| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_007779 | = 608570 | NA (NA) | 177 (0.920) | 104/174 | NT | 96.8% | intergenic (+170/+112) | insL/entD | IS186/IS421 transposase/phosphopantetheinyltransferase component of enterobactin synthase multienzyme complex |
| ? | NC_007779 | 1305025 = | 6 (0.030) | coding (413/921 nt) | oppB | oligopeptide transporter subunit | |||||
Only 100 of 448 total aligned reads displayed.
TTTTTCCTTGCGGTAATACTGGGTGTTAGTGCTGGCGTTATTGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGATATTTGCGATCATTTTGCATTGGCTGCCGGGCGGTGGCTGGAATGGTGGGGCGCTT > NC_007779/1304925‑1305125 | acagcctacaaaacgcaattgaagaatgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatg < 1:775571‑M2/1‑1 (MQ=255)acagcctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatg < 1:3768996‑M2/1‑1 (MQ=255)acagcctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatg < 1:6096815‑M2/1‑1 (MQ=255) agcctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgccttcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatggg > 1:2249427‑M2/99‑101 (MQ=255) agcctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatggg > 1:9324246‑M2/99‑101 (MQ=255) agcctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcctcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatggg < 1:9614710‑M2/3‑1 (MQ=255) gcctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGgt > 1:8411707‑M2/98‑101 (MQ=255) gcctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGgt > 1:4684571‑M2/98‑101 (MQ=255) tCCTTGCGGTAATACTGGGTGTTAGTGCTGGCGTTATTGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGgtt > 1:1010247/1‑101 (MQ=255) acaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGgttgtt > 1:9257732‑M2/94‑101 (MQ=255) aaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGTTGTTAt < 1:5046053‑M2/10‑1 (MQ=255) aaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGTTGTTATc < 1:2354331‑M2/11‑1 (MQ=255) ggTAATACTGGGTGTTAGTGCTGGCGTTATTGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCC > 1:671900‑M1/1‑101 (MQ=255) acgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGTTGTTATccc < 1:1591044‑M2/13‑1 (MQ=255) aTACTGGGTGTTAGTGCTGGCGTTATTGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCata < 1:1043002‑M1/101‑4 (MQ=255) aTACTGGGTGTTAGTGCTGGCGTTATTGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCata > 1:2732387‑M1/1‑98 (MQ=255) tACTGGGTGTTAGTGCTGGCGTTATTGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCataa < 1:5883519‑M1/101‑5 (MQ=255) tACTGGGTGTTAGTGCTGGCGTTATTGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCataa < 1:7413548‑M1/101‑5 (MQ=255) aattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGTTGTTATCCCCAGt > 1:3102950‑M2/85‑101 (MQ=255) aattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGTTGTTATCCCCAGt < 1:5092741‑M2/17‑1 (MQ=255) attgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGTTGTTATCCCCAGtt < 1:3029826‑M2/18‑1 (MQ=255) ttgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGTTGTTATCCCCAGttt < 1:9555714‑M2/19‑1 (MQ=255) cTGGGTGTTAGTGCTGGCGTTATTGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCataagc > 1:8755679‑M1/1‑95 (MQ=255) gaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGTTGTTATCCCCAGTTTtg < 1:5158877‑M2/21‑1 (MQ=255) gaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTgg < 1:2557288‑M2/24‑1 (MQ=255) aacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGt > 1:475301‑M2/77‑101 (MQ=255) tAGTGCTGGCGTTATTGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCataagcgctaactt < 1:6541502‑M1/101‑15 (MQ=255) aGTGCTGGCGTTATTGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCataagcgctaactta < 1:9100227‑M1/101‑16 (MQ=255) gaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCAc > 1:5330394‑M2/72‑101 (MQ=255) gaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCAc > 1:6286479‑M2/72‑101 (MQ=255) ggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCNCCa < 1:7677789‑M2/32‑1 (MQ=255) cTGGCGTTATTGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCataagcgctaacttaaggg > 1:8671727‑M1/1‑82 (MQ=255) gcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCat < 1:4590767‑M2/33‑1 (MQ=255) ggCGTTATTGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCataagcgctaacttaagggtt > 1:40060‑M1/1‑80 (MQ=255) ttATTGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCataagcgctaacttaagggttgtgg < 1:2523216‑M1/101‑26 (MQ=255) ttATTGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCataagcgctaacttaagggttgtgg < 1:1111786‑M1/101‑26 (MQ=255) gtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCAttatta > 1:3578231‑M2/64‑101 (MQ=255) tcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAg > 1:2038451‑M2/63‑101 (MQ=255) tATTGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCataagcgctaacttaagggttgtggt < 1:1334864‑M1/101‑27 (MQ=255) ttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTc < 1:8599999‑M2/41‑1 (MQ=255) ttGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCataagcgctaacttaagggttgtggtat < 1:5250990‑M1/101‑29 (MQ=255) taacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCa > 1:4297969‑M2/60‑101 (MQ=255) taacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCa < 1:4434789‑M2/42‑1 (MQ=255) aacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCAt > 1:8869369‑M2/59‑101 (MQ=255) gaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGat > 1:4165201‑M2/56‑101 (MQ=255) gaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGat < 1:3611003‑M2/46‑1 (MQ=255) gaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGat < 1:4929452‑M2/46‑1 (MQ=255) cATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcc < 1:8946342‑M1/101‑35 (MQ=255) aTTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcct > 1:1781180‑M1/1‑66 (MQ=255) aTTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcct < 1:7552617‑M1/101‑36 (MQ=255) caccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGATAttt < 1:1427228‑M2/50‑1 (MQ=255) caccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGATAttt < 1:2923985‑M2/50‑1 (MQ=255) accgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGATATTTg > 1:284051‑M2/51‑101 (MQ=255) aacaaaacaCCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatat > 1:5385018‑M1/1‑61 (MQ=255) gaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGATATTTGCGa > 1:7813493‑M2/48‑101 (MQ=255) gaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGATATTTGCGa < 1:9804733‑M2/54‑1 (MQ=255) acaaaacaCCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatg > 1:7174192‑M1/1‑60 (MQ=255) caaaacaCCAAATGGGACTATACCGGGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatga < 1:3270674‑M1/101‑43 (MQ=255) aggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGATATTTGCGAt > 1:421879‑M2/47‑101 (MQ=255) gcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGATATTTGCGATCa > 1:5698037‑M2/45‑101 (MQ=255) aaacaCCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatt > 1:9043674‑M1/1‑57 (MQ=255) aaacaCCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTAGCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatt < 1:4111723‑M1/101‑45 (MQ=255) tcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGATATTTGCGATCAttt > 1:2660624‑M2/42‑101 (MQ=255) cacCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaa > 1:10005392‑M1/1‑54 (MQ=255) attcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGATATTTGCGATCATTTTGCa < 1:3495841‑M2/64‑1 (MQ=255) ttcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGATATTTGCGATCATTTTGCAt < 1:5753632‑M2/65‑1 (MQ=255) aaTGGGGCTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgc > 1:1929989‑M1/1‑49 (MQ=255) aTGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgcc > 1:7520757‑M1/1‑48 (MQ=255) tGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCataagcgctaacttaagggttgttgtattacgcctgatatgatttaacgtgccg > 1:7897299‑M1/1‑47 (MQ=255) tcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGATATTTGCGATCATTTTGCATTGGc > 1:3182264‑M2/33‑101 (MQ=255) tcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGATATTTGCGATCATTTTGCATTGGc < 1:8496378‑M2/69‑1 (MQ=255) gACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatg < 1:646987‑M1/101‑58 (MQ=255) cTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaa > 1:7289246‑M1/1‑42 (MQ=255) tataCCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaat > 1:9835358‑M1/1‑41 (MQ=255) tataCCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaat > 1:437911‑M1/1‑41 (MQ=255) tataCCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaat > 1:6620992‑M1/1‑41 (MQ=255) 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cttaagttagcgcttatGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGATATTTGCGATCATTTTGCATTGGCTGCCGGGCGGTGGCt > 1:9143592‑M2/18‑101 (MQ=255) cttaagttagcgcttatGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGATATTTGCGATCATTTTGCATTGGCTGCCGGGCGGTGGCt < 1:8091651‑M2/84‑1 (MQ=255) taagttagcgcttatGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGATATTTGCGATCATTTTGCATTGGCTGCCGGGCGGTGGCTgg > 1:1981713‑M2/16‑101 (MQ=255) cgcttatGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGATATTTGCGATCATTTTGCATTGGCTGCCGGGCGGTGGCTGGAAtggtgg < 1:4835115‑M2/94‑1 (MQ=255) aTGACCGGGGTTGTTATCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtca < 1:1682451‑M1/101‑82 (MQ=255) aTGACCGGGGTTGTTATCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtca > 1:1260886‑M1/1‑20 (MQ=255) tGACCGGGGTTGTTATCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtcag < 1:8171127‑M1/101‑83 (MQ=255) cttatGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGATATTTGCGATCATTTTGCATTGGCTGCCGGGCGGTGGCTGGAATGGTgggg < 1:1489210‑M2/96‑1 (MQ=255) cGGGGTTGTTATCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtcagcaat > 1:6825008‑M1/1‑15 (MQ=255) ggggTTGTTATCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtcagcaatt < 1:799371‑M1/101‑88 (MQ=255) | TTTTTCCTTGCGGTAATACTGGGTGTTAGTGCTGGCGTTATTGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGATATTTGCGATCATTTTGCATTGGCTGCCGGGCGGTGGCTGGAATGGTGGGGCGCTT > NC_007779/1304925‑1305125 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |