| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_007779 | 380484 = | NA (NA) | 232 (0.810) | 114/180 | NT | NA | intergenic (‑418/‑46) | yaiO/insC | hypothetical protein/IS2 insertion element repressor InsA |
| ? | NC_007779 | = 381407 | NA (NA) | coding (510/906 nt) | insD | IS2 insertion element transposase InsAB' | |||||
Only 100 of 253 total aligned reads displayed.
TGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_007779/380573‑380484‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTCACTGTTGAAGCCGCCGGTAGTGACCGCCCAGTGCAGTGCCTCACGATCACAGCAGTCCAGCGCGAACGTGACACGCAGTCTCTCTCCGTTATCACAG < NC_007779/381407‑381308 TGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTATTCACTGTTGA > 1:7056160/1‑101 TTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTATTCACTGTTGAAc > 1:37256/1‑100 TCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTATTCACTGTTGAAGC > 1:7886043/1‑101 CTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTATTCACTGTTGAAGCC > 1:12146388/1‑101 CCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTATTCACTGTTGAAGCCGC > 1:14177219/1‑101 CCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTCGAGATTCAGGGGGCCAGTCTATTCACTGTTGAAGCCGC < 1:1629397/101‑1 CAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTATTCACTGTTGAAGCCGCC < 1:14483032/101‑1 CAATGACTAGTCTAAAAACTAGAATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTATTCACTGTTGAAGCCGCa > 1:5661166/1‑100 TGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTATTCACTGTTGAAGCCGCCGGT < 1:590110/101‑1 ACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTATTCACTGTTGAAGCCGCCGGTAG < 1:9094952/101‑1 CTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTATTCACTGTTGAAGCCGCCGGTAGT < 1:1254049/101‑1 CTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTATTCACTGTTGAAGCCGCCGGTAGTGACCG > 1:6677617/1‑101 TAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTATTCACTGTTGAAGCCGCCGGTAGTGACCGC > 1:5592694/1‑101 AAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTATTCACTGTTGAAGCCGCCGGTAGTGACCGCC > 1:5423163/1‑101 AAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTATTCACTGTTGAAGCCGCCGGAAGTGACCGCC > 1:1139736/1‑101 AAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTATTCACTGTTGAAGCCGCCGGTAGTGACCGCCC > 1:6990768/1‑101 AAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTATTCACTGTTGAAGCCGCCGGTAGTGACCGCCC < 1:5132168/101‑1 AAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTATTCACTGTTGAAGCCGCCGGTAGTGACCGCCCA < 1:1514462/101‑1 AAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTATTCACTGTTGAAGCCGCCGGTAGTGACCGCCCA > 1:10230114/1‑101 ACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTATTCACTGTTGAAGCCGCCGGTAGTGACCGCCCAGT < 1:6345683/101‑1 ACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTATTCACTGTTGAAGCCGCCGGTAGTGACCGCCCAGT > 1:3907206/1‑101 CTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGTAGATTCAGGGGGCCAGTCTATTCACTGTTGAAGCCGCCGGTAGTGACCGCCCAGTG > 1:8709005/1‑101 TAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTATTCACTGTTGAAGCCGCCGGTAGTGACCGCCCAGGGC < 1:13757091/101‑1 AGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTATTCACTGTTGAAGCCGCCGGTAGTGACCGCCCAGTGCA > 1:11693103/1‑101 AGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTATTCACTGTTGAAGCCGCCGGTAGTGACCGCCCAGTGCA < 1:4417458/101‑1 GTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTATTCACTGTTGAAGCCGCCGGTAGTGACCGCCCAGTGCAG < 1:14225424/101‑1 TATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTATTCACTGTTGAAGCCGCCGGTAGTGACCGCCCAGTGCAGT > 1:13010277/1‑101 TATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTATTCACTGTTGAAGCCGCCGGTAGTGACCGCCCAGTGCAGT > 1:11895185/1‑101 TATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTATTCACTGTTGAAGCCGCCGGTAGTGACCGCCCAGTGCAGT > 1:9620491/1‑101 ATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTATTCACTGTTGAAGCCGCCGGTAGTGACCGCCCAGTGCAGTG < 1:1259886/101‑1 TTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTATTCACTGTTGAAGCCGCCGGTAGTGACCGCCCAGTGCAGTGC > 1:80765/1‑101 AAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTATTCACTGTTGAAGCCGCCGGTAGTGACCGCCCAGTGCAGTGCCT > 1:3888422/1‑101 AAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTATTCACTGTTGAAGCCGCCGGTAGTGACCGCCCAGTGCAGTGCCT < 1:11315690/101‑1 AGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTATTCACTGTTGAAGCCGCCGGTAGTGACCGCCCAGTGCAGTGCCTC > 1:2012984/1‑101 GACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTATTCACTGTTGAAGCCGCCGGTAGTGACCGCCCAGTGCAGTGCCTCA < 1:2369350/101‑1 GACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTATTCACTGTTGAAGCCGCCGGTAGTGACCGCCCAGTGCAGTGCCTCA > 1:2671473/1‑101 GACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTATTCACTGTTGAAGCCGCCGGTAGTGACCGCCCAGTGCAGTGCCTCA < 1:9841318/101‑1 GACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTATTCACTGTTGAAGCCGCCGGTAGTGACCGCCCAGTGCAGTGCCTCA > 1:13335496/1‑101 GACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTATTCACTGTTGAAGCCGCCGGTAGTGACCGCCCAGTGCAGTGCCTCA > 1:6031143/1‑101 GACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGAGTCAGGGGGCCAGTCTATTCACTGTTGAAGCCGCCGGTAGTGACCGCCCAGTGCAGTGCCTCA < 1:1765646/101‑1 ACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTATTCACTGTTGAAGCCGCCGGTAGTGACCGCCCAGTGCAGTGCCTCAC < 1:13345565/101‑1 ACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTATTCACTGTTGAAGCCGCCGGTAGTGACCGCCCAGTGCAGTGCCTCAC > 1:3385644/1‑101 CTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTATTCACTGTTGAAGCCGCCGGTAGTGACCGCCCAGTGCAGTGCCTCACG < 1:4494373/101‑1 TATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTATTCACTGTTGAAGCCGCCGGTAGTGACCGCCCAGTGCAGTGCCTCACGA > 1:4942790/1‑101 TATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTATTCACTGTTGAAGCCGCCGGTAGTGACCGCCCAGTGCAGTGCCTCACGA > 1:4825882/1‑101 ATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTATTCACTGTTGAAGCCGCCGGTAGTGACCGCCCAGTGCAGTGCCTCACGAT > 1:5275720/1‑101 TCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTATTCACTGTTGAAGCCGCCGGTAGTGACCGCCCAGTGCAGTGCCTCACGATC < 1:10141562/101‑1 TCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTATTCACTGTTGAAGCCGCCGGTAGTGACCGCCCAGTGCAGTGCCTCACGATC > 1:3322779/1‑101 CACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTATTCACTGTTGAAGCCGCCGGTAGTGACCGCCCAGTGCAGTGCCTCACGATCA < 1:5543149/101‑1 ACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTATTCACTGTTGAAGCCGCCGGTAGTGACCGCCCAGTGCAGTGCCTCACGATCAC > 1:12089447/1‑101 CTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTATTCACTGTTGAAGCCGCCGGTAGTGACCGCCCAGTGCAGTGCCTCACGATCACA > 1:7701070/1‑101 CTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTATTCACTGTTGAAGCCGCCGGTAGTGACCGCCCAGTGCAGTGCCTCACGATCACA > 1:6418893/1‑101 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ATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTATTCACTGTTGAAGCCGCCGGTAGTGACCGCCCAGTGCAGTGCCTCACGATCACAGCAGTCCAGCGCGA > 1:9133239/1‑101 TGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTATTCACTGTTGAAGCCGCCGGTAGTGACCGCCCAGTGCAGTGCCTCACGATCACAGCAGTCCAGCGCGAAC < 1:12842926/101‑1 TGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTATTCACTGTTGAAGCCGCCGGTAGTGACCGCCCAGTGCAGTGCCTCACGATCACAGCAGTCCAGCGCGAAC > 1:14061800/1‑101 TGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTATTCACTGTTGAAGCCGCCGGTAGTGACCGCCCAGTGCAGTGCCTCACGATCACAGCAGTCCAGCGCGAAC < 1:8204467/101‑1 TGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTATTCACTGTTGAAGCCGCCGGTAGTGACCGCCCAGTGCAGTGCCTCACGATCACAGCAGTCCAGCGCGAAC < 1:3149607/101‑1 GGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTATTCACTGTTGAAGCCGCCGGTAGTGACCGCCCAGTGCAGTGCCTCACGATCACAGCAGTCCAGCGCGAACG < 1:8261497/101‑1 GGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTATTCACTGTTGAAGCCGCCGGTAGTGACCGCCCAGTGCAGTGCCTCACGATCACAGCAGTCCAGCGCGAACG < 1:7505034/101‑1 GTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTATTCACTGTTGAAGCCGCCGGTAGTGACCGCCCAGTGCAGTGCCTCACGATCACAGCAGTCCAGCGCGAACGT > 1:11111909/1‑101 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TGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_007779/380573‑380484‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTCACTGTTGAAGCCGCCGGTAGTGACCGCCCAGTGCAGTGCCTCACGATCACAGCAGTCCAGCGCGAACGTGACACGCAGTCTCTCTCCGTTATCACAG < NC_007779/381407‑381308 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |