| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_007779 | = 4355066 | 7 (0.030) | 216 (0.860) | 121/176 | NT | 96.9% | coding (1275/1632 nt) | dcuS | sensory histidine kinase in two‑component regulatory system with DcuR, regulator of anaerobic fumarate respiration |
| ? | NC_007779 | = 4504189 | NA (NA) | intergenic (+9/‑90) | insD/yjgW | IS2 insertion element transposase InsAB'/hypothetical protein | |||||
Only 100 of 603 total aligned reads displayed.
TAATTTCGCCTCCGGGTTCCGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTCGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGA > NC_007779/4354966‑4355166 | aaTTTCGCCTCCGGGTTCCGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGg < 1:7421890‑M1/101‑2 (MQ=255) aaTTTCGCCTCCGGGTTCCGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGg < 1:10402010‑M1/101‑2 (MQ=255) tctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTc < 1:6174257‑M1/9‑1 (MQ=255) tttCGCCTCCGGGTTCCGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGgat < 1:8539556‑M1/101‑4 (MQ=255) tttCGCCTCCGGGTTCCGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGgat < 1:4049604‑M1/101‑4 (MQ=255) ttctccaatgactagtctaaaaaccagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGc > 1:8928980‑M1/89‑101 (MQ=255) cGCCTCCGGGTTCCGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGgatttg < 1:12179758‑M1/101‑7 (MQ=255) ccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCt > 1:9015351‑M1/85‑101 (MQ=255) aatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTgg > 1:8156918‑M1/83‑101 (MQ=255) gggTTCCGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGgatttgcccctat < 1:5382457‑M1/101‑14 (MQ=255) tgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCt > 1:12733066‑M1/81‑101 (MQ=255) ggTTCCGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGgatttgcccctata < 1:2266543‑M1/101‑15 (MQ=255) gactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCtt > 1:12508239‑M1/80‑101 (MQ=255) gactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaACCGCTGTCTGGCAGCTGGCtt > 1:2075671‑M1/80‑101 (MQ=255) gTTCCGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGgatttgcccctatat > 1:12931706‑M1/1‑86 (MQ=255) tctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTg > 1:4167290‑M1/74‑101 (MQ=255) gCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGgatttgcccctatatttccag < 1:10454678‑M1/101‑22 (MQ=255) ctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGt > 1:1831803‑M1/73‑101 (MQ=255) taaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGtt < 1:11739419‑M1/30‑1 (MQ=255) aaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTa > 1:2513904‑M1/70‑101 (MQ=255) aaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattaagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTa > 1:9410655‑M1/70‑101 (MQ=255) aactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTaaa < 1:601125‑M1/34‑1 (MQ=255) aTGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGgatttgcccctatatttccagacatct < 1:10239400‑M1/101‑28 (MQ=255) tGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGgatttgcccctatatttccagacatctg > 1:6871606‑M1/1‑73 (MQ=255) ctagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAAt > 1:12370384‑M1/66‑101 (MQ=255) ctagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAAt > 1:3206025‑M1/66‑101 (MQ=255) ccTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGgatttgcccctatatttccagacatctgtt > 1:2668126‑M1/1‑71 (MQ=255) cTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGgatttgcccctatatttccagacatctgtta > 1:8285177‑M1/1‑70 (MQ=255) cTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGgatttgcccctatatttccagacatctgtta < 1:410996‑M1/101‑32 (MQ=255) cTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGgatttgcccctatatttccagacatctgtta > 1:10822612‑M1/1‑70 (MQ=255) cTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGgatttgcccctatatttccagacatctgtta < 1:4420340‑M1/101‑32 (MQ=255) tCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGgatttgcccctatatttccagacatctgttat < 1:11106140‑M1/101‑33 (MQ=255) gtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAg > 1:11427576‑M1/63‑101 (MQ=255) tattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGc < 1:12636575‑M1/40‑1 (MQ=255) taagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTa < 1:7536680‑M1/43‑1 (MQ=255) gcgTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGgatttgcccctatatttccagacatctgttatcactta < 1:4749486‑M1/101‑39 (MQ=255) tCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGgatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccat < 1:3726491‑M1/101‑45 (MQ=255) cacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTaaa > 1:5862903‑M1/50‑101 (MQ=255) cTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGgatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccatt > 1:2812222‑M1/1‑56 (MQ=255) tatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCgg < 1:5250442‑M1/56‑1 (MQ=255) atttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGt < 1:3628530‑M1/57‑1 (MQ=255) gATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGgatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagc < 1:11949096‑M1/101‑52 (MQ=255) tttCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGgatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagccc < 1:1503854‑M1/101‑54 (MQ=255) taagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTcgc < 1:3473482‑M1/60‑1 (MQ=255) taagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTcgc < 1:9149400‑M1/60‑1 (MQ=255) cccAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGgatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgct < 1:6286545‑M1/101‑57 (MQ=255) cccAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCCCACTGCCGCTGgatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgct < 1:8703867‑M1/101‑57 (MQ=255) tgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTCGCGCgg > 1:2725651‑M1/38‑101 (MQ=255) tgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTCGCGCgg > 1:1751189‑M1/38‑101 (MQ=255) tattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTCGCGCGGTTa > 1:6987130‑M1/35‑101 (MQ=255) tattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTCGCGCGGTTa > 1:10888872‑M1/35‑101 (MQ=255) ttggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTCGCGCGGTTAAt > 1:11279231‑M1/33‑101 (MQ=255) ggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTCGCGCGGTTAATCt < 1:2216707‑M1/71‑1 (MQ=255) gtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTCGCGCGGTTAATCTTGCt > 1:4816790‑M1/27‑101 (MQ=255) tctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTCGCGCGGTTAATCTTGCTg < 1:5702796‑M1/76‑1 (MQ=255) aGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGgatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattccc > 1:5530216‑M1/1‑30 (MQ=255) aGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGgatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattccc > 1:7078832‑M1/1‑30 (MQ=255) gagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTCGCGCGGTTAATCTTGCTGATTa > 1:8766174‑M1/22‑101 (MQ=255) cggcgcgaccTGGTCCTCACTGCCGCTGgatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgt < 1:6611669‑M1/98‑74 (MQ=255) cGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGgatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgt < 1:3279961‑M1/101‑74 (MQ=255) gTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGgatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtg > 1:9579981‑M1/1‑27 (MQ=255) gattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTCGCGCGGTTAATCTTGCTGATTaaa < 1:2952919‑M1/82‑1 (MQ=255) attcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTCGCGCGGTTAATCTTGCTGATTaaaa > 1:10080192‑M1/19‑101 (MQ=255) gcgACCTGGTCCTCACTGCCGCTGgatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcg < 1:3392555‑M1/101‑78 (MQ=255) cgACCTGGTCCTCACTGCCGCTGgatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcga < 1:8391007‑M1/101‑79 (MQ=255) gACCTGGTCCTCACTGCCGCTGgatttgcccctatatttccagacatctgttatcccttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgtg < 1:7208103‑M1/101‑80 (MQ=255) gACCTGGTCCTCACTGCCGCTGgatttgcccctatatttccagacatctgttatcccttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgag < 1:12036092‑M1/101‑80 (MQ=255) gACCTGGTCCTCACTGCCGCTGgatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgag < 1:11639987‑M1/101‑80 (MQ=255) cagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTCGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAAc > 1:7891501‑M1/16‑101 (MQ=255) agggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTCGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAAcc > 1:10583809‑M1/15‑101 (MQ=255) aCCTGGTCCTCCCTGCCGCTGgatttgcccctatatttccagacatctgttatcccttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagc < 1:4937404‑M1/101‑81 (MQ=255) ggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTCGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAg > 1:4580064‑M1/13‑101 (MQ=255) cTGGTCCTCACTGCCGCTGgatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcga > 1:7961272‑M1/1‑19 (MQ=255) tGGTCCTCACTGCCGCTGgatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgat < 1:9220591‑M1/101‑84 (MQ=255) gggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTCGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGc > 1:808057‑M1/12‑101 (MQ=255) gccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTCGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGa < 1:57936‑M1/92‑1 (MQ=255) gTCCTCACTGCCGCTGgatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataa > 1:7715‑M1/1‑16 (MQ=255) ccTCACTGCCGCTGgatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacc < 1:10721015‑M1/101‑88 (MQ=255) tCACTGCCGCTGgatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataaccca < 1:6738357‑M1/101‑90 (MQ=255) cACTGCCGCTGgatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccag > 1:9682181‑M1/1‑11 (MQ=255) ctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTCGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCg < 1:3044873‑M1/98‑1 (MQ=255) ctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTCGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCg < 1:1664484‑M1/98‑1 (MQ=255) aCTGCCGCTGgatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagc > 1:5104842‑M1/1‑10 (MQ=255) cTGCCGCTGgatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcg < 1:5016315‑M1/101‑93 (MQ=255) aGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTCGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGa > 1:5624279‑M1/2‑101 (MQ=255) cGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTGTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTCGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGAt > 1:12284663/1‑101 (MQ=255) gCTGgatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcacta < 1:7653032‑M1/101‑98 (MQ=255) cggTCTGGCAGGTGGCTTTCACTGTTTAAAAGCAGCGTATGGCCTAGATCGGTCGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGAttt < 1:4256242/99‑1 (MQ=255) cTGgatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactat < 1:1427534‑M1/101‑99 (MQ=255) cTGgatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactat < 1:3831246‑M1/101‑99 (MQ=255) cTGgatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactat < 1:11166188‑M1/101‑99 (MQ=255) cTGgatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactat < 1:9799972‑M1/101‑99 (MQ=255) ggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgc < 1:1941988‑M1/101‑101 (MQ=255) ggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgc < 1:3956642‑M1/101‑101 (MQ=255) ggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgc > 1:11545158‑M1/1‑1 (MQ=255) ggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgc > 1:10968566‑M1/1‑1 (MQ=255) ggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgc < 1:6415741‑M1/101‑101 (MQ=255) ggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgc > 1:9312316‑M1/1‑1 (MQ=255) ggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgc > 1:5947287‑M1/1‑1 (MQ=255) gTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTCGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGa < 1:6496654/101‑1 (MQ=255) | TAATTTCGCCTCCGGGTTCCGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTCGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGA > NC_007779/4354966‑4355166 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |