| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_007779 | = 1305037 | 12 (0.050) | 214 (0.970) | 124/172 | NT | 94.9% | coding (425/921 nt) | oppB | oligopeptide transporter subunit |
| ? | NC_007779 | 2519723 = | NA (NA) | intergenic (+33/‑54) | nupC/insL | nucleoside (except guanosine) transporter/transposase | |||||
Only 100 of 278 total aligned reads displayed.
GCGGTAATACTGGGTGTTAGTGCTGGCGTTATTGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_007779/1304934‑1305037‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tcccATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTG > NC_007779/2519723‑2519822 GTAATACTGGGTGTTAGTGCTGGCGTTATTGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCC < 1:7307846/101‑1 ATACTGGGCGTTAGTGCTGGCGTTATTGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATTACCGGGGTTGTTATCCCATA > 1:10810072/1‑101 TACTGGGTGTTAGTGCTGGCGTTATTGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCATAA < 1:9477953/101‑1 CTGGGTGTTAGTGCTGGCGTTATTGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCATAAGC > 1:10647202/1‑101 GGGTGTTAGTGCTGGCGTTATTGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCATAAGCGC > 1:2981730/1‑101 GGGTGTTAGTGCTGGCGTTATTGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCATAAGCGC > 1:600244/1‑101 TGTTAGTGCTGGCGTTATTGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCATAAGCGCTAA < 1:11138679/101‑1 GTTAGTGCTGGCGTTATTGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCATAAGCGCTAAC < 1:10491315/101‑1 TTAGTGCTGGCGTTATTGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCATAAGCGCTAACT > 1:2082058/1‑101 TTAGTGCTGGCGTTATTGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCATAAGCGCTAACT < 1:101/101‑1 TAGTGCTGGCGTTATTGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCATAAGCGCTAACTT > 1:6781419/1‑101 TGCTGGCGTTATTGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCATAAGCGCTAACTTAAG > 1:6911501/1‑101 GCTGGCGTTATTGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCATAAGCGCTAATTTAAGG < 1:8353151/101‑1 CTGGCGTTATTGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGG < 1:1799476/101‑1 TGGCGTTATTGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGT > 1:6187819/1‑101 TGGCGTTATTGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGT < 1:393792/101‑1 TTATTGCCGCATTAAAACAAAACCCCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGG < 1:2785857/101‑1 TTATTGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGG < 1:2336055/101‑1 TATTGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGT > 1:4670120/1‑101 TATTGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGT > 1:3107082/1‑101 TATTGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGT < 1:9576200/101‑1 ATTGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTA < 1:4531379/101‑1 TTGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTAT < 1:3151636/101‑1 TGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATT < 1:8913209/101‑1 TGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATT < 1:7495652/101‑1 TGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATT < 1:6388446/101‑1 TGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATT > 1:5275350/1‑101 CCGCATTAAAACAAAACGCCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTAC < 1:2539536/101‑1 CCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTAC < 1:2993077/101‑1 CGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACG < 1:5669193/101‑1 GCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGC > 1:8235622/1‑101 ATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCT < 1:11218490/101‑1 TAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGA > 1:8521975/1‑101 AAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGAT > 1:2417576/1‑101 AAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGAT > 1:1228382/1‑101 CACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAA > 1:2119490/1‑101 CCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACG > 1:3538499/1‑101 CCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACG < 1:3762066/101‑1 CAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGT > 1:5963798/1‑101 CAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGT < 1:4388798/101‑1 CAAATGGGACTATACCGTGAAGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGT < 1:2880497/101‑1 AATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGC < 1:9833862/101‑1 AATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGC > 1:3421888/1‑101 AATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGC < 1:7873666/101‑1 AATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGC < 1:7214276/101‑1 GGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGA > 1:8695498/1‑101 GGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGA < 1:5163059/101‑1 GACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATG > 1:6423222/1‑101 GACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATG > 1:1619399/1‑101 ACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGA > 1:321841/1‑101 CTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAA < 1:6265755/101‑1 TATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAAT < 1:2161774/101‑1 TATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAAT > 1:8425710/1‑101 TATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAAT > 1:7143731/1‑101 TACCGTGATGGGGNTGNNNANNACCGGGGTTGTTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTA < 1:3667367/101‑1 TACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTA > 1:2618584/1‑101 ACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTAC < 1:1360566/101‑1 ACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTAC < 1:3607706/101‑1 CCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACT < 1:5576077/101‑1 CCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACT < 1:4828462/101‑1 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CCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATAT < 1:5613312/101‑1 CCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATT < 1:8673411/101‑1 CCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATT > 1:3709913/1‑101 CCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATT < 1:7731938/101‑1 CCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATT < 1:7225545/101‑1 CATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTG > 1:61400/1‑101 CATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTG < 1:3995535/101‑1 CATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTG < 1:11087011/101‑1 GCGGTAATACTGGGTGTTAGTGCTGGCGTTATTGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_007779/1304934‑1305037‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tcccATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTG > NC_007779/2519723‑2519822 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |