| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_007779 | 1,496,775 | Δ1 bp | 100% | coding (11/924 nt) | ydcI ← | DNA‑binding transcriptional regulator |
| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_007779 | 1,496,775 | 0 | T→. | 100.0% | 1158.7 | 234 | coding (11/924 nt) | ydcI | DNA‑binding transcriptional regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (117/117): ref base (0/0): total (117/117) | ||||||||||
Only 100 of 258 total aligned reads displayed.
CAAATTAAGGGTTTCAGCCGCGCGCCCCAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTATTTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTGATTGCAAAATATTATTAACAATTA > NC_007779/1496675‑1496871 | aaaTTAAGGGTTTCAGCCGCGCGCCCCAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTAtt > 1:7670089/1‑101 (MQ=255) aaaTTAAGGGTTTCAGCCGCGCGCCCCAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTAtt < 1:10626795/101‑1 (MQ=255) aTTAAGGGTTTCAGCCGCGCGCCCCAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTAtttt < 1:1704266/101‑1 (MQ=255) ttAAGGGTTTCAGCCGCGCGCCCCAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTAttttt > 1:9824504/1‑101 (MQ=255) ttAAGGGTTTCAGCCGCGCGCCCCAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTAttttt > 1:9609900/1‑101 (MQ=255) ttAAGGGTTTCAGCCGCGCGCCCCAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTAttttt < 1:10007370/101‑1 (MQ=255) aaGGGTTTCAGCCGCGCGCCCCAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTAttttttc < 1:5631302/101‑2 (MQ=255) aGGGTTTCAGCCGCGCGCCCCAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTAttttttcc < 1:6672640/101‑3 (MQ=255) gggTTTCAGCCGCGCGCCCCAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTAttttttcca < 1:648559/101‑4 (MQ=255) gggTTTCAGCCGCGCGCCCCAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTAttttttcca < 1:10167013/101‑4 (MQ=255) gTTTCAGCCGCGCGCCCCAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATa < 1:757159/101‑1 (MQ=255) gTTTCAGCCGCGCGCCCCAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATa < 1:11185705/101‑1 (MQ=255) gTTTCAGCCGCGCGCCCCAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATa < 1:3520720/101‑1 (MQ=255) tttCAGCCGCGCGCCCCAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATaa > 1:162988/1‑101 (MQ=255) ttCAGCCGCGCGCCCCAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAg > 1:8542857/1‑101 (MQ=255) ttCAGCCGCGCGCCCCAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAg > 1:3644511/1‑101 (MQ=255) tCAGCCGCGCGCCCCAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGc > 1:9178331/1‑101 (MQ=255) aGCCGCGCGCCCCAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGa < 1:34559/101‑1 (MQ=255) gCCGCGCGCCCCAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGAt < 1:10411330/101‑1 (MQ=255) ccGCGCGCCCCAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATg > 1:3575024/1‑101 (MQ=255) cgcgcgCCCCAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGt > 1:11672067/1‑101 (MQ=255) gcgcgcCCCAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGtt < 1:3815786/101‑1 (MQ=255) cgcgcCCCAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTa < 1:6807720/101‑1 (MQ=255) gcgcCCCAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTaa > 1:4380724/1‑101 (MQ=255) gcCCCAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTaaaa > 1:10356870/1‑101 (MQ=255) cccAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAAc < 1:7370898/101‑1 (MQ=255) cccAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAAc < 1:2040622/101‑1 (MQ=255) aaaGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGaa > 1:8918845/1‑101 (MQ=255) aaaGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGaa > 1:2417688/1‑101 (MQ=255) aaGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAg < 1:690941/101‑1 (MQ=255) aGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGc > 1:6538829/1‑101 (MQ=255) aGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGc < 1:7259702/101‑1 (MQ=255) tCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGgt > 1:2078036/1‑101 (MQ=255) tCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGgt > 1:947410/1‑101 (MQ=255) ccTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGgtg > 1:4564428/1‑101 (MQ=255) cTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGgtgt < 1:8605497/101‑1 (MQ=255) ttgttgTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTc > 1:6066487/1‑101 (MQ=255) ttgttgTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTc < 1:10077717/101‑1 (MQ=255) tgttgtGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCg < 1:12838011/101‑1 (MQ=255) tgttgtGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCg > 1:417534/1‑101 (MQ=255) ttgtGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCt > 1:6990255/1‑101 (MQ=255) ttgtGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCt > 1:3007875/1‑101 (MQ=255) tgtgCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTg > 1:3243935/1‑101 (MQ=255) tgCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGAc > 1:5019787/1‑101 (MQ=255) tgCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGAc > 1:10465025/1‑101 (MQ=255) gCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACa < 1:840864/101‑1 (MQ=255) cGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACaa > 1:11238453/1‑101 (MQ=255) cGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACaa < 1:12088447/101‑1 (MQ=255) gACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAg > 1:670926/1‑101 (MQ=255) aCAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGt > 1:2890682/1‑101 (MQ=255) cAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTg > 1:10793814/1‑101 (MQ=255) aGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGa > 1:7707011/1‑101 (MQ=255) aGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGa < 1:5460526/101‑1 (MQ=255) tACGAATGTATGAAGGTGGCGCAACCGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAgt < 1:5003577/101‑1 (MQ=255) tACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAgt > 1:7103332/1‑101 (MQ=255) tACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAgt > 1:12777563/1‑101 (MQ=255) tACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAgt > 1:1735090/1‑101 (MQ=255) aaTGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAgttgtt > 1:2611878/1‑101 (MQ=255) tGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTg > 1:9066111/1‑101 (MQ=255) gTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGa > 1:9289190/1‑101 (MQ=255) aTGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGAtt > 1:7812368/1‑101 (MQ=255) tGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTa < 1:12214247/101‑1 (MQ=255) gAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTAt < 1:6387601/101‑1 (MQ=255) aaGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATg < 1:5845515/101‑1 (MQ=255) ggTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGAt < 1:7909880/101‑1 (MQ=255) tGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATaa < 1:3234152/101‑1 (MQ=255) ggCGCAAAGGGATGCGCTGACTAAACAGCC‑‑TTTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACt < 1:4044268/101‑1 (MQ=255) ggCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAAc > 1:5788921/1‑101 (MQ=255) gcgcAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACt > 1:8121474/1‑101 (MQ=255) gcAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTg > 1:7984260/1‑101 (MQ=255) gcAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTg > 1:10132843/1‑101 (MQ=255) gcAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTg > 1:6433056/1‑101 (MQ=255) aaaCGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTGAt > 1:4355035/1‑101 (MQ=255) aaaCGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTGAt > 1:8814054/1‑101 (MQ=255) aaaCGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTGAt > 1:8046469/1‑101 (MQ=255) aaaCGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTGAt < 1:2517767/101‑1 (MQ=255) aaCGGATGCGCTGACTAAACGGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTGAtt < 1:9710935/101‑1 (MQ=255) aaCGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTGAtt < 1:12540530/101‑1 (MQ=255) aaCGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTGAtt < 1:12647237/101‑1 (MQ=255) aCGGATGCTCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAGCTTGATTg < 1:2186545/101‑1 (MQ=255) aCGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTGATTg < 1:7972641/101‑1 (MQ=255) cGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTGATTGc > 1:6148287/1‑101 (MQ=255) cGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTGATTGc > 1:5559619/1‑101 (MQ=255) aTGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTGATTGCaaa < 1:9226639/101‑1 (MQ=255) aTGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTGATTGCaaa > 1:1198707/1‑101 (MQ=255) cgcTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTGATTGCAAAata > 1:8252809/1‑101 (MQ=255) gcTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTGATTGCAAAatat > 1:1386374/1‑101 (MQ=255) gACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTGATTGCAAAAtattat < 1:5347047/101‑1 (MQ=255) gACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTGATTGCAAAAtattat < 1:4863972/101‑1 (MQ=255) gACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCACTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTGATTGCAAAAtattat < 1:1983899/101‑1 (MQ=255) cTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTGATTGCAAAATAttatta > 1:2754715/1‑101 (MQ=255) tAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTGATTGCAAAATATTATTaa > 1:1149807/1‑101 (MQ=255) aCAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTGATTGCAAAATATTATTAACaa < 1:11029259/101‑1 (MQ=255) aCAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTGATTGCAAAATATTATTAACaa < 1:482526/101‑1 (MQ=255) cAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTGATTGCAAAATATTATTAACAAt < 1:11771996/101‑1 (MQ=255) cAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTGATTGCAAAATATTATTAACAAt > 1:9579951/1‑101 (MQ=255) aGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTGATTGCAAAATATTATTAACAAtt > 1:5235414/1‑101 (MQ=255) aGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTGATTGCAAAATATTATTAACAAtt > 1:12380384/1‑101 (MQ=255) aGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTGATTGCAAAATATTATTAACAAtt < 1:9730966/101‑1 (MQ=255) gACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTGATTGCAAAATATTATTAACAATTa > 1:11100318/1‑101 (MQ=255) | CAAATTAAGGGTTTCAGCCGCGCGCCCCAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTATTTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTGATTGCAAAATATTATTAACAATTA > NC_007779/1496675‑1496871 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |