| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_007779 | = 4355066 | 9 (0.030) | 240 (0.870) | 125/176 | NT | 96.5% | coding (1275/1632 nt) | dcuS | sensory histidine kinase in two‑component regulatory system with DcuR, regulator of anaerobic fumarate respiration |
| ? | NC_007779 | = 4504189 | NA (NA) | intergenic (+9/‑90) | insD/yjgW | IS2 insertion element transposase InsAB'/hypothetical protein | |||||
Only 100 of 264 total aligned reads displayed.
CTAATTTCGCCTCCGGGTTCCGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_007779/4354965‑4355066‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tgGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTA < NC_007779/4504189‑4504093 TAATTTCGCCTCCGGGTTCCGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTG > 1:11932930/1‑101 AATTTCGCCTCCGGGTTCCGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGG > 1:4118235/1‑101 TTCGCCTCCGGGTTCCGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATT < 1:10923725/101‑1 TCGCCTCCGGGTTCCGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTT > 1:10549445/1‑101 CTCCGGGTTCCGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCC > 1:6527807/1‑101 TCCGGGTTCCGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCC > 1:13258174/1‑101 CCGGGTTCCGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCT < 1:12045433/101‑1 CCGGGTTCCGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCT < 1:8966323/101‑1 CCGGGTTCCGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCT > 1:8381537/1‑101 CGGGTTCCGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTA > 1:11180352/1‑101 GTTCCGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATAT < 1:12544884/101‑1 TTCCGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATT > 1:8865976/1‑101 TTCCGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATT > 1:7918059/1‑101 TCCGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTT > 1:3464123/1‑101 CGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCTCTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCC > 1:5672624/1‑101 CGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCC < 1:7414827/101‑1 CGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCC > 1:10072840/1‑101 GGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCA > 1:10357078/1‑101 GGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCA < 1:7609594/101‑1 GGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCA > 1:12574641/1‑101 GCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAG < 1:1996769/101‑1 GCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAG > 1:11088187/1‑101 GCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGCAATCAGCGTCGCGACCGGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAG > 1:3114627/1‑101 CCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGAC > 1:8847037/1‑101 CCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGAC < 1:7721291/101‑1 CTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACA > 1:4720528/1‑101 TAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACAT > 1:6430102/1‑101 AATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATC > 1:8233388/1‑101 ATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCT < 1:5811284/101‑1 ATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCT < 1:3307330/101‑1 TGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTG < 1:12171291/101‑1 CCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTT > 1:5891899/1‑101 TCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTAT > 1:4852117/1‑101 CAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCA < 1:7316108/101‑1 CAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCCCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCA > 1:8161290/1‑101 AGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCAC < 1:4001222/101‑1 GCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTA < 1:11017695/101‑1 GCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTA > 1:2383304/1‑101 GCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTA > 1:6716660/1‑101 GCGTCTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTA < 1:8517391/101‑1 CGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAA > 1:14247422/1‑101 GTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAAC < 1:14502374/101‑1 TTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACC < 1:8720828/101‑1 TTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCC > 1:612610/1‑101 TTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCC < 1:11637774/101‑1 TTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCC < 1:11188004/101‑1 tcCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCA < 1:9621548/99‑1 TTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCA > 1:4548450/1‑101 TTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCA > 1:10103463/1‑101 CTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATT > 1:6317845/1‑101 CTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATT < 1:714616/101‑1 TATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTA < 1:9223472/101‑1 ATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTAC < 1:10831139/101‑1 ATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTAC < 1:3775434/101‑1 ATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTAC < 1:11608958/101‑1 TCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACA < 1:13776692/101‑1 GATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGC > 1:12086957/1‑101 ATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCC < 1:510492/101‑1 TTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCG < 1:12329602/101‑1 TCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGC > 1:12993940/1‑101 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TCGCGGCCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGG < 1:13659873/101‑1 TCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGG > 1:6903838/1‑101 TCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGG > 1:3819054/1‑101 TCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGG < 1:3669455/101‑1 CGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGC < 1:12261100/101‑1 CGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGC > 1:12000802/1‑101 ACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGC > 1:3534492/1‑101 CCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCG < 1:5978194/101‑1 CCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCG > 1:2161499/1‑101 CTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGA < 1:11299176/101‑1 CTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTCCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGA < 1:12351566/101‑1 TGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGAT > 1:6634946/1‑101 gCCTCACTGCCGCTGGAGTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAAC < 1:1706510/100‑1 TCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAAC < 1:10018367/101‑1 CCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACC < 1:9514419/101‑1 CCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACC > 1:9793127/1‑101 CACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGGCATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAG > 1:4442066/1‑101 ACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGC < 1:7825198/101‑1 CGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACT > 1:2823536/1‑101 CGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACT < 1:14054534/101‑1 GCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTA < 1:4699320/101‑1 GCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTA < 1:10602736/101‑1 GCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTA > 1:10188615/1‑101 GCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCAGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTA > 1:5248856/1‑101 CTAATTTCGCCTCCGGGTTCCGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_007779/4354965‑4355066‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tgGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTA < NC_007779/4504189‑4504093 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |