| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_007779 | 1507316 = | 267 (0.910) | 56 (0.210) | 47/166 | NT | 18.1% | coding (479/1176 nt) | ydcO | benzoate transporter |
| ? | NC_007779 | = 1556743 | 259 (0.960) | coding (641/1698 nt) | sfcA | malate dehydrogenase, NAD‑requiring | |||||
Only 100 of 124 total aligned reads displayed.
GCGGCGGCAATGCTTGCCGGGATTTTATTACGCTTTGGTTTACAGGCGTTTGCCAGTCTGGACGGTCAATTTACGTTGTGTGGAAGTATGTTGCTGGTATGGCTGGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_007779/1507422‑1507316‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ggctggcGTAATCCGCGTATCACTGACGACGAATACTATGAATTCGTTGATGAATTTATCCAGGCTGTGAAACAACGCTGGCCAGACGTGCTGTTGCAGTTTGAAGA < NC_007779/1556743‑1556644 GCGGCGGCAATGCTTGCCGGGATTTTATTACGCTTTGGTTTACAGGCGTTTGCCAGTCTGGACGGTCAATTTACGTTGTGTGGAAGTATGTTGCTGGTATG > 1:832880/1‑101GCGGCGGCAATGCTTGCCGGGATTTTATTACGCTTTGGTTTACAGGCGTTTGCCAGTCTGGACGGTCAATTTACGTTGTGTGGAAGTATGTTGCTGGTATG < 1:10684385/101‑1GCGGCGGCAATGCTTGCCGGGATTTTATTACGCTTTGGTTTACAGGCGTTTGCCAGTCTGGACGGTCAATTTACGTTGTGTGGAAGTATGTTGCTGGTATG < 1:7185371/101‑1GCGGCGGCAATGCTTGCCGGGATTTTATTACGCTTTGGTTTACAGGCGTTTGCCAGTCTGGACGGTCAATTTACGTTGTGTGGAAGTATGTTGCTGGTATG < 1:5804971/101‑1GCGGCGGCAATGCTTGCCGGGATTTTATTACGCTTTGGTTTACAGGCGTTTGCCAGTCTGGACGGTCAATTTACGTTGTGTGGAAGTATGTTGCTGGTATG < 1:5447767/101‑1GCGGCGGCAATGCTTGCCGGGATTTTATTACGCTTTGGTTTACAGGCGTTTGCCAGTCTGGACGGTCAATTTACGTTGTGTGGAAGTATGTTGCTGGTATG < 1:7394381/101‑1 CGGCGGCAATGCTTGCCGGGATTTTATTACGCTTTGGTTTACAGGCGTTTGCCAGTCTGGACGGTCAATTTACGTTGTGTGGAAGTATGTTGCTGGTATGG > 1:4326157/1‑101 CGGCGGCAATGCTTGCCGGGATTTTATTACGCTTTGGTTTACAGGCGTTTGCCAGTCTGGACGGTCAATTTACGTTGTGTGGAAGTATGTTGCTGGTATGG > 1:1697200/1‑101 GGCGGCAATGCTTGCCGGGATTTTATTACGCTTTGGTTTACAGGCGTTTGCCAGTCTGGACGGTCAATTTACGTTGTGTGGAAGTATGTTGCTGGTATGGC > 1:10518801/1‑101 GGCGGCAATGCTTGCCGGGATTTTATTACGCTTTGGTTTACAGGCGTTTGCCAGTCTGGACGGTCAATTTACGTTGTGTGGAAGTATGTTGCTGGTATGGC > 1:6516775/1‑101 GGCGGCAATGCTTGCCGGGATTTTATTACGCTTTGGTTTACAGGCGTTTGCCAGTCTGGACGGTCAATTTACGTTGTGTGGAAGTATGTTGCTGGTATGGC > 1:588263/1‑101 GGCGGCAATGCTTGCCGGGATTTTATTACGCTTTGGTTTACAGGCGTTTGCCAGTCTGGACGGTCAATTTACGTTGTGTGGAAGTATGTTGCTGGTATGGC > 1:11505205/1‑101 GCGGCAATGCTTGCCGGGATTTTATTACGCTTTGGTTTACAGGCGTTTGCCAGTCTGGACGGTCAATTTACGTTGTGTGGAAGTATGTTGCTGGTATGGCT < 1:14224465/101‑1 GCGGCAATGCTTGCCGGGATTTTATTACGCTTTGGTTTACAGGCGTTTGCCAGTCTGGACGGTCAATTTACGTTGTGTGGAAGTATGTTGCTGGTATGGCT < 1:13919337/101‑1 CGGCAATGCTTGCCGGGATTTTATTACGCTTTGGTTTACAGGCGTTTGCCAGTCTGGACGGTCAATTTACGTTGTGTGGAAGTATGTTGCTGGTATGGCTG > 1:3610046/1‑101 CGGCAATGCTTGCCGGGATTTTATTACGCTTTGGTTTACAGGCGTTTGCCAGTCTGGACGGTCAATTTACGTTGTGTGGAAGTATGTTGCTGGTATGGCTG < 1:3149762/101‑1 CGGCAATGCTTGCCGGGATTTTATTACGCTTTGGTTTACAGGCGTTTGCCAGTCTGGACGGTCAATTTACGTTGTGTGGAAGTATGTTGCTGGTATGGCTG < 1:4975780/101‑1 CGGCAATGCTTGCCGGGATTTTATTACGCTTTGGTTTACAGGCGTTTGCCAGTCTGGACGGTCAATTTACGTTGTGTGGAAGTATGTTGCTGGTATGGCTG < 1:10582611/101‑1 GGCAATGCTTGCCGGGATTTTATTACGCTTTGGTTTACAGGCGTTTGCCAGTCTGGACGGTCAATTTACGTTGTGTGGAAGTATGTTGCTGGTATGGCTGG > 1:9270712/1‑101 GCAATGCTTGCCGGGATTTTATTACGCTTTGGTTTACAGGCGTTTGCCAGTCTGGACGGTCAATTTACGTTGTGTGGAAGTATGTTGCTGGTATGGCTGGg > 1:10230659/1‑100 GCAATGCTTGCCGGGATTTTATTACGCTTTGGTTTACAGGCGTTTGCCAGTCTGGACGATCAATTTACGTTGTGTGGAAGTATGTTGCTGGTATGGCTGGC > 1:14152319/1‑101 GCTTGCCGGGATTTTATTACGCTTTGGTTTACAGGCGTTTGCCAGTCTGGACGGTCAATTTACGTTGTGTGGAAGTATGTTGCTGGTATGGCTGGCGgcat > 1:7246455/1‑97 TTGCCGGGATTTTATTACGCTTTGGTTTACAGGCGTTTGCCAGTCTGGACGGTCAATTTACGTTGTGTGGAAGTATGTTGCTGGTATGGCTGGggatagcc > 1:1488057/1‑93 TGCCGGGATTTTATTACGCTTTGGTTTACAGGCGTTTGCCAGTCTGGACGGTCAATTTACGTTGTGTGGAAGTATGTTGCTGGTATGGCTGGCGTAATCCG < 1:7111005/101‑1 TGCCGGGATTTTATTACGCTTTGGTTTACAGGCGTTTGCCAGTCTGGACGGTCAATTTACGTTGTGTGGAAGTATGTTGCTGGTATGGCTGGCGTAATCCG > 1:6275842/1‑101 CCGGGATTTTATTACGCTTTGGTTTACAGGCGTTTGCCAGTCTGGACGGTCAATTTACGTTGTGTGGAAGTATGTTGCTGGTATGGCTGGCGTAATCCCCG > 1:13327357/1‑101 CGGGATTTTATTACGGTTTGGTTTACAGGCGTTTGCCAGTCTGGACGGTCAATTTACGTTGTGTGGAAGTATGTTGCTGGTATGGCTGGGGTAATCCGCGT > 1:14059688/1‑101 CGGGATTTTATTACGCTTTGGTTTACAGGCGTTTGCCAGTCTGGACGGTCAATTTACGTTGTGTGGAAGTATGTTGCTGGTATGGCTGGGGTAATCCGCGT > 1:10199479/1‑101 CGGGATTTTATTACGCTTTGGTTTACAGGCGTTTGCCAGTCTGGACGGTCAATTTACGTTGTGTGGAAGTATGTTGCTGGTATGGCTGGCGTAATCCGCGT < 1:6557102/101‑1 CGGGATTTTATTACGCTTTGGTTTACAGGCGTTTGCCAGTCTGGACGCTCAATTTACGTTGTGTGGAAGTATGTTGCTGGTATGGCTGGCGTAATCCGCGT < 1:5496395/101‑1 GGATTTTATTACGCTTTGGTTTACAGGCGTTTGCCAGTCTGGACGGTCAATTTACGTTGTGTGGAAGTATGTTGCTGGTATGGCTGGCGTAATCCGCGTAT < 1:15006913/101‑1 ATTTTATTACGCTTTGGTTTACAGGCGTTTGCCAGTCTGGACGGTCAATTTACGTTGTGTGGAAGTATGTTGCTGGTATGGCTGGCGGAATCCCCGTATCA > 1:10310189/1‑101 TATTACGCTTTGGTTTACAGGCGTTTGCCAGTCTGGACGGTCAATTTACGTTGTGTGGAAGTATGTTGCTGGTATGGCTGGCGTAATCCGCGTATCACTGA < 1:14405694/101‑1 ATTACGCTTTGGTTTACAGGCGTTTGCCAGTCTGGACGGTCAATTTACGTTGTGTGGAAGTATGTTGCTGGTATGGCTGGCGTAATCCGCGTATCACTGAC > 1:6681166/1‑101 TTACGCTTTGGTTTACAGGCGTTTGCCAGTCTGGACGGTCAATTTACGTTGTGTGGAAGTATGTTGCTGGTATGGCTGGCGTAATCCGCGTATCACTGACG < 1:9213858/101‑1 TACGCTTTGGTTTACAGGCGTTTGCCAGTCTGGACGGTCAATTTACGTTGTGTGGAAGTATGTTGCTGGTATGGCTGGCGTAATCCGCGTATCACTGACGA > 1:11038322/1‑101 TGGTTTACAGGCGTTTGCCAGTCTGGACGGTCAATTTACGTTGTGTGGAAGTATGTTGCTGGTATGGCTGGCGTAATCCGCGTATCACTGACGACGAATAC < 1:12489454/101‑1 GTTTACAGGCGTTTGCCAGTCTGGACGGTCAATTTACGTTGTGTGGAAGTATGTTGCTGGTATGGCTGGCGTAATCCGCGTATCACTGACGACGAATACTA < 1:10583992/101‑1 TTACAGGCGTTTGCCAGTCTGGACGGTCAATTTACGTTGTGTGGAAGTATGTTGCTGGTATGGCTGGCGTAATCCGCGTATCACTGACGACGAATACTATG < 1:14322574/101‑1 CAGGCGTTTGCCAGTCTGGACGGTCAATTTACGTTGTGTGGAAGTATGTTGCTGGTATGGCTGGCGTAATCCGCGTATCACTGACGACGAATACTATGAAT < 1:5745275/101‑1 CGTTTGCCAGTCTGGACGGTCAATTTACGTTGTGTGGAAGTATGTTGCTGGTATGGCTGGCGTAATCCGCGTATCACTGACGACGAATACTATGAATTCGT < 1:6881462/101‑1 GTTTGCCAGTCTGGACGGTCAATTTACGTTGTGTGGAAGTATGTTGCTGGTATGGCTGGCGTAATCCGCGTATCACTGACGACGAATACTATGAATTCGTT > 1:726698/1‑101 GCCAGTCTGGACGGTCAATTTACGTTGTGTGGAAGTATGTTGCTGGTATGGCTGGCGTAATCCGCGTATCACTGACGACGAATACTATGAATTCGTTGATG < 1:2470791/101‑1 CCAGTCTGGACGGTCAATTTACGTTGTGTGGAAGTATGTTGCTGGTATGGCTGGCGTAATCCGCGTATCACTGACGACGAATACTATGAATTCGTTGATGA < 1:4362974/101‑1 CCAGTCTGGACGGTCAATTTACGTTGTGTGGAAGTATGTTGCTGGTATGGCTGGCGTAATCCGCGTATCACTGACGACGAATACTATGAATTCGTTGATGA > 1:11245967/1‑101 CCAGTCTGGACGGTCAATTTACGTTGTGTGGAAGTATGTTGCTGGTATGGCTGGCGTAATCCGCGTATCACTGACGACGAATACTATGAATTCGTTGATGA < 1:4164944/101‑1 AGTCTGGACGGTCAATTTACGTTGTGTGGAAGTATGTTGCTGGTATGGCTGGCGTAATCCGCGTATCACTGACGACGAATACTATCAATTCGTTGATGAAT < 1:14063356/101‑1 CGGTCAATTTACGTTGTGTGGAAGTATGTTGCTGGTATGGCTGGCGTAATCCGCGTATCACTGACGACGAATACTATGAATTCGTTGATGAATTTATCCAG < 1:7408491/101‑1 GGTCAATTTACGTTGTGTGGAAGTATGTTGCTGGTATGGCTGGCGTAATCCGCGTATCACTGACGACGAATACTATGAATTCGTTGATGAATTTATCCAGG > 1:7978986/1‑101 TCAATTTACGTTGTGTGGAAGTATGTTGCTGGTATGGCTGGCGTAATCCGCGTATCACTGACGACGAATACTATGAATTCGTTGATGAATTTATCCAGGCT > 1:10876378/1‑101 AATTTACGTTGTGTGGAAGTATGTTGCTGGTATGGCTGGCGTAATCCGCGTATCACTGACGACGAATACTATGAATTCGTTGATGAATTTATCCAGGCTGT > 1:12820725/1‑101 TACGTTGTGTGGAAGTATGTTGCTGGTATGGCTGGCGTAATCCGCGTATCACTGACGACGAATACTATGAATTCGTTGATGAATTTATCCAGGCTGTGAAA > 1:12404312/1‑101 tCGTTGTGTGGAAGTATGTTGCTTGTATGGCTGGCGTAATCCGCGTATCACTGACGACGAATACTATGAATTCGTTGATGAATTTATCCAGGCTGTGAAAC < 1:5485047/100‑1 TTGTGTGGAAGTATGTTGCTGGTATGGCTGGCGTAATCCGCGTATCACTGACGACGAATACTATGAATTCGTTGATGAATTTATCCAGGCTGTGAAACAAC > 1:12802734/1‑101 TGTGTGGAAGTATGTTGCTGGTATGGCTGGCGTAATCCGCGTATCACTGACGACGAATACTATGAATTCGTTGATGAATTTATCCAGGCTGTGAAACAACG > 1:9498371/1‑101 TGTGGAAGTATGTTGCTGGTATGGCTGGCGTAATCCGCGTATCACTGACGACGAATACTATGAATTCGTTGATGAATTTATCCAGGCTGTGAAACAACGCT < 1:11362479/101‑1 TGTGGAAGTATGTTGCTGGTATGGCTGGCGTAATCCGCGTATCACTGACGACGAATACTATGAATTCGTTGATGAATTTATCCAGGCTGTGAAACAACGCT < 1:930891/101‑1 TGGAAGTATGTTGCTGGTATGGCTGGCGTAATCCGCGTATCACTGACGACGAATACTATGAATTCGTTGATGAATTTATCCAGGCTGTGAAACAACGCTGG < 1:9872471/101‑1 AAGTATGTTGCTGGTATGGCTGGCGTAATCCGCGTATCACTGACGACGAATACTATGAATTCGTTGATGAATTTATCCAGGCTGTGAAACAACGCTGGCCA < 1:5744451/101‑1 gtTGTTGCTGGTATGGCTGGCGTAATCCGCGTATCACTGACGACGAATACTATGAATTCGTTGATGAATTTATCCAGGCTGTGAAACAACGCTGGCCAGAC < 1:700164/99‑1 TATGTTGCTGGTATGGCTGGCGTAATCCGCGTATCACTGACGACGAATACTATGAATTCGTTGATGAATTTATCCAGGCTGTGAAACAACGCTGGCCAGAC > 1:4308709/1‑101 ATGTTGCTGGTATGGCTGGCGTAATCCGCGTATCACTGACGACGAATACTATGAATTCGTTGATGAATTTATCCAGGCTGTGAAACAACGCTGGCCAGACG < 1:11506939/101‑1 GTTGCTGGTATGGCTGGCGTAATCCGCGTATCACTGACGACGAATACTATGAATTCGTTGATGAATTTATCCAGGCTGTGAAACAACGCTGGCCAGACGTG < 1:6713336/101‑1 GTTGCTGGTATGGCTGGCGTAATCCGCGTATCACTGACGACGAATACTATGAATTCGTTGATGAATTTATACAGGCTGTGAAACAACGCTGGCCAGACGTG > 1:14293720/1‑101 TTGCTGGTATGGCTGGCGTAATCCGCGTATCACTGACGACGAATACTATGAATTCGTTGATGAATTTATCCAGGCTGTGAAACAACGCTGGCCAGACGTGC < 1:7009375/101‑1 TTGCTGGTATGGCTGGCGTAATCCGCGTATCACTGACGACGAATACTATGAATTCGTTGATGAATTTATCCAGGCTGTGAAACAACGCTGGCCAGACGTGC > 1:3938014/1‑101 GCTGGTATGGCTGGCGTAATCCGCGTATCACTGACGACGAATACTAAGAATTCGTCGATGAATTTATCCAGGCTGTGAAACAACGCTGGCCAGACGTGCTG < 1:12931526/101‑1 GTATGGCTGGCGTAATCCGCGTATCACTGACGACGAATACTATGAATTCGTTGATGAATTTATACAGGCTGTGAAACAACGCTGGACAGACGTGCTGTTGC > 1:5003103/1‑101 GGCTGGCGTAATCCGCGTATCACTGACGACGAATACTATGAATTCGTTGATGAATTTATCCAGGCTGTGAAACAACGCTGGCCAGACGTGCTGTTGCAGTT > 1:6076902/1‑101 GGCTGGCGTAATCCGCGTATCACTGACGACGAATACTATGAATTCGTTGATGAATTTATCCAGGCTGTGAAACAACGCTGGCCAGACGTGCTGTTGCAGTT < 1:11748853/101‑1 GGCTGGCGTAATCCGCGTATCACTGACGACGAATACTATGAATTCGTTGATGAATTTATCCAGGCTGTGAAACAACGCTGGCCAGACGTGCTGTTGCAGTT < 1:4495116/101‑1 GGCTGGCGTAATCCGCGTATCACTGACGACGAATACTATGAATTCGTTGATGAATTTATCCAGGCTGTGAAACAACGCTGGCCAGACGTGCTGTTGCAGTT < 1:9435463/101‑1 GCTGGCGTAATCCGCGTATCACTGACGACGAATACTATGAATTCGTTGATGAATTTATCCAGGCTGTGAAACAACGCTGGCCAGACGTGCTGTTGCAGTTT > 1:9903552/1‑101 GCTGGCGTAATCCGCGTATCACTGACGACGAATACTATGAATTCGTTGATGAATTTATCCAGGCTGTGAAACAACGCTGGCCAGACGTGCTGTTGCAGTTT > 1:6871408/1‑101 GCTGGCGTAATCCGCGTATCACTGACGACGAATACTATGAATTCGTTGATGAATTTATCCAGGCTGTGAAACAACGCTGGCCAGACGTGCTGTTGCAGTTT < 1:7614831/101‑1 GCTGGCGTAATCCGCGTATCACTGACGACGAATACTATGAATTCGTTGATGAATTTATCCAGGCTGTGAAACAACGCTGGCCAGACGTGCTGTTGCAGTTT < 1:5723423/101‑1 GCTGGCGTAATCCGCGTATCACTGACGACGAATACTATGAATTCGTTGATGAATTTATCCAGGCTGTGAAACAACGCTGGCCAGACGTGCTGTTGCAGTTT < 1:12092858/101‑1 GCTGGCGTAATCCGCGTATCACTGACGACGAATACTATGAATTCGTTGATGAATTTATCCAGGCTGTGAAACAACGCTGGCCAGACGTGCTGTTGCAGTTT < 1:13309522/101‑1 GCTGGCGTAATCCGCCGATCACTGACGACGAATACTATGAATTCGTTGATGAATTTATCCAGGCTGTGAAACAACGCTGGCCAGACGTGCTGTTGCAGTTT < 1:13833874/101‑1 CTGGCGTAATCCGCGTATCACTGACGACGAATACTATGAATTCGTTGATGAATTTATCCAGGCTGTGAAACAACGCTGGCCAGACGTGCTGTTGCAGagat > 1:11003346/1‑97 CTGGCGTAATCCGCGTATCACTGACGACGAATACTATGAATTCGTTGATGAATTTATCCAGGCTGTGAAACAACGCTGGCCAGACGTGCTGTTGCAGTTTG < 1:717287/101‑1 CTGGCGTAATCCGCGTATCACTGACGACGAATACTATGAATTCGTTGATGAATTTATCCAGGCTGTGAAACAACGCTGGCCAGACGTGCTGTTGCAGTTTG > 1:1693430/1‑101 TGGCGTAATCCGCGTATCACTGACGACGAATACTATGAATTCGTTGATGAATTTATCCAGGCTGTGAAACAACGCTGGCCAGACGTGCTGTTGCAGTTTGA < 1:10260654/101‑1 GGCGTAATCCGCGTATCACTGACGACGAATACTATGAATTCGTTGATGAATTTATCCAGGCTGTGAAACAACGCTGGCCAGACGTGCTGTTGCAGTTTGAA < 1:5521957/101‑1 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GCGGCGGCAATGCTTGCCGGGATTTTATTACGCTTTGGTTTACAGGCGTTTGCCAGTCTGGACGGTCAATTTACGTTGTGTGGAAGTATGTTGCTGGTATGGCTGGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_007779/1507422‑1507316‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ggctggcGTAATCCGCGTATCACTGACGACGAATACTATGAATTCGTTGATGAATTTATCCAGGCTGTGAAACAACGCTGGCCAGACGTGCTGTTGCAGTTTGAAGA < NC_007779/1556743‑1556644 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |