| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_007779 | 1221489 = | 4 (0.020) | 199 (1.020) | 109/176 | NT | 98.1% | intergenic (+711/+2393) | ymgF/ymgD | hypothetical protein/hypothetical protein |
| ? | NC_007779 | 1301041 = | NA (NA) | intergenic (+219/‑89) | ychE/insC | inner membrane protein/IS2 element protein | |||||
Only 100 of 471 total aligned reads displayed.
GTGTAACTGGATATATAAATAATGCCAGTGTGATGACTAGTGGTGATGGATCTTATGGTATTTCTGTTGATAGTCAAAACAAAGTATTATATATAAGCGATAGCGATATTAAGACCTCTGGAAGCGTATCTGACAAAGAAAATGGAGGGATAACAGCCAGCGCAGTAGTCAGTGAATTTGGTGGCACCATCTTTATGAATG > NC_007779/1221389‑1221589 | gtgtAACTGGATATATAAATAATGCCAGTGTGATGACTAGTGGTGATGGATCTTATGGTATTTCTGTTGATAGTCAAAACAAAGTATTATATATAagcgat < 1:3458502/101‑1 (MQ=255)acatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtct > 1:5652290‑M1/101‑101 (MQ=255)acatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtct > 1:2362239‑M1/101‑101 (MQ=255)acatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtct > 1:3613503‑M1/101‑101 (MQ=255)acatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtct < 1:779890‑M1/1‑1 (MQ=255)acatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtct > 1:9055213‑M1/101‑101 (MQ=255) tgtAACTGGATATATAAATAATGCCAGTGTGATGACTAGTTGTGATGGATCTTATGGTATTTCTGTTGATAGTCAAAACAAAGTATTATATATAagcgata < 1:8516761/101‑1 (MQ=255) catcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtcTa > 1:6071956‑M1/100‑101 (MQ=255) catcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtcTa < 1:2734746‑M1/2‑1 (MQ=255) catcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtcTa < 1:2062520‑M1/2‑1 (MQ=255) catcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtcTa < 1:1326609‑M1/2‑1 (MQ=255) aaCTGGATATATAAATAATGCCAGTGTGATGACTAGTGGTGATGGATCTTATGGTATTTCTGTTGATAGTCAAAACAAAGTATTATATATAagcgatagcg < 1:6687247/101‑1 (MQ=255) tGGATATATAAATAATGCCAGTGTGATGACTAGTGGTGATGGATCTTATGGTATTTCTGTTGATAGTCAAAACAAAGTATTATATATAAGCGATAGCGATt < 1:8722612‑M1/101‑2 (MQ=255) atataAATAATGCCAGTGTGATGACTAGTGGTGATGGATCTTATGGTATTTCTGTTGATAGTCAAAACAAAGTATTATATATAAGCGATAGCGATtggatt > 1:9027329‑M1/1‑95 (MQ=255) taaataaTGCCAGTGTGATGACTAGTGGTGATGGATCTTATGGTATTTCTGTTGATAGTCAAAACAAAGTATTATATATAAGCGATAGCGATtggatttgc > 1:4689573‑M1/1‑92 (MQ=255) tccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtcTAGCGATATTAAGACctc < 1:9351462‑M1/18‑1 (MQ=255) tccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtcTAGCGATATTAAGACctc < 1:2671171‑M1/18‑1 (MQ=255) ccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtcTAGCGATATTAAGACctct > 1:10047916‑M1/83‑101 (MQ=255) tgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtcTAGCGATATTAAGACCTCTGGaa > 1:3093684‑M1/79‑101 (MQ=255) tgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtcTAGCGATATTAAGACCTCTGGaa < 1:5999583‑M1/23‑1 (MQ=255) ccAGTGTGATGACTAGTGGTGATGGATCTTATGGTATTTCTGTTGATAGTCAAAACAAAGTATTATATATAAGCGATAGCGATtggatttgcccctatatt > 1:506577‑M1/1‑83 (MQ=255) agtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtcTAGCGATATTAAGACCTCTGGAAGCGTa > 1:8307016‑M1/74‑101 (MQ=255) tgtgATGACTAGTGGTGATGGATCTTATGGTATTTCTGTTGATAGTCAAAACAAAGTATTATATATAAGCGATAGCGATtggatttgcccctatatttcca < 1:4870514‑M1/101‑23 (MQ=255) gtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtcTAGCGATATTAAGACCTCTGGAAGCGTAt > 1:4174918‑M1/73‑101 (MQ=255) ctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtcTAGCGATATTAAGACCTCTGGAAGCGTATCt > 1:6284514‑M1/71‑101 (MQ=255) taaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtcTAGCGATATTAAGACCTCTGGAAGCGTATCTg > 1:5586247‑M1/70‑101 (MQ=255) gaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtcTAGCGATATTAAGACCTCTGGAAGCGTATCTGa < 1:9579823‑M1/33‑1 (MQ=255) aaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtcTAGCGATATTAAGACCTCTGGAAGCGTATCTGa < 1:8093825‑M1/33‑1 (MQ=255) aaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtcTAGCGATATTAAGACCTCTGGAAGCGTATCTGa > 1:1778350‑M1/69‑101 (MQ=255) aaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtcTAGCGATATTAAGACCTCTGGAAGCGTATCTGAc < 1:1265864‑M1/34‑1 (MQ=255) gaCTAGTGGTGATGGATCTTATGGTATTTCTGTTGATAGTCAAAACAAAGTATTATATATAAGCGATAGCGATtggatttgcccctatatttccagacatc < 1:3250741‑M1/101‑29 (MQ=255) gaCTAGTGGTGATGGATCTTATGGTATTTCTGTTGATAGTCAAAACAAAGTATTATATATAAGCGATAGCGATtggatttgcccctatatttccagacatc < 1:9427300‑M1/101‑29 (MQ=255) aaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtcTAGCGATATTAAGACCTCTGGAAGCGTATCTGACa < 1:253292‑M1/35‑1 (MQ=255) actagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtcTAGCGATATTAAGACCTCTGGAAGCGTATCTGACaaa < 1:10022488‑M1/37‑1 (MQ=255) tagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtcTAGCGATATTAAGACCTCTGGAAGCGTATCTGACAAAGa < 1:9485473‑M1/39‑1 (MQ=255) aGTGGTGATGGATCTTATGGTATTTCTGTTGATAGTCAAAACAAAGTATTATATATAAGCGATAGCGATtggatttgcccctatatttccagacatctgtt > 1:3178305‑M1/1‑69 (MQ=255) aGTGGTGATGGATCTTATGGTATTTCTGTTGATAGTCAAAACAAAGTATTATATATAAGCGATAGCGATtggatttgcccctatatttccaaacatctgtt > 1:8780269‑M1/1‑69 (MQ=255) tggtgATGGATCTTATGGTATTTCTGTTGATAGTCAAAACAAAGTATTATATATAAGCGATAGCGATtggatttgcccctatatttccagacatctgttat > 1:8428291‑M1/1‑67 (MQ=255) gtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtcTAGCGATATTAAGACCTCTGGAAGCGTATCTGACAAAGaaa > 1:9148239‑M1/61‑101 (MQ=255) gtgATGGATCTTATGGTATTTCTGTTGATAGTCAAAACAAAGTATTATATATAAGCGATAGCGATtggatttgcccctatatttccagacatctgttatca < 1:5357621‑M1/101‑37 (MQ=255) ttaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtcTAGCGATATTAAGACCTCTGGAAGCGTATCTGACAAAGAAAATg < 1:8358874‑M1/44‑1 (MQ=255) tgATGGATCTTATGGTATTTCTGTTGATAGTCAAAACAAAGTATTATATATAAGCGATAGCGATtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcac > 1:1637196‑M1/1‑64 (MQ=255) taagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtcTAGCGATATTAAGACCTCTGGAAGCGTATCTGACAAAGAAAATgg < 1:5954818‑M1/45‑1 (MQ=255) tGGATCTTATGGTATTTCTGTTGATAGTCAAAACAAAGTATTATATATAAGCGATAGCGATtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcactta < 1:3961451‑M1/101‑41 (MQ=255) agactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtcTAGCGATATTAAGACCTCTGGAAGCGTATCTGACAAAGAAAATGGAg < 1:5270678‑M1/47‑1 (MQ=255) ggATCTTATGGTATTTCTGTTGATAGTCAAAACAAAGTATTATATATAAGCGATAGCGATtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaa > 1:8245403‑M1/1‑60 (MQ=255) aTCTTATGGTATTTCTGTTGATAGTCAAAACAAAGTATTATATATAAGCGATAGCGATtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacc > 1:3750400‑M1/1‑58 (MQ=255) atcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtcTAGCGATATTGAGACCTCTGGAAGCGTATCTGACAAAGAAAATGGAGGGATa < 1:7192410‑M1/52‑1 (MQ=255) ttATGGTATTTCTGTTGATAGTCAAAACAAAGTATTATATATAAGCGATAGCGATtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccat < 1:7950056‑M1/101‑47 (MQ=255) ttATGGTATTTCTGTTGATAGTCAAAACAAAGTATTATATATAAGCGATAGCGATtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccat < 1:7275821‑M1/101‑47 (MQ=255) tcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtcTAGCGATATTAAGACCTCTGGAAGCGTATCTGACAAAGAAAATGGAGGGATaa > 1:2978443‑M1/49‑101 (MQ=255) acttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtcTAGCGATATTAAGACCTCTGGAAGCGTATCTGACAAAGAAAATGGAGGGATAAca > 1:5450723‑M1/47‑101 (MQ=255) acttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtcTAGCGATATTAAGACCTCTGGAAGCGTATCTGACAAAGAAAATGGAGGGATAAca > 1:4131836‑M1/47‑101 (MQ=255) tGGTATTTCTGTTGATAGTCAAAACAAAGTATTATATATAAGCGATAGCGATtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattac < 1:6423627‑M1/101‑50 (MQ=255) cttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggagccagtcTAGCGATATTAAGACCTCTGGAAGCGTATCTGACAAAGAAAATGGAGGGATAAcag > 1:7039875‑M1/46‑101 (MQ=255) 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atatataAGCGATAGCGATtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattaaaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagc > 1:1437632‑M1/1‑19 (MQ=255) agggggccagtcTAGCGATATTAAGACCTCTGGAAGCGTATCTGACAAAGAAAATGGAGGGATAACAGCCAGCGCAGTAGTCAGTGAATTTGGTGGCACCa < 1:106757‑M1/89‑1 (MQ=255) ataAGCGATAGCGATtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgata < 1:12225‑M1/101‑87 (MQ=255) ataAGCGATAGCGATtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgata > 1:6787328‑M1/1‑15 (MQ=255) aaGCGATAGCGATtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataac > 1:7460773‑M1/1‑13 (MQ=255) aaGCGATAGCGATtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataac < 1:9927728‑M1/101‑89 (MQ=255) cagtcTAGCGATATTAAGACCTCTGGAAGCGTATCTGACAAAGAAAATGGAGGGATAACAGCCAGCGCAGTAGTCAGTGAATTTGGTGGCACCATCTTTAt < 1:6522914‑M1/96‑1 (MQ=255) cagtcTAGCGATATTAAGACCTCTGGAAGCGTATCTGACAAAGAAAATGGAGGGATAACAGCCAGCGCAGTAGTCAGTGAATTTGGTGGCACCATCTTTAt < 1:439519‑M1/96‑1 (MQ=255) agtcTAGCGATATTAAGACCTCTGGAAGCGTATCTGACAAAGAAAATGGAGGGATAACAGCCAGCGCAGTAGTCAGTGAATTTGGTGGCACCATCTTTATg < 1:6585855‑M1/97‑1 (MQ=255) cTAGCGATATTAAGACCTCTGGAAGCGTATCTGACAAAGAAAATGGAGGGATAACAGCCAGCGCAGTAGTCAGTGAATTTGGTGGCACCATCTTTATGAAt < 1:4048625‑M1/100‑1 (MQ=255) | GTGTAACTGGATATATAAATAATGCCAGTGTGATGACTAGTGGTGATGGATCTTATGGTATTTCTGTTGATAGTCAAAACAAAGTATTATATATAAGCGATAGCGATATTAAGACCTCTGGAAGCGTATCTGACAAAGAAAATGGAGGGATAACAGCCAGCGCAGTAGTCAGTGAATTTGGTGGCACCATCTTTATGAATG > NC_007779/1221389‑1221589 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |