New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_007779 | = 1980095 | 0 (0.000) | 246 (0.960) | 126/178 | NT | 100% | intergenic (‑175/+260) | flhD/insH | DNA‑binding transcriptional dual regulator/IS5 element protein |
? | NC_007779 | 2176984 = | NA (NA) | intergenic (‑283/‑67) | gatB/insH | PTS system galactitol‑specific transporter subunit IIB/IS5 element protein |
Only 100 of 260 total aligned reads displayed.
AATTAGCATTAGAATAGTTGCGATAAGCTGCAATAAGCAGAACCACCTTTTTGGTTTAATATGTCCTTACAAATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_007779/1979995‑1980095 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATGAGTCATCAACTTACCTTCGCCG > NC_007779/2176984‑2177075 AATTAGCATTAGAATAGTTGCGATAAGCTGCAATAAGCAGAACCACCTTTTTGGTTTAATATGTCCTTACAAATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAG < 1:5530612/101‑1 AGCATTAGAATAGTTGCGATAAGCTGCAATAAGCAGAACCACCTTTTTGGTTTAATATGTCCTTACAAATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGGAAG > 1:3636655/1‑101 GCATTAGAATAGTTGCGATAAGCTGCAATAAGCAGAACCACCTTTTTGGTTTAATATGTCCTTACAAATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGGAAGG > 1:624005/1‑101 CATTAGAATAGTTGCGATAAGCTGCAATAAGCAGAACCACCTTTTTGGTTTAATATGTCCTTACAAATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGGAAGGT < 1:2327778/101‑1 CATTAGAATAGTTGCGATAAGCTGCAATAAGCAGAACCACCTTTTTGGTTTAATATGTCCTTACAAATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGGAAGGT < 1:3268927/101‑1 ATTAGAATAGTTGCGATAAGCTGCAATAAGCAGAACCACCTTTTTGGTTTAATATGTCCTTACAAATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGGAAGGTG > 1:930075/1‑101 TAGAATAGTTGCGATAAGCTGCAATAAGCAGAACCACCTTTTTGGTTTAATATGTCCTTACAAATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGGAAGGTGCG > 1:9386298/1‑101 AGAATAGTTGCGATAAGCTGCAATAAGCAGAACCACCTTTTTGGTTTAATATGTCCTTACAAATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGGAAGGTGCGA > 1:4499950/1‑101 AGAATAGTTGCGATAAGCTGCAATAAGCAGAACCACCTTTTTGGTTTAATATGTCCTTACAAATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGGAAGGTGCGA < 1:6163982/101‑1 ATAGTTGCGATAAGCTGCAATAAGCAGAACCACCTTTTTGGTTTAATATGTCCTTACAAATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGGAAGGTGCGAACA > 1:11351441/1‑101 AGTTGCGATAAGCTGCAATAAGCAGAACCACCTTTTTGGTTTAATATGTCCTTACAAATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGGAAGGTGCGAACAAG < 1:11001782/101‑1 AGTTGCGAT‑AGCTGCAATAAGCAGAACCACCTTTTTGGTTTAATATGTCCTTACAAATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGGAAGGTGCGAACAAGT > 1:12891791/1‑101 TTGCGATAAGCTGCAATAAGCAGAACCACCTTTTTGGTTTAATATGTCCTTACAAATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTC > 1:12116174/1‑101 GATAAGCTGCAATAAGCAGAACCACCTTTTTGGTTTAATATGTCCTTACAAATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTG > 1:12496619/1‑101 TAAGCTGCAATAAGCAGAACCACCTTTTTGGTTTAATATGTCCTTACAAATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGGAAGGGGCGAACAAGTCCCTGAT > 1:11501459/1‑101 AGCTGCAATAAGCAGAACCACCTTTTTGGTTTAATATGTCCTTACAAATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATAT > 1:7346217/1‑101 AGCTGCAATAAGCAGAACCACCTTTTTGGTTTAATATGTCCTTACAAATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATAT < 1:10605767/101‑1 GCTGCAATAAGCAGAACCACCTTTTTGGTTTAATATGTCCTTACAAATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATG > 1:6362787/1‑101 GCAATAAGCAGAACCACCTTTTTGGTTTAATATGTCCTTACAAATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGA < 1:4156835/101‑1 GCAATAAGCAGAACCACCTTTTTGGTTTAATATGTCCTTACAAATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGA > 1:7485272/1‑101 GCAATAAGCAGAACCACCTTTTTGGTTTAATATGTCCTTACAAATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGA > 1:12933554/1‑101 GCAATAAGCAGAACCACCTTTTTGGTTTAATATGTCCTTACAAATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGA > 1:9864841/1‑101 CAATAAGCAGAACCACCTTTTTGGTTTAATATGTCCTTACAAATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGAT > 1:11621473/1‑101 CAATAAGCAGAACCACCTTTTTGGTTTAATATGTCCTTACAAATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGAT < 1:7731250/101‑1 AATAAGCAGAACCACCTTTTTGGTTTAATATGTCCTTTCATATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATC < 1:9182340/101‑1 AATAAGCAGAACCACCTTTTTGGTTTAATATGTCCTTACAAATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATC > 1:228013/1‑101 TAAGCAGAACCACCTTTTTGGTTTAATATGTCCTTACAAATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCAT < 1:6324261/101‑1 AAGCAGAACCACCTTTTTGGTTTAATATGTCCTTACAAATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATG > 1:11222249/1‑101 AAGCAGAACCACCTTTTTGGTTTAATATGTCCTTACAAATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATG > 1:1691057/1‑101 AAGCAGAACCACCTTTTTGGTTTAATATGTCCTTACAAATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATG > 1:731227/1‑101 AGCAGAACCACCTTTTTGGTTTAATATGTCCTTACAAATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGT > 1:8020393/1‑101 GCAGAACCACCTTTTTGGTTTAATATGTCCTTACAAATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTT > 1:8657471/1‑101 AGAACCACCTTTTTGGTTTAATATGTCCTTACAAATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTG > 1:6049208/1‑101 GAACCACCTTTTTGGTTTAATATGTCCTTACAAATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGT > 1:6861552/1‑101 AACCACCTTTTTGGTTTAATATGTCCTTACAAATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTC > 1:4307427/1‑101 ACCACCTTTTTGGTTTAATATGTCCTTACAAATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCA < 1:5332820/101‑1 CCACCTTTTTGGTTTAATATGTCCTTACAAATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCAT > 1:1627883/1‑101 CCACCTTTTTGGTTTAATATGTCCTTACAAATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCAT > 1:13009109/1‑101 CCTTTTTGGTTTAATATGTCCTTACAAATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTG < 1:3672924/101‑1 CCTTTTTGGTTTAATATGTCCTTACAAATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTG < 1:1510075/101‑1 TTTTGGTTTAATATGTCCTTACAAATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAG < 1:2252896/101‑1 TTTTGGTTTAATATGTCCTTACAAATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAG < 1:12724373/101‑1 TTTGGTTTAATATGTCCTTACAAATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGC > 1:6503779/1‑101 GGTTTAATATGTCCTTACAAATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCAT > 1:603997/1‑101 GTTTAATATGTCCTTACAAATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATA < 1:1865121/101‑1 TTTAATATGTCCTTACAAATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAG > 1:3980108/1‑101 TTAATATGTCCTTACAAATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGA < 1:3361904/101‑1 TTAATATGTCCTTACAAATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGA > 1:5764867/1‑101 TAATATGTCCTTACAAATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAA > 1:5057989/1‑101 TAATATGTCCTTACAAATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAA > 1:4382941/1‑101 AATATGTCCTTACAAATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAAC > 1:12791159/1‑101 AATATGTCCTTACAAATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAAC < 1:8963387/101‑1 AATATGTCCTTACAAATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAAC < 1:11992348/101‑1 ATATGTCCTTACAAATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACA > 1:12662274/1‑101 ATATGTCCTTACAAATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACA < 1:10340094/101‑1 ATATGTCCTTACAAATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACA < 1:12198528/101‑1 TATGTCCTTACAAATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAG < 1:9325098/101‑1 TATGTCCTTACAAATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAG > 1:9782832/1‑101 TGTCCTTACAAATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGG < 1:8285502/101‑1 TGTCCTTACAAATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGG > 1:5891/1‑101 CCTTACAAATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTC > 1:11144684/1‑101 TTACAAATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCAT < 1:12829237/101‑1 TACAAATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATC < 1:3761089/101‑1 TACAAATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATC > 1:9533679/1‑101 TACAAATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATC < 1:2728420/101‑1 TACAAATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATC > 1:2516830/1‑101 ACAAATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCA < 1:5639427/101‑1 AAATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATG < 1:2402663/101‑1 ATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATGAG > 1:1412921/1‑101 AGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATGAGTC > 1:4850106/1‑101 GAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATGAGTCA < 1:4797840/101‑1 GAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATGAGTCA > 1:10200752/1‑101 AAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATGAGTCAT > 1:2038942/1‑101 AATGGGTCTTTACACTTATCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATGAGTCATC < 1:10522570/101‑1 AATGGGTCTTTACACTTATCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATGAGTCATC > 1:9608864/1‑101 ATGGGTCTTTACACTTATCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATGAGTCATCA > 1:12217130/1‑101 TGGGTCTTTACACTTATCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATGAGTCATCAA < 1:4208600/101‑1 GGGTCTTTACACTTATCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATGAGTCATCAAC > 1:3509890/1‑101 GGTCTTTACACTTATCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATGAGTCATCAACT < 1:2587814/101‑1 GTCTTTACACTTATCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATGAGTCATCAACTT < 1:11924288/101‑1 TCTTTACACTTATCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATGAGTCATCAACTTA > 1:7096715/1‑101 TCTTTACACTTATCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATGAGTCATCAACTTA < 1:10088598/101‑1 TCTTTACACTTATCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATGAGTAATCAACTTA < 1:8755075/101‑1 CTTTACACTTATCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATGAGTCATCAACTTAC > 1:8913463/1‑101 TTTACACTTATCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATGAGTCATCAACTTACC > 1:760300/1‑101 TTTACACTTATCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATGAGTCATCAACTTACC < 1:7004072/101‑1 TTTACACTTATCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATGAGTCATCAACTTACC > 1:4865118/1‑101 TACACTTATCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATGAGTCATCAACTTACCTT > 1:2767891/1‑101 TACACTTATCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATGAGTCATCAACTTACCTT < 1:3792473/101‑1 ACACTTATCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATGAGTCATCAACTTACCTTC > 1:8415327/1‑101 ACACTTATCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATGAGTCATCAACTTACCTTC < 1:2945482/101‑1 CACTTATCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATGAGTCATCAACTTACCTTCG > 1:5868502/1‑101 CACTTATCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATGAGTCATCAACTTACCTTCG > 1:4538984/1‑101 CACTTACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATGAGTCATCAACTTACCTTCG > 1:665216/1‑101 ACTTATCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATGAGTCATCAACTTACCTTCGC > 1:9705987/1‑101 ACTTATCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATGAGTCATCAACTTACCTTCGC < 1:3155931/101‑1 ACTTATCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATGAGTCATCAACTTACCTTCGC > 1:308770/1‑101 CTTATCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATGAGTCATCAACTTACCTTCGCC > 1:9091791/1‑101 TTATCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATGAGTCATCAACTTACCTTCGCCG < 1:9136586/101‑1 TTATCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATGAGTCATCAACTTACCTTCGCCG > 1:11050629/1‑101 AATTAGCATTAGAATAGTTGCGATAAGCTGCAATAAGCAGAACCACCTTTTTGGTTTAATATGTCCTTACAAATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_007779/1979995‑1980095 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATGAGTCATCAACTTACCTTCGCCG > NC_007779/2176984‑2177075 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |