| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_007779 | = 3903279 | 3 (0.010) | 269 (0.950) | 127/178 | NT | 98.9% | coding (42/825 nt) | bax | hypothetical protein |
| ? | NC_007779 | = 4504190 | NA (NA) | intergenic (+10/‑89) | insD/yjgW | IS2 insertion element transposase InsAB'/hypothetical protein | |||||
Only 100 of 602 total aligned reads displayed.
CTCTCAAATTTGTGAAAAATATAAGGTGTTGGAATGATTAAATCCGACCAGGAGACCTGATGATTTTGACTCCCATACGACGATATGGGGCGATGATTCTTATGTTACTCACTCTGGTGTTTTCGAGTGAGGTGTTAGCGAAGACGCACACAACAACAGCGAGTCAAAAGTCCCACTTAACTAAAGCTAGTAATAAACAGG > NC_007779/3903179‑3903379 | ctcAAATTTGTGAAAAATATAAGGTGTTGGAATGAATAAATCCGACCAGGAGACCTGATGATTTTGACTCCCATACGACGATATGGGGCGATGATTCTTgg < 1:12305513‑M1/101‑3 (MQ=255) tcAAATTTGTGAAAAATATAAGGTGTTGGAATGATTAAATCCGACCAGGAGACCTGATGATTTTGACTCCCATACGACGATATGGGGCGATGATTCTTgga > 1:9225282‑M1/1‑98 (MQ=255) aTTTGTGAAAAATATAAGGTGTTGGAATGATTAAATCCGACCAGGAGACCTGATGATTTTGACTCCCATACGACGATATGGGGCGATGATTCTTggatttg < 1:1567330‑M1/101‑8 (MQ=255) gtgAAAAATATAAGGTGTTGGAATGATTAAATCCGACCAGGAGACCTGATGATTTTGACTCCCATACGACGATATGGGGCGATGATTCTTggatttgcccc < 1:9340260‑M1/101‑12 (MQ=255) ccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaATTCTTATGTTactcac < 1:4361706‑M2/17‑1 (MQ=255) gAAAAATATAAGGTGTTGGAATGATTAAATCCGACCAGGAGACCTGATGATTTTGACTCCCATACGACGATATGGGGCGATGATTCTTggatttgccccta < 1:10623016‑M1/101‑14 (MQ=255) aatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaATTCTTATGTTactcactc > 1:3874857‑M2/83‑101 (MQ=255) ataAGGTGTTGGAATGATTAAATCCGACCAGGAGACCTGATGATTTTGACTCCCATACGACGATATGGGGCGATGATTCTTggatttgcccctatatttcc > 1:3726844‑M1/1‑81 (MQ=255) taAGGTGTTGGAATGATTAAATCCGACCAGGAGACCTGATGATTTTGACTCCCATACGACGATATGGGGCGATGATTCTTggatttgcccctatatttcca > 1:6098378‑M1/1‑80 (MQ=255) taAGGTGTTGGAATGATTAAATCCGACCAGGAGACCTGATGATTTTGACTCCCATACGACGATATGGGGCGATGATTCTTggatttgcccctatatttcca > 1:2426562‑M1/1‑80 (MQ=255) tctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaATTCTTATGTTACTCACTCTGGTGtttt > 1:11958862‑M2/74‑101 (MQ=255) aaGGTGTTGGAATGATTAAATCCGACCAGGAGACCTGATGATTTTGACTCCCATACGACGATATGGGGCGATGATTCTTggatttgcccctatatttccag < 1:10529241‑M1/101‑23 (MQ=255) aGGTGTTGGAATGATTAAATCCGACCAGGAGACCTGATGATTTTGACTCCCATACGACGATATGGGGCGATGATTCTTggatttgcccctatatttccaga > 1:11521908‑M1/1‑78 (MQ=255) taaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggcaagcctaATTCTTATGTTACTCACTCTGGTGTTTTCg > 1:2448074‑M2/72‑101 (MQ=255) aaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaATTCTTATGTTACTCACTCTGGTGTTTTCGa < 1:13970022‑M2/31‑1 (MQ=255) tgtTGGAATGATTAAATCCGACCAGGAGACCTGATGATTTTGACTCCCATACGATGATATGGGGCGATGTTTCTTggatttgcccctatatttccagacat > 1:12962224‑M1/1‑75 (MQ=255) aaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaATTCTTATGTTACTCACTCTGGTGTTTTCGAGt > 1:6867491‑M2/69‑101 (MQ=255) ttGGAATGATTAAATCCGACCAGGAGACCTGATGATTTTGACTCCCATACGACGATATGGGGCGATGATTCTTggatttgcccctatatttccagacatct > 1:13424373‑M1/1‑73 (MQ=255) ttGGAATGATTAAATCCGACCAGGAGACCTGATGATTTTGACTCCCATACGACGATATGGGGCGATGATTCTTggatttgcccctatatttccagacatct < 1:6157572‑M1/101‑29 (MQ=255) ttGGAATGATTAAATCCGACCAGGAGACCTGATGATTTTGACTCCCATACGACGATATGGGGCGATGATTCTTggatttgcccctatatttccagacatct > 1:1699602‑M1/1‑73 (MQ=255) tagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaATTCTTATGTTACTCACTCTGGTGTTTTCGAGTGAgg < 1:7821757‑M2/37‑1 (MQ=255) gtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaATTCTTATGTTACTCACTCTGGTGTTTTCGAGTGAGgtg < 1:6701496‑M2/39‑1 (MQ=255) tattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaATTCTTATGTTACTCACTCTGGTGTTTTCGAGTGAGgtgt > 1:5220770‑M2/62‑101 (MQ=255) tattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaATTCTTATGTTACTCACTCTGGTGTTTTCGAGTGAGgtgt > 1:11329490‑M2/62‑101 (MQ=255) tGATTAAATCCGACCAGGAGACCTGATGATTTTGACTCCCATACGACGATATGGGGCGATGATTCTTggatttgcccctatatttccagacatctgttatc > 1:4944355‑M1/1‑67 (MQ=255) attaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaATTCTTATGTTACTCACTCTGGTGTTTTCGAGTGAGGTGtt > 1:14230900‑M2/61‑101 (MQ=255) attaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaATTCTTATGTTACTCACTCTGGTGTTTTCGAGTGAGGTGtt < 1:14115343‑M2/41‑1 (MQ=255) attaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaATTCTTATGTTACTCACTCTGGTGTTTTCGAGTGAGGTGtt > 1:10937322‑M2/61‑101 (MQ=255) ttaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaATTCTTATGTTACTCACTCTGGTGTTTTCGAGTGAGGTgttt > 1:2634836‑M2/60‑100 (MQ=255) ttaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaATTCTTATGTTACTCACTCTGGTGTTTTCGAGTGAGGTGTTa < 1:10138520‑M2/42‑1 (MQ=255) ttAAATCCGACCAGGAGACCTGATGATTTTGACTCCCATACGACGATATGGGGCGATGATTCTTggatttgcccctatatttccagacatctgttatcact > 1:9120793‑M1/1‑64 (MQ=255) taagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaATTCTTATGTTACTCACTCTGGTGTTTTCGAGTGAGGTGTTAg < 1:11884013‑M2/43‑1 (MQ=255) aagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaATTCTTATGTTACTCACTCTGGTGTTTTCGAGTGAGGTGTTAGc < 1:8096128‑M2/44‑1 (MQ=255) gactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaATTCTTATGTTACTCACTCTGGTGTTTTCGAGTGAGGTGTTAGCGa > 1:11423661‑M2/56‑101 (MQ=255) actatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaATTCTTATGTTACTCACTCTGGTGTTTTCGAGTGAGGTGTTAGCGaa < 1:13460914‑M2/47‑1 (MQ=255) actatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaATTCTTATGTTACTCACTCTGGTGTTTTCGAGTGAGGTGTTAGCGaa > 1:13060373‑M2/55‑101 (MQ=255) aTCCGACCAGGAGACCTGATGATTTTGACTCCCATACGACGATATGGGGCGATGATTCTTggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaac > 1:14328593‑M1/1‑60 (MQ=255) aTCCGACCAGGAGACCTGATGATTTTGACTCCCATACGACGATATGGGGCGATGATTCTTggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaac < 1:3249018‑M1/101‑42 (MQ=255) ccGACCAGGAGACCTGATGATTTTGACTCCCATACGACGATATGGGGCGATGATTCTTggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaaccc > 1:7347951‑M1/1‑58 (MQ=255) cGACCAGGAGACCTGATGATTTTGACTCNCATNCGACGATATGGGGCGATGATTCTTggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccn < 1:7003192‑M1/101‑45 (MQ=255) tcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaATTCTTATGTTACTCACTCTGGTGTTTTCGAGTGAGGTGTTAGCGAAGACg < 1:3473508‑M2/51‑1 (MQ=255) gACCAGGAGACCTGATGATTTTGACTCCCATACGACGATATGGGGCGATGATTCTTggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccat > 1:390889‑M1/1‑56 (MQ=255) acttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaATTCTTATGTTACTCACTCTGGTGTTTTCGAGTGAGGTGTTAGCGAAGACGca > 1:11224718‑M2/49‑101 (MQ=255) cAGGAGACCTGATGATTTTGACTCCCATACGACGATATGGGGCGATGATTCTTggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattac < 1:8775367‑M1/101‑49 (MQ=255) cAGGAGACCTGATGATTTTGACTCCCATACGACGATATGGGGCGATGATTCTTggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattac < 1:13264421‑M1/101‑49 (MQ=255) ttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaATTCTTATGTTACTCACTCTGGTGTCTTCGAGTGAGGTGTTAGCGAAGACGcaca > 1:5881542‑M2/47‑101 (MQ=255) aGGAGACCTGATGATTTTGACTCCCATACGACGATATGGGGCGATGATTCTTggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattaca < 1:2224456‑M1/101‑50 (MQ=255) aGGAGACCTGATGATTTTGACTCCCATACGACGATATGGGGCGATGATTCTTggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattaca < 1:5558822‑M1/101‑50 (MQ=255) tatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaATTCTTATGTTACTCACTCTGGTGTTTTCGAGTGAGGTGTTAGCGAAGACGcacac > 1:860390‑M2/46‑101 (MQ=255) tatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaATTCTTATGTTACTCACTCTGGTGTTTTCGAGTGAGGTGTTAGCGAAGACGcacac > 1:1883720‑M2/46‑101 (MQ=255) tatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaATTCTTATGTTACTCACTCTGGTGTTTTCGAGTGAGGTGTTAGCGAAGACGcacac > 1:13770203‑M2/46‑101 (MQ=255) ggAGACCTGATGATTTTGACTCCCATACGACGATATGGGGCGATGATTCTTggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaa < 1:1785722‑M1/101‑51 (MQ=255) gagaCCTGATGATTTTGACTCCCATACGACGATATGGGGCGATGATTCTTggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaag < 1:5390610‑M1/101‑52 (MQ=255) gagaCCTGATGATTTTGACTCCCATACGACGATATGGGGCGATGATTCTTggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaag < 1:3153269‑M1/101‑52 (MQ=255) gaCCTGATGATTTTGACTCCCATACGACGATATGGGGCGATGATTCTTggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcc < 1:12200062‑M1/101‑54 (MQ=255) aCCTGATGATTTTGACTCCCATACGACGATATGGGGCGATGATTCTTggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagccc > 1:5110159‑M1/1‑47 (MQ=255) cTGATGATTTTGACTCCCATACGACGATATGGGGCGATGATTCTTggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgc < 1:4039411‑M1/101‑57 (MQ=255) cTGATGATTTTGACTCCCATACGACGATATGGGGCGATGATTCTTggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgc > 1:10433041‑M1/1‑45 (MQ=255) agtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaATTCTTATGTTACTCACTCTGGTGTTTTCGAGTGAGGTGTTAGCGAAGACGCACacaacaac > 1:312871‑M2/40‑101 (MQ=255) gatattggttgtctggagattcagggggccagtctaATTCTTATGTTACTCACTCTGGTGTTTTCGAGTGAGGTGTTAGCGAAGACGCACACAACAACAGc < 1:4794799‑M2/65‑1 (MQ=255) atgatTTTGACTCCCATACGACGATATGGGGCGATGATTCTTggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgc < 1:6318601‑M1/101‑60 (MQ=255) tgatTTTGACTCCCATACGACGATATGGGGCGATGATTCTTggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgcc > 1:963942‑M1/1‑41 (MQ=255) attggttgtctggagattcagggggccagtctaATTCTTATGTTACTCACTCTGGTGTTTTCGAGTGAGGTGTTAGCGAAGACGCACACAACAACAGCGAg < 1:12584740‑M2/68‑1 (MQ=255) atTTTGACTCCCATACGACGATATGGGGCGATGATTCTTggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgc > 1:233331‑M1/1‑39 (MQ=255) ttttGACTCCCATACGACGATATGGGGCGATGATTCTTggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgca > 1:10742001‑M1/1‑38 (MQ=255) ttggttgtctggagattcagggggccagtctaATTCTTATGTTACTCACTCTGGTGTTTTCGAGTGAGGTGTTAGCGAAGACGCACACAACAACAGCGAGt > 1:8010287‑M2/33‑101 (MQ=255) ttggttgtctggagattcagggggccagtctaATTCTTATGTTACTCACTCTGGTGTTTTCGAGTGAGGTGTTAGCGAAGACGCACACAACAACAGCGAGt > 1:11701078‑M2/33‑101 (MQ=255) ttGACTCCCATACGACGATATGGGGCGATGATTCTTggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcaga > 1:6947060‑M1/1‑36 (MQ=255) ggttgtctggagattcagggggccagtctaATTCTTATGTTACTCACTCTGGTGTTTTCGAGTGAGGTGTTAGCGAAGACGCACACAACAACAGCGAGTCa > 1:13899524‑M2/31‑101 (MQ=255) ggttgtctggagattcagggggccagtctaATTCTTATGTTACTCACTCTGGTGTTTTCGAGTGAGGTGTTAGCGAAGACGCACACAACAACAGCGAGTCa < 1:13603768‑M2/71‑1 (MQ=255) gACTCCCATACGACGATATGGGGCGATGATTCTTggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagata < 1:2990885‑M1/101‑68 (MQ=255) tgtctggagattcagggggccagtctaATTCTTATGTTACTCACTCTGGTGTTTTCGAGTGAGGTGTTAGCGAAGACGCACACAACAACAGCGAGTCaaaa > 1:7699206‑M2/28‑101 (MQ=255) tgtctggagattcagggggccagtctaATTATTATGTTACTCACTCTGGTGTTTTCGAGTGAGGTGTTAGCGAAGACGCACACAACAACAGCGAGTCaaaa > 1:9760470‑M2/28‑101 (MQ=255) gtctggagattcagggggccagtctaATTCTTATGTTACTCACTCTGGTGTTTTCGAGTGAGGTGTTAGCGAAGACGCACACAACAACAGCGAGTCAAAAg < 1:9463546‑M2/75‑1 (MQ=255) ggagattcagggggccagtctaATTCTTATGTTACTCACTCTGGTGTTTTCGAGTGAGGTGTTAGCGAAGACGCACACAACAACAGCGAGTCAAAAGTccc > 1:5997952‑M2/23‑101 (MQ=255) cATACGACGATATGGGGCGATGATTCTTggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccg < 1:502700‑M1/101‑74 (MQ=255) 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cagggggccagtctaATTCTTATGTTACTCACTCTGGTGTTTTCGAGTGAGGTGTTAGCGAAGACGCACACAACAACAGCGAGTCAAAAGTCCCACTTAAc < 1:12906642‑M2/86‑1 (MQ=255) cagggggccagtctaATTCTTATGTTACTCACTCTGGTGTTTTCGAGTGAGGTGTTAGCGAAGACGCACACAACAACAGCGAGTCAAAAGTCCCACTTAAc > 1:6572898‑M2/16‑101 (MQ=255) gaTATGGGGCGATGATTCTTggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaaccccgctgccgcagatattcccgtggcgagc > 1:1990308‑M1/1‑20 (MQ=255) gaTATGGGGCGATGATTCTTggatttgcccatatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagc < 1:2781698‑M1/101‑82 (MQ=255) atatGGGGCGATGATTCTTggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcg < 1:13316259‑M1/101‑83 (MQ=255) tatGGGGCGATGATTCTTggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcga < 1:4125871‑M1/101‑84 (MQ=255) ggggCGATGATTCTTggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataa < 1:5733436‑M1/101‑87 (MQ=255) cagtctaATTCTTATGTTACTCACTCTGGTGTTTTCGAGTGAGGTGTTAGCGAAGACGCACACAACAACAGCGAGTCAAAAGTCCCACTTAACTAAAGCTa > 1:10853695‑M2/8‑101 (MQ=255) agtctaATTCTTATGTTACTCACTCTGGTGTTTTCGAGTGAGGTGTTAGCGAAGACGCACACAACAACAGCGAGTCAAAAGTCCCACTTAACTAAAGCTAg < 1:11619995‑M2/95‑1 (MQ=255) gtctaATTCTTATGTTACTCACTCTGGTGTTTTCGAGTGAGGTGTTAGCGAAGACGCACACAACAACAGCGAGTCAAAAGTCCCACTTAACTAAAGCTAGt > 1:11042270‑M2/6‑101 (MQ=255) gatgatTCTTggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccag < 1:4647503‑M1/101‑92 (MQ=255) atgatTCTTggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagc < 1:9044384‑M1/101‑93 (MQ=255) aATTCTTATGTTACTCACTCTGGTGTTTTCGAGTGAGGTGTTAGCGAAGACGCACACAACAACAGCGAGTCAAAAGTCCCACTTAACTAAAGCTAGtaata < 1:7153234‑M2/100‑1 (MQ=255) ttCTTggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcac > 1:12804214‑M1/1‑5 (MQ=255) tCTTATGTTACTCACTCTGGTGTTTTCGAGTGAGGTGTTAGCGAAGACGCACACAACAACAGCGAGTCAAAAGTCCCACTTAACTAAAGCTAGTAATAAAc < 1:8283097/101‑1 (MQ=255) cTTATGTTACTCACTCTGGTGTTTTCGAGTGAGGTGTTAGCGAAGACGCACACAACAACAGCGAGTCAAAAGTCCCACTTAACTAAAGCTAGTAATAAACa > 1:7504779/1‑101 (MQ=255) tATGTTACTCACTCTGGTGTTTTCGAGTGAGGTGTTAGCGAAGACGCACACAACAACAGCGAGTCAAAAGTCCCACTTAACTAAAGCTAGTAATAAACAgg < 1:8434823/101‑1 (MQ=255) | CTCTCAAATTTGTGAAAAATATAAGGTGTTGGAATGATTAAATCCGACCAGGAGACCTGATGATTTTGACTCCCATACGACGATATGGGGCGATGATTCTTATGTTACTCACTCTGGTGTTTTCGAGTGAGGTGTTAGCGAAGACGCACACAACAACAGCGAGTCAAAAGTCCCACTTAACTAAAGCTAGTAATAAACAGG > NC_007779/3903179‑3903379 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |