| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_007779 | 1,213,001 | T→C | 2.9% | intergenic (+245/+256) | mcrA → / ← elbA | 5‑methylcytosine‑specific restriction endonuclease B/hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_007779 | 1,213,001 | 0 | T→C | 2.9% | 9.8 ‑0.4 ‑0.4 | 205 | intergenic (+245/+256) | mcrA/elbA | 5‑methylcytosine‑specific restriction endonuclease B/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (4/2): ref base (112/87): total (116/89) | ||||||||||
| Fisher's exact test strand distribution p-value = 6.99e-01 | ||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 3.59e-01 | ||||||||||
Only 100 of 214 total aligned reads displayed.
TTATAGAAATGCTAAGGGCTAATGAGTTATATGCAAATTAGTAAAATTATGTTGCTATGTCAGATAGTTACGATTTAGTCATCTAACTAATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCG > NC_007779/1212901‑1213101 | ttATAGAAATGCTAAGGGCTAATGAGTTATATGCAAATTAGTAAAATTATGTTGCTATGTCAGATAGTTACGATTTAGTCATCTAACTAATGCTGCGCCat > 1:294070/1‑101 (MQ=255)ttATAGAAATGCTAAGGGCTAATGAGTTATATGCAAATTAGTAAAATTATGTTGCTATGTCAGATAGTTACGATTTAGTCATCTAACTAATGCTGCGCCat < 1:1066958/101‑1 (MQ=255) ataGAAATGCTAAGGGCTAATGAGTTATATGCAAATTAGTAAAATTATGTTGCTATGTCAGATAGTTACGATTTAGTCATCTAACTAATGCTGCGCCatat > 1:2754005/1‑101 (MQ=255) aGAAATGCTAAGGGCTAATGAGTTATATGCAAATTAGTAAAATTATGTTGCTATGTCAGATAGTTACGATTTAGTCATCTAACTAATGCTGCGCCATATgg < 1:3555065/101‑1 (MQ=255) gAAATGCTAAGGGCTAATGAGTTATATGCAAATTAGTAAAATTATGTTGCTATGTCAGATAGTTACGATTTAGTCATCTAACTAATGCTGCGCCATATggg < 1:4591842/101‑1 (MQ=255) gAAATGCTAAGGGCTAATGAGTTATATGCAAATTAGTAAAATTATGTTGCTATGTCAGATAGTTACGATTTAGTCATCTAACTAATGCTGCGCCATATggg > 1:6539310/1‑101 (MQ=255) gAAATGCTAAGGGCTAATGAGTTATATGCAAATTAGTAAAATTATGTTGCTATGTCAGATAGTTACGATTTAGTCATCTAACTAATGCTGCGCCATATggg > 1:1151343/1‑101 (MQ=255) tGCTAAGGGCTAATGAGTTATATGCAAATTAGTAAAATTATGTTGCTATGTCAGATAGTTACGATTTAGTCATCTAACTAATGCTGCGCCATATGGGTTgg > 1:443697/1‑101 (MQ=255) tGCTAAGGGCTAATGAGTTATATGCAAATTAGTAAAATTATGTTGCTATGTCAGATAGTTACGATTTAGTCATCTAACTAATGCTGCGCCATATGGGTTgg > 1:4247005/1‑101 (MQ=255) tAAGGGCTAATGAGTTATATGCAAATTAGTAAAATTATGTTGCTATGTCAGATAGTTACGATTTAGTCATCTAACTAATGCTGCGCCATATGGGTTGGACt > 1:7935478/1‑101 (MQ=255) aaGGGCTAATGAGTTATATGCAAATTAGTAAAATTATGTTGCTATGTCAGATAGTTACGATTTAGTCATCTAACTAATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTg > 1:1550790/1‑101 (MQ=255) gggCTAATGAGTTATATGCAAATTAGTAAAATTATGTTGCTATGTCAGATAGTTACGATTTAGTCATCTAACTAATGCTGCGCCACATGGGTTGGACCGaa < 1:4815150/101‑1 (MQ=255) cTAATGAGTTATATGCAAATTAGTAAAATTATGTTGCTATGTCAGATAGTTACGATTTAGTCATCTAACTAATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCg < 1:665449/101‑1 (MQ=255) tAATGAGTTATATGCAAATTAGTAAAATTATGTTGCTATGTCAGATAGTTACGATTTAGTCATCTAACTAATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCgg < 1:2532582/101‑1 (MQ=255) tAATGAGTTATATGCAAATTAGTAAAATTATGTTGCTATGTCAGATAGTTACGATTTAGTCATCTAACTAATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCgg > 1:11796007/1‑101 (MQ=255) tAATGAGTTATATGCAAATTAGTAAAATTATGTTGCTATGTCAGATAGTTACGATTTAGTCATCTAACTAATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCgg > 1:8532534/1‑101 (MQ=255) aaTGAGTTATATGCAAATTAGTAAAATTATGTTGCTATGTCAGATAGTTACGATTTAGTCATCTAACTAATGCTGCGCCACATGGGTTGGACCGAAGCGGc > 1:5597170/1‑101 (MQ=255) tGAGTTATATGCAAATTAGTAAAATTATGTTGCTATGTCAGATAGTTACGATTTAGTCATCTAACTAATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTg > 1:1318204/1‑101 (MQ=255) tGAGTTATATGCAAATTAGTAAAATTATGTTGCTATGTCAGATAGTTACGATTTAGTCATCTAACTAATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTg > 1:12528696/1‑101 (MQ=255) tGAGTTATATGCAAATTAGTAAAATTATGTTGCTATGTCAGATAGTTACGATTTAGTCATCTAACTAATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTg > 1:4007984/1‑101 (MQ=255) gAGTTATATGCAAATTAGTAAAATTATGTTGCTATGTCAGATAGTTACGATTTAGTCATCTAACTAATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGa > 1:3681369/1‑101 (MQ=255) ttATATGCAAATTAGTAAAATTATGTTGCTATGTCAGATAGTTACGATTTAGTCATCTAACTAATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCt > 1:8193894/1‑101 (MQ=255) tataTGCAAATTAGTAAAATTATGTTGCTATGTCAGATAGTTACGATTTAGTCATCTAACTAATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTg < 1:814052/101‑1 (MQ=255) tataTGCAAATTAGTAAAATTATGTTGCTATGTCAGATAGTTACGATTTAGTCATCTAACTAATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTg > 1:2109585/1‑101 (MQ=255) atGCAAATTAGTAAAATTATGTTGCTATGTCAGATAGTTACGATTTAGTCATCTAACTAATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGAtt > 1:5635440/1‑101 (MQ=255) tGCAAATTAGTAAAATTATGTTGCTATGTCAGATAGTTACGATTTAGTCATCTAACTAATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTg > 1:7044204/1‑101 (MQ=255) gCAAATTAGTAAAATTATGTTGCTATGTCAGATAGTTACGATTTAGTCATCTAACTAATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGt < 1:9453194/101‑1 (MQ=255) cAAATTAGTAAAATTATGTTGCTATGTCAGATAGTTACGATTTAGTCATCTAACTAATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGtt > 1:8808810/1‑101 (MQ=255) cAAATTAGTAAAATTATGTTGCTATGTCAGATAGTTACGATTTAGTCATCTAACTAATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGtt > 1:10882778/1‑101 (MQ=255) cAAATTAGTAAAATTATGTTGCTATGTCAGATAGTTACGATTTAGTCATCTAACTAATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGtt > 1:2901698/1‑101 (MQ=255) aaaTTAGTAAAATTATGTTGCTATGTCAGATAGTTACGATTTAGTCATCTAACTAATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGCTTGTTa < 1:11545068/101‑1 (MQ=255) aaaTTAGTAAAATTATGTTGCTATGTCAGATAGTTACGATTTAGTCATCTAACTAATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTa > 1:6850776/1‑101 (MQ=255) aaaTTAGTAAAATTATGTTGCTATGTCAGATAGTTACGATTTAGTCATCTAACTAATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTa > 1:10256248/1‑101 (MQ=255) aTTAGTAAAATTATGTTGCTATGTCAGATAGTTACGATTTAGTCATCTAACTAATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTaaa > 1:3506009/1‑101 (MQ=255) ttAGTAAAATTATGTTGCTATGTCAGATAGTTACGATTTAGTCATCTAACTAATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAg > 1:7574536/1‑101 (MQ=255) ttAGTAAAATTATGTTGCTATGTCAGATAGTTACGATTTAGTCATCTAACTAATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAg < 1:3479695/101‑1 (MQ=255) ttAGTAAAATTATGTTGCTATGTCAGATAGTTACGATTTAGTCATCTAACTAATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAg < 1:5290293/101‑1 (MQ=255) tAGTAAAATTATGTTGCTATGTCAGATAGTTACGATTTAGTCATCTAACTAATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAgg > 1:5023114/1‑101 (MQ=255) tAGTAAAATTATGTTGCTATGTCAGATAGTTACGATTTAGTCATCTAACTAATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAgg > 1:8254445/1‑101 (MQ=255) aGTAAAATTATGTTGCTATGTCAGATAGTTACGATTTAGTCATCTAACTAATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGt < 1:10539169/101‑1 (MQ=255) gTAAAATTATGTTGCTATGTCAGATAGTTACGATTTAGTCATCTAACTAATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTa > 1:910554/1‑101 (MQ=255) gTAAAATTATGTTGCTATGTCAGATAGTTACGATTTAGTCATCTAACTAATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTa > 1:1262272/1‑101 (MQ=255) tAAAATTATGTTGCTATGTCAGATAGTTACGATTTAGTCATCTAACTAATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTAt > 1:8932817/1‑101 (MQ=255) tAAAATTATGTTGCTATGTCACATAGTTACGATTTAGTCATCTAACTAATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTAt > 1:9381532/1‑101 (MQ=255) aaaaTTATGTTGCTATGTCAGATAGTTACGATTTAGTCATCTAACTAATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATg < 1:8229687/101‑1 (MQ=255) aaaTTATGTTGCTATGTCAGATAGTTACGATTTAGTCATCTAACTAATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATgg > 1:7955274/1‑101 (MQ=255) aaTTATGTTGCTATGTCAGATAGTTACGATTTAGTCATCTAACTAATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGa > 1:6932432/1‑101 (MQ=255) aaTTATGTTGCTATGTCAGATAGTTACGATTTAGTCATCTAACTAATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGa > 1:2170419/1‑101 (MQ=255) aTTATGTTGCTATGTCAGATAGTTACGATTTAGTCATCTAACTAATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGaa < 1:897907/101‑1 (MQ=255) ttATGTTGCTATGTCAGATAGTTACGATTTAGTCATCTAACTAATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAg < 1:4655755/101‑1 (MQ=255) aTGTTGCTATGTCAGATAGTTACGATTTAGTCATCTAACTAATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGgc > 1:578549/1‑101 (MQ=255) tGTTGCTATGTCAGATAGTTACGATTTAGTCATCTAACTAATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGgcg < 1:12018575/101‑1 (MQ=255) tGTTGCTATGTCAGATAGTTACGATTTAGTCATCTAACTAATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGgcg > 1:4083726/1‑101 (MQ=255) tGTTGCTATGTCAGATAGTTACGATTTAGTCATCTAACTAATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGgcg < 1:6263384/101‑1 (MQ=255) tGTTGCTATGTCAGATAGTTACGATTTAGTCATCTAACTAATGCTGCGCCACATGGGTTGGACCGAAGCGGCTGACTTAATTGTTAAAGGTATGGAAGgcg > 1:10429262/1‑101 (MQ=18) gTTGCTATGTCAGATAGTTACGATTTAGTCATCTAACTAATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGgcgc > 1:9875463/1‑101 (MQ=255) gTTGCTATGTCAGATAGTTACGATTTAGTCATCTAACTAATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGgcgc > 1:1522178/1‑101 (MQ=255) gTTGCTATGTCAGATAGTTACGATTTAGTCATCTAACTAATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGgcgc < 1:11901100/101‑1 (MQ=255) tGCTATGTCAGATAGTTACGATTTAGTCATCTAACTAATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGcaa < 1:1613755/101‑1 (MQ=255) cTATGTCAGATAGTTACGATTTAGTCATCTAACTAATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGcaatc < 1:861564/101‑1 (MQ=255) cTATGTCAGATAGTTACGATTTAGTCATCTAACTAATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGcaatc < 1:6336292/101‑1 (MQ=255) aTGTCAGATAGTTACGATTTAGTCATCTAACTAATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGcaatcaa < 1:3826080/101‑1 (MQ=255) aTGTCAGATAGTTACGATTTAGTCATCTAACTAATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGcaatcaa > 1:12929139/1‑101 (MQ=255) tCAGATAGTTACGATTTAGTCATCTAACTAATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGc < 1:12225041/101‑1 (MQ=255) cAGATAGTTACGATTTAGTCATCTAACTAATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGcc > 1:961674/1‑101 (MQ=255) cAGATAGTTACGATTTAGTCATCTAACTAATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGcc > 1:1473042/1‑101 (MQ=255) aTAGTTACGATTTAGTCATCTAACTAATGCTGCGCCACATGGGTTGGACCGAAGCGGCTGACTTAATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGGAATCAACGCGaaa > 1:6427634/1‑100 (MQ=11) ttACGATTTAGTCATCTAACTAATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCg < 1:4058293/101‑1 (MQ=255) aTTTAGTCATCTAACTAATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACt < 1:10354393/101‑1 (MQ=255) aTTTAGTCATCTAACTAATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACt < 1:12734558/101‑1 (MQ=255) tttAGTCATCTAACTAATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACtt > 1:3638720/1‑101 (MQ=255) tAGTCATCTAACTAATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTAt > 1:9283885/1‑101 (MQ=255) tAGTCATCTAACTAATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTAt > 1:1844519/1‑101 (MQ=255) aGTCATCTAACTGATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATg > 1:7864886/1‑101 (MQ=255) aGTCATCTAACTAATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTTAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATg > 1:4841238/1‑101 (MQ=255) cATCTAACTAATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACt > 1:10160485/1‑101 (MQ=255) aTCTAACTAATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACtt > 1:5046515/1‑101 (MQ=255) tCTAACTAATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTc > 1:320154/1‑101 (MQ=255) ctaactaaTGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCg > 1:9827945/1‑101 (MQ=255) ctaactaaTGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCg < 1:11296067/101‑1 (MQ=255) aactaaTGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGaa < 1:744522/101‑1 (MQ=255) aactaaTGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGaa > 1:12186457/1‑101 (MQ=255) actaaTGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAAc > 1:2029727/1‑101 (MQ=255) actaaTGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAAc < 1:3137325/101‑1 (MQ=255) taaTGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGt > 1:8852998/1‑101 (MQ=255) aaTGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTc < 1:12640614/101‑1 (MQ=255) aTGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCt < 1:5421095/101‑1 (MQ=255) aTGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCt < 1:11648176/101‑1 (MQ=255) aTGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCt < 1:5709137/101‑1 (MQ=255) tgctgcGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTg > 1:3911335/1‑101 (MQ=255) tgctgcGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTg > 1:6013579/1‑101 (MQ=255) tgctgcGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTg < 1:7475629/101‑1 (MQ=255) tgctgcGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTg > 1:4852023/1‑101 (MQ=255) gctgcGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGa < 1:8957193/101‑1 (MQ=255) gctgcGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGa < 1:3039143/101‑1 (MQ=255) tgcGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATg > 1:11484272/1‑101 (MQ=255) gcgcCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATgg < 1:5461978/101‑1 (MQ=255) cATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAgg < 1:11172716/101‑1 (MQ=255) atatGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGgc < 1:10581902/101‑1 (MQ=255) atatGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGgc < 1:4877711/101‑1 (MQ=255) | TTATAGAAATGCTAAGGGCTAATGAGTTATATGCAAATTAGTAAAATTATGTTGCTATGTCAGATAGTTACGATTTAGTCATCTAACTAATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCG > NC_007779/1212901‑1213101 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |