Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_007779 | 1,496,775 | Δ1 bp | 100% | coding (11/924 nt) | ydcI ← | DNA‑binding transcriptional regulator |
Read alignment evidence... | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_007779 | 1,496,775 | 0 | T→. | 100.0% | 1662.1 | 340 | coding (11/924 nt) | ydcI | DNA‑binding transcriptional regulator |
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (157/183): ref base (0/0): total (157/183) |
Only 100 of 376 total aligned reads displayed.
CAAATTAAGGGTTTCAGCCGCGCGCCCCAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTATTTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTGATTGCAAAATATTATTAACAATTAAAG > NC_007779/1496675‑1496874 | cAAATTAAGGGTTTCAGCCGCGCGCCCCAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTAt > 1:5291370/1‑101 (MQ=255) cAAATTAAGGGTTTCAGCCGCGCGCCCCAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTAt > 1:8989240/1‑101 (MQ=255) aaTTAAGGGTTTCAGCCGCGTGCCCCAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTAttt > 1:777590/1‑101 (MQ=255) aTTAAGGGTTTCAGCCGCGCGCCCCAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTAtttt < 1:10289912/101‑1 (MQ=255) aTTAAGGGTTTCAGCCGCGCGCCCCAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTAtttt > 1:11849606/1‑101 (MQ=255) ttAAGGGTTTCAGCCGCGCGCCCCAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTAttttt < 1:9253056/101‑1 (MQ=255) tAAGGGTTTCAGCCGCGCGCCCCAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTAtttttt < 1:3110726/101‑1 (MQ=255) tAAGGGTTTCAGCCGCGCGCCCCAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTAtttttt < 1:9654316/101‑1 (MQ=255) aaGGGTTTCAGCCGCGCGCCCCAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGAAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTAttttttc > 1:7854018/1‑100 (MQ=255) aGGGTTTCAGCCGCGCGCCCCAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTAttttttcc < 1:8812827/101‑3 (MQ=255) ggTTTCAGCCGCGCGCCCCAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTAttttttccat < 1:3833364/101‑5 (MQ=255) tttCAGCCGCGCGCCCCACAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATaa > 1:4551350/1‑101 (MQ=255) tttCAGCCGCGCGCCCCAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAGTGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATaa > 1:4833932/1‑101 (MQ=255) tttCAGCCGCGCGCCCCAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATaa > 1:6975/1‑101 (MQ=255) tCAGCCGCGCGCCCCAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGc < 1:12551174/101‑1 (MQ=255) tCAGCCGCGCGCCCCAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGc < 1:11446217/101‑1 (MQ=255) tCAGCCGCGCGCCCCAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGc < 1:3323740/101‑1 (MQ=255) cAGCCGCGCGCCCCAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCg > 1:1221665/1‑101 (MQ=255) cAGCCGCGCGCCCCAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCg > 1:1904342/1‑101 (MQ=255) cAGCCGCGCGCCCCAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCg < 1:2165323/101‑1 (MQ=255) aGCCGCGCGCCCCAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGGGa < 1:14272644/101‑1 (MQ=255) aGCCGCGCGCCCCAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGa > 1:18153418/1‑101 (MQ=255) gCCGCGCGCCCCAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGAt > 1:16910669/1‑101 (MQ=255) gCCGCGCGCCCCAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGAt < 1:3524383/101‑1 (MQ=255) ccGCGCGCCCCAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATg > 1:2824336/1‑101 (MQ=255) ccGCGCGCCCCAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATg > 1:253364/1‑101 (MQ=255) ccGCGCGCCCCAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATg > 1:7561951/1‑101 (MQ=255) ccGCGCGCCCCAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATg < 1:4348954/101‑1 (MQ=255) gcgcgcCCCAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGtt < 1:15997723/101‑1 (MQ=255) gcccgcCCCAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACTAATGTATTAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGtt < 1:6781229/98‑1 (MQ=255) cgcgcCCCAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTa > 1:3681327/1‑101 (MQ=255) cgcgcCCCAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGCCGCAAACGGATGCGCTGACT‑AACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTaa < 1:5251570/101‑1 (MQ=255) cgcCCCAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTaaa > 1:13899181/1‑101 (MQ=255) gcCCCAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTaaaa < 1:14809428/101‑1 (MQ=255) gcCCCAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTaaaa < 1:15526709/101‑1 (MQ=255) ccccAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTaaaaa < 1:12029884/101‑1 (MQ=255) ccAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACg < 1:7386699/101‑1 (MQ=255) cAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGa < 1:13563849/101‑1 (MQ=255) cAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGa > 1:4983573/1‑101 (MQ=255) aaGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTGTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAg > 1:13390927/1‑101 (MQ=255) aGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGc < 1:6231862/101‑1 (MQ=255) aGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGc < 1:9422545/101‑1 (MQ=255) aGTTCCTTGTTGCGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGc < 1:2345161/101‑1 (MQ=255) gTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCg < 1:17386471/101‑1 (MQ=255) gTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCg < 1:2950533/101‑1 (MQ=255) ttCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCgg < 1:6344102/101‑1 (MQ=255) tCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGgt > 1:9367875/1‑101 (MQ=255) tCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGCTAAAAACGAAGCGgt > 1:12906257/1‑101 (MQ=255) ttgttgTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTc < 1:8252523/101‑1 (MQ=255) ttgttgTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTc < 1:1828038/101‑1 (MQ=255) tgttgtGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCg < 1:15017390/101‑1 (MQ=255) tgtgCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTg < 1:8333096/101‑1 (MQ=255) gtgCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAATCAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGa < 1:11591592/101‑1 (MQ=255) tgCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGAc > 1:18371486/1‑101 (MQ=255) gCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACa < 1:11502217/101‑1 (MQ=255) gACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAg > 1:16366396/1‑101 (MQ=255) gCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGaa < 1:5983391/101‑1 (MQ=255) gCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGaa < 1:12447377/101‑1 (MQ=255) cTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAg > 1:885502/1‑101 (MQ=255) tACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAgt > 1:660185/1‑101 (MQ=255) gAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAgttgt < 1:10097537/101‑1 (MQ=255) aaTGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAgttgtt < 1:14616647/101‑1 (MQ=255) aaTGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAgttgtt < 1:11209715/101‑1 (MQ=255) gTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTGTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGa < 1:16523636/101‑1 (MQ=255) tATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGAt > 1:18624/1‑101 (MQ=255) tGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGCCTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTa > 1:534588/1‑101 (MQ=255) ggTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGAt < 1:17203792/101‑1 (MQ=255) ggTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGAt > 1:8660077/1‑101 (MQ=255) gTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATa < 1:10711140/101‑1 (MQ=255) ggCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAAc > 1:8164899/1‑101 (MQ=255) ggCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAAc < 1:5533589/101‑1 (MQ=255) gcgcAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACt > 1:12761830/1‑101 (MQ=255) cgcAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACtt < 1:16315896/101‑1 (MQ=255) gcAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTg < 1:10813077/101‑1 (MQ=255) gcAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTg < 1:6469060/101‑1 (MQ=255) gcAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTg > 1:14941344/1‑101 (MQ=255) cAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTGa < 1:14433068/101‑1 (MQ=255) aaaCGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTGAt < 1:10523593/101‑1 (MQ=255) aaaCGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTGAt > 1:2613640/1‑101 (MQ=255) aaaCGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTGAt < 1:9214713/101‑1 (MQ=255) aaaCGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTGAt < 1:9141217/101‑1 (MQ=255) aCGGATGCGCTGACTAAATAGACTATTTTTTCCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTGAtt < 1:2751612/101‑1 (MQ=255) cGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTGATTGc > 1:17986175/1‑101 (MQ=255) ggATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGCAGTTGTTTGATTATGATAACTTGATTGCa > 1:4011229/1‑101 (MQ=255) tGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTGATTGCaaaa < 1:17741216/101‑1 (MQ=255) cgcTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTGATTGCAAAata < 1:16216807/101‑1 (MQ=255) cgcTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTGATTGCAAAata < 1:15200107/101‑1 (MQ=255) gcTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTGATTGCAAAatat > 1:17892975/1‑101 (MQ=255) gcTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTGATTGCAAAatat > 1:10897491/1‑101 (MQ=255) gcTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTGATTGCAAAatat > 1:13831589/1‑101 (MQ=255) gcTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTGATTGCAAAatat > 1:14057843/1‑101 (MQ=255) gcTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTGATTGCAAAatat < 1:14524805/101‑1 (MQ=255) tGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACTAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTGATTGCAAAAtatta < 1:10971751/101‑1 (MQ=255) tGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTGATTGCAAAAtatta < 1:13001960/101‑1 (MQ=255) aCTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTGATTGCAAAATattatt < 1:7991128/101‑1 (MQ=255) tAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTGATTGCAAAATATTATTaa > 1:13696386/1‑101 (MQ=255) aaaCAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTGATTGCAAAATATTATTAAc > 1:4118043/1‑101 (MQ=255) aaaCAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTGATTGCAAAATATTATTAAc > 1:7712926/1‑101 (MQ=255) aaCAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTGATTGCAAAATATTATTAACa > 1:12935886/1‑101 (MQ=255) aGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTGATTGCAAAATATTATTAACAAtt > 1:15324581/1‑101 (MQ=255) | CAAATTAAGGGTTTCAGCCGCGCGCCCCAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTATTTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTGATTGCAAAATATTATTAACAATTAAAG > NC_007779/1496675‑1496874 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |