| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_007779 | = 3903279 | 2 (0.010) | 177 (0.900) | 111/178 | NT | 98.9% | coding (42/825 nt) | bax | hypothetical protein |
| ? | NC_007779 | = 4504190 | NA (NA) | intergenic (+10/‑89) | insD/yjgW | IS2 insertion element transposase InsAB'/hypothetical protein | |||||
Only 100 of 219 total aligned reads displayed.
CTCTCAAATTTGTGAAAAATATAAGGTGTTGGAATGATTAAATCCGACCAGGAGACCTGATGATTTTGACTCCCATACGACGATATGGGGCGATGATTCTT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_007779/3903179‑3903279‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTAT < NC_007779/4504190‑4504092 CTCTCAAATTTGTGAAAAATATAAGGTGTTGGAATGATTAAATCCGACCAGGAGACCTGATGATTTTGACTCCCATACGACGATATGGGGCGATGATTCTT > 1:5642725/1‑101CTCTCAAATTTGTGAAAAATATAAGGTGTTGGAATGATTAAATCCGACCAGGAGACCTGATGATTTTGACTCCCATACGACGATATGGGGCGATGATTCTT > 1:5307218/1‑101CTCTCAAATTTGTGAAAAATATAAGGTGTTGGAATGATTAAATCCGACCAGGAGACCTGATGATTTTGACTCCCATACGACGATATGGGGCGATGATTCTT > 1:1430704/1‑101CTCTCAAATTTGTGAAAAATATAAGGTGTTGGAATGATTAAATCCGACCAGGAGACCTGATGATTTTGACTCCCATACGACGATATGGGGCGATGATTCTT < 1:802593/101‑1 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AATATAAGGTGTTGGAATGATTAAATCCGACCAGGAGACCTGATGATTTTGACTCCCATACGACGATATGGGGCGATGATTCTTGGATTTGCCCCTATATT < 1:8176747/101‑1 TATAAGGTGTTGGAATGATTAAATCCGACCAGGAGACCTGATGATTTTGACTCCCATACGACGATATGGGGCGATGATTCTTGGATTTGCCCCTATATTTC < 1:1422662/101‑1 ATAAGGTGTTGGAATGATTAAATCCGACCAGGAGACCTGATGATTTTGACTCCCATACGACGATATGGGGCGATGATTCTTGGATTTGCCCCTATATTTCC < 1:8678434/101‑1 ATAAGGTGTTGGAATGATTAAATCCGACCAGGAGACCTGATGATTTTGACTCCCATACGACGATATGGGGCGATGATTCTTGGATTTGCCCCTATATTTCC > 1:2085853/1‑101 ATAAGGTGTTGGAATGATTAAATCCGACCAGGAGACCTGATGATTTTGACTCCCATACGACGATATGGGGCGATGATTCTTGGATTTGCCCCTATATTTCC > 1:3936182/1‑101 AAGGTGTTGGAATGATTAAATCCGACCAGGAGACCTGATGATTTTGACTCCCATACGACGATATGGGGCGATGATTCTTGGATTTGCCCCTATATTTCCAG > 1:4208964/1‑101 AAGGTGTTGGAATGATTAAATCCGACCAGGAGACCTGATGATTTTGACTCCCATACGACGATATGGGGCGATGATTCTTGGATTTGCCCCTATATTTCCAG > 1:9696573/1‑101 AGGTGTTGGAATGATTAAATCCGACCAGGAGACCTGATGATTTTGACTCCCATACGACGATATGGGGCGATGATTCTTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGA > 1:8062521/1‑101 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |