New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_007779 | = 3186081 | NA (NA) | 396 (1.120) | 156/178 | NT | 99.0% | coding (26/2466 nt) | yqiG | outer membrane usher protein |
? | NC_007779 | 3512753 = | 4 (0.010) | coding (529/1026 nt) | cytR | DNA‑binding transcriptional dual regulator |
Only 100 of 451 total aligned reads displayed.
AGTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAATTCAACAAAGATTTAATCGAAGCCGAAGATCGTGAAAACGTTAACCTTTCCCAATTTGAA > NC_007779/3185985‑3186181 | aGTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGtt < 1:15149203/101‑1 (MQ=31) tGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTat > 1:6467332/1‑101 (MQ=32) gcgcTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTatc > 1:13959357/1‑101 (MQ=33) gcTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTatcat < 1:13169531/101‑1 (MQ=35) cTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTatcatc > 1:14076637/1‑101 (MQ=37) tGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTAtcatca > 1:4701525/1‑101 (MQ=38) tGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTAtcatca < 1:3987001/101‑1 (MQ=38) tGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATATCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTAtcatca > 1:235462/1‑101 (MQ=38) gggTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAGGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATcatcat < 1:1759697/101‑1 (MQ=255) ttATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTgg > 1:1241346/1‑101 (MQ=255) tATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGt < 1:7420148/101‑1 (MQ=255) gctcgcCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTtgtg > 1:716823/1‑101 (MQ=255) gctcgcCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTtgtg < 1:16786293/101‑1 (MQ=255) gctcgcCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTtgtg > 1:1866456/1‑101 (MQ=255) ctcgcCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGc > 1:12867266/1‑101 (MQ=255) ctcgcCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGc > 1:2031882/1‑101 (MQ=255) ctcgcCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGc > 1:7608867/1‑101 (MQ=255) tcgcCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTgttagcgta < 1:14560773/101‑9 (MQ=255) tcgcCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCg > 1:11302111/1‑101 (MQ=255) gcCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTc < 1:545129/101‑1 (MQ=255) ccACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCa > 1:16968412/1‑101 (MQ=255) cACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAg > 1:15230887/1‑101 (MQ=255) aCGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGc < 1:16017163/101‑1 (MQ=255) cGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCt > 1:6086151/1‑101 (MQ=255) ggAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTa < 1:7830436/101‑1 (MQ=255) ggAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTa < 1:9417824/101‑1 (MQ=255) ggAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTa > 1:9806741/1‑101 (MQ=255) ggAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTa > 1:10721325/1‑101 (MQ=255) gAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTAt < 1:17271020/101‑1 (MQ=255) gAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTAt < 1:16443019/101‑1 (MQ=255) aaTATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATg < 1:6254794/101‑1 (MQ=255) atCTCCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCg > 1:10009115/1‑101 (MQ=255) gCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGa > 1:14900688/1‑101 (MQ=255) ggCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAAt > 1:8037490/1‑101 (MQ=255) ggCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAAt < 1:17097847/101‑1 (MQ=255) aGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAATTca < 1:3901020/101‑1 (MQ=255) gCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAATTcaa > 1:5933402/1‑101 (MQ=255) cGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAATTcaac > 1:519943/1‑101 (MQ=255) gggCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAATTcaaca < 1:5584181/101‑1 (MQ=255) gggCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAATTcaaca < 1:8440697/101‑1 (MQ=255) gggCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAATTcaaca < 1:15777963/101‑1 (MQ=255) gggCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAATTcaaca > 1:13730763/1‑101 (MQ=255) ggCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAATTcaacaa > 1:15294668/1‑101 (MQ=255) ggCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAATTcaacaa < 1:291629/101‑1 (MQ=255) gCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAATTCAACaaa > 1:7090848/1‑101 (MQ=255) tGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCGGTTGAATTCAACAAAGAt < 1:8223052/101‑1 (MQ=255) tGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAATTCAACAAAGAt > 1:12092506/1‑101 (MQ=255) tAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAATTCAACAAAGAttt < 1:17714619/101‑1 (MQ=255) tAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAATTCAACAAAGAttt > 1:459779/1‑101 (MQ=255) aaTGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCTTTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAATTCAACAAAGATTTa < 1:12325095/101‑1 (MQ=255) aaTGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGTCGTTGAATTCAACAAAGATTTa > 1:3273921/1‑101 (MQ=255) aaTGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAATTCAACAAAGATTTa > 1:9599990/1‑101 (MQ=255) aTGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAATTCAACAAAGATTTaa < 1:16201300/101‑1 (MQ=255) tGGGTTAATTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAATTCAACAAAGATTTAAt < 1:9305246/101‑1 (MQ=255) ggTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAATTCAACAAAGATTTAATCg < 1:15483557/101‑1 (MQ=255) ggTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAATTCAACAAAGATTTAATCg > 1:11739801/1‑101 (MQ=255) ttAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAATTCAACAAAGATTTAATCGaa < 1:15867725/101‑1 (MQ=255) aaGTGATAACAGATGTCTGGAAATTTAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAATTCAACAAACATTTAATCGAAGc > 1:3868193/1‑101 (MQ=255) aaGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAATTCAACAAAGATTTAATCGAAGc < 1:1204959/101‑1 (MQ=255) aaGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAATTCAACAAAGATTTAATCGAAGc < 1:14308328/101‑1 (MQ=255) aaGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAATTCAACAAAGATTTAATCGAAGc > 1:3097758/1‑101 (MQ=255) aaGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAATTCAACAAAGATTTAATCGAAGc < 1:6934716/101‑1 (MQ=255) aGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAATTCAACAAAGATTTAATCGAAGcc < 1:4315370/101‑1 (MQ=255) gTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAATTCAACAAAGATTTAATCGAAGCCg < 1:13465226/101‑1 (MQ=255) tGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAATTCAACAAAGATTTAATCGAAGCCGa > 1:10351139/1‑101 (MQ=255) tGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAATTCAACAAAGATTTAATCGAAGCCGa > 1:12725846/1‑101 (MQ=255) tGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAATTCAACAAAGATTTAATCGAAGCCGa < 1:6732468/101‑1 (MQ=255) gATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAATTCAACAAAGATTTAATCGAAGCCGaa < 1:11499047/101‑1 (MQ=255) tAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAATTCAACAAAGATTTAATCGAAGCCGAAGa > 1:6614372/1‑101 (MQ=255) aCAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAATTCAACAAAGATTTAATCGAAGCCGAAGATc > 1:17373121/1‑101 (MQ=255) cAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAATTCAACAAAGATTTAATCGAAGCCGAAGATCg < 1:10525544/101‑1 (MQ=255) cAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAATTCAACAAAGATTTAATCGAAGCCGAAGATCg < 1:11033668/101‑1 (MQ=255) aGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAATTCAACAAAGATTTAATCGAAGCCGAAGATCGt > 1:75002/1‑101 (MQ=255) aGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAATTCAACAAAGATTTAATCGAAGCCGAAGATCGt > 1:1798405/1‑101 (MQ=255) gATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAATTCAACAAAGATTTAATCGAAGCCGAAGATCGTg > 1:5280095/1‑101 (MQ=255) tGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAATTCAACAAAGATTTAATCGAAGCCGAAGATCGTGaa < 1:13839562/101‑1 (MQ=255) 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cTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAATTCAACAAAGATTTAATCGAAGCCGAAGATCGTGAAAAc < 1:13607826/101‑1 (MQ=255) cTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAATTCAACAAAGATTTAATCGAAGCCGAAGATCGTGAAAAc < 1:8724776/101‑1 (MQ=255) tGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAATTCAACAAAGATTTAATCGAAGCCGAAGATCGTGAAAACg > 1:8583365/1‑101 (MQ=255) tGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAATTCAACAAAGATTTAATCGAAGCCGAAGATCGTGAAAACg > 1:11409516/1‑101 (MQ=255) ggAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAATTCAACAAAGATTTAATCGAAGCCGAAGATCGTGAAAACGt > 1:4866277/1‑101 (MQ=255) aaaTATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAATTCAACAAAGATTTAATCGAAGCCGAAGATCGTGAAAACGTTa < 1:814717/101‑1 (MQ=255) aaaTATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAATTCAACAAAGATTTAATCGAAGCCGAAGATCGTGAAAACGTTa < 1:15608437/101‑1 (MQ=255) aaTATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAATTCAACAAAGATTTAATCGAAGCCGAAGATCGTGAAAACGTTaa < 1:2785178/101‑1 (MQ=255) tataGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAATTCAACAAAGATTTAATCGAAGCCGAAGATCGTGAAAACGTTAAcc > 1:2475633/1‑101 (MQ=255) taGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAATTCAACAAAGATTTAATCGAAGCCGAAGATCGTGAAAACGTTAACCtt < 1:10871020/101‑1 (MQ=255) gggCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAATTCAACAAAGATTTAATCGAAGCCGAAGATCGTGAAAACGTTAACCTTTcc < 1:5755838/101‑1 (MQ=255) ggCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAATTCAACAAAGATTTAATCGAAGCCGAAGATCGTGAAAACGTTAACCTTTccc < 1:11678647/101‑1 (MQ=255) gCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAATTCAACAAAGATTTAATCGAAGCCGAAGATCGTGAAAACGTTAACCTTTCCCa < 1:15010765/101‑1 (MQ=255) aaTCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAATTCAACAAAGATTTAATCGAAGCCGAAGATCGTGAAAACGTTAACCTTTCCCAAtt > 1:18176575/1‑101 (MQ=255) aaTCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAATTCAACAAAGATTTAATCGAAGCCGAAGATCGTGAAAACGTTAACCTTTCCCAAtt < 1:3677965/101‑1 (MQ=255) aTCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAATTCAACAAAGATTTAATCGAAGCCGAAGATCGTGAAAACGTTAACCTTTCCCAAttt < 1:2534851/101‑1 (MQ=255) ccAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAATTCAACAAAGATTTAATCGAAGCCGAAGATCGTGAAAACGTTAACCTTTCCCAATTTGa > 1:14696044/1‑101 (MQ=255) | AGTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCATCATTGGTTGTGCGTCAGCTTATGCCGTTGAATTCAACAAAGATTTAATCGAAGCCGAAGATCGTGAAAACGTTAACCTTTCCCAATTTGAA > NC_007779/3185985‑3186181 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |