New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_007779 | 1909276 = | 220 (0.750) | 56 (0.190) | 48/178 | NT | 20.5% | coding (30/144 nt) | yobF | hypothetical protein |
? | NC_007779 | 2411459 = | NA (NA) | intergenic (‑148/+14) | lrhA/insB | DNA‑binding transcriptional repressor/IS1 element protein |
Only 100 of 322 total aligned reads displayed.
ACACACAAACAAGCAATTCCATTTGTAATGTGCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACT‑AAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCG > NC_007779/2411359‑2411556 | cacaAACAAGCAATTCCATTTGTAATGTGCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACT‑AAAAAAGCGGTaa > 1:8170858/1‑101 (MQ=255) cacaAACAAGCAATTCCATTTGTAATGTGCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACT‑AAAAAAGCGGTaa > 1:198005/1‑101 (MQ=255) aacaaGCAATTCCATTTGTAATGTGCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACT‑AAAAAAGCGGTAATGAc > 1:509242/1‑101 (MQ=255) aacaaGCAATTCCATTTGTAATGTGCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACT‑AAAAAAGCGGTAATGAc < 1:1743509/101‑1 (MQ=255) acaaGCAATTCCATTTGTAATGTGCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACT‑AAAAAAGCGGTAATGACt < 1:10555822/101‑1 (MQ=255) caaGCAATTCCATTTGTAATGTGCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACT‑AAAAAAGCGGTAATGACTc < 1:5509283/101‑1 (MQ=255) aaGCAATTCCATTTGTAATGTGCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACT‑AAAAAAGCGGTAATGACTcc < 1:9492902/101‑1 (MQ=255) gCAATTCCATTTGTAATGTGCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACT‑AAAAAAGCGGTAATGACTCCaa < 1:1295719/101‑1 (MQ=255) gCAATTCCATTTGTAATGTGCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACT‑AAAAAAGCGGTAATGACTCCaa < 1:10662792/101‑1 (MQ=255) gCAATTCCATTTGTAATGTGCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACT‑AAAAAAGCGGTAATGACTCCaa > 1:12778375/1‑101 (MQ=255) aTTCCATTTGTAATGTGCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACT‑AAAAAAGCGGTAATGACTCCAACtt < 1:1808687/101‑1 (MQ=255) aTTCCATTTGTAATGTGCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACT‑AAAAAAGCGGTAATGACTCCAACtt < 1:11454438/101‑1 (MQ=255) ttCCATTTGTAATGTGCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACT‑AAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTa > 1:10969069/1‑101 (MQ=255) ttCCATTTGTAATGTGCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACT‑AAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTa < 1:9666852/101‑1 (MQ=255) tCCATTTGTAATGTGCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACT‑AAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTAt > 1:9778050/1‑101 (MQ=255) cATTTGTAATGTGCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACT‑AAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTg < 1:3936586/101‑1 (MQ=255) tttGTAATGTGCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACT‑AAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGAt < 1:6754730/101‑1 (MQ=255) ttGTAATGTGCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACT‑AAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATa > 1:11880376/1‑101 (MQ=255) gTAATGTGCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACT‑AAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAgt > 1:5964231/1‑101 (MQ=255) tAATGTGCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACT‑AAAAAAGCGGTAATGACTCGAACTTATTGATAgtg > 1:8593704/1‑101 (MQ=255) tAATGTGCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACT‑AAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAgtg < 1:4081133/101‑1 (MQ=255) aTGTGCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACT‑AAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGtt < 1:3373135/101‑1 (MQ=255) tgCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACT‑AAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTa < 1:13772229/101‑1 (MQ=255) gCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACT‑AAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTAt < 1:6377277/101‑1 (MQ=255) ccTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACT‑AAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATg > 1:6208896/1‑101 (MQ=255) ccTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACT‑AAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATg < 1:10028658/101‑1 (MQ=255) cTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACT‑AAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGt > 1:13380817/1‑101 (MQ=255) cTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACT‑AAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGt < 1:11734614/101‑1 (MQ=255) tCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACT‑AAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGtt < 1:3901003/101‑1 (MQ=255) tCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACT‑AAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGtt > 1:344176/1‑101 (MQ=255) cccTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACT‑AAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTc < 1:2943985/101‑1 (MQ=255) cccTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAACGCATATGAGTTGCACT‑AAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTc < 1:7273050/101‑1 (MQ=255) ccTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACT‑AAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCa < 1:9144277/101‑1 (MQ=255) tGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACT‑AAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGa > 1:14393462/1‑101 (MQ=255) ggCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACT‑AAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGAt > 1:802917/1‑101 (MQ=255) ggCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACT‑AAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGAt < 1:7617904/101‑1 (MQ=255) ggCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACT‑AAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGAt > 1:1852269/1‑101 (MQ=255) gCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACT‑AAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATa > 1:12673148/1‑101 (MQ=255) cAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACT‑AAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATaa < 1:12230969/101‑1 (MQ=255) cAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACT‑AAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATaa < 1:12050954/101‑1 (MQ=255) aGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACT‑AAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAAt < 1:5305780/101‑1 (MQ=255) aGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACT‑AAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAAt < 1:11152083/101‑1 (MQ=255) aGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACT‑AAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAAt > 1:8332474/1‑101 (MQ=255) aGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACT‑AAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAAt < 1:6575206/101‑1 (MQ=255) ttCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACT‑AAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGcc > 1:59201/1‑101 (MQ=255) tCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACT‑AAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGccc < 1:3069237/101‑1 (MQ=255) tCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACT‑AAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGccc < 1:4598459/101‑1 (MQ=255) tCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACT‑AAAAAAGCGATAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGccc > 1:12724074/1‑101 (MQ=255) cATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACT‑AAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCg < 1:10748452/101‑1 (MQ=255) cATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACT‑AAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCg < 1:3690729/101‑1 (MQ=255) aTCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACT‑AAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCgc < 1:14529437/101‑2 (MQ=255) aTCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACT‑AAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGa > 1:10348015/1‑101 (MQ=255) tCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACT‑AAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGAt < 1:4166372/101‑1 (MQ=255) ccGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACT‑AAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATg > 1:3178791/1‑101 (MQ=255) ccGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACT‑AAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATg < 1:14851101/101‑1 (MQ=255) 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aCCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACT‑AAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACttt < 1:5436943/101‑1 (MQ=255) cccGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACT‑AAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTg < 1:6144396/101‑1 (MQ=255) ccGGACGAAAGTAAAAATGCGTATGAGTTGCACTAAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTg > 1:9274459/1‑101 (MQ=255) ccGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACT‑AAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGt > 1:7860705/1‑101 (MQ=255) gACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACT‑AAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCAt > 1:3791501/1‑101 (MQ=255) gACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACT‑AAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCAt < 1:7112518/101‑1 (MQ=255) gACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACT‑AAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCAt > 1:6891444/1‑101 (MQ=255) 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aGTAAAAATGCATATGAGTTGCACT‑AAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCt > 1:2226924/1‑101 (MQ=255) tAAAAATGCATATGAGTTGCACT‑AAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTcc > 1:12610342/1‑101 (MQ=255) aaaaTGCATATGAGTTGCACT‑‑AAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCAcc < 1:6696027/101‑1 (MQ=255) aaaTGCATATGAGTTGCACT‑AAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCAcc > 1:1660464/1‑101 (MQ=255) aaTGCATATGAGTTGCACT‑AAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCg < 1:8916149/101‑1 (MQ=255) gCATATGAGTTGCACT‑AAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGAtt > 1:4951973/1‑101 (MQ=255) cATATGAGTTGCACT‑AAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGAttt > 1:11310587/1‑101 (MQ=255) tatGAGTTGCACT‑AAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTg > 1:13464440/1‑101 (MQ=255) atGAGTTGCACT‑AAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTgn < 1:10865805/101‑2 (MQ=255) aGTTGCACT‑AAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGaa < 1:3533724/101‑1 (MQ=255) gTTGCACT‑AAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAAc > 1:3661340/1‑101 (MQ=255) gTTGCACT‑AAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAAc > 1:2966575/1‑101 (MQ=255) ttGCACT‑AAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCGCCGATTTTGAGAACg > 1:11244457/1‑101 (MQ=255) ttGCACT‑AAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACg < 1:4765210/101‑1 (MQ=255) ttGCACT‑AAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACg > 1:9046566/1‑101 (MQ=255) gCACT‑AAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGAc < 1:13591645/101‑1 (MQ=255) aCT‑AAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAg < 1:12439383/101‑1 (MQ=40) t‑AAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCg > 1:7810327/1‑101 (MQ=38) t‑AAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCg < 1:1410529/101‑1 (MQ=38) aaaaaaGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGa > 1:10475586/1‑101 (MQ=37) aaaaaGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGAc < 1:4248369/101‑1 (MQ=35) aaaaaGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGAc < 1:5732039/101‑1 (MQ=35) aaGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTc > 1:7012156/1‑101 (MQ=32) aGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTcc < 1:7897265/101‑1 (MQ=31) | ACACACAAACAAGCAATTCCATTTGTAATGTGCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACT‑AAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCG > NC_007779/2411359‑2411556 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |