| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_007779 | = 1909205 | 182 (0.620) | 143 (0.490) | 91/178 | NT | 44.3% | coding (101/144 nt) | yobF | hypothetical protein |
| ? | NC_007779 | 2411459 = | NA (NA) | intergenic (‑148/+14) | lrhA/insB | DNA‑binding transcriptional repressor/IS1 element protein | |||||
Only 100 of 198 total aligned reads displayed.
TTTAGACTCGTTGAACCACTTAACCTGACCTTTAATCTTTGCCATTTGAAAAATTCCTTAGATTGTTTTCTTCGCCCGCAGGCATAACATAGATAAAACTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_007779/1909105‑1909205‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTC > NC_007779/2411459‑2411558 TTTAGACTCGTTGAACCACTTAACCTGACCTTTAATCTTTGCCATTTGAAAAATTCCTTAGATTGTTTTCTTCGCCCGCAGGCATAACATAGATAAAACTG < 1:1236610/101‑1TTTAGACTCGTTGAACCACTTAACCTGACCTTTAATCTTTGCCATTTGAAAAATTCCTTAGATTGTTTTCTTCGCCCGCAGGCATAACATAGATAAAACTG < 1:119495/101‑1 TAGACTCGTTGAACCACTTAACCTGACCTTTAATCTTTGCCATTTGAAAAATTCCTTAGATTGTTTTCTTCGCCCGCAGGCATAACATAGATAAAACTGGT > 1:7518863/1‑101 TAGACTCGTTGAACCACTTAACCTGACCTTTAATCTTTGCCATTTGAAAAATTCCTTAGATTGGTTTCTTCGCCCGCAGGCATAACATAGATAAAACTGGT < 1:1013345/101‑1 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CACTTAACCTGACCTTTAATCTTTGCCATTTTAAAAATTCCTTAGATTGTTTTCTTCGCCCGCAGGCATAACATAGATAAAACTGGTAATGACTCCAACTT < 1:3444359/101‑1 ACTTAACCTGACCTTTAATCTTTGCCATTTGAAAAATTCCTTAGATTGTTTTCTTCGCCCGCAGGCATAACATAGATAAAACTGGTAATGACTCCAACTTA < 1:4580155/101‑1 ACTTAACCTGACCTTTAATCTTTGCCATTTGAAAAATTCCTTAGATTGTTTTCTTCGCCCGCAGGCATAACATAGATAAAACTGGTAATGACTCCAACTTA > 1:2731111/1‑101 ACTTAACCTGACCTTTAATCTTTGCCATTTGAAAAATTCCTTAGATTGTTTTCTTCGCCCGCAGGCATAACATAGATAAAACTGGTAATGACTCCAACTTA > 1:14634520/1‑101 TAACCTGACCTTTAATCTTTGCCATTTGAAAAATTCCTTAGATTGTTTTCTTCGCCCGCAGGCATAACATAGATAAAACTGGTAATGACTCCAACTTATTG < 1:13891579/101‑1 AACCTGACCTTTAATCTTTGCCATTTGAAAAATTCCTTAGATTGTTTTCTTCGCCCGCAGGCATAACATAGATAAAACTGGTAATGACTCCAACTTATTGA > 1:8698029/1‑101 CTGACCTTTAATCTTTGCCATTTGAAAAATTCCTTAGATTGTTTTCTTCGCCCGCAGGCATAACATAGATAAAACTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAG < 1:1569883/101‑1 TGACCTTTAATCTTTGCCATTTGAAAAATTCCTTAGATTGTTTTCTTCGCCCGCAGGCATAACATAGATAAAACTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGT > 1:5344343/1‑101 TGACCTTTAATCTTTGCCATTTGAAAAATTCCTTAGATTGTTTTCTTCGCCCGCAGGCATAACATAGATAAAACTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGT < 1:5542170/101‑1 ACCTTTAATCTTTGCCATTTGAAAAATTCCTTAGATTGTTTTCTTCGCCCGCAGGCATAACATAGATAAAACTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGT < 1:620594/101‑1 ACCTTTAATCTTTGCCATTTGAAAAATTCCTTAGATTGTTTTCTTCGCCCGCAGGCATAACATAGATAAAACTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGT < 1:14406900/101‑1 CCTTTAATCTTTGCCATTTGAAAAATTCCTTAGATTGTTTTCTTCGCCCGCAGGCATAACATAGATAAAACTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTT < 1:13013977/101‑1 TTAATCTTTGCCATTTGAAAAATTCCTTAGATTGTTTTCTTCGCCCGCAGGCATAACATAGATAAAACTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTA > 1:11379809/1‑101 TAATCTTTGCCATTTGAAAAATTCCTTAGATTGTTTTCTTCGCCCGCAGGCATAACATAGATAAAACTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTAT < 1:3282621/101‑1 TAATCTTTGCCATTTGAAAAATTCCTTAGATTGTTTTCTTCGCCCGCAGGCATAACATAGATAAAACTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTAT < 1:250085/101‑1 TCTTTGCCATTTGAAAAATTCCTTAGATTGTTTTCTTCGCCCGCAGGCATAACATAGATAAAACTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTT < 1:6479560/101‑1 TCTTTGCCATTTGAAAAATTCCTTAGATTGTTTTCTTCGCCCGCAGGCATAACATAGATAAAACTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTT < 1:6085331/101‑1 TTTGCCATTTGAAAAATTCCTTAGATTGTTTTCTTCGCCCGCAGGCATAACATAGATAAAACTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCA > 1:10575286/1‑101 TTTGCCATTTGAAAAATTCCTTAGATTGTTTTCTTCGCCCGCAGGCATAACATAGATAAAACTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCA > 1:14421730/1‑101 TTTGCCATTTGAAAAATTCCTTAGATTGTTTTCTTCGCCCGCAGGCATAACATAGATAAAACTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCA < 1:9724958/101‑1 TTGCCATTTGAAAAATTCCTTAGATTGTTTTCTTCGCCCGCAGGCATAACATAGATAAAACTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAG > 1:1944890/1‑101 TGCCATTTGAAAAATTCCTTAGATTGTTTTCTTCGCCCGCAGGCATAACATAGATAAAACTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGA < 1:14994160/101‑1 GCCATTTGAAAAATTCCTTAGATTGTTTTCTTCGCCCGCAGGCATAACATAGATAAAACTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGAT < 1:1863357/101‑1 GCCATTTGAAAAATTCCTTAGATTGTTTTCTTCGCCCGCAGGCATAACATAGATAAAACTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGAT < 1:8309776/101‑1 CATTTGAAAAATTCCTTAGATTGTTTTCTTCGCCCGCAGGCATAACATAGATAAAACTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAA > 1:374669/1‑101 ATTTGAAAAATTCCTTAGATTGTTTTCTTCGCCCGCAGGCATAACATAGATAAAACTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAAT > 1:1919168/1‑101 TTTGAAAAATTCCTTAGATTGTTTTCTTCGCCCGCAGGCATAACATAGATAAAACTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATG > 1:10883603/1‑101 TTTGAAAAATTCCTTAGATTGTTTTCTTCGCCCGCAGGCATAACATAGATAAAACTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATG > 1:4854144/1‑101 TTTGAAAAATTCCTTAGATTGTTTTCTTCGCCCGCAGGCATAACATAGATAAAACTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATG > 1:4097731/1‑101 TTGAAAAATTCCTTAGATTGTTTTCTTCGCCCGCAGGCATAACATAGATAAAACTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGC < 1:1767673/101‑1 TTGAAAAATTCCTTAGATTGTTTTCTTCGCCCGCAGGCATAACATAGATAAAACTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGC > 1:7106283/1‑101 AAAATTCCTTAGATTGTTTTCTTCGCCCGCAGGCATAACATAGATAAAACTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGA < 1:636437/101‑1 AAATTCCTTAGATTGTTTTCTTCGCCCGCAGGCATAACATAGATAAAACTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGAT < 1:8106090/101‑1 AATTCCTTAGATTGTTTTCTTCGCCCGCAGGCAAAACATAGATAAAACTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATG < 1:14246331/101‑1 CTTAGATTGTTTTCTTCGCCCGCAGGCATAACATAGATAAAACTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTT < 1:12029065/101‑1 CTTAGATTGTTTTCTTCGCCCGCAGGCATAACATAGATAAAACTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATATTCAGATAATGCCCGATGACTTT > 1:925350/1‑101 GATTGTTTTCTTCGCCCGCAGGCATAACATAGATAAAACTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCA > 1:12826192/1‑101 GATTGTTTTCTTCGCCCGCAGGCATAACATAGATAAAACTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCA < 1:6615821/101‑1 GATTGTTTTCTTCGCCCGCAGGCATAACATAGATAAAACTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCA > 1:14681074/1‑101 ATTGTTTTCTTCGCCCGCAGGCATAACATAGATAAAACTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCAT < 1:13452599/101‑1 ATTGTTTTCTTCGCCCGCAGGCATAACATAGATAAAACTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCAT < 1:9697755/101‑1 TTGTTTTCTTCGCCCGCAGGCATAACATAGATAAAACTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATG > 1:11027762/1‑101 GTTTTCTTCGCCCGCAGGCATAACATAGATAAAACTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCA < 1:11789886/101‑1 GTTTTCTTCGCCCGCAGGCATAACATAGATAAAACTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCA < 1:8023093/101‑1 GTTTTCTTCGCCCGCAGGCATAACATAGATAAAACTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCA < 1:6743352/101‑1 TTCTTCGCCCGCAGGCATAACATAGATAAAACTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCT < 1:14053431/101‑1 TTCTTCGCCCGCAGGCATAACATAGATAAAACTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCT < 1:790812/101‑1 TCTTCGCCCGCAGGCATAACATAGATAAAACTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTC > 1:3185482/1‑101 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ACATAGATAAAACTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGA > 1:14334941/1‑101 ATAGATAAAACTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACA < 1:12526051/101‑1 aagaagtcCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGC > 1:10473776/9‑101 AGATAAAACTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGC > 1:5719941/1‑101 agaagtcCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCG < 1:8358882/94‑1 GATAAAACTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCG < 1:848590/101‑1 aagtcCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGAC < 1:12212609/96‑1 aagtcCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGAC < 1:7408334/96‑1 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |