New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_007779 | = 1907288 | 13 (0.040) | 238 (0.810) | 131/180 | NT | 94.8% | intergenic (+315/‑114) | yobD/yebN | inner membrane protein/inner membrane protein |
? | NC_007779 | 2411458 = | NA (NA) | intergenic (‑147/+15) | lrhA/insB | DNA‑binding transcriptional repressor/IS1 element protein |
Only 100 of 325 total aligned reads displayed.
CACACACAAACAAGCAATTCCATTTGTAATGTGCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACT‑AAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCG > NC_007779/2411358‑2411556 | cacacacaAACAAGCAATTCCATTTGTAATGTGCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACT‑AAAAAAGCg > 1:905372/1‑101 (MQ=255) acacacaAACAAGCAATTCCATTTGTAATGTGCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACT‑AAAAAAGCgg < 1:6191330/101‑1 (MQ=255) acacacaAACAAGCAATTCCATTTGTAATGTGCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTCGCACT‑AAAAAAGCgg > 1:13839171/1‑101 (MQ=255) cacacaAACAAGCAATTCCATTTGTAATGTGCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACT‑AAAAAAGCGGt < 1:12827378/101‑1 (MQ=255) cacaAACAAGCAATTCCATTTGTAATGTGCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACT‑AAAAAAGCGGTaa > 1:8170858/1‑101 (MQ=255) caaacaaGCAATTCCATTTGTAATGTGCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACT‑AAAAAAGCGGTAATg < 1:14787483/101‑1 (MQ=255) acaaGCAATTCCATTTGTAATGTGCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACT‑AAAAAAGCGGTAATGACt < 1:10555822/101‑1 (MQ=255) aaGCAATTCCATTTGTAATGTGCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACT‑AAAAAAGCGGTAATGACTcc < 1:9492902/101‑1 (MQ=255) aaGCAATTCCATTTGTAATGTGCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACT‑AAAAAAGCGGTAATGACTcc > 1:510785/1‑101 (MQ=255) gCAATTCCATTTGTAATGTGCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACT‑AAAAAAGCGGTAATGACTCCaa < 1:10662792/101‑1 (MQ=255) gCAATTCCATTTGTAATGTGCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACT‑AAAAAAGCGGTAATGACTCCaa < 1:1295719/101‑1 (MQ=255) cAATTCCATTTGTAATGTGCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACT‑AAAAAAGCGGTAATGACTCCAAc < 1:8665335/101‑1 (MQ=255) aaTTCCATTTGTAATGTGCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACT‑AAAAAAGCGGTAATGACTCCAACt < 1:5960611/101‑1 (MQ=255) aTTCCATTTGTAATGTGCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGAACT‑AAAAAAGCGGTAATGACTCCAACtt > 1:3060572/1‑101 (MQ=255) ttCCATTTGTAATGTGCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACT‑AAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTa < 1:9666852/101‑1 (MQ=255) tCCATTTGTAATGTGCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACT‑AAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTAt > 1:9778050/1‑101 (MQ=255) ccATTTGTAATGTGCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACT‑AAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTAtt < 1:1810710/101‑1 (MQ=255) ccATTTGTAATGTGCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACT‑AAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTAtt > 1:3707709/1‑101 (MQ=255) ttGTAATGTGCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACT‑AAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATa > 1:11880376/1‑101 (MQ=255) gTAATGTGCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACT‑AAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAgt > 1:192513/1‑101 (MQ=255) tAATGTGCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACT‑AAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAgtg < 1:8986154/101‑1 (MQ=255) aaTGTGCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACT‑AAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAgtgt > 1:14547435/1‑101 (MQ=255) aTGTGCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACT‑AAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGtt > 1:6741859/1‑101 (MQ=255) gtgCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACT‑AAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGtttt < 1:2203560/101‑1 (MQ=255) tgCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACT‑AAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTa > 1:4296383/1‑101 (MQ=255) gCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACT‑AAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTAt < 1:2550824/101‑1 (MQ=255) ccTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACT‑AAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATg < 1:10028658/101‑1 (MQ=255) cTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACT‑AAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGt < 1:2004138/101‑1 (MQ=255) cTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACT‑AAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGt < 1:11734614/101‑1 (MQ=255) tCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACT‑AAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGtt > 1:13481358/1‑101 (MQ=255) tCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACT‑AAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGtt < 1:4718186/101‑1 (MQ=255) tCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACT‑AAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGtt > 1:1869234/1‑101 (MQ=255) tCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACT‑AAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGtt > 1:8035774/1‑101 (MQ=255) cccTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACT‑AAAAAAGCGGTAATGACTACAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTc > 1:5716140/1‑101 (MQ=255) ccTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACT‑AAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCa < 1:9144277/101‑1 (MQ=255) tGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACT‑AAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGa > 1:13679016/1‑101 (MQ=255) ggCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACT‑AAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGAt < 1:7617904/101‑1 (MQ=255) ggCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACT‑AAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGAt > 1:3386863/1‑101 (MQ=255) gCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACT‑AAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATa < 1:14430569/101‑1 (MQ=255) aGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACT‑AAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAAt < 1:11152083/101‑1 (MQ=255) aGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACT‑AAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAAt > 1:6849233/1‑101 (MQ=255) tttCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACT‑AAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAAtcc > 1:3842609/1‑99 (MQ=255) tCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACT‑AAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGccc < 1:1338286/101‑1 (MQ=255) cATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACT‑AAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCg < 1:10748452/101‑1 (MQ=255) aTCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACT‑AAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGa > 1:6259186/1‑101 (MQ=255) aTCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACT‑AAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGa > 1:10348015/1‑101 (MQ=255) tCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACT‑AAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGCTAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGAt > 1:1151656/1‑101 (MQ=255) cGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACT‑AAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGa > 1:2945259/1‑101 (MQ=255) ggAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACT‑AAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGAc < 1:5397508/101‑1 (MQ=255) ggAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACT‑AAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGAc > 1:9921274/1‑101 (MQ=255) ggAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACT‑AAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGAc < 1:7469130/101‑1 (MQ=255) ggAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACT‑AAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGAc > 1:8334111/1‑101 (MQ=255) gAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACT‑AAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACt > 1:10898398/1‑101 (MQ=255) aaCCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACT‑AAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACtt > 1:5286892/1‑101 (MQ=255) aCCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACT‑AAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACttt < 1:7047664/101‑1 (MQ=255) aCCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACT‑AAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACttt < 1:1020509/101‑1 (MQ=255) aCCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACT‑AAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACttt < 1:10476925/101‑1 (MQ=255) aCCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACT‑AAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACttt < 1:4865797/101‑1 (MQ=255) aCCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACT‑AAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACttt < 1:12522285/101‑1 (MQ=255) aCCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGGTGCACT‑AAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACttt < 1:16668/101‑1 (MQ=255) ccGGACGAAAGTAAAAATGCGTATGAGTTGCACTAAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTg > 1:9274459/1‑101 (MQ=255) ggACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACT‑AAAAAAGCGGTAATGACTCCAAGTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCa > 1:12730808/1‑101 (MQ=255) gACGAAAGTAAAAATGGATATGAGTTGCACT‑AAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCAt < 1:3786550/101‑1 (MQ=255) gACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACT‑AAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCAt < 1:12139175/101‑1 (MQ=255) aCGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACT‑AAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATg < 1:7167519/101‑1 (MQ=255) aCGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACT‑AAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATg < 1:1771347/101‑1 (MQ=255) cGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACT‑AAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGtagatc > 1:12295383/1‑96 (MQ=255) cGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACT‑AAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGc > 1:7988400/1‑101 (MQ=255) cGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACT‑AAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGc > 1:14344210/1‑101 (MQ=255) 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tAAAAATGCATATGAGTTGCACT‑AAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTcc > 1:12610342/1‑101 (MQ=255) aaaaTGCATATGAGTTGCACT‑AAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCAc > 1:14894231/1‑101 (MQ=255) aaaaTGCATATGAGTTGCACT‑AAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCAc > 1:8481739/1‑101 (MQ=255) aaaTGCATATGAGTTGCACT‑AAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCAcc < 1:3664061/101‑1 (MQ=255) aaTGCATATGAGTTGCACT‑AAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCg < 1:11327944/101‑1 (MQ=255) aaTGCATATGAGTTGCACT‑AAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCg < 1:8916149/101‑1 (MQ=255) aTGCATATGAGTTGCACT‑AAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGa > 1:10978018/1‑101 (MQ=255) tGCATATGAGTTGCACT‑AAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGAt > 1:310735/1‑101 (MQ=255) tGAGTTGCACT‑AAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTgag < 1:3945326/101‑1 (MQ=255) gAGTTGCACT‑AAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTgaga > 1:7888779/1‑101 (MQ=255) aGTTGCACT‑AAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGaa > 1:3924366/1‑101 (MQ=255) aGTTGCACT‑AAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGaa > 1:3461000/1‑101 (MQ=255) gTTGCACT‑AAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAAc > 1:2297344/1‑101 (MQ=255) ttGCACT‑AAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCGCCGATTTTGAGAACg > 1:11244457/1‑101 (MQ=255) tGCACT‑AAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGa > 1:5038139/1‑101 (MQ=255) cT‑AAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAATGACAGc < 1:12691376/101‑1 (MQ=255) t‑AAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCg > 1:7810327/1‑101 (MQ=38) t‑AAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCg < 1:3209690/101‑1 (MQ=38) aaaaaGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGAc > 1:4078661/1‑101 (MQ=35) aaaaGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACt > 1:4156855/1‑101 (MQ=34) aaaaGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACt > 1:6424095/1‑101 (MQ=34) aaaGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAACGCCtt > 1:4527630/1‑101 (MQ=16) aaGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTc > 1:2798864/1‑101 (MQ=32) aGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTcc < 1:359270/101‑1 (MQ=31) | CACACACAAACAAGCAATTCCATTTGTAATGTGCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACT‑AAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCG > NC_007779/2411358‑2411556 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |