Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_007779 | 4,198,505 | C→A | 6.9% | A63D (GCT→GAT) | rpsK → | 30S ribosomal protein S11 |
Read alignment evidence... | ||||||||||
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seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_007779 | 4,198,505 | 0 | C→A | 6.9% | 32.6 ‑0.9 ‑0.0 | 204 | A63D (GCT→GAT) | rpsK | 30S ribosomal protein S11 |
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (8/6): ref base (83/107): total (91/113) | ||||||||||
Fisher's exact test strand distribution p-value = 4.07e-01 | ||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 9.52e-01 |
Only 100 of 211 total aligned reads displayed.
ACCATCGTGACTATCACTGATCGTCAGGGTAACGCGTTGGGTTGGGCAACAGCCGGTGGTTCCGGTTTCCGTGGTTCTCGCAAATCCACTCCGTTTGCAGCTCAGGTTGCAGCAGAGCGTTGCGCTGACGCCGTGAAAGAATACGGCATCAAGAATCTGGAAGTTATGGTTAAAGGTCCGGGTCCAGGCCGCGAATCTACT > NC_007779/4198405‑4198605 | ccATCGTGACTATCACTGATCGTCAGGGTAACGCGTTGGGTTGGGCAACAGCCGGTGGTTCCGGTTTCCGTGGTTCTCGCAAATCCACTCCGTTTGCAGCt < 1:6638876/101‑1 (MQ=255) cATCGTGACTATCACTGATCGTCAGGGTAACGCGTTGGGTTGGGCAACAGCCGGTGGTTCCGGTTTCCGTGGTTCTCGCAAATCCACTCCGTTTGCAGCTc > 1:3705213/1‑101 (MQ=255) cATCGTGACTATCACTGATCGTCAGGGTAACGCGTTGGGTTGGGCAACAGCCGGTGGTTCCGGTTTCCGTGGTTCTCGCAAATCCACTCCGTTTGCAGATc > 1:3929824/1‑101 (MQ=255) tCGTGACTATCACTGATCGTCAGGGTAACGCGTTGGGTTGGGCAACAGCCGGTGGTTCCGGTTTCCGTGGTTCTCGCAAATCCACTCCGTTTGCAGCTCAg < 1:2832548/101‑1 (MQ=255) tCGTGACTATCACTGATCGTCAGGGTAACGCGTTGGGTTGGGCAACAGCCGGTGGTTCCGGTTTCCGTGGTTCTCGCAAATCCACTCCGTTTGCAGCTCAg < 1:426789/101‑1 (MQ=255) tGACTATCACTGATCGTCAGGGTAACGCGTTGGGTTGGGCAACAGCCGGTGGTTCCGGTTTCCGTGGTTCTCGCAAATCCACTCCGTTTGCAGCTCAGGtt < 1:7074263/101‑1 (MQ=255) cTATCACTGATCGTCAGGGTAACGCGTTGGGTTGGGCAACAGCCGGTGGTTCCGGTTTCCGTGGTTCTCGCAAATCCACTCCGTTTGCAGCTCAGGTTgca < 1:2821536/101‑1 (MQ=255) cTATCACTGATCGTCAGGGTAACGCGTTGGGTTGGGCAACAGCCGGTGGTTCCGGTTTCCGTGGTTCTCGCAAATCCACTCCGTTTGCAGCTCAGGTTgca > 1:1444592/1‑101 (MQ=255) tATCACTGATCGTCAGGGTAACGCGTTGGGTTGGGCAACAGCCGGTGGTTCCGGTTTCCGTGGTTCTCGCAAATCCACTCCGTTTGCAGCTCAGGTTgcag < 1:693935/101‑1 (MQ=255) aTCACTGATCGTCAGGGTAACGCGTTGGGTTGGGCAACAGCCGGTGGTTCCGGTTTCCGTGGTTCTCGCAAATCCACTCCGTTTGCAGCTCAGGTTgcagc > 1:715807/1‑101 (MQ=255) tCACTGATCGTCAGGGTAACGCGTTGGGTTGGGCAACAGCCGGTGGTTCCGGTTTCCGTGGTTCTCGCAAATCCACTCCGTTTGCAGCTCAGGTTgcagca < 1:4751981/101‑1 (MQ=255) aCTGATCGTCAGGGTAACGCGTTGGGTTGGGCAACAGCCGGTGGTTCCGGTTTCCGTGGTTCTCGCAAATCCACTCCGTTTGCAGCTCAGGTTGCAGCaga < 1:2773420/101‑1 (MQ=255) cTGATCGTCAGGGTAACGCGTTGGGTTGGGCAACAGCCGGTGGTTCCGGTTTCCGTGGTTCTCGCAAATCCACTCCGTTTGCAGCTCAGGTTGCAGCagag > 1:1880213/1‑101 (MQ=255) tGATCGTCAGGGTAACGCGTTGGGTTGGGCAACAGCCGGTGGTTCCGGTTTCCGTGGTTCTCGCAAATCCACTCCGTTTGCAGATCAGGTTGCAGCAGAGc > 1:3325898/1‑101 (MQ=255) aTCGTCAGGGTAACGCGTTGGGTTGGGCAACAGCCGGTGGTTCCGGTTTCCGTGGTTCTCGCAAATCCACTCCGTTTGCAGCTCAGGTTGCAGCAGAGCGt > 1:4081391/1‑101 (MQ=255) cGTCAGGGTAACGCGTTGGGTTGGGCAACAGCCGGTGGTTCCGGTTTCCGTGGTTCTCGCAAATCCACTCCGTTTGCAGCTCAGGTTGCAGCAGAGCGTTg < 1:8387060/101‑1 (MQ=255) cGTCAGGGTAACGCGTTGGGTTGGGCAACAGCCGGTGGTTCCGGTTTCCGTGGTTCTCGCAAATCCACTCCGTTTGCAGCTCAGGTTGCAGCAGAGCGTTg > 1:3446153/1‑101 (MQ=255) gTCAGGGTAACGCGTTGGGTTGGGCAACAGCCGGTGGTTCCGGTTTCCGTGGTTCTCGCAAATCCACTCCGTTTGCAGCTCAGGTTGCAGCAGAGCGTTgc < 1:745234/101‑1 (MQ=255) tCAGGGTAACGCGTTGGGTTGGGCAACAGCCGGTGGTTCCGGTTTCCGTGGTTCTCGCAAATCCACTCCGTTTGCAGCTCAGGTTGCAGCAGAGCGTTgcg > 1:3357930/1‑101 (MQ=255) tCAGGGTAACGCGTTGGGTTGGGCAACAGCCGGTGGTTCCGGTTTCCGTGGTTCTCGCAAATCCACTCCGTTTGCAGCTCAGGTTGCAGCAGAGCGTTgcg < 1:8520395/101‑1 (MQ=255) cAGGGTAACGCGTTGGGTTGGGCAACAGCCGGTGGTTCCGGTTTCCGTGGTTCTCGCAAATCCACTCCGTTTGCAGCTCAGGTTGCAGCAGAGCGTTgcgc > 1:3696837/1‑101 (MQ=255) aaggTAACGCGTTGGGTTGGGCAACAGCCGGTGGGTCCGGTTTCCGTGGTTCTCGCAAATCCACTCCGTTTGCAGCTCAGGTTGCAGCAGAGCGTTGCGCt < 1:4186886/99‑1 (MQ=255) gggTAACGCGTTGGGTTGGGCAACAGCCGGTGGTTCCGGTTTCCGTGGTTCTCGCAAATCCACTCCGTTTGCAGCTCAGGTTGCAGCAGAGCGTTGCGCTg < 1:1073900/101‑1 (MQ=255) gTAACGCGTTGGGTTGGGCAACAGCCGGTGGTTCCGGTTTCCGTGGTTCTCGCAAATCCACTCCGTTTGCAGCTCAGGTTGCAGCAGAGCGTTGCGCTGAc > 1:3017225/1‑101 (MQ=255) gTAACGCGTTGGGTTGGGAAACAGCCGGTGGTTCCGGTTTCCGTGGTTCTCGCAAATCCACTCCGTTTGCAGCTCAGGTTGCAGCAGAGCGTTGCGCTGAc < 1:6583145/101‑1 (MQ=255) tAACGCGTTGGGTTGGGCAACAGCCGGTGGTTCCGGTTTCCGTGGTTCTCGCAAATCCACTCCGTTTGCAGCTCAGGTTGCAGCAGAGCGTTGCGCTGACg > 1:7318747/1‑101 (MQ=255) tAACGCGTTGGGTTGGGCAACAGCCGGTGGTTCCGGTTTCCGTGGTTCTCGCAAATCCACTCCGTTTGCAGCTCAGGTTGCAGCAGAGCGTTGCGCTGACg < 1:1630340/101‑1 (MQ=255) aaCGCGTTGGGTTGGGCAACAGCCGGTGGTTCCGGTTTCCGTGGTTCTCGCAAATCCACTCCGTTTGCAGCTCAGGTTGCAGCAGAGCGTTGCGCTGACGc > 1:4219705/1‑101 (MQ=255) aCGCGTTGGGTTGGGCAACAGCCGGTGGTTCCGGTTTCCGTGGTTCTCGCAAATCCACTCCGTTTGCAGATCAGGTTGCAGCAGAGCGTTGCGCTGACGcc < 1:2423880/101‑1 (MQ=255) gcgTTGGGTTGGGCAACAGCCGGTGGTTCCGGTTTCCGTGGTTCTCGCAAATCCACTCCGTTTGCAGCTCAGGTTGCAGCAGAGCGTTGCGCTGACGCCGt < 1:9756958/101‑1 (MQ=255) gcgTTGGGTTGGGCAACAGCCGGTGGTTCCGGTTTCCGTGGTTCTCGCAAATCCACTCCGTTTGCAGCTCAGGTTGCAGCAGAGCGTTGCGCTGACGCCGt > 1:3164765/1‑101 (MQ=255) gcgTTGGGTTGGGCAACAGCCGGTGGTTCCGGTTTCCGTGGTTCTCGCAAATCCACTCCGTTTGCAGCTCAGGTTGCAGCAGAGCGTTGCGCTGACGCCGt > 1:1377212/1‑101 (MQ=255) gcgTTGGGTTGGGCAACAGCCGGTGGTTCCGGTTTCCGTGGTTCTCGCAAATCCACTCCGTTTGCAGCTCAGGTTGCAGCAGAGCGTTGCGCTGACGCCGt > 1:9777581/1‑101 (MQ=255) cgTTGGGTTGGGCAACAGCCGGTGGTTCCGGTTTCCGTGGTTCTCGCAAATCCACTCCGTTTGCAGCTCAGGTTGCAGCAGAGCGTTGCGCTGACGCCGTg < 1:8131816/101‑1 (MQ=255) ttgggttgggCAACAGCCGGTGGTTCCGGTTTCCGTGGTTCTCGCAAATCCACTCCGTTTGCAGCTCAGGTTGCAGCAGAGCGTTGCGCTGACGCCGTGaa < 1:7035/101‑1 (MQ=255) tgggttgggCAACAGCCGGTGGTTCCGGTTTCCGTGGTTCTCGCAAATCCACTCCGTTTGCAGCTCAGGTTGCAGCAGAGCGTTGCGCTGACGCCGTGaaa > 1:6193659/1‑101 (MQ=255) gggttgggCAACAGCCGGTGGTTCCGGTTTCCGTGGTTCTCGCAAATCCACTCCGTTTGCAGCTCAGGTTGCAGCAGAGCGTTGCGCTGACGCCGTGAAAg > 1:8497762/1‑101 (MQ=255) gggttgggCAACAGCCGGTGGTTCCGGTTTCCGTGGTTCTCGCAAATCCACTCCGTTTGCAGATCAGGTTGCAGCAGAGCGTTGCGCTGACGCCGTGAAAg > 1:9075483/1‑101 (MQ=255) gggttgggCAACACCCGGTGGTTTCGGTTTGCGTGGTTGTCGCAAATCCACTCCGTTTGCAGTTCAGGTTGCCCGAGAGCGTTGCGCTGACGCCGTGNAAg < 1:7981622/101‑1 (MQ=255) ggttgggCAACAGCCGGTGGTTCCGGTTTCCGTGGTTCTCGCAAATCCACTCCGTTTGCAGCTCAGGTTGCAGCAGAGCGTTGCGCTGACGCCGTGAAAGa < 1:4667073/101‑1 (MQ=255) gttgggCAACAGCCGGTGGTTCCGGTTTCCGTGGTTCTCGCAAATCCACTCCGTTTGCAGCTCAGGTTGCAGCAGAGCGTTGCGCTGACGCCGTGAAAGaa > 1:1962588/1‑101 (MQ=255) ttgggCAACAGCCGGTGGTTCCGGTTTCCGTGGTTCTCGCAAATCCACTCCGTTTGCAGCTCAGGTTGCAGCAGAGCGTTGCGCTGACGCCGTGAAAGAAt > 1:545308/1‑101 (MQ=255) ttgggCAACAGCCGGTGGTTCCGGTTTCCGTGGTTCTCGCAAATCCACTCCGTTTGCAGCTCAGGTTGCAGCAGAGCGTTGCGCTGACGCCGTGAAAGAAt < 1:455585/101‑1 (MQ=255) ttgggCAACAGCCGGTGGTTCCGGTTTCCGTGGTTCTCGCAAATCCACTCCGTTTGCAGCTCAGGTTGCAGCAGAGCGTTGCGCTGACGCCGTGAAACAAt > 1:2719906/1‑101 (MQ=255) gggCAACAGCCGGTGGTTCCGGTTTCCGTGGTTCTCGCAAATCCACTCCGTTTGCAGCTCAGGTTGCAGCAGAGCGTTGCGCTGACGCCGTGAAAGAATAc < 1:122812/101‑1 (MQ=255) gggCAACAGCCGGTGGTTCCGGTTTCCGTGGTTCTCGCAAATCCACTCCGTTTGCAGCTCAGGTTGCAGCAGAGCGTTGCGCTGACGCCGTGAAAGAATAc < 1:4784944/101‑1 (MQ=255) gCAACAGCCGGTGGTTCCGGTTTCCGTGGTTCTCGCAAATCCACTCCGTTTGCAGCTCAGGTTGCAGCAGAGCGTTGCGCTGACGCCGTGAAAGAATACgg < 1:2924524/101‑1 (MQ=255) gCAACAGCCGGTGGTTCCGGTTTCCGTGGTTCTCGCAAATCCACTCCGTTTGCAGATCAGGTTGCAGCAGAGCGTTGCGCTGACGCCGTGAAAGAATACgg < 1:2711944/101‑1 (MQ=255) aaCAGCCGGTGGTTCCGGTTTCCGTGGTTCTCGCAAATCCACTCCGTTTGCAGCTCAGGTTGCAGCAGAGCGTTGCGCTGACGCCGTGAACGAATACGGCa > 1:508807/1‑101 (MQ=255) aCAGCCGGTGGTTCCGGTTTCCGTGGTTCTCGCAAATCCACTCCGTTTGCAGCTCAGGTTGCAGCAGAGCGTTGCGCTGACGCCGTGAAAGAATACGGCAt < 1:6081711/101‑1 (MQ=255) aGCCGGTGGTTCCGGTTTCCGTGGTTCTCGCAAATCCACTCCGTTTGCAGCTCAGGTTGCAGCAGAGCGTTGCGCTGACGCCGTGAAAGAATACGGCATCa > 1:5965049/1‑101 (MQ=255) aGCCGGTGGTTCCGGTTTCCGTGGTTCTCGCAAATCCACTCCGTTTGCAGCTCAGGTTGCAGCAGAGCGTTGCGCTGACGCCGTGAAAGAATACGGCATCa > 1:9219431/1‑101 (MQ=255) ccGGTGGTTCCGGTTTCCGTGGTTCTCGCAAATCCACTCCGTTTGCAGCTCAGGTTGCAGCAGAGCGTTGCGCTGACGCCGTGAAAGAATACGGCATCAAg < 1:75611/101‑1 (MQ=255) cGGTGGTTCCGGTTTCCGTGGTTCTCGCAAATCCACTCCGTTTGCAGCTCAGGTTGCAGCAGAGCGTTGCGCTGACGCCGTGAAAGAATACGGCATCAAGa > 1:4838888/1‑101 (MQ=255) cGGTGGTTCCGGTTTCCGTGGTTCTCGCAAATCCACTCCGTTTGCAGCTCAGGTTGCAGCAGAGCGTTGCGCTGACGCCGTGAAAGAATACGGCATCAAGa < 1:8862332/101‑1 (MQ=255) ggtggtTCCGGTTTCCGTGGTTCTCGCAAATCCACTCCGTTTGCAGCTCAGGTTGCAGCAGAGCGTTGCGCTGACGCCGTGAAAGAATACGGCATCAAGaa > 1:3646026/1‑101 (MQ=255) ggtggtTCCGGTTTCCGTGGTTCTCGCAAATCCACTCCGTTTGCAGATCAGGTTGCAGCAGAGCGTTGCGCTGACGCCGTGAAAGAATACGGCATCAAGaa < 1:7484617/101‑1 (MQ=255) ttCCGGTTTCCGTGGTTCTCGCAAATCCACTCCGTTTGCAGCTCAGGTTGCAGCAGAGCGTTGCGCTGACGCCGTGAAAGAATACGGCATCAAGAATCTgg < 1:3751181/101‑1 (MQ=255) tCCGGTTTCCGTGGTTCTCGCAAATCCACTCCGTTTGCAGCTCAGGTTGCAGCAGAGCGTTGCGCTGACGCCGTGAAAGAATACGGCATCAAGAATCTGGa > 1:2481727/1‑101 (MQ=255) cGGTTTCCGTGGTTCTCGCAAATCCACTCCGTTTGCAGCTCAGGTTGCAGCAGAGCGTTGCGCTGACGCCGTGAAAGAATACGGCATCAAGAATCTGGAAg < 1:1666482/101‑1 (MQ=255) ggTTTCCGTGGTTCTCGCAAATCCACTCCGTTTGCAGCTCAGGTTGCAGCAGAGCGTTGCGCTGACGCCGTGAAAGAATACGGCATCAAGAATCTGGAAGt > 1:9612151/1‑101 (MQ=255) gTTTCCGTGGTTCTCGCAAATCCACTCCGTTTGCAGCTCAGGTTGCAGCAGAGCGTTGCGCTGACGCCGTGAAAGAATACGGCATCAAGAATCTGGAAGtt < 1:6716223/101‑1 (MQ=255) tttCCGTGGTTCTCGCAAATCCACTCCGTTTGCAGCTCAGGTTGCAGCAGAGCGTTGCGCTGACGCCGTGAAAGAATACGGCATCAAGAATCTGGAAGTTa > 1:7428276/1‑101 (MQ=255) ttCCGTGGTTCTCGCAAATCCACTCCGTTTGCAGCTCAGGTTGCAGCAGAGCGTTGCGCTGACGCCGTGAAAGAATACGGCATCAAGAATCTGGAAGTTAt > 1:774968/1‑101 (MQ=255) ccGTGGTTCTCGCAAATCCACTCCGTTTGCAGCTCAGGTTGCAGCAGAGCGTTGCGCTGACGCCGTGAAAGAATACGGCATCAAGAATCTGGAAGTTATgg > 1:1776069/1‑101 (MQ=255) ccGTGGTTCTCGCAAATCCACTCCGTTTGCAGCTCAGGTTGCAGCAGAGCGTTGCGCTGACGCCGTGAAAGAATACGGCATCAAGAATCTGGAAGTTATgg < 1:9425076/101‑1 (MQ=255) cGTGGTTCTCGCAAATCCACTCCGTTTGCAGCTCAGGTTGCAGCAGAGCGTTGCGCTGACGCCGTGAAAGAATACGGCATCAAGAATCTGGAAGTTATGGt > 1:7610333/1‑101 (MQ=255) gTGGTTCTCGCAAATCCACTCCGTTTGCAGCTCAGGTTGCAGCAGAGCGTTGCGCTGACGCCGTGAAAGAATACGGCATCAAGAATCTGGAAGTTATGGtt < 1:5894483/101‑1 (MQ=255) tGGTTCTCGCAAATCCACTCCGTTTGCAGCTCAGGTTGCAGCAGAGCGTTGCGCTGACGCCGTGAAAGAATACGGCATCAAGAATCTGGAAGTTATGGTTa < 1:946327/101‑1 (MQ=255) tGGTTCTCGCAAATCCACTCCGTTTGCAGCTCAGGTTGCAGCAGAGCGTTGCGCTGACGCCGTGAAAGAATACAGCATCAAGAATCTGGAAGTTATGGTTa > 1:9000627/1‑101 (MQ=255) ggTTCTCGCAAATCCACTCCGTTTGCAGCTCAGGTTGCAGCAGAGCGTTGCGCTGACGCCGTGAAAGACTACGGCATCACGAATCTGGAAGTTATGGTTaa > 1:102648/1‑101 (MQ=255) ggTTCTCGCAAATCCACTCCGTTTGCAGCTCAGGTTGCAGCAGAGCGTTGCGCTGACGCCGTGAAAGAATACGGCATCAAGAATCTGGAAGTTATGGTTaa < 1:5670958/101‑1 (MQ=255) ggTTCTCGCAAATCCACTCCGTTTGCAGATCAGGTTGCAGCAGAGCGTTGCGCTGACGCCGTGAAAGAATACGGCATCAAGAATCTGGAAGTTATGGTTaa < 1:1556903/101‑1 (MQ=255) gTTCTCGCAAATCCACTCCGTTTGCAGCTCAGGTTGCAGCAGAGCGTTGCGCTGACGCCGTGAAAGAATACGGCATCAAGAATCTGGAAGTTATGGTTaaa > 1:6777025/1‑101 (MQ=255) ttCTCGCAAATCCACTCCGTTTGCAGCTCAGGTTGCAGCAGAGCGTTGCGCTGACGCCGTGAAAGAATACGGCATCAAGAATCTGGAAGTTATGGTTAAAg < 1:8671206/101‑1 (MQ=255) cGCAAATCCACTCCGTTTGCAGCTCAGGTTGCAGCAGAGCGTTGCGCTGACGCCGTGAAAGAATACGGCATCAAGAATCTGGAAGTTATGGTTAAAGGTcc > 1:1532919/1‑101 (MQ=255) 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cACTCCGTTTGCAGCTCAGGTTGCAGCAGAGCGTTGCGCTGACGCCGTGAAAGAATACGGCATCAAGAATCTGGAAGTTATGGTTAAAGGTCCGGGTCCAg < 1:5331818/101‑1 (MQ=255) aCTCCGTTTGCAGCTCAGGTTGCAGCAGAGCGTTGCGCTGACGCCGTGAAAGAATACGGCATCAAGAATCTGGAAGTTATGGTTAAAGGTCCGGGTCCAgg > 1:8750219/1‑101 (MQ=255) aCTCCGTTTGCAGATCAGGTTGCAGCAGAGCGTTGCGCTGACGCCGTGAAAGAATACGGCATCAAGAATCTGGAAGTTATGGTTAAAGGTCCGGGTCCAgg > 1:5861975/1‑101 (MQ=255) cTCCGTTTGCAGCTCAGGTTGCAGCAGAGCGTTGCGCTGACGCCGTGAAAGAATACGGCATCAAGCATCTGGAAGTTATGGTTAAAGGTCCGGGTCCAGGc < 1:7244607/101‑1 (MQ=255) cTCCGTTTGCAGCTCAGGTTGCAGCAGAGCGTTGCGCTGACGCCGTGAAAGAATACGGCATCAAGAATCTGGAAGTTATGGTTAAAGGTCCGGGTCCAGGc < 1:3245648/101‑1 (MQ=255) cTCCGTTTGCAGCTCAGGTTGCAGCAGAGCGTTGCGCTGACGCCGTGAAAGAATACGGCATCAAGAATCTGGAAGTTATGGTTAAAGGTCCGGGTCCAGGc < 1:1115851/101‑1 (MQ=255) ccGTTTGCAGCTCAGGTTGCAGCAGAGCGTTGCGCTGACGCCGTGAAAGAATACGGCATCAAGAATCTGGAAGTTATGGTTAAAGGTCCGGGTCCAGGCcg < 1:2167295/101‑1 (MQ=255) gTTTGCAGCTCAGGTTGCAGCAGAGCGTTGCGCTGACGCCGTGAAAGAATACGGCATCAAGAATCTGGAAGTTATGGTTAAAGGTCCGGGTCCAGGCcgcg > 1:6480600/1‑101 (MQ=255) tttGCAGCTCAGGTTGCAGCAGAGCGTTGCGCTGACGCCGTGAAAGAATACGGCATCAAGAATCTGGAAGTTATGGTTAAAGGTCCGGGTCCAGGCCGCGa > 1:4356580/1‑101 (MQ=255) ttGCAGCTCAGGTTGCAGCAGAGCGTTGCGCTGACGCCGTGAAAGAATATGGCATCAAGAATCTGGAAGTTATGGTTAAAGGTCCGGGTCCAGGCCGCGaa < 1:1006477/101‑1 (MQ=255) ttGCAGCTCAGGTTGCAGCAGAGCGTTGCGCTGACGCCGTGAAAGAATACGGCATCAAGAATCTGGAAGTTATGGTTAAAGGTCCGGGTCCAGGCCGCGaa < 1:6968319/101‑1 (MQ=255) gCAGCTCAGGTTGCAGCAGAGCGTTGCGCTGACGCCGTGAAAGAATACGGCATCAAGAATCTGGAAGTTATGGTTAAAGGTCCGGGTCCAGGCCGCGAATc < 1:183041/101‑1 (MQ=255) cAGCTCAGGTTGCAGCAGAGCGTTGCGCTGACGCCGTGAAAGAATACGGCATCAAGAATCTGGAAGTTATGGTTAAAGGTCCGGGTCCAGGCCGCGAATct < 1:2127208/101‑1 (MQ=255) cAGCTCAGGTTGCAGCAGAGCGTTGCGCTGACGCCGTGAAAGAATACGGCATCAAGAATCTGGAAGTTATGGTTAAAGGTCCGGGTCCAGGCCGCGAATct < 1:2587305/101‑1 (MQ=255) cAGCTCAGGTTGCAGCAGAGCGTTGCGCTGACGCCGTGAAAGAATACGGCATCAAGAATCTGGAAGTTATGGTTAAAGGTCCGGGTCCAGGCCGCGAATct < 1:5492270/101‑1 (MQ=255) cAGCTCAGGTTGCAGCAGAGCGTTGCGCTGACGCCGTGAAAGAATACGGCATCAAGAATCTGGAAGTTATGGTTAAAGGTCCGGGTCCAGGCCGCGAATct < 1:3435804/101‑1 (MQ=255) gCTCAGGTTGCAGCAGAGCGTTGCGCTGACGCCGTGAAAGAATACGGCATCAAGAATCTGGAAGTTATGGTTAAAGGTCCGGGTCCAGGCCGCGAATctac > 1:1685235/1‑101 (MQ=255) | ACCATCGTGACTATCACTGATCGTCAGGGTAACGCGTTGGGTTGGGCAACAGCCGGTGGTTCCGGTTTCCGTGGTTCTCGCAAATCCACTCCGTTTGCAGCTCAGGTTGCAGCAGAGCGTTGCGCTGACGCCGTGAAAGAATACGGCATCAAGAATCTGGAAGTTATGGTTAAAGGTCCGGGTCCAGGCCGCGAATCTACT > NC_007779/4198405‑4198605 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |