| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_007779 | 3746911 = | NA (NA) | 282 (0.990) | 130/180 | NT | 99.6% | intergenic (‑509/‑68) | mdtL/insH | multidrug efflux system protein/IS5 element protein |
| ? | NC_007779 | = 3748646 | 1 (0.000) | intergenic (+687/+425) | insH/tnaA | IS5 element protein/tryptophanase/L‑cysteine desulfhydrase, PLP‑dependent | |||||
Only 100 of 311 total aligned reads displayed.
TGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_007779/3747006‑3746911‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTAGTGAAACGATATCAATGAATTTGGGTTATCACGCTAATCCACGTATTGTCGGGATCTGCACAGCCATTTTCGTTGCCAGCGTATTGTGGTTAAGTTC < NC_007779/3748646‑3748547 TGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGT < 1:10102110/101‑1TGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGT < 1:5941507/101‑1TGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGT < 1:7823624/101‑1 GTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTG > 1:9105565/1‑101 GTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTG > 1:7948969/1‑101 TCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTGA < 1:4634024/101‑1 TCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTGA > 1:605172/1‑101 CGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTGAA < 1:13859729/101‑1 CGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTGAA > 1:12117760/1‑101 GGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACGCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTGAtt < 1:11399060/101‑3 GCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTGAAAC < 1:10438589/101‑1 GAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTGAAACGA > 1:6493437/1‑101 GAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTGAAACGA > 1:714517/1‑101 GAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTGAAACGA > 1:10251943/1‑101 GAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTGAAACGA > 1:925980/1‑101 AGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCCCCTTCCTTAGTGAACCGATA > 1:8515753/1‑101 AGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTGAAACGATA > 1:953936/1‑101 TAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTGTGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTGAAACGATATCA > 1:5096912/1‑101 TAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTGAAACGATATCA < 1:24578/101‑1 TAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTGAAACGATATCA > 1:4975605/1‑101 AGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTGAAACGATATCAAT < 1:13630062/101‑1 TGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCGGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTGAAACGATATCAATGAA < 1:8979465/101‑1 TGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTGAAACGATATCAATGAA < 1:2303930/101‑1 ATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTGAAACGATATCAATGAATT < 1:8899541/101‑1 TGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTGAAACGATATCAATGAATTT < 1:7242937/101‑1 GACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTGAAACGATATCAATGAATTTG < 1:5564935/101‑1 GACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTGAAACGATATCAATGAATTTG < 1:3647121/101‑1 GACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCACATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTGAAACGATATCAATGAATTTG > 1:3553165/1‑101 GACTCATGACGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTGAAACGATATCAATGAATTTG < 1:13165247/101‑1 ACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTGAAACGATATCAATGAATTTGG > 1:4603993/1‑101 CTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTGAAACGATATCAATGAATTTGGG > 1:10333782/1‑101 CATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTGAAACGATATCAATGAATTTGGGTT < 1:2847860/101‑1 CATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTGAAACGATATCAATGAATTTGGGTT < 1:8697497/101‑1 ATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTGAAACGATATCAATGAATTTGGGTTA > 1:10228222/1‑101 ATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTGAAACGATATCAATGAATTTGGGTTA < 1:8209967/101‑1 TGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTGAAACGATATCAATGAATTTGGGTTAT > 1:3706241/1‑101 TGATGAACCCTGTTCGATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTGAAACGATATCAATGAATTTGGGTTAT < 1:9827012/101‑1 GATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTGAAACGATATCAATGAATTTGGGTTATC < 1:2377264/101‑1 ATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTGAAACGATATCAATGAATTTGGGTTATCA > 1:6732231/1‑101 ATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTGAAACGATATCAATGAATTCGGGTTATCA > 1:9124550/1‑101 TGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTGAAACGATATCAATGAATTTGGGTTATCAC > 1:5617912/1‑101 GAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTGAAACGATATCAATGAATTTGGGTTATCACG > 1:12561328/1‑101 ACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTGAAACGATATCAATGAATTTGGGTTATCACGCT < 1:2138502/101‑1 CCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTGAAACGATATCAATGAATTTGGGTTATCACGCTA > 1:10816603/1‑101 CTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTGAAACGATATCAATGAATTTGGGTTATCACGCTAAT > 1:11962278/1‑101 CTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTGAAACGATATCAATGAATTTGGGTTATCACGCTAAT < 1:11733676/101‑1 CTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTGAAACGATATCAATGAATTTGGGTTATCACGCTAAT > 1:9482501/1‑101 TGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTGAAACGATATCAATGAATTTGGGTTATCACGCTAATC < 1:11252985/101‑1 GTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTGAAACGATATCAATGAATTTGGGTTATCACGCTAATCC < 1:3269593/101‑1 GTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTGAAACGATATCAATGAATTTGGGTTATCACGCTAATCC > 1:3434944/1‑101 TTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTGAAACGATATCAATGAATTTGGGTTATCACGCTAATCCA > 1:7040642/1‑101 TTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTGAAACGATATCAATGAATTTGGGTTATCACGCTAATCCA < 1:5727794/101‑1 CTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTGAAACGATATCAATGAATTTGGGTTATCACGCTAATCCACG < 1:11499570/101‑1 TATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTGAAACGATATCAATGAATTTGGGTTATCACGCTAATCCACGT > 1:4026215/1‑101 ATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTGAAACGATATCAATGAATTTGGGTTATCACGCTAATCCACGTA < 1:5443126/101‑1 ATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTGAAACGATATCAATGAATTTGGGTTATCACGCTAATCCACGTA > 1:8162078/1‑101 TGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTGAAACGATATCAATGAATTTGGGTTATCACGCTAATCCACGTAT > 1:4451026/1‑101 TGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTGAAACGATATCAATGAATTTGGGTTATCACGCTAATCCACGTAT > 1:6662088/1‑101 GCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTGAAACGATATCAATGAATTTGGGTTATCACGCTAATCCACGTATTG > 1:14510677/1‑101 GCTCCAGATAACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTGAAACGATATCAATGAATTTGGGTTATCACGCTAATCCACGTATTG < 1:10605018/101‑1 CTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTGAAACGATATCAATGAATTTGGGTTATCACGCTAATCCACGTATTGT > 1:9629493/1‑101 TCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTGAAACGATATCAATGAATTTGGGTTATCACGCTAATCCACGTATTGTC > 1:2547407/1‑101 ATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTCCCTTAGTGAAACGATATCAATGAATTTGGGTTATCACGCTAATCCACGTATTGTCGGGAT > 1:10276546/1‑101 TGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTGAAACGATATCAATGAATTTGGGTTATCACGCTAATCCACGTATTGTCGGGATC < 1:12019255/101‑1 GACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTGAAACGATATCAATGAATTTGGGTTATCACGCTAATCCACGTATTGTCGGGATCT > 1:12995203/1‑101 ACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTGAAACGATATCAATGAATTTGGGTTATCACGCTAATCCACGTATTGTCGGGATCTG > 1:2991675/1‑101 AAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTGAAACGATATCAATGAATTTGGGTTATCACGCTAATCCACGTATTGTCGGGATCTGCA > 1:6291888/1‑101 AAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTGAAACGATAACAATGAATTTGGGTTATCACGCTAATCCACGTATTGTCGGGATCTGCA > 1:7296831/1‑101 AACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTGAAACGATATCAATGAATTTGGGTTATCACGCTAATCCACGTATTGTCGGGATCTGCAC > 1:2712098/1‑101 ACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTGAAACGATATCAATGAATTTGGGTTATCACGCTAATCCACGTATTGTCGGGATCTGCACA < 1:11327113/101‑1 ACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTGAAACGATATCAATGAATTTGGGTTATCACGCTAATCCACGTATTGTCGGGATCTGCACA < 1:967193/101‑1 ATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTGAAACGATATCAATGAATTTGGGTTATCACGCTAATCCACGTATTGTCGGGATCTGCACAGC > 1:3993796/1‑101 TGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTGAAACGATATCAATGAATTTGGGTTATCACGCTAATCCACGTATTGTCGGGATCTGCACAGCC > 1:1276348/1‑101 GATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTGAAACGATATCAATGAATTTGGGTTATCACGCTAATCCACGTATTGTCGGGATCTGCACAGCCA > 1:7661937/1‑101 ATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTGAAACGATATCAATGAATTTGGGTTATCACGCTAATCCACGTATTGTCGGGATCTGCACAGCCAT > 1:11568002/1‑101 TCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTGAAACGATATCAATGAATTTGGGTTATCACGCTAATCCACGTATTGTCGGGATCTGCACAGCCATT > 1:12247200/1‑101 CATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTGAAACGATATCAATGAATTTGGGTTATCACGCTAATCCACGTATTGTCGGGATCTGCACAGCCATTTTC < 1:4146137/101‑1 CATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTGAAACGATATCAATGAATTTGGGTTATCACGCTAATCCACGTATTGTCGGGATCTGCACAGCCATTTTC < 1:4191535/101‑1 ATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTGAAACGATATCAATGAATTTGGGTTATCACGCTAATCCACGTATTGTCGGGATCTGCACAGCCATTTTCG > 1:13544540/1‑101 TATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTGAAACGATATCAATGAATTTGGGTTATCACGCTAATCCACGTATTGTCGGGATCTGCACAGCCATTTTCGT > 1:480060/1‑101 ATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTGAAACGATATCAATGAATTTGGGTTATCACGCTAATCCACGTATTGTCGGGATCTGCACAGCCATTTTCGTT < 1:8410616/101‑1 AGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTGAAACGATATCAATGAATTTGGGTTATCACGCTAATCCACGTATTGTCGGGATCTGCACAGCCATTTTCGTTGCC > 1:8605241/1‑101 GACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTGAAACGATATCAATGAATTTGGGTTATCACGCTAATCCACGTATTGTCGGGATCTGCACAGCCATTTTCGTTGCCAGC > 1:12821665/1‑101 GACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTGAAACGATATCAATGAATTTGGGTTATCACGCTAATCCACGTATTGTCGGGATCTGCACAGCCATTTTCGTTGCCAGC < 1:3126103/101‑1 TGTTCGCACCTTCCTTAGTGAAACGATATCAATGAATTTGGGTTATCACGCTAATCCACGTATTGTCGGGATCTGCACAGCCATTTTCGTTGCCAGCGTAT > 1:14365833/1‑101 TGTTCGCACCTTCCTTAGTGAAACGATATCAATGAATTTGGGTTATCACGCTAATCCACGTATTGTCGGGATCTGCACAGCCATTTTCGTTGCCAGCGTAT > 1:8783410/1‑101 GTTCGCACCTTCCTTAGTGAAACGATATCAATGAATTTGGGTTATCACGCTAATCCACGTATTGTCGGGATCTGCAGAGCCATTTTCGTTGCCAGCGTATT > 1:9230600/1‑101 GTTCGCACCTTCCTTAGTGAAACGATATCAATGAATTTGGGTTATCACGCTAATCCACGTATTGTCGGGATCTGCACAGCCATTTTCGTTGCCAGCGTATT > 1:1877442/1‑101 TTCGCACCTTCCTTAGTGAAACGATATCAATGAATTTGGGTTATCACGCTAATCCACGTATTGTCGGGATCTGCACAGCCATTTTCGTTGCCAGCGTATTG > 1:11057533/1‑101 TTCGCACCTTCCTTAGTGAAACGATATCAATGAATTTGGGTTATCACGCTAATCCACGTATTGTCGGGATCTGCACAGCCATTTTCGTTGCCAGCGTATTG < 1:13689640/101‑1 TCGCACCTTCCTTAGTGAAACGATATCAATGAATTTGGGTTATCACGCTAATCCACGTATTGTCGGGATCTGCACAGCCATTTTCGTTGCCAGCGTATTGT < 1:13378326/101‑1 tGCACCTTCCTTAGTGAAACGATATCAATGAATTTGGGTTATCACGCTAATCCACGTATTGTCGGGATCTGCACAGCCATTTTCGTTGCCAGCGTATTGTG < 1:1608035/100‑1 GCACCTTCCTTAGTGAAACGATATCAATGAATTTGGGTTATCACGCTAATCCACGTATTGTCGGGATCTGCACAGCCATTTTCGTTGCCAGCGTATTGTGG < 1:7480791/101‑1 CACCTTCCTTAGTGAAACGATATCAATGAATTTGGGTTATCACGCTAATCCACGTATTGTCGGGATCTGCACAGCCATTTTCGTTGCCAGCGTATTGTGGT > 1:8344811/1‑101 TCCTTAGTGAAACGATATCAATGAATTTGGGTTATCACGCTAATCCACGTATTGTCGGGATCTGCACAGCCATTTTCGTTGCCAGCGTATTGTGGTTAAGT < 1:14193771/101‑1 TCCTTAGTGAAACGATATCAATGAATTTGGGTTATCACGCTAATCCACGTATTGTCGGGATCTGCACAGCCATTTTCGTTGCCAGCGTATTGTGGTTAAGT > 1:5296914/1‑101 TCCTTAGTGAAACGATATCAATGAATTTGGGTTATCACGCTAATCCACGTATTGTCGGGATCTGCACAGCCATTTTCGTTGCCAGCGTATTGTGGTTAAGT > 1:12694504/1‑101 CCTTAGTGAAACGATATCAATGAATTTGGGTTATCACGCTAATCCACGTATTGTCGGGATCTGCACAGCCATTTTCGTTGCCAGCGTATTGTGGTTAAGTT < 1:5204024/101‑1 CCTTAGTGAAACGATATCAATGAATTTGGGTTATCACGCTAATCCACGTATTGTCGGGATCTGCACAGCCATTTTCGTTGCCAGCGTATTGTGGTTAAGTT > 1:176706/1‑101 CCTTAGTGAAACGATATCAATGAATTTGGGTTATCACGCTAATCCACGTATTGTCGGGATCTGCACAGCCATTTTCGTTGCCAGCGTATTGTGGTTAAGTT < 1:12405089/101‑1 TGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_007779/3747006‑3746911‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTAGTGAAACGATATCAATGAATTTGGGTTATCACGCTAATCCACGTATTGTCGGGATCTGCACAGCCATTTTCGTTGCCAGCGTATTGTGGTTAAGTTC < NC_007779/3748646‑3748547 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |