| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_007779 | 1909276 = | 143 (0.500) | 116 (0.410) | 85/178 | NT | 45.1% | coding (30/144 nt) | yobF | hypothetical protein |
| ? | NC_007779 | 2411459 = | NA (NA) | intergenic (‑148/+14) | lrhA/insB | DNA‑binding transcriptional repressor/IS1 element protein | |||||
Only 100 of 162 total aligned reads displayed.
AAAAATGGCTTGCCATAATTAACGTTGTATGTGATAACAGATTTCGGGTTAAACGAGGTACAGTTCTGTTTATGTGTGGCATTTTCAGTAAAGAAGTCCTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_007779/1909376‑1909276‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTC > NC_007779/2411459‑2411558 AAAAATGGCTTGCCATAATTAACGTTGTATGTGATAACAGATTTCGGGTTAAACGAGGTACAGTTCTGTTTATGTGTGGCATTTTCAGTAAAGAAGTCCTG < 1:3594225/101‑1AAAAATGGCTTGCCATAATTAACGTTGTATGTGATAACAGATTTCGGGTTAAACGAGGTACAGTTCTGTTTATGTGTGGCATTTTCAGTAAAGAAGTCCTG > 1:4892204/1‑101 AAATGGCTTGCCATAATTAACGTTGTATGTGATAACAGATTTCGGGTTAAACGAGGTACAGTTCTGTTTATGTGTGGCATTTTCAGTAAAGAAGTCCTGGT < 1:926342/101‑1 AATGGCTTGCCATAATTAACGTTGTATGTGATAACAGATTTCGGGTTAAACGAGGTACAGTTCTGTTTATGTGTGGCATTTTCAGTAAAGAAGTCCTGGTA < 1:8291207/101‑1 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CAGATTTCGGGTTAAACGAGGTACAGTTCTGTTTATGTGTGGCATTTTCAGTAAAGAAGTCCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCA > 1:688231/1‑101 CAGATTTCGGGTTAAACGAGGTACAGTTCTGTTTATGTGTGGCATTTTCAGTAAAGAAGTCCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCA < 1:7228300/101‑1 ATTTCGGGTTAAACGAGGTACAGTTCTGTTTATGTGTGGCATTTTCAGTAAAGAAGTCCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGAT < 1:9758739/101‑1 ATTTCGGGTTAAACGAGGTACAGTTCTGTTTATGTGTGGCATTTTCAGTAAAGAAGTCCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGAT < 1:7474846/101‑1 ATTTCGGGTTAAACGAGGTACAGTTCTGTTTATGTGTGGCATTTTCAGTAAAGAAGTCCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGAT < 1:1310923/101‑1 TTTCGGGTTAAACGAGGTACAGTTCTGTTTATGTGTGGCATTTTCAGTAAAGAAGTCCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATA < 1:7765558/101‑1 CGGGTTAAACGAGGTACAGTTCTGTTTATGTGTGGCATTTTCAGTAAAGAAGTCCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATG < 1:3609169/101‑1 CGGGTTAAACGAGGTACAGTTCTGTTTATGTGTGGCATTTTCAGTAAAGAAGTCCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATG < 1:6834602/101‑1 CGGGTTAAACGAGGTACAGTTCTGTTTATGTGTGGCATTTTCAGTAAAGAAGTCCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATG > 1:13469111/1‑101 GGTTAAACGAGGTACAGTTCTGTTTATGTGTGGCATTTTCAGTAAAGAAGTCCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCC > 1:10031226/1‑101 TTAAACGAGGTACAGTTCTGTTTATGTGTGGCATTTTCAGTAAAGAAGTCCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCG < 1:3053921/101‑1 TTAAACGAGGTACAGTTCTGTTTATGTGTGGCATTTTCAGTAAAGAAGTCCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCG < 1:13927544/101‑1 AAACGAGGTACAGTTCTGTTTATGTGTGGCATTTTCAGTAAAGAAGTCCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGAT < 1:6887078/101‑1 AAACGAGGTACAGTTCTGTTTATGTGTGGCATTTTCAGTAAAGAAGTCCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGAT < 1:13923697/101‑1 ACGAGGTACAGTTCTGTTTATGTGTGGCATTTTCAGTAAAGAAGTCCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGA > 1:2444811/1‑101 ACGAGGTACAGTTCTGTTTATGTGTGGCATTTTCAGTAAAGAAGTCCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGA < 1:7163280/101‑1 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AAAAATGGCTTGCCATAATTAACGTTGTATGTGATAACAGATTTCGGGTTAAACGAGGTACAGTTCTGTTTATGTGTGGCATTTTCAGTAAAGAAGTCCTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_007779/1909376‑1909276‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTC > NC_007779/2411459‑2411558 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |