| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_007779 | 274,733 | Δ97,240 bp | 100% | [mmuP]–[mhpD] | 90 genes [mmuP], mmuM, afuC, afuB, insB, insA, ykgN, yagB, yagA, yagE, yagF, yagG, yagH, yagI, argF, insB, insA, yagJ, yagK, yagL, yagM, yagN, intF, yagP, yagQ, yagR, yagS, yagT, yagU, ykgJ, yagV, yagW, yagX, yagY, yagZ, ykgK, ykgL, Y75_p4288, Y75_p4289, eaeH, insE, insF, ykgA, ykgB, ykgI, ykgC, ykgD, ykgE, ykgF, ykgG, ykgH, betA, betB, betI, betT, yahA, yahB, yahC, yahD, yahE, yahF, yahG, yahH, yahI, yahJ, yahK, yahL, yahM, yahN, yahO, prpR, prpB, prpC, prpD, prpE, codB, codA, cynR, cynT, cynS, cynX, lacA, lacY, lacZ, lacI, mhpR, mhpA, mhpB, mhpC, [mhpD] |
|
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_007779 | 274733 | 371972 | 97240 | 225 [0] | [0] 225 | [mmuP]–[mhpD] | 90 genes [mmuP], mmuM, afuC, afuB, insB, insA, ykgN, yagB, yagA, yagE, yagF, yagG, yagH, yagI, argF, insB, insA, yagJ, yagK, yagL, yagM, yagN, intF, yagP, yagQ, yagR, yagS, yagT, yagU, ykgJ, yagV, yagW, yagX, yagY, yagZ, ykgK, ykgL, Y75_p4288, Y75_p4289, eaeH, insE, insF, ykgA, ykgB, ykgI, ykgC, ykgD, ykgE, ykgF, ykgG, ykgH, betA, betB, betI, betT, yahA, yahB, yahC, yahD, yahE, yahF, yahG, yahH, yahI, yahJ, yahK, yahL, yahM, yahN, yahO, prpR, prpB, prpC, prpD, prpE, codB, codA, cynR, cynT, cynS, cynX, lacA, lacY, lacZ, lacI, mhpR, mhpA, mhpB, mhpC, [mhpD] |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_007779 | = 274732 | 0 (0.000) | 175 (0.850) | 92/160 | NT | 100% | coding (184/1404 nt) | mmuP | S‑methylmethionine transporter |
| ? | NC_007779 | 371973 = | 0 (0.000) | coding (635/810 nt) | mhpD | 2‑keto‑4‑pentenoate hydratase | |||||
Only 100 of 225 total aligned reads displayed.
AAAACTGCGCCATGAAGATGACGCGTAATAACGAAGAGGTTTCTAGCGGGCGCGGCAGCGAATGCCTGGGACATCCGCTTAATGCGGCCGTCTGGCTGGCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCATTCTTACCGGGGCATTAGGTCCGATGGTGGCGGTGAATGCGGGCGATCGTTTT > NC_007779/371874‑372073 | gcacaggattattcttcaataccgggtacatcatttccaccactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCa > 1:8615289‑M2/100‑101 (MQ=255) acaggattattcttcaataccgggtacatcatttccaccactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctgggggtctggctggCACg > 1:106394‑M2/98‑101 (MQ=255) aggattattcttcaataccgggtacatcatttccaccactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctgggggtctggctggCACGCa > 1:1682751‑M2/96‑101 (MQ=255) gattattcttcaataccgggtacatcatttccaccactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCaaa > 1:4986421‑M2/94‑101 (MQ=255) gattattcttcaataccgggtacatcatttccaccactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCaaa > 1:6987480‑M2/94‑101 (MQ=255) attattcttcaataccgggtacatcatttccaccactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCaaaa > 1:1504848‑M2/93‑101 (MQ=255) tattcttcaataccgggtacatcatttccaccactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATg < 1:3111657‑M2/11‑1 (MQ=255) attcttcaataccgggtacatcatttccaccactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATgg > 1:6700153‑M2/90‑101 (MQ=255) tcttcaataccgggtacatcatttccaccactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGcc < 1:7341059‑M2/14‑1 (MQ=255) tcttcaataccgggtacatcatttccaccactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGcc > 1:5496944‑M2/88‑101 (MQ=255) ttcaataccgggtacatcatttccaccactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAg > 1:4688500‑M2/86‑101 (MQ=255) ttcaataccgggtacatcatttccaccactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAg < 1:3734916‑M2/16‑1 (MQ=255) tcaataccgggtacatcatttccaccactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGt < 1:10541018‑M2/17‑1 (MQ=255) tcaataccgggtacatcatttccaccactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGt < 1:2524870‑M2/17‑1 (MQ=255) taccgggtacatcatttccaccactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTgg < 1:8065509‑M2/21‑1 (MQ=255) taccgggtacatcatttccaccactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTgg < 1:3657151‑M2/21‑1 (MQ=255) ccgggtacatcatttccaccactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCCAAATGGCCAGGCtgggg > 1:5988858‑M2/79‑100 (MQ=255) cgggtacatcatttccaccactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTg < 1:453386‑M2/24‑1 (MQ=255) cgggtacatcatttccaccactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTg < 1:5053603‑M2/24‑1 (MQ=255) ggtacatcatttccaccactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCCGTCTGGgtgga > 1:5898471‑M2/76‑99 (MQ=255) ggtacatcatttccaccactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGaa < 1:1526218‑M2/26‑1 (MQ=255) ggtacatcatttccaccactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGaa < 1:7044913‑M2/26‑1 (MQ=255) gtacatcatttccaccactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAAc < 1:7755305‑M2/27‑1 (MQ=255) catcatttccaccactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCCGTCTGGGGGAACCGc > 1:5476303‑M2/72‑101 (MQ=255) catttccaccactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTgc < 1:4754679‑M2/33‑1 (MQ=255) catttccaccactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAAAGGCCAGTCTGGGGGAACCGCTgc > 1:5957367‑M2/69‑101 (MQ=255) tttccaccactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTgcgc < 1:7385898‑M2/35‑1 (MQ=255) tttccaccactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAATCTGGGTGAAACCCTgcgc > 1:4835320‑M2/67‑101 (MQ=255) ttccaccactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGGGAACCGCTGCGCa > 1:5417158‑M2/66‑101 (MQ=255) tccaccactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCAc < 1:261015‑M2/37‑1 (MQ=255) ccaccactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGGGAACCGCTGCGCAcc > 1:6851765‑M2/64‑101 (MQ=255) ccaccactggagcggcgggaacgctgctcgcccatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCAcc > 1:7523549‑M2/64‑101 (MQ=255) caccactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCg > 1:1006440‑M2/63‑101 (MQ=255) cactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGgag < 1:2787709‑M2/42‑1 (MQ=255) cactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGgag > 1:1492931‑M2/60‑101 (MQ=255) cactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGgag < 1:1432162‑M2/42‑1 (MQ=255) actggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGgaga < 1:6266707‑M2/43‑1 (MQ=255) actggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGGGAACCGCTGCGCACCGgaga > 1:10365213‑M2/59‑101 (MQ=255) actggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctgggggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGgaga > 1:11600153‑M2/59‑101 (MQ=255) ctggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGat > 1:10838714‑M2/58‑101 (MQ=255) tggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGata > 1:11403861‑M2/57‑101 (MQ=255) ggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctgggggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGatat > 1:9062037‑M2/56‑101 (MQ=255) cggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCAtt < 1:9194823‑M2/50‑1 (MQ=255) ggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCATTc > 1:9242435‑M2/51‑101 (MQ=255) gcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCATTCt < 1:3018022‑M2/52‑1 (MQ=255) gcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCATTCt < 1:2478012‑M2/52‑1 (MQ=255) gcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCATTCt < 1:5714224‑M2/52‑1 (MQ=255) cgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCATTCtt < 1:4860532‑M2/53‑1 (MQ=255) 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tggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCATTCTTACCGGGGCATTAGGTCCGAtggtgg < 1:2110292‑M2/78‑1 (MQ=255) tggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCATTCTTACCGGGGCATTAGGTCCGAtggtgg < 1:102367‑M2/78‑1 (MQ=255) gtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCATTCTTACCGGGGCATTAGGTCCGATGGTGGCg < 1:10738113‑M2/80‑1 (MQ=255) gcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCATTCTTACCGGGGCATTAGGTCCGATGGTGGCGGt > 1:8553307‑M2/20‑101 (MQ=255) ggctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCATTCTTACCGGGGCATTAGGTCCGATGGTGGCGGTg < 1:1984983‑M2/83‑1 (MQ=255) ctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCATTCTTACCGGGGCATTAGGTCCGATGGTGGCGGTGaa < 1:9473406‑M2/85‑1 (MQ=255) tggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCATTCTTACCGGGGCATTAGGTCCGATGGTGGCGGTGAAt > 1:10434251‑M2/16‑101 (MQ=255) tggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCATTCTTACCGGGGCATTAGGTCCGATGGTGGCGGTGAAt < 1:8798286‑M2/86‑1 (MQ=255) ggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCATTCTTACCGGGGCATTAGGTCCGATGGTGGCGGTGAATg < 1:5650200‑M2/87‑1 (MQ=255) tggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCATTCTTACCGGGGCATTAGGTCCGATGGTGGCGGTGAATGCg < 1:9795094‑M2/89‑1 (MQ=255) ggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCATTCTTACCGGGGCATTAGGTCCGATGGTGGCGGTGAATGCgg < 1:9098269‑M2/90‑1 (MQ=255) ggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCATTCTTACCGGGGCATTAGGTCCGATGGTGGCGGTGAATGCgg < 1:2231427‑M2/90‑1 (MQ=255) gtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCATTCTTACCGGGGCATTAGGTCCGATGGTGGCGGTGAATGCggg < 1:8313812‑M2/91‑1 (MQ=255) gtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCATTCTTACCGGGGCATTAGGTCCGATGGTGGCGGTGAATGCggg > 1:3722730‑M2/11‑101 (MQ=255) gctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCATTCTTACCGGGGCATTAGGTCCGATGGTGGCGGTGAATGCGGGCGATc < 1:6640646‑M2/96‑1 (MQ=255) ctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCATTCTTACCGGGGCATTAGGTCCGATGGTGGCGGTGAATGCGGGCGATCg < 1:6024620‑M2/97‑1 (MQ=255) tggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCATTCTTACCGGGGCATTAGGTCCGATGGTGGCGGTGAATGCGGGCGATCGt > 1:6952530‑M2/4‑101 (MQ=255) tggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCATTCTTACCGGGGCATTAGGTCCGATGGTGGCGGTGAATGCGGGCGATCGt < 1:11148694‑M2/98‑1 (MQ=255) tggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCATTCTTACCGGGGCATTAGGTCCGATGGTGGCGGTGAATGCGGGCGATCGt > 1:11245050‑M2/4‑101 (MQ=255) tggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCATTCTTACCGGGGCATTAGGTCCGATGGTGGCGGTGAATGCGGGCGATCGt > 1:4632593‑M2/4‑101 (MQ=255) tggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCATTCTTACCGGGGCATTAGGTCCGATGGTGGCGGTGAATGCGGGCGATCGt > 1:4029042‑M2/4‑101 (MQ=255) gCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCATTCTTACCGGGGCATTAGGTCCGATGGTGGCGGTGAATGCGGGCGATCGttt < 1:2386965‑M2/100‑1 (MQ=255) cACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCATTCTTACCGGGGCATTAGGTCCGATGGTGGCGGTGAATGCGGGCGATCGtttt > 1:2300491/1‑101 (MQ=255) cACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCATTCTTACCGGGGCATTAGGTCCGATGGTGGCGGTGAATGCGGGCGATCGtttt < 1:2672277/101‑1 (MQ=255) | AAAACTGCGCCATGAAGATGACGCGTAATAACGAAGAGGTTTCTAGCGGGCGCGGCAGCGAATGCCTGGGACATCCGCTTAATGCGGCCGTCTGGCTGGCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCATTCTTACCGGGGCATTAGGTCCGATGGTGGCGGTGAATGCGGGCGATCGTTTT > NC_007779/371874‑372073 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |