| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_007779 | 4355060 = | 1 (0.000) | 339 (1.150) | 150/180 | NT | 99.7% | coding (1281/1632 nt) | dcuS | sensory histidine kinase in two‑component regulatory system with DcuR, regulator of anaerobic fumarate respiration |
| ? | NC_007779 | 4502861 = | NA (NA) | intergenic (+241/‑46) | intB/insC | integrase/IS2 insertion element repressor InsA | |||||
Only 100 of 723 total aligned reads displayed.
TTACGCTAATTTCGCCTCCGGGTTCCGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTCGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAG > NC_007779/4354960‑4355160 | atcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctag > 1:6465885‑M1/101‑101 (MQ=255)atcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctag > 1:6034896‑M1/101‑101 (MQ=255)atcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctag < 1:10980057‑M1/1‑1 (MQ=255) caatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctagcg < 1:14331144‑M1/3‑2 (MQ=255) cGCTAATTTCGCCTCCGGGTTCCGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCg > 1:13114088/1‑101 (MQ=255) aatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctagcga < 1:7692381‑M1/4‑3 (MQ=255) gCTAATTTCGCCTCCGGGTTCCGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGc > 1:10627947/1‑101 (MQ=255) atcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGc < 1:12632969‑M1/5‑1 (MQ=255) atcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGc > 1:8532433‑M1/97‑101 (MQ=255) tcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctagcgata > 1:4050091‑M1/96‑97 (MQ=255) tcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCt < 1:7541887‑M1/6‑1 (MQ=255) tAATTTCGCCTCCGGGTTCCGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTG < 1:8417794‑M1/101‑1 (MQ=255) tAATTTCGCCTCCGGGTTCCGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTG < 1:2254960‑M1/101‑1 (MQ=255) catctgttctccaatgattagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctagcgatat > 1:12884262‑M1/95‑96 (MQ=255) catctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctagcgatat < 1:12255424‑M1/7‑6 (MQ=255) tctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctagcgatatta > 1:696095‑M1/93‑94 (MQ=255) tctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctagcgatatta < 1:7357719‑M1/9‑8 (MQ=255) tctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctagcgatatta > 1:3961726‑M1/93‑94 (MQ=255) aTTTCGCCTCCGGGTTCCGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGga < 1:8847132‑M1/101‑3 (MQ=255) aTTTCGCCTCCGGGTTCCGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGga > 1:8196890‑M1/1‑99 (MQ=255) aTTTCGCCTCCGGGTTCCGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGga < 1:4173569‑M1/101‑3 (MQ=255) tttCGCCTCCGGGTTCCGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGgat < 1:9519381‑M1/101‑4 (MQ=255) ttCGCCTCCGGGTTCCGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGgatt > 1:2455366‑M1/1‑97 (MQ=255) tgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcccttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTg < 1:89503‑M1/11‑1 (MQ=255) tgttatcaaatgactaatctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTg > 1:11436872‑M1/91‑101 (MQ=255) gttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTgg < 1:14008933‑M1/12‑1 (MQ=255) ttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGc < 1:13698320‑M1/13‑1 (MQ=255) tctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCa < 1:7938907‑M1/14‑1 (MQ=255) gCCTCCGGGTTCCGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGgatttgc > 1:1783124‑M1/1‑94 (MQ=255) ctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAg < 1:5291370‑M1/15‑1 (MQ=255) ccTCCGGGTTCCGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGgatttgcc > 1:9391477‑M1/1‑93 (MQ=255) ccGGGTTCCGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGgatttgcccct < 1:13324050‑M1/101‑12 (MQ=255) aatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTgg < 1:12753589‑M1/19‑1 (MQ=255) atgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGc > 1:3776584‑M1/82‑101 (MQ=255) tCCGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGgatttgcccctatattt > 1:14463531‑M1/1‑84 (MQ=255) ctagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTc > 1:5590515‑M1/78‑101 (MQ=255) ctagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTc < 1:11729930‑M1/24‑1 (MQ=255) ctagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTc < 1:12055656‑M1/24‑1 (MQ=255) ccGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGgatttgcccctatatttc < 1:2012463‑M1/101‑19 (MQ=255) cGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGgatttgcccctatatttcc > 1:2109320‑M1/1‑82 (MQ=255) gtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACt > 1:6799456‑M1/75‑101 (MQ=255) tctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGACGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTg < 1:11045407‑M1/28‑1 (MQ=255) aaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGttt < 1:13023985‑M1/31‑1 (MQ=255) tAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGgatttgcccctatatttccagacat < 1:4420609‑M1/101‑26 (MQ=255) aaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTaa < 1:1702308‑M1/33‑1 (MQ=255) aaTGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGgatttgcccctatatttccagacatc < 1:11251095‑M1/101‑27 (MQ=255) gCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGgatttgcccctatatttccagacatctgt < 1:3827567‑M1/101‑30 (MQ=255) ctagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAAt < 1:2892588‑M1/36‑1 (MQ=255) tagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATc < 1:627227‑M1/37‑1 (MQ=255) agtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCa < 1:13402915‑M1/38‑1 (MQ=255) tattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGc < 1:14800152‑M1/40‑1 (MQ=255) ccAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGgatttgcccctatatttccagacatctgttatc < 1:2341497‑M1/101‑34 (MQ=255) ccAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGgatttgcccctatatttccagacatctgttatc < 1:13792457‑M1/101‑34 (MQ=255) cAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGgatttgcccctatatttccagacatctgttatca < 1:14676494‑M1/101‑35 (MQ=255) attaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCg < 1:475710‑M1/41‑1 (MQ=255) ttaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATAAGCGt < 1:5743246‑M1/42‑1 (MQ=255) gcgcGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGgatttgcccctatatttccagacatctgttatcact > 1:907469‑M1/1‑65 (MQ=255) actatcacttatttaagtgatattgtttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGc < 1:72486‑M1/47‑1 (MQ=255) actatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGc > 1:1531053‑M1/55‑101 (MQ=255) tatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCt < 1:10545387‑M1/49‑1 (MQ=255) atcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTa > 1:1417562‑M1/52‑101 (MQ=255) tATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGgatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccatta < 1:10246964‑M1/101‑47 (MQ=255) cttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATc > 1:3077478‑M1/48‑101 (MQ=255) aTCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGgatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattac < 1:11888143‑M1/101‑48 (MQ=255) tCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGTGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGgatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattaca < 1:499067‑M1/101‑49 (MQ=255) tatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCgg > 1:5138381‑M1/46‑101 (MQ=255) cAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGgatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaa > 1:1905622‑M1/1‑52 (MQ=255) atttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGt < 1:4261367‑M1/57‑1 (MQ=255) ttCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGgatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaggcccg > 1:9248003‑M1/1‑47 (MQ=255) ttCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGgatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccg > 1:9752435‑M1/1‑47 (MQ=255) agtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTcgcgc > 1:3596553‑M1/40‑101 (MQ=255) agtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTcgcgc > 1:14584309‑M1/40‑101 (MQ=255) gatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTCGCGCGGt < 1:2997318‑M1/65‑1 (MQ=255) tattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTTACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTCGCGCGGTTa < 1:612670‑M1/67‑1 (MQ=255) tattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTCGCGCGGTTa < 1:7155281‑M1/67‑1 (MQ=255) tattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTCGCGCGGTTa > 1:13920599‑M1/35‑101 (MQ=255) tggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTCGCGCGGTTAATc > 1:7791879‑M1/32‑101 (MQ=255) ggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTCGCGCGGTTAATCt < 1:2610720‑M1/71‑1 (MQ=255) tAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGgatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagata > 1:9156787‑M1/1‑35 (MQ=255) gtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTCGCGCGGTTAATCTTGCt > 1:10701507‑M1/27‑101 (MQ=255) aTCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGgatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccggtgccgcagatatt > 1:12485420‑M1/1‑33 (MQ=255) tctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTCGCGCGGTTAATCTTGCTg < 1:4539722‑M1/76‑1 (MQ=255) ctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTCGCGCGGTTAATCTTGCTGa < 1:6563337‑M1/77‑1 (MQ=255) tggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTCGCGCGGTTAATCTTGCTGAt > 1:3511971‑M1/24‑101 (MQ=255) tggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTCGCGCGGTTAATCTTGCTGAt < 1:3350101‑M1/78‑1 (MQ=255) ggattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTCGCGCGGTTAATCTTGCTGATTaa > 1:6390111‑M1/21‑101 (MQ=255) gTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGgatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtg > 1:13585982‑M1/1‑27 (MQ=255) cgcgACCTGGTCCTCACTGCCGCTGgatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggc > 1:9622248‑M1/1‑25 (MQ=255) cgACCTGGTCCTCACTGCCGCTGgatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcga > 1:2724653‑M1/1‑23 (MQ=255) agggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTCGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAAcc < 1:4636055‑M1/87‑1 (MQ=255) cTGGTCCTCACTGCCGCTGgatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcga < 1:10908716‑M1/101‑83 (MQ=255) tGGTCCTCACTGCCGCTGgatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgat < 1:8699966‑M1/101‑84 (MQ=255) tGGTCCTCACTGCCGCTGgatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgat > 1:12324728‑M1/1‑18 (MQ=255) ggTCCTCACTGCCGCTGgatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgata < 1:3217474‑M1/101‑85 (MQ=255) agtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTGTGGCCTAAATCGGTCGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATaa < 1:10020094‑M1/95‑1 (MQ=255) agtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTCGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATaa > 1:11505024‑M1/7‑101 (MQ=255) agtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTCGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATaa > 1:9917381‑M1/7‑101 (MQ=255) tCACTGCCGCTGgatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccatggcgagcgataaccca > 1:10354603‑M1/1‑12 (MQ=255) ctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTCGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCg > 1:5443942‑M1/4‑101 (MQ=255) aCTGCCGCTGgatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagc < 1:11631496‑M1/101‑92 (MQ=255) | TTACGCTAATTTCGCCTCCGGGTTCCGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTCGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAG > NC_007779/4354960‑4355160 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |