| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_007779 | 4310363 = | NA (NA) | 217 (0.860) | 116/180 | NT | 100% | intergenic (‑287/‑68) | yjcS/insH | alkyl sulfatase/IS5 element protein |
| ? | NC_007779 | 4353540 = | 0 (0.000) | intergenic (‑118/+453) | dcuB/dcuR | C4‑dicarboxylate antiporter/DNA‑binding response regulator in two‑component regulatory system with DcuS | |||||
Only 100 of 236 total aligned reads displayed.
TAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_007779/4310446‑4310363‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTAGCAAATACCTCACAGTGAATATTGGCTGATTAAAGCAGCGGCAAATTTATGCACTGTGATAAGCGGCTTTTTCAGAGAGAAAGACTCTCTGGCGATG > NC_007779/4353540‑4353639 TAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTGTGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCAAATACCTCACA < 1:7689090/101‑1 TTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCAAATACCTCACAGTGA < 1:8924760/101‑1 TGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCAAATACCTCACAGTGAA > 1:3701791/1‑101 GATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCAAATACCTCACAGTGAAT < 1:1852849/101‑1 GACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCAAATACCTCACAGTGAATATT < 1:10119659/101‑1 GACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCAAATACCTCACAGTGAATATT < 1:4869371/101‑1 CTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCAAATACCTCACAGTGAATATTGG > 1:5135137/1‑101 CTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCAAATACCTCACAGTGAATATTGG < 1:3954623/101‑1 CATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCAAATACCTCACAGTGAATATTGGCT > 1:2305840/1‑101 CATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCAAATACCTCACAGTGAATATTGGCT < 1:3255973/101‑1 ATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCAAATACCTCACAGTGAATATTGGCTG > 1:12521141/1‑101 ATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCAAATACCTCACAGTGAATATTGGCTG < 1:5832384/101‑1 ATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCAAATACCTCACAGTGAATATTGGCTGATT > 1:7207665/1‑101 ATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCAAATACCTCACAGTGAATATTGGCTGATT < 1:11959164/101‑1 ATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCAAATACCTCACAGTGAATATTGGCTGATT > 1:5295774/1‑101 TGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCAAATACCTCACAGTGAATATTGGCTGATTA < 1:3509032/101‑1 TGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCAAATACCTCACAGTGAATATTGGCTGATTA > 1:7124772/1‑101 GAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCAAATACCTCACAGTGAATATTGGCTGATTAA > 1:248174/1‑101 CCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCAAATACCTCACAGTGAATATTGGCTGATTAAAGCA < 1:5609994/101‑1 CCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCAAATACCTCACAGTGAATATTGGCTGATTAAAGCA < 1:6256755/101‑1 CCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCAAATACCTCACAGTGAATATTGGCTGATTAAAGCA > 1:11110794/1‑101 CTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCAAATACCTCACAGTGAATATTGGCTGATTAAAGCAG > 1:8001427/1‑101 TCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCAAATACCTCACAGTGAATATTGGCTGATTAAAGCAGCGGC < 1:10959218/101‑1 CTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCAAATACCTCACAGTGAATATTGGCTGATTAAAGCAGCGGCA > 1:8721778/1‑101 CTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCAAATACCTCACAGTGAATATTGGCTGATTAAAGCAGCGGCA < 1:1348183/101‑1 CTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCAAATACCTCACAGTGAATATTGGCTGATTAAAGCAGCGGCA > 1:4484744/1‑101 TATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCAAATACCTCACAGTGAATATTGGCTGATTAAAGCAGCGGCAA > 1:6548644/1‑101 ATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCAAATACCTCACAGTGAATATTGGCTGATTAAAGCAGCGGCAAA > 1:9165649/1‑101 ATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCAAATACCTCACAGTGAATATTGGCTGATTAAAGCAGCGGCAAA < 1:4450808/101‑1 ATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCAAATACCTCACAGTGAATATTGGCTGATTAAAGCAGCGGCAAA > 1:11824207/1‑101 TGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCAAATACCTCACAGTGAATATTGGCTGATTAAAGCAGCGGCAAAT > 1:3198223/1‑101 GGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCAAATACCTCACAGTGAATATTGGCTGATTAAAGCAGCGGCAAATT < 1:8310083/101‑1 GCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCAAATACCTCACAGTGAATATTGGCTGATTAAAGCAGCGGCAAATTT > 1:1454664/1‑101 TCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCAAATACCTCACAGTGAATATTGGCTGATTAAAGCAGCGGCAAATTTAT < 1:9538389/101‑1 TCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCAAATACCTCACAGTGAATATTGGCTGATTAAAGCAGCGGCAAATTTAT > 1:8761663/1‑101 TCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCAAATACCTCACAGTGAATATTGGCTGATTAAAGCAGCGGCAAATTTAT < 1:9656655/101‑1 CCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCAAATACCTCACAGTGAATATTGGCTGATTAAAGCAGCGGCAAATTTATG < 1:3915814/101‑1 CCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCAAATACCTCACAGTGAATATTGGCTGATTAAAGCAGCGGCAAATTTATG < 1:9076911/101‑1 CCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCAAATACCTCACAGTGAATATTGGCTGATTAAAGCAGCGGCAAATTTATG < 1:12601232/101‑1 CAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCAAATACCTCACAGTGAATATTGGCTGATTAAAGCAGCGGCAAATTTATGC > 1:9106206/1‑101 CAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCAAATACCTCACAGTGAATATTGGCTGATTAAAGCAGCGGCAAATTTATGC > 1:11365421/1‑101 CAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCAAATACCTCACAGTGAATATTGGCTGATTAAAGCAGCGGCAAATTTATGC < 1:10861404/101‑1 AGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCAAATAACTCACAGTGAATATTGGCTGATTAAAGCAGCGGCAAATTTATGCA < 1:6441970/101‑1 ATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCAAATACCTCACAGTGAATATTGGCTGATTAAAGCAGCGGCAAATTTATGCACT < 1:17728/101‑1 ATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCAAATACCTCACAGTGAATATTGGCTGATTAAAGCAGCGGCAAATTTATGCACT > 1:2103974/1‑101 GACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCAAATACCTCACAGTGAATATTGGCTGATTAAAGCAGCGGCAAATTTATGCACTGT < 1:11629019/101‑1 GACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCAAATACCTCACAGTGAATATTGGCTGATTAAAGCAGCGGCAAATTTATGCACTGT > 1:7616719/1‑101 ACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCAAATACCTCACAGTGAATATTGGCTGATTAAAGCAGCGGCAAATTTATGCACTGTG < 1:6684449/101‑1 AACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCAAATACCTCACAGTGAATATTGGCTGATTAAAGCAGCGGCAAATTTATGCACTGTGATA < 1:1684916/101‑1 AACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCAAATACCTCACAGTGAATATTGGCTGATTAAAGCAGCGGCAAATTTATGCACTGTGATA < 1:2455602/101‑1 ACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCAAATACCTCACAGTGAATATTGGCTGATTAAAGCAGCGGCAAATTTATGCACTGTGATAA < 1:2922647/101‑1 ACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCAAATACCTCACAGTGAATATTGGCTGATTAAAGCAGCGGCAAATTTATGCACTGTGATAA < 1:4742559/101‑1 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AGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCAAATACCTCACAGTGAATATTGGCTGATTAAAGCAGCGGCAAATTTATGCACTGTGATAAGCGGCTTTTTCAGAG < 1:10461657/101‑1 AGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCAAATACCTCACAGTGAATATTGGCTGATTAAAGCAGCGGCAAATTTATGCACTGTGATAAGCGGCTTTTTCAGAG < 1:9502818/101‑1 GGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCAAATACCTCACAGTGAATATTGGCTGATTAAAGCAGCGGCAAATTTATGCACTGTGATAAGCGGCTTTTTCAGAGAG > 1:8088533/1‑101 GACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCAAATACCTCACAGTGAATATTGGCTGATTAAAGCAGCGGCAAATTTATGCACTGTGATAAGCGGCTTTTTCAGAGAGA > 1:11527552/1‑101 GACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCAAATACCTCACAGTGAATATTGGCTGATTAAAGCAGCGGCAAATTTATGCACTGTGATAAGCGGCTTTTTCAGAGAGA > 1:6868844/1‑101 CTTGTTCGCACCTTCCTTAGCAAATACCTCACAGTGAATATTGGCTGATTAAAGCAGCGGCAAATTTATGCACTGTGATAAGCGGCTTTTTCAGAGAGAAA < 1:62264/101‑1 CTTGTTCGCACCTTCCTTAGCAAATACCTCACAGTGAATATTGGCTGATTAAAGCAGCGGCAAATTTATGCACTGTGATAAGCGGCTTTTTCAGAGAGAAA > 1:2949315/1‑101 CTTGTTCGCACCTTCCTTAGCAAATACCTCACAGTGAATATTGGCTGATTAAAGCAGCGGCAAATTTATGCACTGTGATAAGCGGCTTTTTCAGAGAGAAA < 1:2411823/101‑1 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TAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_007779/4310446‑4310363‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTAGCAAATACCTCACAGTGAATATTGGCTGATTAAAGCAGCGGCAAATTTATGCACTGTGATAAGCGGCTTTTTCAGAGAGAAAGACTCTCTGGCGATG > NC_007779/4353540‑4353639 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |