New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_007779 | = 274373 | NA (NA) | 5 (0.020) | 5/180 | NT | 0.20% | intergenic (‑32/‑176) | insH/mmuP | IS5 transposase and trans‑activator/S‑methylmethionine transporter |
? | NC_007779 | 675375 = | 2488 (8.730) | intergenic (‑170/‑65) | leuS/ybeL | leucyl‑tRNA synthetase/hypothetical protein |
Only 100 of 2808 total aligned reads displayed.
GCATAGCCCAAACGTCCGCGTCAAAACAGCCTTTCGCGCACTCGACGTTGAAATGATGCCCGGATTATTCATACATTAATTTACAGAGTTTGTGGGCGTATTAGCAAAGCAAGGAACAAAGAACGTCTATTATTATAGTCAGTTAACGACCCGGGAGATGAAACGATGAACAAGGTTGCTCAATATTACCGTGAACTGGTT > NC_007779/675275‑675475 | catagcCCAAACGTCCGCGTCAAAACAGCCTTTCGCGCACTCGACGTTGAAATGATGCCCGGATTATTCATACATTAATTTACAGAGTTTGTGGGCGTAtt < 1:11045394/101‑1 (MQ=255) tagcCCAAACGTCCGCGTCAAAACAGCCTTTCGCGCACTCGACGTTGAAATGATGCCCGGATTATTCATACATTAATTTACAGAGTTTGTGGGCGTATTag < 1:9164512/101‑1 (MQ=255) tagcCCAAACGTCCGCGTCAAAACAGCCTTTCGCGCACTCGACGTTGAAATGATGCCCGGATTATTCATACATTAATTTACAGAGTTTGTGGGCGTATTag > 1:1079803/1‑101 (MQ=255) tagcCCAAACGTCCGCGTCAAAACAGCCTTTCGCGCACTCGACGTTGAAATGATGCCCGGATTATTCATACATTAATTTACAGAGTTTGTGGGCGTATTag > 1:6639466/1‑101 (MQ=255) cccAAACGTCCGCGTCAAAACAGCCTTTCGCGCACTCGACGTTGAAATGATGCCCGGATTATTCATACATTAATTTACAGAGTTTGTGGGCGTATTagcaa > 1:8433574/1‑101 (MQ=255) ccAAACGTCCGCGTCAAAACAGCCTTTCGCGCACTCGACGTTGAAATGATGCCCGGATTATTCATACATTAATTTACAGAGTTTGTGGGCGTATTagcaaa < 1:4522044/101‑1 (MQ=255) cAAACGTCCGCGTCAAAACAGCCTTTCGCGCACTCGACGTTGAAATGATGCCCGGATTATTCATACATTAATTTACAGAGTTTGTGGGCGTATTagcaaag < 1:906851/101‑1 (MQ=255) aaaCGTCCGCGTCAAAACAGCCTTTCGCGCACTCGACGTTGAAATGATGCCCGGATTATTCATACATTAATTTACAGAGTTTGTGGGCGTATTagcaaagc > 1:8072761/1‑101 (MQ=255) aaCGTCCGCGTCAAAACAGCCTTTCGCGCACTCGACGTTGAAATGATGCCCGGATTATTCATACATTAATTTACAGAGTTTGTGGGCGTATTagcaaagca > 1:3010024/1‑101 (MQ=255) aCGTCCGCGTCAAAACAGCCTTTCGCGCACTCGACGTTGAAATGATGCCCGGATTATTCATACATTAATTTACAGAGTTTGTGGGCGTATTagcaaagcaa < 1:14171113/101‑1 (MQ=255) cGTCCGCGTCAAAACAGCCTTTCGCGCACTCGACGTTGAAATGATGCCCGGATTATTCATACATTAATTTACAGAGTTTGTGGGCGTATTAGCAAAGCAAg < 1:374905/101‑1 (MQ=255) tCCGCGTCAAAACAGCCTTTCGCGCACTCGACGTTGAAATGATGCCCGGATTATTCATACATTAATTTACAGAGTTTGTGGGCGTATTAGCAAAGCAAGGa < 1:10163758/101‑1 (MQ=255) tCCGCGTCAAAACAGCCTTTCGCGCACTCGACGTTGAAATGATGCCCGGATTATTCATACATTAATTTACAGAGTTTGTGGGCGTATTAGCAAAGCAAGGa < 1:9288667/101‑1 (MQ=255) cgcgTCAAAACAGCCTTTCGCGCACTCGACGTTGAAATGATGCCCGGATTATTCATACATTAATTTACAGAGTTTGTGGGCGTATTAGCAAAGCAAGGAAc < 1:12012950/101‑1 (MQ=255) cgcgTCAAAACAGCCTTTCGCGCACTCGACGTTGAAATGATGCCCGGATTATTCATACATTAATTTACAGAGTTTGTGGGCGTATTAGCAAAGCAAGGAAc < 1:14427791/101‑1 (MQ=255) gcgTCAAAACAGCCTTTCGCGCACTCGACGTTGAAATGATGCCCGGATTATTCATACATTAATTTACAGAGTTTGTGGGCGTATTAGCAAAGCAAGGAACa < 1:5351559/101‑1 (MQ=255) gcgTCAAAACAGCCTTTCGCGCACTCGACGTTGAAATGATGCCCGGATTATTCATACATTAATTTACAGAGTTTGTGGGCGTATTAGCAAAGCAAGGAACa > 1:8527819/1‑101 (MQ=255) gTCAAAACAGCCTTTCGCGCACTCGACGTTGAAATGATGCCCGGATTATTCATACATTAATTTACAGAGTTTGTGGGCGTATTAGCAAAGCAAGGAACgaa < 1:11211423/101‑1 (MQ=255) gTCAAAACAGCCTTTCGCGCACTCGACGTTGAAATGATGCCCGGATTATTCATACATTAATTTACAGAGTTTGTGGGCGTATTAGCAAAGCAAGGAACaaa < 1:10001419/101‑1 (MQ=255) cAAAACAGCCTTTCGCGCACTCGACGTTGAAATGATGCCCGGATTATTCATACATTAATTTACAGAGTTTGTGGGCGTATTAGCAAAGCAAGGAACAAAGa > 1:1861393/1‑101 (MQ=255) aaaCAGCCTTTCGCGCACTCGACGTTGAAATGATGCCCGGATTATTCATACATTAATTTACAGAGTTTGTGGGCGTATTAGCAAAGCAAGGAACAAAGAAc > 1:1094296/1‑101 (MQ=255) aaaCAGCCTTTCGCGCACTCGACGTTGAAATGATGCCCGGATTATTCATACATTAATTTACAGAGTTTGTGGGCGTATTAGCAAAGCAAGGAACAAAGAAc < 1:6003288/101‑1 (MQ=255) aaCAGCCTTTCGCGCACTCGACGTTGAAATGATGCCCGGATTATTCATACATTAATTTACAGAGTTTGTGGGCGTATTAGCAAAGCAAGGAACAAAGAACg < 1:4158767/101‑1 (MQ=255) aaCAGCCTTTCGCGCACTCGACGTTGAAATGATGCCCGGATTATTCATACATTAATTTACAGAGTTTGTGGGCGTATTAGCAAAGCAAGGAACAAAGAACg < 1:6173240/101‑1 (MQ=255) aaCAGCCTTTCGCGCACTCGACGTTGAAATGATGCCCGGATTATTCATACATTAATTTACAGAGTTTGTGGGCGTATTAGCAAAGCAAGGAACAAAGAACg < 1:3942137/101‑1 (MQ=255) cTTTCGCGCACTCGACGTTGAAATGATGCCCGGATTATTCATACATTAATTTACAGAGTTTGTGGGCGTATTAGCAAAGCAAGGAACAAAGAACGTCtatt > 1:12951134/1‑101 (MQ=255) cTTTCGCGCACTCGACGTTGAAATGATGCCCGGATTATTCATACATTAATTTACAGAGTTTGTGGGCGTATTAGCAAAGCAAGGAACAAAGAACGTCtatt < 1:427683/101‑1 (MQ=255) cTTTCGCGCACTCGACGTTGAAATGATGCCCGGATTATTCATACATTAATTTACAGAGTTTGTGGGCGTATTAGCAAAGCAAGGAACAAAGAACGTCtatt < 1:6312979/101‑1 (MQ=255) tttCGCGCACTCGACGTTGAGATGATGCCCGGATTATTCATACATTAATTTACAGAGTTTGTGGGCGTATTAGCAAAGCAAGGAACAAAGAACGTCtatta < 1:10472555/101‑1 (MQ=255) ttCGCGCACTCGACGTTGAAATGATGCCCGGATTATTCATACATTAATTTACAGAGTTTGTGGGCGTATTAGCAAAGCAAGGAACAAAGAACGTCtattat < 1:13491178/101‑1 (MQ=255) ttCGCGCACTCGACGTTGAAATGATGCCCGGATTATTCATACATTAATTTACAGAGTTTGTGGGCGTATTAGCAAAGCAAGGAACAAAGAACGTCtattat < 1:4902478/101‑1 (MQ=255) ttCGCGCACTCGACGTTGAAATGATGCCCGGATTATTCATACATTAATTTACAGAGTTTGTGGGCGTATTAGCAAAGCAAGGAACAAAGAACGTCtattat < 1:8763562/101‑1 (MQ=255) ttCGCGCACTCGACGTTGAAATGATGCCCGGATTATTCATACATTAATTTACAGAGTTTGTGGGCGTATTAGCAAAGCAAGGAACAAAGAACGTCtattat < 1:5652940/101‑1 (MQ=255) tCGCGCACTCGACGTTGAAATGATGCCCGGATTATTCATACATTAATTTACAGAGTTTGTGGGCGTATTAGCAAAGCAAGGAACAAAGAACGTCtattatt < 1:4043340/101‑1 (MQ=255) gcgcACTCGACGTTGAAATGATGCCCGGATTATTCATACATTAATTTACAGAGTTTGTGGGCGTATTAGCAAAGCAAGGAACAAAGAACGTCtattattat > 1:7653276/1‑101 (MQ=255) gcgcACTCGACGTTGAAATGATGCCCGGATTATTCATACATTAATTTACAGAGTTTGTGGGCGTATTAGCAAAGCAAGGAACAAAGAACGTCtattattat < 1:12172861/101‑1 (MQ=255) cACTCGACGTTGAAATGATGCCCGGATTATTCATACATTAATTTACAGAGTTTGTGGGCGTATTAGCAAAGCAAGGAACAAAGAACGTCTATTATTATAGt > 1:2745557/1‑101 (MQ=255) cACTCGACGTTGAAATGATGCCCGGATTATTCATACATTAATTTACAGAGTTTGTGGGCGTATTAGCAAAGCAAGGAACAAAGAACGTCTATTATTATAGt < 1:5752684/101‑1 (MQ=255) cACTCGACGTTGAAATGATGCCCGGATTATTCATACATTAATTTACAGAGTTTGTGGGCGTATTAGCAAAGCAAGGAACAAAGAACGTCTATTATTATAGt > 1:2378878/1‑101 (MQ=255) aCTCGACGTTGAAATGATGCCCGGATTATTCATACATTAATTTACAGAGTTTGTGGGCGTATTAGCAAAGCAAGGAACAAAGAACGTCTATTATTATAGTc < 1:14306864/101‑1 (MQ=255) aCTCGACGTTGAAATGATGCCCGGATTATTCATACATTAATTTACAGAGTTTGTGGGCGTATTAGCAAAGCAAGGAACAAAGAACGTCTATTATTATAGTc < 1:7026961/101‑1 (MQ=255) cTCGACGTTGAAATGATGCCCGGATTATTCATACATTAATTTACAGAGTTTGTGGGCGTATTAGCAAAGCAAGGAACAAAGAACGTCTATTATTATAGTCa > 1:14037685/1‑101 (MQ=255) tCGACGTTGAAATGATGCCCGGATTATTCATACATTAATTTACAGAGTTTGTGGGCGTATTAGCAAAGCAAGGAACAAAGAACGTCTATTATTATAGTCAg < 1:7539683/101‑1 (MQ=255) tCGACGTTGAAATGATGCCCGGATTATTCATACATTAATTTACAGAGTTTGTGGGCGTATTAGCAAAGCAAGGAACAAAGAACGTCTATTATTATAGTCAg > 1:13331232/1‑101 (MQ=255) cGACGTTGAAATGATGCCCGGATTATTCATACATTAATTTACAGAGTTTGTGGGCGTATTAGCAAAGCAAGGAACAAAGAACGTCTATTATTATAGTCAGt < 1:3464210/101‑1 (MQ=255) aCGTTGAAATGATGCCCGGATTATTCATACATTAATTTACAGAGTTTGTGGGCGTATTAGCAAAGCAAGGAACAAAGAACGTCTATTATTATAGTCAGTTa > 1:14569415/1‑101 (MQ=255) ttGAAATGATGCCCGGATTATTCATACATTAATTTACAGAGTTTGTGGGAGTATTAGCAAAGAAAGGAACAAAGAACGTCTATTATTATAGTCAGTTAACg > 1:640414/1‑101 (MQ=255) tGAAATGATGCCCGGATTATTCATACATTAATTTACAGAGTTTGTGGGCGTATTAGCAAAGCAAGGAACAAAGAACGTCTATTATTATAGTCAGTTAACGa < 1:13615116/101‑1 (MQ=255) 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ttCATACATTAATTTACAGAGTTTGTGGGCGTATTAGCAAAGCAAGGAACAAAGAACGTCTATTATTATAGTCAGTTAACGACCCGGAAGATGAAACGATg > 1:10701795/1‑101 (MQ=255) tCATACATTAATTTACAGAGTTTGTGGGCGTATTAGCAAAGCAAGGAACAAAGAACGTCTATTATTATAGTCAGTTAACGGCCCGGGAGATGAAACGATGa > 1:13042107/1‑101 (MQ=255) tCATACATTAATTTACAGAGTTTGTGGGCGTATTAGCAAAGCAAGGAACAAAGAACGTCTATTATTATAGTCAGTTAACGACCCGGGAGATGAAACGATGa > 1:5481266/1‑101 (MQ=255) cATACATTAATTTACAGAGTTTGTGGGCGTATTAGCAAAGCAAGGAACAAAGAACGTCTATTATTATAGTCAGTTAACGACCCGGGAGATGAAACGATGaa > 1:7289768/1‑101 (MQ=255) tACATTAATTTACAGAGTTTGTGGGCGTATTAGCAAAGCAAGGAACAAAGAACGTCTATTATTATAGTCAGTTAACGACCCGGGAGATGAAACGATGAACa > 1:6546395/1‑101 (MQ=255) aCATTAATTTACAGAGTTTGTGGGCGTATTAGCAAAGCAAGGAACAAAGAACGTCTATTATTATAGTCAGTTAACGACCCGGGAGATGAAACGATGAACaa > 1:5106943/1‑101 (MQ=255) aCATTAATTTACAGAGTTTGTGGGCGTATTAGCAAAGCAAGGAACAAAGAACGTCTATTATTATAGTCAGTTAACGACCCGGGAGATGAAACGATGAACaa < 1:9521579/101‑1 (MQ=255) 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tATTAGCAAAGCAAGGAACAAAGAACGTCTATTATTATAGTCAGTTAACGACCCGGGAGATGAAACGATGAACAAGGTTGCTCAATATTACCGTGAACTgg < 1:6896555/101‑1 (MQ=255) aTTAGCAAAGCAAGGAACAAAGAACGTCTATTATTATAGTCAGTTAACGACCCGGGAGATGAAACGATGAACAAGGTTGCTCAATATTACCGTGAACTGGt > 1:13768684/1‑101 (MQ=255) ttAGCAAAGCAAGGAACAAAGAACGTCTATTATTATAGTCAGTTAACGACCCGGGAGATGAAACGATGAACAAGGTTGCTCAATATTACCGTGAACTGGtt > 1:3310663/1‑101 (MQ=255) | GCATAGCCCAAACGTCCGCGTCAAAACAGCCTTTCGCGCACTCGACGTTGAAATGATGCCCGGATTATTCATACATTAATTTACAGAGTTTGTGGGCGTATTAGCAAAGCAAGGAACAAAGAACGTCTATTATTATAGTCAGTTAACGACCCGGGAGATGAAACGATGAACAAGGTTGCTCAATATTACCGTGAACTGGTT > NC_007779/675275‑675475 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |