New junction evidence
  seq id position reads (cov) reads (cov) score skew freq annotation gene product
* ? NC_007779 1907280 =10 (0.040)226 (0.880) 117/180 NT 95.8% intergenic (+307/‑122) yobD/yebN inner membrane protein/inner membrane protein
?NC_007779 = 2412225 NA (NA)intergenic (‑55/‑782) insA/yfbQ IS1 element protein/aminotransferase

Only 100 of 232 total aligned reads displayed.

CCATAAAACACATCATCGCCCCCAGCAAACATGCATACATGAACAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑  <  NC_007779/1907379‑1907280
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTT  <  NC_007779/2412225‑2412137
                                                                                                                                                                                             
CCATAAAACACATCATCGCCCCCAGCAAACATGCATACATGAACAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGG                                                                                          <  1:436669/101‑1
  ATAAAACACATCATCGCCCCCAGCAAACATGCATACATGAACAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGT                                                                                        <  1:3227069/101‑1
     AAACACATCATCGCCCCCAGCAAACATGCATACATGAACAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGAT                                                                                     >  1:8487042/1‑101
      AACACATCATCGCCCCCAGCAAACATGCATACATGAACAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATG                                                                                    >  1:1598098/1‑101
       ACACATCATCGCCCCCAGCAAACATGCATACATGAACAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGC                                                                                   <  1:12280492/101‑1
         ACATCATCGCCCCCAGCAAACATGCATACATGAACAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTG                                                                                 <  1:5225563/101‑1
          CATCATCGCCCCCAGCAAACATGCATACATGAACAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGC                                                                                <  1:6285870/101‑1
           ATCATCGCCCCCAGCAAACATGCATACATGAACAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCC                                                                               >  1:4974808/1‑101
           ATCATCGCCCCCAGCAAACATGCATACATGAACAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCC                                                                               >  1:1458723/1‑101
             CATCGCCCCCAGCAAACATGCATACATGAACAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAA                                                                             >  1:384083/1‑101
              ATCGCCCCCAGCAAACATGCATACATGAACAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAAC                                                                            >  1:10330763/1‑101
              ATCGCCCCCAGCAAACATGCATACATGAACAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAAC                                                                            >  1:8165095/1‑101
                  CCCCCAGCAAACATGCATACATGAACAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTAC                                                                        <  1:2933403/101‑1
                   CCCCAGCAAACATGCATACATGAACAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACT                                                                       <  1:3437229/101‑1
                   CCCCAGCAAACATGCATACATGAACAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACT                                                                       >  1:1824198/1‑101
                     CCAGCAAACATGCATACATGAACAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATGTGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGA                                                                     >  1:3911625/1‑101
                     CCAGCAAACATGCATACATGAACAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGA                                                                     >  1:6568093/1‑101
                     CCAGCAAACATGCATACATGAACAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGA                                                                     <  1:6854699/101‑1
                      CAGCAAACATGCATACATGAACAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGAT                                                                    >  1:10141371/1‑101
                       AGCAAACATGCATACATGAACAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATT                                                                   <  1:7720722/101‑1
                       AGCAAACATGCATACATGAACAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATT                                                                   >  1:9020469/1‑101
                         CAAACATGCATACATGAACAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTA                                                                 <  1:10930016/101‑1
                         CAAACATGCATACATGAACAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTA                                                                 >  1:1137134/1‑101
                          AAACATGCATACATGAACAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAG                                                                <  1:3577661/101‑1
                          AAACATGCATACATGAACAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAG                                                                >  1:12660708/1‑101
                           AACATGCATACATGAACAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGT                                                               >  1:10106266/1‑101
                           AACATGCATACATGAACAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGT                                                               >  1:5845073/1‑101
                           AACATGCATACATGAACAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGT                                                               <  1:4904275/101‑1
                             CATGCATACATGAACAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGT                                                             <  1:6631834/101‑1
                              ATGCATACATGAACAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTA                                                            <  1:4601283/101‑1
                              ATGCATACATGAACAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTA                                                            >  1:8312154/1‑101
                               TGCATACATGAACAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTAT                                                           <  1:4733230/101‑1
                               TGCATACATGAACAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTAT                                                           >  1:10767432/1‑101
                                GCATACATGAACAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATG                                                          <  1:11064692/101‑1
                                GCATACATGAACAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATG                                                          >  1:3647763/1‑101
                                GCATACATGAACAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATG                                                          <  1:6763637/101‑1
                                GCATACATGAACAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATG                                                          >  1:6960098/1‑101
                                  ATACATGAACAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGAT                                                        <  1:7554627/101‑1
                                       TGAACAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGT                                                   >  1:913408/1‑101
                                         AACAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGGGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTT                                                 >  1:4279568/1‑101
                                         AACAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTT                                                 >  1:2134118/1‑101
                                         AACAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTT                                                 >  1:13048204/1‑101
                                          ACAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTT                                                >  1:544437/1‑101
                                          ACAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTT                                                >  1:11210121/1‑101
                                           CAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTT                                               <  1:4422273/101‑1
                                             ACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGt                                             >  1:8874096/1‑100
                                             ACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGA                                             <  1:3354278/101‑1
                                             ACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGA                                             <  1:12554667/101‑1
                                              CAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAG                                            <  1:1900193/101‑1
                                                AGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGT                                          <  1:5691066/101‑1
                                                AGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGT                                          <  1:862538/101‑1
                                                   CGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCT                                       >  1:12225901/1‑101
                                                    GTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTC                                      >  1:5597453/1‑101
                                                    GTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGACGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTC                                      >  1:11503563/1‑101
                                                     TGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCC                                     >  1:10372398/1‑101
                                                      GATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCA                                    <  1:10032576/101‑1
                                                       ATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAG                                   >  1:925219/1‑101
                                                       ATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAG                                   <  1:11768102/101‑1
                                                        TGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGT                                  <  1:6913718/101‑1
                                                         GGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTG                                 <  1:12148524/101‑1
                                                          GTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGG                                <  1:6453246/101‑1
                                                          GTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGG                                <  1:10578651/101‑1
                                                           TTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGC                               >  1:7379072/1‑101
                                                           TTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGC                               >  1:5795297/1‑101
                                                            TTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCT                              <  1:5905828/101‑1
                                                            TTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCT                              <  1:8083544/101‑1
                                                            TTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCT                              >  1:6692555/1‑101
                                                              TCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTC                            >  1:894546/1‑101
                                                               CGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCT                           >  1:8787407/1‑101
                                                                 CGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGT                         >  1:9574247/1‑101
                                                                  GTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTT                        >  1:2644121/1‑101
                                                                  GTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTT                        >  1:5545393/1‑101
                                                                  GTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGGGCTCCAGTGGCTTttttt                        >  1:7081284/1‑96
                                                                   TTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTT                       <  1:12618097/101‑1
                                                                    TCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTC                      >  1:7934682/1‑101
                                                                      ATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTA                    >  1:10266646/1‑101
                                                                      ATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTA                    >  1:3545141/1‑101
                                                                       TGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTAT                   >  1:7493660/1‑101
                                                                       TGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTAT                   <  1:5295379/101‑1
                                                                       TGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTAT                   <  1:6008515/101‑1
                                                                       TGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTAT                   <  1:2699176/101‑1
                                                                        GCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATC                  <  1:11582815/101‑1
                                                                         CAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCA                 <  1:11868470/101‑1
                                                                          AGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAG                >  1:8993339/1‑101
                                                                          AGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAG                <  1:6126779/101‑1
                                                                          AGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAG                >  1:2165435/1‑101
                                                                          AGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAG                <  1:11421532/101‑1
                                                                           GGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGC               <  1:6231443/101‑1
                                                                            GCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCT              <  1:8562609/101‑1
                                                                             CATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTG             >  1:142450/1‑101
                                                                                 GCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCC         >  1:1355278/1‑101
                                                                                  CGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCT        >  1:2483555/1‑101
                                                                                  CGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCT        >  1:7517977/1‑101
                                                                                  CGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCT        <  1:281195/101‑1
                                                                                  CGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCT        <  1:2982125/101‑1
                                                                                   GATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTC       >  1:723852/1‑101
                                                                                    ATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCC      >  1:8234627/1‑101
                                                                                     TTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCT     <  1:5979805/101‑1
                                                                                      TGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTG    <  1:400117/101‑1
                                                                                        ATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGCGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTT  <  1:8974347/101‑1
                                                                                                                                                                                             
CCATAAAACACATCATCGCCCCCAGCAAACATGCATACATGAACAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑  <  NC_007779/1907379‑1907280
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTT  <  NC_007779/2412225‑2412137

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: 
Reads not counted as support for junction
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint.
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication.