTCCTTAAAACGCCTAACCTTGGTa < 1:11921464/101‑1 (MQ=255) gTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTATCCACTATATCGGTGATCTGGTACAGCGTACCGAGGTTGAGCTCCTTAAAACGCCTAACCTTGGTaa < 1:13179744/101‑1 (MQ=255) gTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTATCCACTATATCGGTGATCTGGTACAGCGTACCGAGGTTGAGCTCCTTAAAACGCCTAACCTTGGTaa > 1:13590086/1‑101 (MQ=255) tCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTATCCACTATATCGGTGATCTGGTACAGCGTACCGAGGTTGAGCTCCTTAAAACGCCTAACCTTGGTaaa < 1:4418035/101‑1 (MQ=255) tCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTATCCACTATATCGGTGATCTGGTACAGCGTACCGAGGTTGAGCTCCTTAAAACGCCTAACCTTGGTaaa < 1:11675057/101‑1 (MQ=255) ccGCTCTGCTAACTGCCTTGAAGCAGAAGCTATCCACTATATCGGTGATCTGGTACAGCGTACCGAGGTTGAGCTCCTTAAAACGCCTAACCTTGGTaaaa < 1:10698303/101‑1 (MQ=255) ccGCTCTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTATCCACTATATCGGTGATCTGGTACAGCGTACCGAGGTTGAGCTCCTTAAAACGCCTAACCTTGGTaaaa > 1:2316639/1‑101 (MQ=255) cGCTCTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTATCCACTATATCGGTGATCTGGTACAGCGTACCGAGGTTGAGCTCCTTAAAACGCCTAACCTTGGTaaaaa > 1:9405387/1‑101 (MQ=255) cGCTCTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTATCCACTATATCGGTGATCTGGTACAGCGTACCGAGGTTGAGCTCCTTAAAACGCCTAACCTTGGTaaaaa > 1:3147411/1‑101 (MQ=255) gCTCTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTATCCACTATATCGGTGATCTGGTACAGCGTACCGAGGTTGAGCTCCTTAAAACGCCTAACCTTGGTaaaaaa > 1:1804126/1‑101 (MQ=255) tctGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTATCCACTATATCGGTGATCTGGTACAGCGTACCGAGGTTGAGCTCCTTAAAACGCCTAACCTTGGTAAAAAAtc < 1:826517/101‑1 (MQ=255) tGCTAACTGCCTTGAAGCAGAAGCTATCCACTATATCGGTGATCTGGTACAGCGTACCGAGGTTGAGCTCCTTAAAACGCCTAACCTTGGTAAAAAAtctc > 1:10367683/1‑101 (MQ=255) gCTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTATCCACTATATCGGTGATCTGGTACAGCGTACCGAGGTTGAGCTCCTTAAAACGCCTAACCTTGGTAAAAAATctct > 1:7308415/1‑101 (MQ=255) cTAACTGCCTTGAAGCAGAAGCTATCCACTATATCGGTGATCTGGTACAGCGTACCGAGGTTGAGCTCCTTAAAACGCCTAACCTTGGTAAAAAATCTCtt > 1:493323/1‑101 (MQ=255) cTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTATCCACTATATCGGTGATCTGGTACAGCGTACCGAGGTTGAGCTCCTTAAAACGCCTAACCTTGGTAAAAAATCTCtt < 1:8973912/101‑1 (MQ=255) tAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTATCCACTATATCGGTGATCTGGTACAGCGTACCGAGGTTGAGCTCCTTAAAACGCCTAACCTTGGTAAAAAATCTCTTa > 1:1207864/1‑101 (MQ=255) aaCTGCCTTAAAGCAGAAGCTATCCACTATATCGGTGATCTGGTACAGCGTACCGAGGTTGAGCTCCTTAAAACGACTAACCTTGGTAAAAAATCTCTTAc > 1:4735132/1‑101 (MQ=255) aCTGCCTTAAAGCAGAAGCTATCCACTATATCGGTGATCTGGTACAGCGTACCGAGGTTGAGCTCCTTAAAACGCCTAACCTTGGTAAAAAATCTCTTACt > 1:8237355/1‑101 (MQ=255) tGCCTTAAAGCAGAAGCTATCCACTATATCGGTGATCTGGTACAGCGTACCGAGGTTGAGCTCCTTAAAACGCCTAACCTTGGTAAAAAATCTCTTACTga > 1:7961364/1‑101 (MQ=255) tGCCTTAAAGCAGAAGCTATCCACTATATCGGTGATCTGGTACAGCGTACCGAGGTTGAGCTCCTTAAAACGCCTAACCTTGGTAAAAAATCTCTTACTga > 1:1564521/1‑101 (MQ=255) ccTTAAAGCAGAAGCTATCCACTATATCGGTGATCTGGTACAGCGTACCGAGGTTGAGCTCCTTAAAACGCCTAACCTTGGTAAAGAATCTCTTACTgaga > 1:8686309/1‑101 (MQ=255) cTTAAAGCAGAAGCTATCCACTATATCGGTGATCTGGTACAGCGTACCGAGGTTGAGCTCCTTAAAACGCCTAACCTTGGTAAAAAATCTCTTACTGAGAt < 1:7576897/101‑1 (MQ=255) | ACGTCAGCCTGAAGTGAAAGAAGAGAAACCAGAGTTCGATCCGATCCTGCTGCGCCCTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTATCCACTATATCGGTGATCTGGTACAGCGTACCGAGGTTGAGCTCCTTAAAACGCCTAACCTTGGTAAAAAATCTCTTACTGAGATTAA > NC_007779/4200097‑4200297 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |